期刊文献+
共找到4篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
中间锦鸡儿WRKY12基因克隆与生物信息学分析 被引量:2
1
作者 万东莉 张杰 +2 位作者 王瑞刚 李国婧 万永青 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期100-108,共9页
WRKY转录因子是植物信号网络中不可缺少的部分,是最大的调节子家族之一。本研究从中间锦鸡儿干旱转录组及基因表达检测数据中,挑选出对干旱、冷、盐、碱及ABA都响应明显的CiWRKY12基因,对其进行克隆及生物信息学分析。结果显示:CiWRKY1... WRKY转录因子是植物信号网络中不可缺少的部分,是最大的调节子家族之一。本研究从中间锦鸡儿干旱转录组及基因表达检测数据中,挑选出对干旱、冷、盐、碱及ABA都响应明显的CiWRKY12基因,对其进行克隆及生物信息学分析。结果显示:CiWRKY12基因的开放阅读框为696 bp,编码232个氨基酸,含有一个典型的WRKY保守结构域,属于GroupⅡc亚族。对转录因子CiWRKY12与其它8种植物的同源蛋白的理化性质和一、二、三级结构进行生物信息学比较分析,发现这9个蛋白无规则卷曲比例较高,大部分属于不稳定蛋白;亚细胞定位预测表明大部分的蛋白定位于细胞核内;多重序列比对显示WRKY保守结构域保守性很高,其三级结构上也呈现较高的相似性,推测这9个转录因子可能具有相似的转录调控功能。通过本研究生物信息学分析将有助于对CiWRKY12深层次功能研究提供借鉴作用。 展开更多
关键词 中间锦鸡儿(caragana intermedia) WRKY12 基因克隆 生物信息学
原文传递
中间锦鸡儿WRKY蛋白与豆科等植物同源蛋白的比较分析 被引量:1
2
作者 万永青 万东莉 +2 位作者 柳金华 王瑞刚 李国婧 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第20期6639-6650,共12页
WRKY转录因子是植物最大的转录调节子家族之一,是信号网络不可缺少的部分。本研究基于前期从中间锦鸡儿筛选鉴定的53条含有完整WRKY结构域的CiWRKYs基因序列,利用生物信息分析手段对其中28个具有完整开放阅读框CiWRKYs的理化性质进行研... WRKY转录因子是植物最大的转录调节子家族之一,是信号网络不可缺少的部分。本研究基于前期从中间锦鸡儿筛选鉴定的53条含有完整WRKY结构域的CiWRKYs基因序列,利用生物信息分析手段对其中28个具有完整开放阅读框CiWRKYs的理化性质进行研究,并与豆科植物和拟南芥的WRKYs转录因子的同源性和进化特征进行比较分析,同时对干旱和盐胁迫条件下蒺藜苜蓿和中间锦鸡儿中同源WRKYs的表达模式进行了比较分析。理化性质分析结果显示28个CiWRKYs的各个氨基酸的组成在各类Group和亚族之间没有明显的规律,脂肪系数范围为37.61~74.76,平均亲水系数均小于0,在-1.269至-0.545之间,表明都属于亲水性蛋白。相似性比对结果表明28个CiWRKYs蛋白序列与拟南芥WRKYs的相似性较低,与豆科植物WRKYs相似性相对较高,GroupⅢ类的3个成员CiWRKY30、CiWRKY70-1和CiWRKY75-1均与拟南芥中同源的WRKYs的相似性较低。系统发育树结果显示中间锦鸡儿与蒺藜苜蓿在进化进程中的距离可能较近。表达模式分析比较显示,蒺藜苜蓿中对干旱响应显著的6个WRKYs与中间锦鸡儿的同源WRKYs基因有类似的表达趋势;而在盐胁迫条件下,蒺藜苜蓿根部受盐胁迫上调的8个WRKYs中有7个同源基因在中间锦鸡儿的地上组织中对盐胁迫有不同的响应。通过本研究分析挖掘的中间锦鸡儿潜在、特有的WRKYs,可以优先选择开展进一步的功能研究。 展开更多
关键词 中间锦鸡儿(caragana intermedia) WRKY 豆科植物 同源蛋白 生物信息学
原文传递
中间锦鸡儿WRKY30的克隆及生物信息学分析 被引量:2
3
作者 柳金华 万永青 +2 位作者 刘杨 王瑞刚 李国婧 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第14期4600-4609,共10页
为了研究CiWRKY30转录因子在植物应对多种胁迫中发挥重要的作用,及对植物形态发育方面的影响。本研究以生长于内蒙古干旱高原地带且具有较高的抗寒抗旱特性的中间锦鸡儿为材料,从本实验室干旱转录数据库中获得胁迫响应转录因子CiWRKY30... 为了研究CiWRKY30转录因子在植物应对多种胁迫中发挥重要的作用,及对植物形态发育方面的影响。本研究以生长于内蒙古干旱高原地带且具有较高的抗寒抗旱特性的中间锦鸡儿为材料,从本实验室干旱转录数据库中获得胁迫响应转录因子CiWRKY30核苷酸序列,NCBI比对为全长序列,设计引物对该基因进行互补脱氧核糖核酸(complementary DNA,cDNA)克隆,测序结果显示CiWRKY30的开放阅读框(open reading frame,ORF)长1083 bp,编码361个氨基酸。然后通过生物信息学的比对分析方法,来对CiWRKY30和其它7种WRKY转录因子的分子量、等电点等一级结构,及其它二三级结构加以预测。结果推测这8种同源性较高蛋白很可能在细胞核中发挥作用,由此得到有效信息来对接下来的功能研究起到推动作用。另外,通过对CiWRKY30转录因子氨基酸序列进行生物信息学分析,预测CiWRKY30转录因子的结构,推断其可能的功能,以及对其他同源性较高植物WRKY转录因子结构功能的预测都有助于我们对CiWRKY30转录因子的研究加以深入了解。 展开更多
