猪乳头数性状遗传育种的研究进展

在猪生产中,需要保证母猪足够的猪乳头数以满足仔猪营养需要。乳头数是一个受微效多基因控制的具有品种特性的数量性状,影响仔猪的断奶成活率、断奶窝重及窝均匀度,解析其遗传机制对于选育优良种猪具有重要意义。近年来有许多研究一直关注于猪乳头数性状的改良,相关的分子标记和候选基因被相继报道。本文主要对猪乳头数与数量性状之间的联系、影响乳头数的因素以及QTL定位和GWAS鉴别候选基因等方面的研究进展进行综述,为后续乳头数的选育提供理论基础。

基于全基因组填充重测序关联分析鉴别影响苏山猪初生体尺与乳头数性状的遗传位点

旨在鉴别影响苏山猪初生体尺和乳头数性状的遗传位点,开发可用于辅助育种的分子标记,为苏山猪生长和繁殖性能的持续选育提供理论基础。本试验对269头苏山猪初生仔猪(出生后24 h内)的体尺和乳头数表型进行测定,并采集耳组织样品。基于全基因组重测序及基因型填充策略,利用全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)和群体分化指数(fixation index,Fst)的方法挖掘与目的性状强关联位点,并对位置功能候选基因开展GO和KEGG分析,确定最有可能的主效基因。本研究共鉴别到4个候选位点,分布在13、14和X染色体上,其中与初生体尺性状显著关联的位点有2个,与乳头数性状显著关联的位点有2个。本研究筛选出1个与体长性状相关的候选基因ACTA2;1个与胸围性状相关的候选基因COL4A6;3个与乳头数性状相关的候选基因ACTA2、CRTAP和SEPTIN6,为苏山猪初生体尺性状和乳头数性状的遗传改良提供了重要的分子标记。

基因组分析对猪乳头数相关数量性状基因座鉴定

【目的】分析乳头数的变异,挖掘与乳头数相关的数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL)和候选基因,为猪乳头数的选育研究提供重要分子标记。【方法】准确测定了709头苏淮猪(335头育肥猪和374头种猪)的左、右和总乳头数。对苏淮育肥猪进行80K芯片分型,并使用芯片数据计算左、右、总乳头数的遗传力和基因组估计育种值(genomic estimated breeding value,GEBV)。基于乳头数GEBV和表型排名,选择前10%的个体以及后10%的个体进行群体分化指数分析(fixation Index,FST)检测高度分化的位点。接着,通过全基因组关联分析(genome wide association analysis,GWAS)鉴定与乳头数关联的位点,选择高度分化且与乳头数显著关联的位点作为候选位点,选择位于候选位点附近且功能注释后与乳头数相关的基因作为候选基因。最后,选择每个染色体上最显著的候选位点对709头苏淮猪进行乳头数关联分析,以验证上述位点的显著性。【结果】苏淮育肥猪左、右、总乳头数的变异系数分别为10.20%、9.26%、8.50%,遗传力分别为0.212、0.257、0.312。基于FST和GWAS分析,总共在7、13、16、18号染色体(Sus Scrofa Chromosome,SSC)上鉴定到20个乳头数的候选位点,这些候选位点可解释5.49%—8.03%的表型方差。其中,SSC7上与总乳头数关联的位点rs80894106与文献中报道的影响大白和杜洛克猪总乳头数的候选位点一致,但左乳头的候选位点rs81444134(26.51 Mb,SSC13)和rs81233299(8.13 Mb,SSC18)均为新发现的与乳头数相关的位点。左、右、总乳头的候选位点主要集中在SSC16上的6.36—10.66 Mb区间;连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析发现,区间内7.47—8.27 Mb的候选位点拟合成了一个795 kb的单倍型块,且该单倍型块是新发现的影响乳头数的候选区域;单倍型块内的rs337606862(7.47 Mb)与右乳头和总乳头最显著关联,单倍型块内的3个位点均位于cadherin 18(CDH18)基因的内含子上,CDH18编码Ⅱ型钙黏附素,且钙黏附素与发育中组织细胞的识别、分选、增殖、凋亡以及乳腺癌的发生有关。因此,CDH18可能是新的影响猪乳头数的候选基因。再者,本研究对4个染色体上最显著的位点:rs81444134、rs80894106、rs337606862、rs81233299在709头苏淮猪中基因分型,经关联分析后发现,这些位点均与乳头数显著相关,可以作为潜在分子标记用于乳头数的选育。【结论】本研究通过基因组分析在苏淮猪群体中鉴定到20个与乳头数显著相关的位点。其中SSC13上的26.51 Mb和SSC18上的8.13 Mb是新的乳头数的候选QTLs,SSC16上的7.47—8.27 Mb也是新发现的乳头数的候选QTL,且区间内CDH18可能是新的影响猪乳头形成的候选基因。

