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甘蓝型油菜光敏色素互作因子4(BnaPIF4)基因克隆和功能分析 被引量:4
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作者 冯韬 官春云 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期204-213,共10页
光敏色素互作因子4 (phytochrome interacting factor 4, PIF4)是光信号途径关键转录因子, PIF4与BZR互作介导光信号与油菜素内酯信号互作,参与植物光响应。本文在甘蓝型油菜湘油15号中克隆到2个PIF4基因,分别定位于A03号染色体和C03号... 光敏色素互作因子4 (phytochrome interacting factor 4, PIF4)是光信号途径关键转录因子, PIF4与BZR互作介导光信号与油菜素内酯信号互作,参与植物光响应。本文在甘蓝型油菜湘油15号中克隆到2个PIF4基因,分别定位于A03号染色体和C03号染色体,命名为BnaPIF4_A03和BnaPIF4_C03,全长编码序列(coding sequence, CDS)、全长mRNA和全长基因分别为1242 bp和1245 bp、1701 bp和1731 bp、2527 bp和2665 bp,各自编码413和414个氨基酸。BnaPIF4_A03具有7个外显子和6个内含子, BnaPIF4_C03具有8个外显子和7个内含子,与测序品种中双11号相比, BnaPIF4_A03基因第1内含子存在单碱基插入突变,第4和第6内含子存在缺失突变,且具有更长的3'-UTR,两基因其他序列在湘油15号和中双11号之间无差别。BnaPIF4_A03和BnaPIF4_C03基因编码蛋白具有典型的植物bHLH结构域,亚细胞定位于细胞核,是典型的植物PIF4蛋白。多序列比对和进化分析表明, BnaPIF4蛋白与白菜、拟南芥、亚麻芥等PIF4蛋白高度同源。PIF4蛋白进化关系与物种进化关系一致,近缘物种中的PIF4蛋白在进化树中高度聚类,大量植物中可见PIF4蛋白重复且低等植物中分化程度明显低于高等植物中,表明PIF4蛋白是一个晚期进化事件且可能存在功能冗余。酵母杂交实验表明BnaPIF4与BnaBZR蛋白存在互作,但BnaPIF4不能与BnaBZR基因的启动子互作,表明BnaPIF4与BnaBZR在蛋白水平而非转录水平发生互作。湘油15号中BnaPIF4_A03和BnaPIF4_C03基因表达规律一致,BnaPIF4基因主要表达于油菜茎表皮、未成熟角果和叶中,在花和根中表达较低,且其表达随油菜生育进程逐渐降低。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 光敏色素互作因子4 基因克隆 基因 基因表达 生物信息学分析
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谷子生长调节因子互作因子基因家族生物信息学分析 被引量:2
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作者 张立全 张浩林 +2 位作者 李丛丛 魏建华 张杰伟 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期878-883,共6页
【目的】生长调节因子互作因子(GRF-interacting factor,GIF)是植物体内一类转录共激活因子,在植物生长发育和逆境胁迫中起重要作用。通过系统分析谷子GIF基因家族的组成、各成员的结构以及进化关系,为GIF基因调节机制研究提供参考。【... 【目的】生长调节因子互作因子(GRF-interacting factor,GIF)是植物体内一类转录共激活因子,在植物生长发育和逆境胁迫中起重要作用。通过系统分析谷子GIF基因家族的组成、各成员的结构以及进化关系,为GIF基因调节机制研究提供参考。【方法】利用谷子基因组数据库,采用生物信息学的方法,鉴定谷子GIF基因家族的基因结构、染色体定位,编码蛋白相似性、二级结构、跨膜区和磷酸化位点预测,通过序列比对进行进化和分类分析。【结果】谷子含有3个GIF基因,均含有4个外显子,分布于第3、8和9号染色体上。编码SiGIF1蛋白和SiGIF2蛋白相似性最高,为72.04%,SiGIF1蛋白和SiGIF3蛋白相似性最低,为37.08%。二级结构分析显示,谷子GIF蛋白无规则卷曲占比最高(41.56%~56.60%),其次为α-螺旋(34.43%~35.50%),再次为β-转角(5.19%~11.69%),β-折叠最低(3.23%~11.26%)。TMHMM跨膜区进行分析显示,谷子GIF蛋白均不含有跨膜区。MEME保守基序分析显示,谷子GIF蛋白均含有保守的SSXT(PF05030)结构域。磷酸化位点预测分析表明谷子GIF蛋白均含有潜在磷酸化位点。【结论】谷子GIF基因家族的基因结构、磷酸化位点预测等生物信息学分析结果将为揭示谷子GIF基因家族在谷子生长发育过程中的功能提供重要的线索。 展开更多
关键词 谷子 生长调节因子互作因子 基因家族 进化分析
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小麦光敏色素互作因子TaPIF4基因的克隆与表达分析 被引量:7
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作者 李璐 王翔 +4 位作者 王状元 曹云 胡格 王留壹 尹钧 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第1期74-82,共9页
