目的:采用网络药理学和分子对接技术预测竹沥-生姜配伍治疗中风病的作用靶点,探讨其治疗中风病的潜在分子作用机制和有效物质。方法:利用PubChem、SwissTargetPrediction和UniProt数据库挖掘竹沥-生姜药对的潜在活性成分及药物靶点,通过...目的:采用网络药理学和分子对接技术预测竹沥-生姜配伍治疗中风病的作用靶点,探讨其治疗中风病的潜在分子作用机制和有效物质。方法:利用PubChem、SwissTargetPrediction和UniProt数据库挖掘竹沥-生姜药对的潜在活性成分及药物靶点,通过GeneCards数据库筛选疾病靶点。将药物靶点与疾病靶点匹配所得交集靶点导入STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。借助Cytoscape软件筛选关键靶点,将关键靶点与对应成分联系起来绘制网络图,筛选关键成分;对关键靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过AutoDock软件对关键活性成分与潜在作用靶点进行分子对接验证。结果:筛选得到药组活性成分41个,相关靶点291个,中风病相关靶基因729个,以及竹沥-生姜药对治疗中风病的交集靶点67个。这些交集靶点主要参与细胞炎症反应、细胞活化、细胞免疫反应等过程,并与癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation EndProduct,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Receptor for Advanced Glycation End Products,RAGE)信号通路等相关。分子对接结果显示,竹沥、生姜的主要活性成分与中风病的潜在作用靶点间具有一定的结合活性。结论:竹沥-生姜可通过多成分、多靶点、多通路发挥对中风病的治疗作用。本研究为后续药理机制探索提供方向,为该药对临床应用提供了理论依据。展开更多
目的:运用图数据库Neo4j Community 3.5.25初步构建中医医案中风病知识图谱,探索名老中医中风病知识图谱构建与应用的标准化流程。方法:以《中国百年百名中医临床家丛书》《中国现代名中医医案精粹》中治疗中风病的医案资料为基础,采用...目的:运用图数据库Neo4j Community 3.5.25初步构建中医医案中风病知识图谱,探索名老中医中风病知识图谱构建与应用的标准化流程。方法:以《中国百年百名中医临床家丛书》《中国现代名中医医案精粹》中治疗中风病的医案资料为基础,采用实体链指、关系抽取、知识表示及融合、知识存储及构建技术,借鉴SNOMED、UMLS和TCMLS的语义关系科学,人工整理构建素材并将构建素材以表格形式存储于WPS office。利用SQL Server 2019对数据进行预处理,在Neo4j Browser中运用Cypher语言以关联知识图谱的形式将“证-症”“证-法”“证-方-药”“症-方-药”“症-证-法”的关系予以展示;在图数据库Neo4j中构建中风病关系的语义网络支持系统。结果:共收集到中风病医案资料217份,初步构建中风病知识图谱,其中包含实体1853个和关联5781个。得到“证-症”“证-法”“证-方-药”“症-方-药”“症-证-法”中风病分类知识图谱。结论:本研究清晰地展示了“症-证-法-方-药”之间复杂的网络关系,展现了辨病与辨证相结合的思路并为在线诊治提供方法,还为发现中风病知识图谱与复杂网络的共性及探索运用它们的普遍方法奠定了基础。展开更多
文摘目的:采用网络药理学和分子对接技术预测竹沥-生姜配伍治疗中风病的作用靶点,探讨其治疗中风病的潜在分子作用机制和有效物质。方法:利用PubChem、SwissTargetPrediction和UniProt数据库挖掘竹沥-生姜药对的潜在活性成分及药物靶点,通过GeneCards数据库筛选疾病靶点。将药物靶点与疾病靶点匹配所得交集靶点导入STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。借助Cytoscape软件筛选关键靶点,将关键靶点与对应成分联系起来绘制网络图,筛选关键成分;对关键靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过AutoDock软件对关键活性成分与潜在作用靶点进行分子对接验证。结果:筛选得到药组活性成分41个,相关靶点291个,中风病相关靶基因729个,以及竹沥-生姜药对治疗中风病的交集靶点67个。这些交集靶点主要参与细胞炎症反应、细胞活化、细胞免疫反应等过程,并与癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation EndProduct,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(Receptor for Advanced Glycation End Products,RAGE)信号通路等相关。分子对接结果显示,竹沥、生姜的主要活性成分与中风病的潜在作用靶点间具有一定的结合活性。结论:竹沥-生姜可通过多成分、多靶点、多通路发挥对中风病的治疗作用。本研究为后续药理机制探索提供方向,为该药对临床应用提供了理论依据。
文摘目的:运用图数据库Neo4j Community 3.5.25初步构建中医医案中风病知识图谱,探索名老中医中风病知识图谱构建与应用的标准化流程。方法:以《中国百年百名中医临床家丛书》《中国现代名中医医案精粹》中治疗中风病的医案资料为基础,采用实体链指、关系抽取、知识表示及融合、知识存储及构建技术,借鉴SNOMED、UMLS和TCMLS的语义关系科学,人工整理构建素材并将构建素材以表格形式存储于WPS office。利用SQL Server 2019对数据进行预处理,在Neo4j Browser中运用Cypher语言以关联知识图谱的形式将“证-症”“证-法”“证-方-药”“症-方-药”“症-证-法”的关系予以展示;在图数据库Neo4j中构建中风病关系的语义网络支持系统。结果:共收集到中风病医案资料217份,初步构建中风病知识图谱,其中包含实体1853个和关联5781个。得到“证-症”“证-法”“证-方-药”“症-方-药”“症-证-法”中风病分类知识图谱。结论:本研究清晰地展示了“症-证-法-方-药”之间复杂的网络关系,展现了辨病与辨证相结合的思路并为在线诊治提供方法,还为发现中风病知识图谱与复杂网络的共性及探索运用它们的普遍方法奠定了基础。