猪雌激素受体基因与产仔数和乳头数的关系研究

用PCR RFLPs法检测了 90头姜曲海、梅山、二花脸母猪雌激素受体基因 (ESR)的多态性 ,分析了该基因与产仔数和乳头数的关系。结果表明 ,ESR基因型间总产仔数 (TNB)和产活仔数 (NBA)差异极显著 (P <0 0 1)。BB基因型母猪头胎产仔数和产活仔数分别比AA基因型多 3 0 3和 3 0 1头 ;经产胎次比AA基因型多 1 80和 1 82头。ESR基因型间乳头数差异不显著 (P >0 0 5 )。

母猪FSHβ基因多态与乳头数的关系研究

用PCR SSCP法对 152头姜曲海母猪的FSHβ基因进行了分型 ,分析了NN、Nn和nn 3种不同基因型母猪的乳头数差异。结果表明 ,NN、Nn和nn基因型母猪的左乳头数分别为 8 733± 0 743 ,9 182± 0 72 4和 9 2 0 0± 0 756 ,右乳头数分别为 9 0 33± 0 850 ,9 2 0 0± 0 931和 9 30 0± 0 971,总乳头数分别为 17 766± 1 0 82 ,18 382± 1 0 98和 18 50 0± 1 177,Nn基因型母猪中左右乳头数不对称个体比例明显高于另外 2种基因型的比例。另外 ,对于以上 3性状 ,n基因的加性替代效应值分别为 0 2 4 8(P <0 0 5) ,0 183 (P <0 0 1)和 0 4 16 (P <0 0 5) ,左乳头数和总乳头数的显性效应值分别为 0 2 16(P <0 0 1)和 0 2 4 8(P <0 0 1)。结果说明FSHβ基因对乳头数的影响符合加性

猪窝产活仔数与初生窝重、断奶窝重及母猪乳头数的相关分析

测定河南省黄泛区鑫欣牧业有限公司种猪场健康、繁殖正常的92头大约克夏母猪的窝产活仔猪数、母猪有效乳头数、初生窝重、断奶窝重，按照窝产活仔猪数分组进行方差分析和性状间的相关回归分析。结果表明：窝产活仔猪数、初生窝重、断奶窝重组间差异均呈极显著（P〈0．01），初生窝重在窝产活仔猪数为10头和11头、9头之间差异均不显著，其余各组之间差异显著或极显著。断奶窝重在窝产活仔猪数为9、10、11、12、13头之间差异均不显著。对窝产活仔猪数、母猪有效乳头数、初生窝重、断奶窝重进行相关分析，母猪有效乳头数和其余各指标相关不显著（P〉0．05），其余各指标相关均达到极显著（P〈0．01）。经分析得出窝产活仔猪数在10—12头之间可取得最佳经济效益。

ESR和FSHβ基因与母猪乳头数的关系研究

用PCR-RFLP和PCR方法对144头大约克母猪的ESR和FSHβ基因进行分型,分析了ESR和FSHβ不同基因型和合并基因型大约克母猪的乳头数差异。结果表明:ESR和FSHβ基因对大约克母猪乳头数均有显著影响。无论ESR基因还是FSHβ基因,BB基因型均为乳头数最多的基因型,而BBBB是乳头数最多的合并基因型。从基因型效应来看,ESR和FSHβ基因型为BB的母猪平均乳头数分别为14.45和14.37,而合并基因型BBBB的母猪平均乳头数为14.73,说明合并基因型的遗传效应大于单个基因型的效应,但不是各个基因型效应的简单加和。

可乐猪乳头数性状全基因组关联分析

乳头数性状是猪最重要的繁殖性状之一,与养猪业的经济效益密切相关。本试验以Illunima Porcine SNP60K芯片对22头可乐猪进行基因分型,通过Plink 1.07软件,基于混合线性模型对左乳头数、右乳头数和总乳头数性状进行全基因组关联分析。经过严格的质量控制和多重检验之后,共鉴定出全基因组水平潜在关联的SNPs位点4个(P<2.06E-5);染色体水平显著关联位点3个,潜在关联位点18个;在关联SNP位点可能连锁的上、下游1cM区间内检索到304个基因,其中Wnt及Fgf信号通路中的候选基因BTRC、FGF5、FGF8和BMP3、RASGEF1B、HMGB3可能影响猪的乳头数性状或繁殖性状。通过全基因组关联分析策略发掘出的关联SNP位点及潜在候选基因,将为可乐猪的选育保种奠定基础。

