目的通过数据挖掘、网络药理学与分子对接分析中医治疗糖尿病(Diabetes Mellitus,DM)合并骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的用药规律及作用机制。方法检索中国知网、维普期刊数据库、万方数据库、中国生物医学文献服务系统、pubmed、web of...目的通过数据挖掘、网络药理学与分子对接分析中医治疗糖尿病(Diabetes Mellitus,DM)合并骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的用药规律及作用机制。方法检索中国知网、维普期刊数据库、万方数据库、中国生物医学文献服务系统、pubmed、web of science等数据库收录的相关文献,并利用古今医案云平台构建中医药处方数据库,通过药物频次频率、性味归经、关联规则及系统聚类分析等方式挖掘核心药物;运用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chi-nese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索高频药对化合物及治疗靶点,与Genecards和OMIM数据库筛选出糖尿病合并骨质疏松的靶点相映射并取交集;利用STRING 11.0数据库与Cytoscape软件构建可视化蛋白质相互作用网络(Protein-Protein Interaction,PPI)网络与药物成分靶点网络,并对关键靶点进行基因本体论分析(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书通路富集分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,最后进行分子对接。结果共纳入处方108首,涉及药物173味,归经以肝肾脾较为突出,性味以甘苦为主。关联规则分析得到药物组合10组,共7味中药,使用频次在25以上的中药有9味,其中熟地的使用频次最高;关联规则表明药对,山药-熟地,淫羊藿-黄芪支持度最高;聚类分析得到4类中药分类。将关联分析与聚类分析结果与临床应用相结合,最终得到核心组方:“熟地、山药、山茱萸、骨碎补、淫羊藿、黄芪、丹参”。核心药物组合治疗糖尿病合并骨质疏松的关键成分为豆甾醇(Stigmasterol)、亚油酸乙酯(Mandenol)、8-异戊二烯黄酮[8-(3-methylbut-2-enyl)-2-phenyl-chromone],等,核心靶点为IL-6、PPARG、IL1B、VEGFA、NR3C1等,主要通路为AMPK信号通路、cGMP-PKG信号通路等。结论中医药治疗糖尿病合并骨质疏松基本思路为补益肝脾肾三脏,活血行气。通过数据挖掘,得出中医药治疗糖尿病合并骨质疏松症核心组方为“熟地、山药、山茱萸、骨碎补、淫羊藿、黄芪、丹参”,其核心成分为豆甾醇(Stigmasterol),亚油酸乙酯(Mandenol),8-异戊二烯黄酮[8-(3-methylbut-2-enyl)-2-phenyl-chromone]等,这些成分通过AMPK信号通路、cGMP-PKG信号通路作用于NR3C1、CNR2等靶点,为中医治疗糖尿病合并骨质疏松筛选药物提供参考。展开更多
目的 探讨绝经后骨质疏松的发病机制,并基于逆向网络药理学进行靶点和中药成分的分子对接验证及中药组方预测。方法 利用韦恩图提取并展示“骨质疏松”与“绝经后”的共有靶点;对提取的共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基...目的 探讨绝经后骨质疏松的发病机制,并基于逆向网络药理学进行靶点和中药成分的分子对接验证及中药组方预测。方法 利用韦恩图提取并展示“骨质疏松”与“绝经后”的共有靶点;对提取的共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络以明确绝经后骨质疏松的发病机制、通路和关键靶点,最终构建关键靶点-有效成分-中药网络,确定度值较高的中药并整理其性、味、归经。结果 针对绝经后骨质疏松,保留度值≥10的17个可匹配中药成分的关键靶点,于中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology data base and analysis platform,TCMSP)中匹配中药成分信息,以度值最高的3个靶点与度值≥5且口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18的6种中药成分进行18次分子对接验证,结果稳定且良好。逆向收集300种中药,其中度值≥4的52种中药以寒性药、苦味药居多;在归经上,以肝、肺经居多;在功效上,以活血化瘀居多。结论 运用逆向网络药理学思维及分子对接技术对绝经后骨质疏松进行靶点、通路、成分和中药预测;结合临床实践,在辨证论治绝经后骨质疏松治疗中适当加入苦寒、归肝肺经、活血化瘀类药物并适当添加银杏叶、菟丝子、鸡血藤、甘草、黄芪等中药以改善关节炎症、抑制破骨细胞分化、促进成骨细胞分化、预防骨质疏松,为今后临床辨证论治中药组方拓宽思路。展开更多