为研究小麦光敏色素互作因子TaPIF4基因的结构、特性以及在小麦中的具体功能,从小麦中克隆TaPIF4基因并进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析该基因在48 h内的节律表达及在低温、干旱、高盐和脱落酸(ABA)处理条件下的... 为研究小麦光敏色素互作因子TaPIF4基因的结构、特性以及在小麦中的具体功能,从小麦中克隆TaPIF4基因并进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析该基因在48 h内的节律表达及在低温、干旱、高盐和脱落酸(ABA)处理条件下的表达模式,推测其可能参与的生物学过程。结果表明,TaPIF4基因的开放阅读框为1 053 bp,编码350个氨基酸,所编码的蛋白在C端含有1个b HLH结构域。TaPIF4蛋白的b HLH结构域保守程度高,在进化关系上与粗山羊草的PIF4-like蛋白最近。TaPIF4基因的表达具有昼夜节律性,在光照条件下表达量低,在黑暗条件下表达量高。TaPIF4基因在外源ABA处理下表达被明显抑制;在干旱处理下,短时间内其表达量升高,之后下降;冷处理下,表达模式与干旱处理相反;盐处理下,其表达无明显规律。推测TaPIF4基因可能参与植物ABA、干旱、低温胁迫的信号通路。 展开更多
关键词 小麦 光敏色素互作因子 光周期 昼夜节律性 胁迫
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采用酵母双杂交系统筛选梨PbTMT4互作因子 被引量:1
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作者 程寅胜 杨立 +3 位作者 陈健秋 张绍铃 伍涛 张虎平 《湖北农业科学》 2019年第24期240-245,共6页
为筛选梨糖转运相关蛋白PbTMT4互作因子,基于已经建立好的砀山酥梨果实发育时期的cDNA文库,利用MatchmakerTM Gold酵母双杂交系统,以构建的重组质粒pDHB1-PbTMT4为诱饵质粒,采用PEG/LiAc法转化酵母菌株NMY51。利用表型筛选法检测PbTMT4... 为筛选梨糖转运相关蛋白PbTMT4互作因子,基于已经建立好的砀山酥梨果实发育时期的cDNA文库,利用MatchmakerTM Gold酵母双杂交系统,以构建的重组质粒pDHB1-PbTMT4为诱饵质粒,采用PEG/LiAc法转化酵母菌株NMY51。利用表型筛选法检测PbTMT4的自激活作用和毒害作用,利用氨基酸缺陷型培养基筛选PbTMT4互作因子。结果表明,诱饵蛋白PbTMT4在酵母双杂交系统中无毒性和自激活作用。通过酵母双杂交筛选以及测序和序列比对分析,共获得13个与PbTMT4蛋白相互作用的宿主蛋白。 展开更多
关键词 PbTMT4 酵母双杂交系统 CDNA文库 互作因子
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光敏色素互作因子参与生长素调控的植物生长发育
5
作者 钱静洁 林苏梦 +1 位作者 张冬平 高勇 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期29-33,共5页
光敏色素互作因子(PIFs)属于碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子家族,能在细胞核内与活性形式的光敏色素(PHYS)相互作用并被降解。PIFs参与多种信号转导途径,调控植物的生长发育,如抑制种子萌发、促进幼苗的暗形态建成和植物开花等。作为... 光敏色素互作因子(PIFs)属于碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子家族,能在细胞核内与活性形式的光敏色素(PHYS)相互作用并被降解。PIFs参与多种信号转导途径,调控植物的生长发育,如抑制种子萌发、促进幼苗的暗形态建成和植物开花等。作为胞内信号调控的重要组分,PIFs广泛参与植物外部环境因素(如高温、光),以及内部激素(如生长素、细胞分裂素和油菜素内酯等)介导的信号网络。当光信号和温度变化时,PIFs会通过影响生长素合成、运输和信号转导,参与生长素路径,调控植物生长发育。论文就PIFs参与生长素调控的植物生长发育研究进展进行综述,并对未来研究方向加以展望。 展开更多
关键词 光敏色素互作因子 生长素 光信号 生长发育
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钩藤光敏色素互作因子鉴定及其表达分析 被引量:1
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作者 王晓红 郑浩杰 +4 位作者 李雪 强玮 于晓松 上官黎阳 张明生 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期2104-2116,共13页
光敏色素互作因子(phytochrome-interacting factors,PIFs)是具有基本螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域的转录因子,它们与光敏色素相互作用,在光信号转导过程发挥重要作用。基于转录组数据注释及蛋白同源比对,共筛选出28个钩藤PIF家族成员(UrPI... 光敏色素互作因子(phytochrome-interacting factors,PIFs)是具有基本螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域的转录因子,它们与光敏色素相互作用,在光信号转导过程发挥重要作用。基于转录组数据注释及蛋白同源比对,共筛选出28个钩藤PIF家族成员(UrPIFs),编码蛋白的长度在420~741个氨基酸之间,理论分子量46.47~79.46 kDa;等电点5.97~9.15。亚细胞定位预测结果显示UrPIFs均位于细胞核。系统进化关系和保守基序分析表明,28个UrPIFs分为4组,都具有活性光敏色素B结合(active phytochrome B-binding,APB)结构域和bHLH结构域,而且每组成员之间具有相似的保守基序。组织表达谱显示多数UrPIFs在叶中表达量较高,其次是茎,最低的是根。在遮光条件下,除UrPIF05外,7个UrPIFs表达量呈上升趋势;转移至正常光照条件后,8个Ur PIFs的表达量均呈下降趋势。尤其是UrPIF15对光较为敏感,可能在光信号转导中发挥重要作用。UrPIFs的鉴定和分析可为进一步构建钩藤光调控网络提供参考。 展开更多