猪乳头数的参数估计及翻乳头遗传方式的判定

太原花猪总乳头数和先天有效乳头数分别为１４．７２和１３．３４个。山西黑猪分别为１４．３３和１３．６３个。乳头数具有显著的母体效应及性别和品种差异，且品种和性别间存在显著互作。按阈性状估计遗传力可以消除某些系统误差。山西黑猪翻乳头的出现范围大致是０～６个，多出现在２～５对乳头。翻乳头呈常染色体隐性遗传，其隐性基因频率为０．４５，外显率为８．４１％。由于其不完全外显，可能呈主基因遗传。

枫泾猪保种群乳头数性状的遗传研究

为研究枫泾猪保种群乳头数性状的遗传规律,统计分析了镇江牧苑动物科技开发有限公司种猪场23头种公猪、103头母猪、3612头仔猪的乳头数资料。结果显示,保种群种公猪、母猪及其后代的总乳头数(个)平均分别为17.14、16.86、16.65,种公猪、母猪间差异不显著(P>0.05),种公猪、母猪与后代间差异均极显著(P<0.01);平均乳头数右侧比左侧分别多0.50、0.25、0.25,左右两侧间差异均极显著(P<0.01)。总乳头数性状的表型相关系数父子间、母子间、父母双亲均值与子间分别是0.2723、0.2182、0.2528,均达极显著水平(P<0.01);用亲子回归法、公畜内母仔回归法、父系半同胞相关法估算的遗传力分别为0.2035、0.1059、0.9040,也均达极显著水平(P<0.01)。镇江牧苑动物科技开发公司种猪场枫泾猪保种群的乳头数性状在近10年内遗传稳定。

撒坝猪乳头数遗传力及其与繁殖性能关系的研究

本研究对 4个世代共 577头撒坝猪的乳头数进行了分析 ,并用HARVEY程序对乳头数的遗传力进行了估计 ,同时利用 1 2 8头有繁殖性能记录的母猪资料对乳头数与繁殖性状的关系进行了分析。结果表明 ,各世代的乳头数存在着显著差异 ,且逐代均有显著提高 ;乳头数的遗传力为 0 .331 ;乳头数与总产仔数和活产仔数间遗传相关和表型相关均为负值 ,与初生窝重、2 0日窝重、断奶仔数和断奶窝重间则存在着正的遗传相关和表型相关 ;乳头数与所有繁殖性状的环境相关都较弱 ( -0 .0 0 2～ 0 .0 94 )

利用Gibbs抽样方法估计丹系长白猪乳头数的遗传参数

建立了单性状动物模型通过 Gibbs抽样对丹系长白猪乳头数遗传参数进行贝叶斯 (Bayesian)估计 ,并与约束最大似然 (REML)估计进行比较。数据包括 9898个个体总乳头数及系谱记录。模型中性别为固定效应 ,个体遗传效应为随机效应。结果表明 ,丹系长白猪乳头数的遗传方差组分、环境方差组分及遗传力的后验均值估计分别为 1.0 4 6± 0 .0 0 9,0 .534± 0 .0 0 5,0 .6 6 1± 0 .0 0 4 ,相应的 REML 估计值为 1.0 36 ,0 .539,0 .6 58,两者之间差异不显著 (P>0 .0 5)。 Gibbs抽样时不同的先验值对后验均值估计有一定影响。

新嘉系猪乳头数遗传特性研究

前言 乳头数是猪的重要繁殖性状之一,高繁殖品系(种)的建立离不开高乳头数作为其生理基础。明确乳头数及其与其他繁殖性状的关系在猪育种和养猪生产中有重要的现实作用,为此,人们对乳头数的研究较为重视,尤其是在品系培育中。张文灿(1983年)曾对太湖猪各类群的乳头数作为统计,结果表明,太湖猪(枫泾、梅山、嘉兴黑)平均乳头数为16.4个(2015头统计),其遗传力为0.41;有效乳头数与产活仔数、断乳窝重的表型相关分别为0.22和—0.26;

猪部分内脏器官性状和乳头数的QTL检测(英文)

