甘西鼠尾草中丹参二醇B抑制血管新生活性研究

目的研究丹参二醇B的抑制血管新生活性。方法采用硅胶柱色谱和Sephadex LH-20柱色谱等分离手段从甘西鼠尾草丙酮提取物中分离得到丹参二醇B,并通过人脐静脉内皮细胞的生长、迁移及其促血管生长因子的测定实验来评价丹参二醇B的体外抑制血管新生作用,以鸡胚尿囊膜为体内模型对丹参二醇B抑制血管新生活性进行研究。结果丹参二醇B对人脐静脉内皮细胞的生长、迁移及其促血管生长因子的分泌、鸡胚尿囊膜血管生成都呈现出剂量依赖型的抑制作用。结论丹参二醇B具有抑制血管新生活性,可作为潜在的血管新生抑制剂得以开发和应用。

结合Bulk RNA和Single-cell RNA测序探索年龄相关性黄斑变性能量代谢关键基因及调控中药化合物预测

目的探寻年龄相关性黄斑变性(age-related macular degeneration,AMD)能量代谢的关键基因和潜在调控的中药化合物。方法从GEO数据库获取AMD相关Bulk RNA测序数据集GSE135092,利用R语言筛选差异表达基因,并与GSEA数据库下载的能量代谢相关基因(energy metabolism-related genes,EMRGs)映射取交集,获取AMD差异表达EMRGs,通过Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)、转录因子(transcription factor,TF)、微小RNA(microRNA,miRNA)网络。使用LASSO回归在差异表达EMRGs中筛选AMD标志物,构建风险评分。同时,将AMD相关Single-cell RNA测序数据集GSE188280进行主成分分析(principal component analysis,PCA)及统一流形逼近与投影(uniform manifold approximation and projection,UMAP)分析以聚类降维,并进行细胞类型注释,进一步评估AMD关键差异表达EMRGs在不同细胞类型间的表达水平。将关键差异表达EMRGs导入Coremine Medical数据库中进行相关中药活性成分预测及分子对接、分子动力学验证。结果筛选出6个AMD关键差异表达EMRGs:FOXO3、GSK3B、MEF2A、NCOA1、HDAC1、PPARG,并构建相应PPI、TF-mRNA、mRNA-miRNA网络。LASSO回归得出NCOA1、MEF2A、FOXO3、GSK3B表达与AMD发生呈正相关,HDAC1表达与AMD发生呈负相关。分析AMD相关Single-cell RNA测序将32714个细胞分类为19个簇,使用marker基因将细胞簇鉴定为9种细胞类型,进一步得到HDAC1、MEF2A、FOXO3及NCOA1在内皮细胞中高表达。根据关键基因HDAC1、MEF2A、FOXO3筛选到9味中药及其285种活性成分,经分子对接及分子动力学模拟,其中丹参醇B治疗AMD潜力最大。结论HDAC1和丹参醇B为AMD能量代谢的潜在关键基因及作用化合物。