关键词 钩藤 光敏色素互作因子 遮光 系统进化分析 基因表达
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弓形虫免疫作图蛋白1互作因子的筛选与鉴定
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作者 姚营营 张丽新 +9 位作者 赵桂华 徐超 孙慧 刘功振 肖婷 朱嵩 魏庆宽 黄炳成 闫歌 尹昆 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2020年第3期306-310,316,共6页
目的采用酵母双杂交技术筛选弓形虫免疫作图蛋白1(TgIMP1)在人类宿主胞内的相互作用因子并鉴定其相互作用。方法以刚地弓形虫RH株基因组为模板,PCR扩增TgIMP1全长编码序列,扩增产物经双酶切后插入诱饵表达质粒pGBKT7中。重组质粒转化入... 目的采用酵母双杂交技术筛选弓形虫免疫作图蛋白1(TgIMP1)在人类宿主胞内的相互作用因子并鉴定其相互作用。方法以刚地弓形虫RH株基因组为模板,PCR扩增TgIMP1全长编码序列,扩增产物经双酶切后插入诱饵表达质粒pGBKT7中。重组质粒转化入酵母Y2H Gold细胞中,采用酵母细胞融合方法与人胎脑cDNA酵母文库菌双杂交筛选互作因子。筛选的阳性质粒经测序和共转化验证TgIMP1体内相互作用。结果成功构建了不具备细胞毒性和自激活活性的pGBKT7-IMP1重组诱饵表达质粒,该诱饵在人胎脑cDNA文库中共计筛选得到Ringfinger protein2(RNF2)、Murine retroviru sinte grationsite1homolog(MRVI1)、Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3(HNRNPA3)等6种相互作用因子。结论筛选得到6种人类宿主能够与弓形虫TgIMP1发生相互作用的蛋白因子,其中RNF2体内可与TgIMP1直接互作。 展开更多
关键词 酵母双杂交 互作因子 免疫图蛋白1 弓形虫
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埃博拉病毒复制、转录和翻译过程中宿主互作因子的研究进展 被引量:3
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作者 王中一 付莹莹 +5 位作者 李佳明 郭振东 赵宗正 张春茂 钱军 刘林娜 《军事医学》 CSCD 北大核心 2017年第11期938-941,共4页
埃博拉病毒(EBOV)是一种可在人类及非人灵长类间通过接触传播的烈性病原微生物,致死率25%~90%。针对该病毒的早期研究主要聚焦到病毒自身蛋白的作用,但近年来,研究重心逐渐转向病毒增殖过程中宿主相互作用因子的研究。该文综述了EBOV在... 埃博拉病毒(EBOV)是一种可在人类及非人灵长类间通过接触传播的烈性病原微生物,致死率25%~90%。针对该病毒的早期研究主要聚焦到病毒自身蛋白的作用,但近年来,研究重心逐渐转向病毒增殖过程中宿主相互作用因子的研究。该文综述了EBOV在复制、转录和翻译过程中宿主互作因子的研究进展,旨在增强对EBOV在胞内增殖过程中与宿主细胞相互作用情况的了解,为今后制定研究策略、开发新型抗病毒药物提供理论参考。 展开更多
关键词 埃博拉病毒 复制 转录 翻译 宿主 互作因子
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肿瘤微环境趋化因子通过与细胞因子受体互作参与HCC诱导的炎症反应 被引量:4
9
作者 韩鑫鑫 梁浩源 +4 位作者 唐玉莲 倪安妮 陆瑞群 李曙波 李根亮 《右江民族医学院学报》 2019年第6期610-613,共4页
目的探讨肿瘤微环境(TM)中趋化因子参与肝细胞癌(HCC)引起的炎症反应的可能机制。方法提取肿瘤组织(TM组)和癌旁组织(对照组)总RNA并通过RNA-seq和生物信息学手段分析趋化因子相关差异表达基因的功能及其编码蛋白的互作情况,并以RT-qPC... 目的探讨肿瘤微环境(TM)中趋化因子参与肝细胞癌(HCC)引起的炎症反应的可能机制。方法提取肿瘤组织(TM组)和癌旁组织(对照组)总RNA并通过RNA-seq和生物信息学手段分析趋化因子相关差异表达基因的功能及其编码蛋白的互作情况,并以RT-qPCR验证实验结果。结果TM中共有43个趋化因子相关差异表达基因,它们被富集到2个KEGG信号通路、5个生物学过程和2个细胞组分,其中大量趋化因子相关基因参与炎症反应、免疫反应、趋化性、细胞对IL-1的反应和细胞对肿瘤坏死因子的反应过程。尤其值得一提的是,涉及趋化性的7个基因(ACKR3、CCL20、CCL3、CCL5、CCR4、CCR6、PTGDR2)中,有6个参与细胞因子-细胞因子受体信号通路、5个参与免疫反应、4个参与炎症反应;涉及细胞因子-细胞因子受体信号通路的134个基因中有7个参与炎症反应。结论TM中趋化因子通过与细胞因子受体互作的方式参与HCC诱导的炎症反应。 展开更多
关键词 趋化因子 细胞因子-细胞因子受体 肿瘤微环境 肝细胞
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多年生黑麦草LpPIL15-like基因转录模式及耐逆功能分析
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作者 关昊 姚佳明 +5 位作者 张欣栎 王硕 宋欣瑶 刘信宝 张敬 徐彬 《中国草地学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期24-34,共11页
