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牛病毒性腹泻病毒E2蛋白多表位疫苗筛选及生物信息学验证
被引量:
6
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作者
何金科
杨亚军
+5 位作者
邓肖玉
何延华
张超
马忠臣
王震
陈创夫
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期1690-1698,共9页
为了筛选牛病毒性腹泻病毒(BVDV)E2蛋白的多表位亚单位疫苗,本研究选用4种B细胞预测软件(immunomedicine group、ABCpred、BepiPred、SMVTriP)和2种T细胞预测软件(NetBoLApan、NetMHCIIpan)筛选出重叠肽作为优势表位,通过柔性linker连...
为了筛选牛病毒性腹泻病毒(BVDV)E2蛋白的多表位亚单位疫苗,本研究选用4种B细胞预测软件(immunomedicine group、ABCpred、BepiPred、SMVTriP)和2种T细胞预测软件(NetBoLApan、NetMHCIIpan)筛选出重叠肽作为优势表位,通过柔性linker连接成多表位疫苗,使用免疫信息学方法对抗原性、过敏源、理化性质、糖基化位点、二级和三级结构进行评估。通过二硫化物工程提高疫苗稳定性。使用分子对接评估疫苗构建体与免疫受体的结合能力,最后进行silico克隆。结果表明,成功构建17000相对分子质量的可溶性蛋白质,免疫信息学结果表明,疫苗构建体是非过敏性良好抗原,具有一个潜在的N-糖基化位点,在二级结构中α螺旋占约3.2%,β折叠占约43.2%,无规卷曲占约53.6%。三级结构Ramachandran作图发现优势区域中含有88.2%残基,进行细化后优势区域的残基增加到93.5%,3D模型表位作图也证明多表位疫苗具有良好的免疫原性,二硫化物工程确定出3对残留物可以形成二硫键,分子对接表明疫苗构建体与TLR3受体具有高亲和力,最后密码子优化和silico克隆确保设计的亚单位疫苗在大肠杆菌K12表达系统中更高表达。免疫信息学分析表明这种多表位疫苗可以有效表达并能够诱导强烈的T细胞和B细胞免疫应答。本研究为BVDV E2多表位疫苗的设计提供了一种新的方法。
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关键词
牛病毒性腹泻病毒
E2蛋白
B细胞表位
T细胞表位
分子对接
二硫化物工程
silico克隆
原文传递
题名
牛病毒性腹泻病毒E2蛋白多表位疫苗筛选及生物信息学验证
被引量:
6
1
作者
何金科
杨亚军
邓肖玉
何延华
张超
马忠臣
王震
陈创夫
机构
石河子大学生命科学学院
石河子大学动物科技学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期1690-1698,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目(U1803236)
兵团重大科技资助项目(2017AA003)。
文摘
为了筛选牛病毒性腹泻病毒(BVDV)E2蛋白的多表位亚单位疫苗,本研究选用4种B细胞预测软件(immunomedicine group、ABCpred、BepiPred、SMVTriP)和2种T细胞预测软件(NetBoLApan、NetMHCIIpan)筛选出重叠肽作为优势表位,通过柔性linker连接成多表位疫苗,使用免疫信息学方法对抗原性、过敏源、理化性质、糖基化位点、二级和三级结构进行评估。通过二硫化物工程提高疫苗稳定性。使用分子对接评估疫苗构建体与免疫受体的结合能力,最后进行silico克隆。结果表明,成功构建17000相对分子质量的可溶性蛋白质,免疫信息学结果表明,疫苗构建体是非过敏性良好抗原,具有一个潜在的N-糖基化位点,在二级结构中α螺旋占约3.2%,β折叠占约43.2%,无规卷曲占约53.6%。三级结构Ramachandran作图发现优势区域中含有88.2%残基,进行细化后优势区域的残基增加到93.5%,3D模型表位作图也证明多表位疫苗具有良好的免疫原性,二硫化物工程确定出3对残留物可以形成二硫键,分子对接表明疫苗构建体与TLR3受体具有高亲和力,最后密码子优化和silico克隆确保设计的亚单位疫苗在大肠杆菌K12表达系统中更高表达。免疫信息学分析表明这种多表位疫苗可以有效表达并能够诱导强烈的T细胞和B细胞免疫应答。本研究为BVDV E2多表位疫苗的设计提供了一种新的方法。
关键词
牛病毒性腹泻病毒
E2蛋白
B细胞表位
T细胞表位
分子对接
二硫化物工程
silico克隆
Keywords
bovine viral diarrhea virus
E2 protein
B cell epitope
T cell epitope
molecular docking
disulfide engineering
silico cloning
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
牛病毒性腹泻病毒E2蛋白多表位疫苗筛选及生物信息学验证
何金科
杨亚军
邓肖玉
何延华
张超
马忠臣
王震
陈创夫
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
6
原文传递
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参考文献
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