关键词 中间锦鸡儿(caragana intermedia) WRKY30 CiWRKY30转录因子 生物信息学
原文传递
Carbon-water coupling and its relationship with environmental and biological factors in a planted Caragana liouana shrub community in desert steppe,northwest China 被引量:1
4
作者 Ling-Tong Du Long-Long Ma +5 位作者 Hai-Zhu Pan Cheng-Long Qiao Chen Meng Hong-Yue Wu Jing Tian Hong-Yi Yuan 《Journal of Plant Ecology》 SCIE CSCD 2022年第5期947-960,共14页
The carbon and water cycle,an important biophysical process of terrestrial ecosystems,is changed by anthropogenic revegetation in arid and semiarid areas.However,there is still a lack of understanding of the mechanism... The carbon and water cycle,an important biophysical process of terrestrial ecosystems,is changed by anthropogenic revegetation in arid and semiarid areas.However,there is still a lack of understanding of the mechanisms of carbon and water coupling in intrinsic ecosystems in the context of human activities.Based on the CO,and H,O flux measurements of the desert steppe with the planted shrub Caragana liouana,this study explored the carbon and water flux coupling of the ecosystem by analyzing the variations in gross primary productivity(GPP),evapotranspiration(ET)and water use efficiency(WUE)and discussing the driving mechanisms of biological factors.The seasonal variation in climate factors induced a periodic variation pattern of biophysical traits and carbon and water fluxes.The GPP and ET fluctuated in seasons,but the WUE was relatively stable in the growing season.The GP,ET and WUE were significantly driven by global radiation(R,),temperature(T,and T),water vapor pressure deficit,leaf area index and plant water stress index(PWSI).However,R,temperature and PWSI were the most important factors regulating WUE.R,and temperature directly affected WUE with a positive effect but indirectly inhibited WUE by rising PWSl.Plant water stress inhibited photosynthesis and transpiration of the planted shrub community in the desert steppe.When the plant water stress exceeded a threshold(PWSI>0.54),the WUE would decrease since the GPP responded more quickly to the plant water stress than ET.Our findings suggest that policies related to large-scale carbon sequestration initiatives under afforestation must first fully consider the status of water consumption and WUE. 展开更多
关键词 eddy covariance evapotranspiration(ET) gross primary production(GPP) water use eficiency(WUE) desert steppe caragana liouana
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部