光敏色素互作因子(Phytochrome-interacting factors,PIFs)属于bHLH家族成员,在植物光信号传导、光形态建成和抗逆性等方面发挥重要作用。本研究基于已发表的多年生黑麦草转录组数据,克隆了逆境响应差异表达PIF基因LpPIL15-like,并初步... 光敏色素互作因子(Phytochrome-interacting factors,PIFs)属于bHLH家族成员,在植物光信号传导、光形态建成和抗逆性等方面发挥重要作用。本研究基于已发表的多年生黑麦草转录组数据,克隆了逆境响应差异表达PIF基因LpPIL15-like,并初步分析其基因特征、转录模式及耐逆功能。LpPIL15-like基因具有5个外显子,编码区全长为1671 bp,编码556个氨基酸,与硬直黑麦草LrPIL15-like基因亲缘关系最近。LpPIL15-like蛋白具有典型的bHLH结构域及APB和APA功能域,定位于细胞核。LpPIL15-like启动子中含有ABRE、CGTCA-motif和G-box等激素、逆境和光响应顺式作用元件。定量分析表明,LpPIL15-like在伸展叶中表达量最高,在茎、根和叶鞘中表达量较低。此外,LpPIL15-like基因的表达受昼夜节律调控,在光照条件下的表达量显著高于黑暗条件。PEG、NaCl、CdCl2、高温胁迫以及6-BA、ABA等激素处理0.5、2、6、12、24 h显著增强了叶片中LpPIL15-like基因表达,而逆境胁迫和激素处理0.5、2、6、12 h均显著抑制了LpPIL15-like基因在根中的表达。异源过量表达LpPIL15-like基因显著提高了酵母的耐盐、高温和干旱的能力。综上,LpPIL15-like的转录受昼夜节律、非生物逆境和植物激素调控,可作为黑麦草耐逆遗传改良的候选基因。 展开更多
关键词 多年生黑麦草 光敏色素互作因子 转录模式 非生物胁迫 耐逆功能
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CIN-like TCP转录因子:植物发育及免疫的关键调节因子(英文) 被引量:4
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作者 王志才 崔大勇 胡玉欣 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第3期215-223,共9页
TEOSINTE BRANCHED1、CYCLOIDEA和PCF(TCP)是植物特有的一类转录因子,具有由碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基序组成的TCP结构域.根据TCP结构域的不同特征将TCP分为2个家族:class Ⅰ TCP和class Ⅱ TCP.越来越多的证据表明,class Ⅱ TCP的亚家... TEOSINTE BRANCHED1、CYCLOIDEA和PCF(TCP)是植物特有的一类转录因子,具有由碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基序组成的TCP结构域.根据TCP结构域的不同特征将TCP分为2个家族:class Ⅰ TCP和class Ⅱ TCP.越来越多的证据表明,class Ⅱ TCP的亚家族成员CINCINNATA-like(CIN-like)TCPs通过激素合成及信号转导在植株形态建成等方面起关键作用.最近研究表明,CIN-like TCP除了调控植物生长发育外,还介导植物抵御病原菌入侵的免疫反应,称为效应因子引发的免疫反应(effectors-triggered immunity,ETI).目前,虽然CIN-like TCP的调控机理已有较多报道,但其发育及免疫方面的调控较为复杂,有必要基于目前的研究对该亚家族成员的功能做进一步梳理.因此,本文对CIN-like TCP在发育及免疫调控中的作用机理进行了综述,着重论述了CIN-like TCP相关突变体特征及其与蛋白质及植物激素之间的互作关系,也讨论了目前研究中仍然存在的问题,为今后该亚家族基因的进一步功能解析提供新的思路. 展开更多
关键词 CIN-like TCP转录因子 植物发育 免疫 互作因子
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水曲柳FmPIF基因家族克隆及表达模式分析 被引量:3
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作者 吕义品 梁楠松 +3 位作者 宋婷婷 崔靖弘 于磊 詹亚光 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期58-68,共11页
【目的】探究水曲柳光敏色素互作因子(FmPIFs)在激素调控与非生物胁迫应答过程中的重要作用,为揭示水曲柳抗逆分子机制和制定林木遗传育种策略提供理论依据。【方法】在水曲柳中克隆FmPIFs基因,并对其基因结构、蛋白质理化性质、保守基... 【目的】探究水曲柳光敏色素互作因子(FmPIFs)在激素调控与非生物胁迫应答过程中的重要作用,为揭示水曲柳抗逆分子机制和制定林木遗传育种策略提供理论依据。【方法】在水曲柳中克隆FmPIFs基因,并对其基因结构、蛋白质理化性质、保守基序、系统进化关系等进行生物信息学分析。采用qRT-PCR方法分析水曲柳中FmPIFs基因在不同组织及不同激素与胁迫条件下的表达模式。【结果】获得5个水曲柳FmPIFs基因家族成员,分别命名为FmPIF1、FmPIF3、FmPIF4、FmPIF7和FmPIF8,其对应的蛋白均为亲水性不稳定蛋白,全部定位在细胞核内。多序列比对结果表明FmPIFs均存在APB保守结构域,成员FmPIF1与FmPIF3存在特有的APA结构域。组织特异性分析显示FmPIFs均在叶中表达量最高,其中成员FmPIF8表达量最高,为对照的3.96倍;但在茎中少量表达,茎中表达量最高的是FmPIF3,仅是对照的0.21倍;而在根中表达量均极低。