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题名大豆GmGW2基因的生物信息学分析
被引量:2
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作者
吕金东
刘灿
屈亦潇
陈汉谋
杨翊晖
丁晨
郭蓓
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机构
北京农学院植物科学技术学院
北京农学院生物科学与工程学院
中华人民共和国农业农村部华北都市农业重点实验室
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出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期379-384,共6页
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文摘
GW2基因在多种植物中发挥调控籽粒性状的功能,为预测分析大豆中GW2基因的功能,前期通过同源克隆的方法从大豆中成功克隆出GmGW2基因的cDNA序列。为了继续开展深入研究,本试验从大豆中黄10号中克隆出GmGW2基因的全长DNA序列并进行了较为详细的生物信息学分析。结果表明:GmGW2全长8 467 bp,包含8个外显子和7个内含子,编码431个氨基酸。预测是一个不稳定亲水蛋白,定位于细胞核或细胞质中,不含跨膜结构域及信号肽,具有Zinc finger和RING-type结构域。二级、三级结构预测分析显示,α-螺旋及不规则卷曲是其整体蛋白质结构中的主要组成结构元件。利用该基因的DNA序列,构建进化树分析得出该基因与木豆、相思子、鹰嘴豆亲缘关系较近。根据以上分析结果推测GmGW2基因可能也具有调控大豆籽粒发育的功能。此研究旨在为进一步挖掘和验证GmGW2基因功能奠定基础,为大豆产量育种工作提供有益信息。
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关键词
大豆
中黄10号
GmGW2
生物信息学分析
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Keywords
Soybean
Zhonghuang 10
GmGW2
Bioinformatics analysis
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分类号
S565.1
[农业科学—作物学]
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