文摘目的通过数据挖掘、网络药理学与分子对接分析中医治疗糖尿病(Diabetes Mellitus,DM)合并骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的用药规律及作用机制。方法检索中国知网、维普期刊数据库、万方数据库、中国生物医学文献服务系统、pubmed、web of science等数据库收录的相关文献,并利用古今医案云平台构建中医药处方数据库,通过药物频次频率、性味归经、关联规则及系统聚类分析等方式挖掘核心药物;运用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chi-nese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索高频药对化合物及治疗靶点,与Genecards和OMIM数据库筛选出糖尿病合并骨质疏松的靶点相映射并取交集;利用STRING 11.0数据库与Cytoscape软件构建可视化蛋白质相互作用网络(Protein-Protein Interaction,PPI)网络与药物成分靶点网络,并对关键靶点进行基因本体论分析(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书通路富集分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,最后进行分子对接。结果共纳入处方108首,涉及药物173味,归经以肝肾脾较为突出,性味以甘苦为主。关联规则分析得到药物组合10组,共7味中药,使用频次在25以上的中药有9味,其中熟地的使用频次最高;关联规则表明药对,山药-熟地,淫羊藿-黄芪支持度最高;聚类分析得到4类中药分类。将关联分析与聚类分析结果与临床应用相结合,最终得到核心组方:“熟地、山药、山茱萸、骨碎补、淫羊藿、黄芪、丹参”。核心药物组合治疗糖尿病合并骨质疏松的关键成分为豆甾醇(Stigmasterol)、亚油酸乙酯(Mandenol)、8-异戊二烯黄酮[8-(3-methylbut-2-enyl)-2-phenyl-chromone],等,核心靶点为IL-6、PPARG、IL1B、VEGFA、NR3C1等,主要通路为AMPK信号通路、cGMP-PKG信号通路等。结论中医药治疗糖尿病合并骨质疏松基本思路为补益肝脾肾三脏,活血行气。通过数据挖掘,得出中医药治疗糖尿病合并骨质疏松症核心组方为“熟地、山药、山茱萸、骨碎补、淫羊藿、黄芪、丹参”,其核心成分为豆甾醇(Stigmasterol),亚油酸乙酯(Mandenol),8-异戊二烯黄酮[8-(3-methylbut-2-enyl)-2-phenyl-chromone]等,这些成分通过AMPK信号通路、cGMP-PKG信号通路作用于NR3C1、CNR2等靶点,为中医治疗糖尿病合并骨质疏松筛选药物提供参考。
文摘目的 探讨绝经后骨质疏松的发病机制,并基于逆向网络药理学进行靶点和中药成分的分子对接验证及中药组方预测。方法 利用韦恩图提取并展示“骨质疏松”与“绝经后”的共有靶点;对提取的共有靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络以明确绝经后骨质疏松的发病机制、通路和关键靶点,最终构建关键靶点-有效成分-中药网络,确定度值较高的中药并整理其性、味、归经。结果 针对绝经后骨质疏松,保留度值≥10的17个可匹配中药成分的关键靶点,于中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology data base and analysis platform,TCMSP)中匹配中药成分信息,以度值最高的3个靶点与度值≥5且口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18的6种中药成分进行18次分子对接验证,结果稳定且良好。逆向收集300种中药,其中度值≥4的52种中药以寒性药、苦味药居多;在归经上,以肝、肺经居多;在功效上,以活血化瘀居多。结论 运用逆向网络药理学思维及分子对接技术对绝经后骨质疏松进行靶点、通路、成分和中药预测;结合临床实践,在辨证论治绝经后骨质疏松治疗中适当加入苦寒、归肝肺经、活血化瘀类药物并适当添加银杏叶、菟丝子、鸡血藤、甘草、黄芪等中药以改善关节炎症、抑制破骨细胞分化、促进成骨细胞分化、预防骨质疏松,为今后临床辨证论治中药组方拓宽思路。