胁迫响应分析表明,FmPIFs正调控水曲柳植株盐、碱和干旱胁迫抗性,而对植株抗寒性起负调控作用,其中成员FmPIF3对寒冷及盐胁迫明显响应,FmPIF8在碱胁迫下表达量明显上调,FmPIF1在干旱胁迫下表达量明显上调。在激素响应结果中,FmPIFs对脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)和赤霉素(GA_(3))的响应较为一致,而对生长素(IAA)和茉莉酸甲酯(MeJA)的响应存在差异。FmPIF1在施加MeJA后剧烈应答且表达量显著上调,FmPIF7在SA处理后表达量明显上调,FmPIF3和FmPIF4在GA3处理后表达量明显上调。【结论】FmPIFs各成员在基因及蛋白结构上表现出较高的一致性。RT-qPCR结果表明,FmPIFs在水曲柳叶片中表达量最高。在盐、碱、干旱和寒冷胁迫下,FmPIFs被诱导表达,且大部分表达模式相似。FmPIFs也在水曲柳响应IAA、ABA、MeJA、SA、GA3激素调控过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 水曲柳 光敏色素互作因子 基因克隆 生物信息分析 表达模式
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金鱼草AmPIF4基因克隆及调控花香物质合成释放功能分析 被引量:3
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作者 李彤 邵慧慧 +3 位作者 韩嘉宁 王雪莲 胡增辉 吴静 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1994-2001,共8页
为了研究光敏因素互作因子(phytochrome-interacting factors,PIFs)在光诱导花香物质合成释放中的调控作用,该研究从‘马里兰’金鱼草(Antirrhinum majus‘Maryland True Pink’)中克隆PIF4转录因子(AmPIF4)编码区序列,进行生物信息学... 为了研究光敏因素互作因子(phytochrome-interacting factors,PIFs)在光诱导花香物质合成释放中的调控作用,该研究从‘马里兰’金鱼草(Antirrhinum majus‘Maryland True Pink’)中克隆PIF4转录因子(AmPIF4)编码区序列,进行生物信息学分析、亚细胞定位和瞬时表达载体转化烟草,研究AmPIF4蛋白在细胞中的分布;并采用qRT-PCR技术检测AmPIF4基因的时空表达,运用病毒诱导的基因沉默(VIGS)验证基因功能,采用ATD-GC/MS技术测定花香成分含量。结果显示:(1)成功克隆到AmPIF4基因开放阅读框全长1497 bp,编码498个氨基酸;理论分子量55.58 kD,理论等电点6.44;同源比对分析显示AmPIF4蛋白与芝麻(Sesamum indicum)序列相似度最高。(2)AmPIF4蛋白主要定位于细胞核。(3)实时定量分析表明,AmPIF4基因在金鱼草各个时期及不同器官、组织中均有表达,而在花盛开期达到最高,其中在盛开期的叶片中表达量最高,但叶片与茎和萼片中的表达差异不显著。(4)基因沉默使金鱼草花瓣中AmPIF4基因的相对表达量较野生型显著下调约65%,且与阴性对照相比AmPIF4表达量也显著降低,同时使金鱼草花瓣中主要花香挥发物成分月桂烯、罗勒烯、苯甲酸甲酯较野生型分别显著增加了22%、24%、12%,花香释放量总体含量上升。研究表明,AmPIF4对花香物质合成释放有负调控作用,可能参与光对花香次生代谢的调控。 展开更多
关键词 金鱼草 光敏色素互作因子 基因沉默 花香 调控
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龙眼PIFs家族全基因组鉴定及其表达分析
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作者 李小芳 林晓艺 +5 位作者 苏炳茜 张城瑜 罗彬彬 陈裕坤 杜迎刚 赖钟雄 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1025-1037,共13页
【目的】PIFs属于basic helix-loop-helix(bHLH)转录因子家族的第15亚族,研究其在龙眼(Dimocarpus longan Lour.)中的表达特征可为其参与调控植物的生长发育和抵御逆境胁迫过程中的作用机制提供参考。【方法】基于龙眼基因组和转录组数... 【目的】PIFs属于basic helix-loop-helix(bHLH)转录因子家族的第15亚族,研究其在龙眼(Dimocarpus longan Lour.)中的表达特征可为其参与调控植物的生长发育和抵御逆境胁迫过程中的作用机制提供参考。【方法】基于龙眼基因组和转录组数据进行PIFs基因家族的鉴定与生物信息学分析,对其启动子序列进行顺式作用元件分析;基于龙眼体胚发生早期3个阶段[胚性愈伤组织(Embryogenic callus,EC)、不完全胚性紧实结构(Incomplete embryotic compacted structure,ICpEC)、球形胚(Spherical embryo,GE)]、不同组织部位(花、花蕾、叶、果皮、果肉、根、种子、茎、幼果)、不同温度(15℃、25℃、35℃)和不同光质(蓝光、白光和黑暗)处理下龙眼EC转录组数据,通过龙眼PIFs的FPKM值分析其表达模式,并采用实时荧光定量PCR(Quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)分析DlPIFs在龙眼体胚发生早期、不同生长调节剂[生长素(2,4-D)、脱落酸(ABA)、赤霉素(GA3)、水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)]处理下的表达情况。