对内脏器官重量性状的QTL定位研究,所见报道不多;对于猪的繁殖性状,尚需做进一步的探讨。本研究在总共214头(180头F2个体)组成的资源家系中,在猪的SSC4、SSC6、SSC7、SSC8 和 SSC13上共选取39个微卫星标记,检测了8种内脏器官的重量性状:心重 (HW)、肺重 (LW)、肝+胆重 (LGW)、脾重 (SPW)、胃重 (STW)、小肠重(SIW)、大肠重(LIW) 和肾重(KW);其他一些胴体性状:胴体长性状1(自第一颈椎,CL1)、胴体长性状2(自第一胸椎,CL2)、肋骨数(RNS)和繁殖性状乳头数(TNS)的QTL定位。结果表明,检测到3个染色体极显著水平的QTL(P≤0.01),它们是HW QTL定位在SSC6上30 cM处,RNS QTL定位在SSC7上115 cM处和TNS QTL定位在SSC7上 110 cM处;另外6个染色体显著水平的QTL(P≤0.05)是:LW(SSC13上119 cM处)、LGW(SSC6上94 cM处)、SPW(SSC8上106 cM处)、SIW(SSC 4上0 cM处)、LIW(SSC 4上170 cM 处)和TNS(SSC 6上95 cM处)。上述QTL解释的表型变异从 0.04% 到 14.06%,有些位点的 QTL 可以解释表型变异的 10%以上,如 HW 的 QTL 解释表型变异的9.52%、SIW的QTL解释表型变异的13.47%、定位在SSC6上的TNS QTL解释表型变异的14.06%,而定位在 SSC7上的TNS QTL解释表型变异的11.30%。多数内脏器官重量性状的QTL定位结果未见报道。胴体长未见显著水平的QTL,而在SSC7上定位染色体极显著水平的肋骨数QTL。

中国瘦肉猪DV系乳头数遗传的初步研究

本文研究了继代选育中的DV系猪(零至三世代)乳头数的遗传。零至三世代猪的乳头数分别为14.36、14.13、14.19、14.05个,变异系数分别为6.20％、6.55％、6.45％,6.83％,随世代增加前者有下降趋势,后者有上升趋势;强度选择日增重,乳头数有下降趋势。乳头数在近交后代有衰退现象,在遗传上公母性别的差异很小。

乳头数对母兔繁殖力的影响

按照母兔乳头数为１０和８分为试验Ａ组和试验Ｂ组，每组１６只。测定哺乳前三（组）周，每组母兔的泌乳量、仔兔每天的平均吮乳量等。试验结果表明：哺乳前三周，母兔的泌乳量、仔兔每天平均吮乳量、仔兔日增重、断奶窝重及断奶成活率，试验Ａ组分别为３１３８．６２克、２１．９８克／天、只、１４．１８克／日、５２４９．６８克和９３．９７％，分别比Ｂ组高８．３０％、１２．４３％、７．３４％、４．２７％和１０．５５％。经ｔ检验和Ｘ２检验后发现，除断奶窝重在Ａ、Ｂ两组之间差异不显著外，其它各项指标在Ａ、Ｂ两组之间均差异显著（Ｐ＜０．０５）。由此可以得出结论：有较多乳头数的母兔能哺乳更多的仔兔。

雌激素受体基因和骨调素基因对苏钟猪初生重和乳头数量的影响

本文研究了雌激素受体基因和骨调素基因对苏钟猪生长繁殖性能的影响。41头母猪120多窝产仔数记录用来分析雌激素受体和骨调素基因型对仔猪初生重、母猪乳头个数和仔猪乳头个数的影响。在母猪乳头个数方面,骨调素142/152和168/170、142/168基因型之间差异显著(P<0.05);在经产胎次中,仔猪初生重140/152和168/170、164/168、142/168、142/152基因型之间差异显著(P<0.05)。母猪乳头个数雌激素受体AA型和AB型之间差异显著(P<0.05)。

皖南花猪乳头数的研究

皖南花猪总乳头数为14．36个，变异范围为12～18个，以7对、8对居多。乳头数的遗传力为0．1384，属低遗传力性状。乳头数与初生重、20d重、断奶重、4月龄重、体长、体高和胸围诸性状表型相关很小。一般认为，选择对提高乳头数的效果不明显；但对于皖南花猪选择是有效的，改变了乳头数在猪群中的分布。

猪乳头数性状的观察及其与产仔数关系的研究

对种猪24头、仔猪487头的乳头数性状的遗传规律及其与产仔数的关系进行了调查与分析,用SAS软件对数据进行处理。结果表明:猪的乳头数具有相对稳定的遗传性,接近于父母代的群体均值,且具有一定的集中性;乳头数目不同的父母代组合其后代的乳头数目趋向于父母代的群体均值;父系乳头数与窝平均产仔数呈正相关,母系乳头数与窝平均产仔数呈弱负相关;采用父系半同胞相关法估测猪乳头数性状的遗传力为0 26,属中等遗传力。