广州地区HCMV低传代临床病毒株UL143基因的多态性研究(英文)

目的研究广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代分离株UL143基因的多态性。方法对3株经多重PCR鉴定的HCMV临床低传代分离株进行HCMVUL143基因全序列扩增,扩增产物克隆到pMD18-T载体上测序,并将其序列与GenBank中公布的其它临床分离株UL143基因一起进行分析。结果D3株UL143基因因碱基缺失形成多处终止密码无法产生有功能的蛋白;Toledo株UL143基因开放读码框由279个核苷酸组成,编码蛋白由92个氨基酸残基组成;其它临床分离株UL143基因开放读码框均由252个核苷酸组成,DNA序列比较保守,变异均为碱基替换,编码蛋白由83个氨基酸残基组成,氨基酸序列也很保守,不同临床分离株氨基酸变异率为1.2%～2.4%;HCMVUL143蛋白翻译后修饰位点在除Toledo株之外的所有分离株中均高度保守,没有缺失或新增;不同临床分离株UL143蛋白二级结构有所不同;除Toledo株外,其余分离株UL143蛋白的等电点均为8.75。结论临床低传代分离株HCMVUL143基因DNA及其编码产物的氨基酸序列极为保守,但仍存在一定多态性。

广州地区HCMV临床病毒株UL144 ORF的序列变异研究

目的研究广州地区先天性感染的人巨细胞病毒（HCMV）临床低传代分离病毒株UL144基因序列的多态性，探讨UL144基因在HCMV致病中的作用。方法对3株经多重PCR鉴定HCMVDNA为阳性的临床低传代分离株进行HCMVuL144基因全序列PCR扩增，PCR产物克隆到pMD18-T载体上再测序，将其序列与GenBank中公布的其它10株临床分离株uL144基因一起进行分析。结果本实验克隆并测序了HCMV临床低传代D3、D2和D52病毒株的UL144基因，提交GenBank，已被GenBank收录，序列号分别为DO180368、DQ180382和DQ180355。HCMV临床低传代D3、D2和D52病毒株的UL144基因均全长531bp。通过blast分析，从GenBank中找到了10株HCMV病毒株的UL144与D3、D2和D52的UL144基因具有较高的同源性，经过序列的比对，发现UL144基因DNA序列比较保守，只在4处有变异，且变异均为碱基替换，无插入或缺失，编码蛋白由176个氨基酸残基组成，氨基酸序列也比较保守，各分离株中变异率为1．1％；HCMVUL144编码蛋白翻译后修饰位点在所有分离株中均高度保守：所有分离株UL144蛋白的等电点均为8．97。结论广州地区临床低传代分离株HCMVUL144基因DNA及其编码产物的氨基酸序列是比较保守的，但仍存在一定的多态性。提示UL144基因在先天性感染中可能具有重要作用。