【结果】生物信息学分析表明所鉴定的龙眼PIFs家族8个成员均具有bHLH结构域,编码区长度介于975~2298 bp,包含5~8个外显子和6个motif,亚细胞定位预测均定位于细胞核。DlPIFs启动子中不仅含有响应光、激素和非生物胁迫的作用元件,还具有与种子生长和胚胎发育过程相关的作用元件。系统进化树分析显示DlPIFs分布在4大分支上,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、甜橙[Citrus sinensis(L.)Osbeck]亲缘关系较近。不同组织器官的转录组数据分析结果表明,DlPIF1-1的表达量在种子中最高,DlPIF1-2的表达量在果肉中最高,DlPIF4的表达量在茎中最高,DlPIF5的表达量在花蕾中最高,DlPIF7和DlPIF8的表达量在叶中最高。不同光质转录组数据分析结果表明,DlPIF1-1、DlPIF5和DlPIF8在蓝光处理下的表达量明显高于对照,DlPIF4在白光和蓝光处理下的表达量均明显高于对照,DlPIF1-2在3种光质处理下的表达量差别不明显。不同温度的转录组数据分析结果表明,相对高温(35℃)促进DlPIF4和DlPIF6的表达,抑制DlPIF1-1、DlPIF1-2、DlPIF3和DlPIF8的表达;相对低温(15℃)促进DlPIF1-1、DlPIF3和DlPIF5的表达,抑制DlPIF1-2、DlPIF4、DlPIF6和DlPIF8的表达。qRT-PCR结果显示,DlPIF1-1、DlPIF5、DlPIF6和DlPIF8的表达量随着龙眼体胚早期的发育不断下降,DlPIF1-2和DlPIF3的表达量在EC到ICpEC阶段下降,在ICpEC到GE阶段上升,DlPIF4和DlPIF7的表达模式与之相反。与其他成员相比,DlPIF5和DlPIF7的表达量在5种生长调节剂处理下都具有明显变化。【结论】DlPIFs家族在龙眼的生长发育进程中可能具有不同的功能,并可能参与生物胁迫和非生物胁迫的响应过程。 展开更多
关键词 龙眼 光敏色素互作因子 基因家族鉴定 表达分析
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基于投影寻踪回归的混凝土抗渗性能研究 被引量:1
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作者 崔俊 卫帅帅 +1 位作者 王莉 侯旭军 《混凝土》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期52-53,56,共3页
混凝土抗渗性直接影响着混凝土的耐久性,传统试验方法耗费大量的人力、物力、财力以及时间的不足,文中借鉴统计学的思想,提出用多投影寻踪回归对多种配合比的混凝土进行渗透性仿真计算。结果表明此模型的可靠度很高,可以用于混凝土渗透... 混凝土抗渗性直接影响着混凝土的耐久性,传统试验方法耗费大量的人力、物力、财力以及时间的不足,文中借鉴统计学的思想,提出用多投影寻踪回归对多种配合比的混凝土进行渗透性仿真计算。结果表明此模型的可靠度很高,可以用于混凝土渗透性的设计。 展开更多
关键词 统计学 混凝土 因子项逐步回归 抗渗性
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多年生黑麦草LpPIL5基因特征分析及转录调控 被引量:1
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作者 姚佳明 何悦 +3 位作者 郝欢欢 黄心如 张敬 徐彬 《草业学报》 CSCD 北大核心 2022年第9期155-167,共13页
光敏色素互作因子(PIFs)属于bHLH家族的一个亚家族,在植物光信号、激素信号传导和调控植物耐逆性等方面发挥重要作用。本研究从多年生黑麦草中克隆出一个PIF基因,其与拟南芥AtPIF5的亲缘关系最近,因此命名为LpPIL5-like(LpPIL5)。LpPIL... 光敏色素互作因子(PIFs)属于bHLH家族的一个亚家族,在植物光信号、激素信号传导和调控植物耐逆性等方面发挥重要作用。本研究从多年生黑麦草中克隆出一个PIF基因,其与拟南芥AtPIF5的亲缘关系最近,因此命名为LpPIL5-like(LpPIL5)。LpPIL5基因编码区序列(CDS)全长为1410 bp,具有5个外显子,编码470个氨基酸,具有典型的bHLH结构域和APB功能域,且其蛋白定位于细胞核。LpPIL5的启动子区域(1500 bp)具有ABRE、MBS和G-box等多种光、激素和逆境响应顺式作用元件。表达模式分析结果显示LpPIL5在叶片中表达量较高,而在根、茎、叶鞘等部位表达量较低。LpPIL5基因的表达受昼夜节律调控,且在光下的表达量显著高于黑暗。此外,聚乙二醇(PEG)、NaCl、CdCl_(2)和高温逆境及6-苄基腺嘌呤(6-BA)和脱落酸(ABA)等激素处理显著抑制了叶片中LpPIL5基因表达,而在根中,LpPIL5基因的相对表达量在处理的12 h后明显增加,处理24 h时,显著高于对照。 展开更多
关键词 多年生黑麦草 碱性螺旋-环-螺旋 光敏色素互作因子 亚细胞定位 表达分析
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玉米PHYB1基因的克隆、改造及其在拟南芥中的功能分析 被引量:2
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作者 马晓净 赵斌斌 +2 位作者 刘扬 马梦迪 王海洋 《生物技术进展》 2019年第4期350-356,共7页
