目的:基于网络药理学探讨丹参-红花药对治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索丹参-红花的化学成...目的:基于网络药理学探讨丹参-红花药对治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索丹参-红花的化学成分及其相关靶点;利用GeneCards、PharmGKB、OMIM以及Drugbank等数据库检索脑缺血再灌注损伤的相关靶点。通过Venny 2.1.0映射得到丹参-红花治疗脑缺血再灌注损伤的交集靶点;使用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图。通过Metascape数据库来进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛出丹参-红花活性成分66个,有效靶点234个,药物疾病交集靶点128个;蛋白质-蛋白质相互作用网络图发现丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、前列腺素氧化环化酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase2,PTGS2)、FOS原癌基因(Fos Proto-Oncogene,AP-1 Transcription Factor Subunit,FOS)、JUN原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)等可能是关键靶点;GO功能富集分析涉及869个条目,其中有687个生物过程,70个细胞组分,112个分子功能;KEGG通路富集分析涉及107条相关信号通路。结论:本研究为丹参-红花的药效物质基础的进一步研究提供了理论基础,同时为其应用于抗脑缺血再灌注损伤提供了参考依据。展开更多
文摘目的:基于网络药理学探讨丹参-红花药对治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索丹参-红花的化学成分及其相关靶点;利用GeneCards、PharmGKB、OMIM以及Drugbank等数据库检索脑缺血再灌注损伤的相关靶点。通过Venny 2.1.0映射得到丹参-红花治疗脑缺血再灌注损伤的交集靶点;使用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图。通过Metascape数据库来进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛出丹参-红花活性成分66个,有效靶点234个,药物疾病交集靶点128个;蛋白质-蛋白质相互作用网络图发现丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、前列腺素氧化环化酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase2,PTGS2)、FOS原癌基因(Fos Proto-Oncogene,AP-1 Transcription Factor Subunit,FOS)、JUN原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)等可能是关键靶点;GO功能富集分析涉及869个条目,其中有687个生物过程,70个细胞组分,112个分子功能;KEGG通路富集分析涉及107条相关信号通路。结论:本研究为丹参-红花的药效物质基础的进一步研究提供了理论基础,同时为其应用于抗脑缺血再灌注损伤提供了参考依据。