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标志物研究中常用蛋白组学质谱方法的定量准确性评估
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作者 张磊 申华莉 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第11期191-199,共9页
在疾病发生过程中,蛋白质的表达水平、修饰状态或相互作用模式的变化有可能反映病理状态或疾病进展,因此蛋白质常被用作疾病标志物.基于质谱的蛋白质组学发现了大量的潜在疾病标志物,这些标志物及其质谱检测方法能否进一步推广至临床检... 在疾病发生过程中,蛋白质的表达水平、修饰状态或相互作用模式的变化有可能反映病理状态或疾病进展,因此蛋白质常被用作疾病标志物.基于质谱的蛋白质组学发现了大量的潜在疾病标志物,这些标志物及其质谱检测方法能否进一步推广至临床检测,定量准确性和稳定性是关键.本文合成了32条标准肽段,对数据非依赖性采集(DIA)、多反应监测(MRM)及平行反应监测(PRM) 3种有潜力在临床质谱方面大规模应用的定量方法进行了比较和评估.将肽段稀释成4个不同的浓度来模拟不同丰度的实际样本,用以上3种质谱方法采集数据后,比较了肽段发现率、标准曲线线性、日间和日内精密度及保留时间(RT)漂移等情况,总结了3种定量方法各自的优缺点和潜在应用方向.结果表明,MRM定量方法最适合临床应用,在于其优异的日间日内稳定性、灵敏度和定量精度;PRM适合科研方向靶向定量,因其拥有最高灵敏度和较高稳定性定量精度;而DIA由于高通量而依赖于软件和算法解析,定量数目多的同时,对于特定肽段定量准确性比PRM/MRM差. 展开更多
关键词 临床质谱 蛋白质组学 平行反应监测 多反应监测 数据非依赖性采集
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蛋白质质谱检测技术在临床中的应用 被引量:4
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作者 刘晓慧 申华莉 +3 位作者 张莹 陆豪杰 刘宝红 杨芃原 《中国医学装备》 2019年第7期1-6,共6页
质谱技术前期在大分子离子化技术与仪器技术以及蛋白质质谱(组)定性定量方法学的进展,为临床蛋白质质谱的应用奠定了技术基础。由于蛋白质是生命的执行体,蛋白的表达与否和表达量与人们的健康情况及疾病状态紧密的相连,人类蛋白质组计... 质谱技术前期在大分子离子化技术与仪器技术以及蛋白质质谱(组)定性定量方法学的进展,为临床蛋白质质谱的应用奠定了技术基础。由于蛋白质是生命的执行体,蛋白的表达与否和表达量与人们的健康情况及疾病状态紧密的相连,人类蛋白质组计划的实施推动了医学界对临床蛋白质检测和临床蛋白质组的关注和应用,以蛋白质组学驱动的精准医学很快将和以基因组学驱动的精准医学并驾齐驱。通过重点介绍蛋白质质谱定性和定量技术的进展,总结如何通过临床质谱和临床蛋白质组方法,尤其是采用三重四级杆质谱和同位素标记参比的多重反应监测质谱方法,寻找重要疾病的临床标志物群的技术路线和方案。 展开更多
关键词 临床质谱 蛋白质 多肽 标志物 三重四级杆 多反应监测
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临床医学质谱检验技术质量管理研究 被引量:2
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作者 李明珠 张雪珂 《现代仪器与医疗》 CAS 2022年第1期25-28,共4页
液相色谱串联质谱技术具有较高的选择性和准确性,目前广泛应用于临床检验医学.质谱技术复杂性会产生潜在的质量风险,结构化、系统化的质量管理对于临床检验高标准的准确度和可靠性至关重要.通过对临床质谱检验技术的自建检测项目、溯源... 液相色谱串联质谱技术具有较高的选择性和准确性,目前广泛应用于临床检验医学.质谱技术复杂性会产生潜在的质量风险,结构化、系统化的质量管理对于临床检验高标准的准确度和可靠性至关重要.通过对临床质谱检验技术的自建检测项目、溯源性以及实验室的质量管理研究,分析质量管理现状和发展方向,探讨临床质谱应用面对的挑战,推动国内临床质谱质量管理的发展. 展开更多
关键词 临床质谱 检验 质量管理
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标准物质在临床质谱技术中的应用 被引量:1
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作者 沈凌晓 马金飞 +2 位作者 杨青青 刘鹏云 刘华芬 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期437-441,共5页
标准物质是实现检验结果准确可比的主要技术手段之一,而质谱技术作为一种临床检验新技术,在使用标准物质时同样需要区分标准物质的不同作用,合理选择并应用于测量方法确认、校准及质量控制等方面,从而保证检验结果的准确性和可比性。本... 标准物质是实现检验结果准确可比的主要技术手段之一,而质谱技术作为一种临床检验新技术,在使用标准物质时同样需要区分标准物质的不同作用,合理选择并应用于测量方法确认、校准及质量控制等方面,从而保证检验结果的准确性和可比性。本文从标准物质在临床质谱中存在的问题出发,对于标准物质在测量方法确认、校准物及质量控制等方面的使用注意事项进行了介绍和总结。 展开更多
关键词 标准物质 临床质谱技术 应用
原文传递
Clin-TOF-ⅡMS联合配套预处理试剂盒快速鉴定血培养阳性病原菌的研究 被引量:1
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作者 姚冰洁 肖晓光 +1 位作者 傅容 郭伟 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第20期2454-2457,共4页