光是一个重要的环境因子,影响植物生长发育的诸多方面。植物通过多种光受体感受环境中的光信号,其中以红光与远红光受体--光敏色素的研究最为透彻。研究表明,将拟南芥phyB的104位点与361位点的酪氨酸(Y)残基改造为苯丙氨酸(F)残基可增... 光是一个重要的环境因子,影响植物生长发育的诸多方面。植物通过多种光受体感受环境中的光信号,其中以红光与远红光受体--光敏色素的研究最为透彻。研究表明,将拟南芥phyB的104位点与361位点的酪氨酸(Y)残基改造为苯丙氨酸(F)残基可增强其活性。为了研究玉米光敏色素B1(PHYB1)的功能,构建了玉米光敏色素B1基因的3种重组质粒:pZmPHYB1∷ZmPHYB1WT、pZmPHYB1∷ZmPHYB1Y98F(对应拟南芥Y104F突变)和pZmPHYB1∷ZmPHYB1Y359F(对应拟南芥Y361F突变),并将其转入拟南芥phyB-9突变体中,然后对转基因株系进行表型分析。结果表明,ZmPHYB1可抑制phyB-9突变体下胚轴及叶柄的伸长;ZmPHYB1可与拟南芥AtPIF5互作并诱导下游避荫反应响应基因和生长素合成基因的表达;Y98F和Y359F氨基酸的替换可增强ZmPHYB1的活性。研究结果表明ZmPHYB1在拟南芥中具有介导避荫反应的作用,同时也将为玉米耐密株型改良提供参考。 展开更多
关键词 ZmPHYB1 下胚轴 避荫反应 光敏色素互作因子(PIFs)
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Dynamics models of soil organic carbon 被引量:7
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作者 杨丽霞 潘剑君 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2003年第4期323-330,共8页
As the largest pool of terrestrial organic carbon, soils interact strongly with atmosphere composition, climate, and land change. Soil organic carbon dynamics in ecosystem plays a great role in global carbon cycle and... As the largest pool of terrestrial organic carbon, soils interact strongly with atmosphere composition, climate, and land change. Soil organic carbon dynamics in ecosystem plays a great role in global carbon cycle and global change. With development of mathematical models that simulate changes in soil organic carbon, there have been considerable advances in understanding soil organic carbon dynamics. This paper mainly reviewed the composition of soil organic matter and its influenced factors, and recommended some soil organic matter models worldwide. Based on the analyses of the developed results at home and abroad, it is suggested that future soil organic matter models should be developed toward based-process models, and not always empirical ones. The models are able to reveal their interaction between soil carbon systems, climate and land cover by technique and methods of GIS (Geographical Information System) and RS (Remote Sensing). These models should be developed at a global scale, in dynamically describing the spatial and temporal changes of soil organic matter cycle. Meanwhile, the further researches on models should be strengthen for providing theory basis and foundation in making policy of green house gas emission in China. 展开更多
关键词 Soil carbon Soil organic carbon Dynamic model
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Avr/Cf Interaction Induce the Expression of Ptis, Genes Encoding Pto-interactors
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作者 蔡新忠 徐幼平 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第5期628-630,共3页