目的使用临床基质辅助激光解析电离飞行时间质谱系统(Clin-TOF-ⅡMS)联合配套预处理试剂盒直接检测血培养阳性报警瓶中的病原菌并评估该方法的鉴定符合率。方法收集大连医科大学附属第一医院2019年1—5月的血培养阳性报警标本254例,在... 目的使用临床基质辅助激光解析电离飞行时间质谱系统(Clin-TOF-ⅡMS)联合配套预处理试剂盒直接检测血培养阳性报警瓶中的病原菌并评估该方法的鉴定符合率。方法收集大连医科大学附属第一医院2019年1—5月的血培养阳性报警标本254例,在转种培养的同时,抽取报警瓶中的液体并使用血培养预处理试剂盒富集、纯化报警瓶中的菌体,采用Clin-TOF-ⅡMS对待测病原菌进行直接鉴定,并将直接鉴定结果与转种培养后的菌落鉴定结果进行比较。结果254例血培养阳性报警瓶中,237例为单一菌感染标本,17例为混合菌感染标本。与菌落鉴定结果相比,单一菌感染标本中Clin-TOF-ⅡMS直接检测鉴定的符合率为86.5%(205/237),其中革兰阳性菌的符合率为81.0%(94/116),革兰阴性菌的符合率为93.9%(108/115);17例混合菌感染标本鉴定的符合率为17.6%(3/17),有3例未鉴定出结果,其余11例混合菌感染均鉴定出其中一种细菌。结论Clin-TOF-ⅡMS联合配套预处理试剂盒直接检测血培养阳性报警瓶中病原菌,可缩短病原菌的鉴定时间,且与传统菌落鉴定方法比有较高的鉴定符合率,适合在临床微生物实验室推广应用。 展开更多
关键词 临床基质辅助激光解析电离飞行时间质谱系统 血培养 直接鉴定
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Discovery of Metastasis-Associated Biomarkers in Ovarian Cancer Using SELDI-TOF: An in Vitro and Clinical Study 被引量:6
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作者 Zhiguo Zheng Yun Gao +4 位作者 Linhui Gu Hanzhou Mou Chihong Zhu Jianqing Zhu Shenhua Xu 《Clinical oncology and cancer researeh》 CAS CSCD 2009年第5期317-321,共5页
OBJECTIVE To identify metastasis-related biomarkers in humanovarian cancer cell lines and in serum.METHODS We isolated total protein from cell lysis solutionsand cultured supernatants from 2 human ovarian cancer cell ... OBJECTIVE To identify metastasis-related biomarkers in humanovarian cancer cell lines and in serum.METHODS We isolated total protein from cell lysis solutionsand cultured supernatants from 2 human ovarian cancer cell linesand used SELDI-TOF-MS to detect the differential expressionof the proteins in the 2 cell lines.The proteomic spectra weregenerated using weak cation exchange chips.The biomarkerswere validated by analyzing serum proteins or peptides in ovariancancer patients,relapsed ovarian cancer patients,patients withbenign ovarian tumors,and healthy people.RESULTS Four proteins in the culture supernatant fromHO-8910PM cells were up-regulated,relative to the culturesupernatant of HO-8910 cells.One protein (3,144 Da m/z value)was up-regulated in both the cell lysis solution and in the culturesupernatant of HO-8910PM cells.In addition,expression of the3,144 Da m/z protein differed significantly between serum fromthe 26 ovarian cancer patients,from the 22 relapsed ovarianpatients and from the 37 healthy women (P<0.01).However,therewas no difference between patients with benign ovarian tumorsand healthy people (P>0.5).CONCLUSION Ovarian cancer cell lines with high or lowmetastatic potential have distinct protein profiles.Protein 3,144Da m/z could be a useful biomarker for diagnosing ovarian cancermetastasis. 展开更多
关键词 ovarian cancer METASTASIS SELDI-TOF.
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