Products of plant resistance ( R ) genes Pto and Cf contain distinct domains, and have different cellular localization. It is intriguing to compare the development mechanisms of resistance conferred by the t... Products of plant resistance ( R ) genes Pto and Cf contain distinct domains, and have different cellular localization. It is intriguing to compare the development mechanisms of resistance conferred by the two R genes. In the present report, two hypersensitive response (HR) initiation systems were employed to study the time_course expression induced by Avr / Cf interaction of the genes encoding Pti4, Pti5 and Pti6 which interact directly with Pto: (1) Seeds of tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) containing complementary gene pairs Avr 4/ Cf _4 and Avr 9/ Cf _9 were obtained through crossing. Their seedlings developed HR under room temperature. (2) Avr / Cf seedlings grew normally at 33 ℃. When the temperature was shifted down to 25 ℃, HR occurred within hours in the seedlings. Results of both experiments showed that expression of Pti4, Pti5 and Pti6 was induced upon development of hypersensitive necrosis in Avr / Cf seedlings. However, the expression levels and patterns of these Pti s differed. This finding indicated that these Pti s function complementarily, and might be involved in regulation of both Pto and Cf _conferred resistance. 展开更多
关键词 Pti CF hypersensitive response resistance
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心力衰竭大鼠血液亚甲基四氢叶酸还原酶和CITED2基因表达水平与血气波浪式信号的相关性研究
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作者 程帆 朱艳霞 +1 位作者 刘琴 司小敏 《中国心血管病研究》 CAS 2022年第1期77-83,共7页
目的研究心力衰竭(HF)大鼠血液亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因和c AMP反应元件结合蛋白/P300互作反式激活因子2(CITED2)基因的表达水平与血气波浪式信号的相关性。方法 SPF级8周龄的雌性Wistar大鼠建立HF模型大鼠分为Sham组和HF组(n=8... 目的研究心力衰竭(HF)大鼠血液亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因和c AMP反应元件结合蛋白/P300互作反式激活因子2(CITED2)基因的表达水平与血气波浪式信号的相关性。方法 SPF级8周龄的雌性Wistar大鼠建立HF模型大鼠分为Sham组和HF组(n=8)。Sham组大鼠仅暴露左冠状动脉前降支和HF组进行左冠状动脉前降支结扎。手术后7周监测血流动力学指标,和血气波浪式信号,收集术后1周、3周、7周大鼠的血液,7周后安乐死大鼠收集心脏组织。使用HE染色法观察大鼠心脏病理变化,q RTPCR检测1周、3周、7周大鼠血液汇总MTHFR和CITED2基因的表达,试剂盒法检测血液MTHFR和CITED2基因启动子区的甲基化水平。皮尔森相关性检测法分析MTHFR和CITED2基因表达和血气波浪式信号的相关性。结果 HF组血液MTHFR和CITED2的表达[(2.51±0.52)和(3.19±0.24)]高于Sham组[(1.00±0.00)和(1.00±0.00),t=12.079、9.635,P<0.05]。HF组血液MTHFR和CITED2[(0.78±0.06)和(1.05±0.11)]的启动子区甲基化水平低于Sham组[(1.22±0.31)和(1.67±0.27),t=13.821、15.633,P<0.05]。HF组中MTHFR水平与血氧分压(Pa O2)[(6.01±1.29)mm Hg]和动脉血氧饱和度(Sa O2)(0.19±0.04)%呈负相关性(t=-0.521、-0.786,P<0.05)。CITED2水平与Sa O2呈负相关性(t=-0.839,P<0.05)。结论 HF大鼠血液MTHFR和CITED2基因表达升高与血氧饱和度降低有关。 展开更多
关键词 心力衰竭 亚甲基四氢叶酸还原酶 cAMP反应元件结合蛋白/P300反式激活因子2 血气波浪式信号 启动子区甲基化
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