载脂蛋白(a)五核苷酸重复序列基因多态性与冠心病及血浆Lp(a)水平的关系

目的 :探讨载脂蛋白[apo(a)]五核苷酸重复序列基因多态性在冠心病患者中的分布状况及其与血浆Lp(a)水平的关系。方法 :对293例经冠脉造影确诊的冠心病患者及163例正常对照组进行apo(a)基因多态性频率分析及血浆Lp(a)水平的检测。PCR法扩增相应的apo(a)DNA片段 ,聚丙烯酰胺凝胶电泳分离扩增产物并确定其基因型。ELISA法测定血浆Lp(a)水平。结果 :共检出8种等位基因 ,19种基因型 ,常见的基因型为8/8、8/9、5/8、9/94种。2组中5/8基因型携带者的血浆Lp(a)水平均高于其他基因型携带者 (P<0.05) ;高Lp(a)组5/8基因型携带者多于低Lp(a)组 (P<0.05) ;且高Lp(a)组中冠心病患者所占比例明显高于低Lp(a)组(P<0.05)。结论 :5/8基因型携带者血浆Lp(a)水平升高 。

汉族人群载脂蛋白(a)五核苷酸重复序列基因多态性对血脂水平的影响

目的 :了解健康湖北汉族人群载脂蛋白 (a)五核苷酸重复序列 (pentanucleotiderepeat,PNR)基因多态性并分析其对血清脂质的影响。方法 :随机选取 15 3例健康湖北汉族受试者 ,测定其血清胆固醇 (TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇 (HDL -C)、低密度脂蛋白胆固醇 (LDL -C) ,载脂蛋白AI(apoAⅠ )、载脂蛋白B(apoB)及脂蛋白 (a) [Lp(a) ]的浓度 ,并采用PCR -SSCP的方法检测载脂蛋白 (a)PNR基因多态性 ,计算各等位基因的分布频率。结果 :我国汉族人群apo(a)PNR等位基因频率分布与欧美人群有显著性差异 ,apo(a)PNR(TTTTA) 5等位基因与高Lp(a)水平相关 ,apo(a)PNR等位基因变异对TC、TG、HDL -C、LDL -C、ApoAI和ApoB无明显影响。结论 :本研究获得了湖北健康汉族人群的血脂及apo(a)PNR等位基因分布的资料 ,apo(a)PNR(TTTTA) 5等位基因与汉族人群高Lp(a)

153例内蒙古汉族人群载脂蛋白(a)五核苷酸重复序列基因多态性与乳腺癌的关系

目的研究载脂蛋白(a)[apo(a)]5′调控区五核苷酸(TTTTA)n重复序列(PNR)基因多态性在内蒙古地区汉族健康人群及乳腺癌患者中的分布特点,进一步探讨其与血脂水平的关系。方法采用PCR-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法检测143例健康人群及153例乳腺癌患者apo(a)的PNR基因多态性。结果乳腺癌患者血浆Lp(a)、HDL-C及TG水平显著性高于健康对照组;乳腺癌患者组检测出(TTTTA)序列重复次数为5、8、9共3种等位基因,频率分别为0.029 4、0.767 9、0.202 6,并检测出5/8、5/9、5/5、8/8、8/9、9/9共6种基因型,频率分别为0.026 1、0.019 6、0.006 5、0.627 5、0.255 0、0.065 4;健康对照组检测出(TTTTA)序列重复次数为5、7、8、9共4种等位基因,频率分别为0.090 9、0.007 0、0.720 3、0.181 8,并检测出5/8、5/9、5/5、7/9、8/8、8/9、9/9共7种基因型,频率分别为0.076 9、0.035 0、0.035 0、0.014 0、0.559 4、0.244 8、0.035 0;乳腺癌患者apo(a)的(TTTTA)5等位基因频率显著低于健康对照组(P<0.05),且与乳腺癌的发生呈负相关性;乳腺癌患者基因型8/8与8/9间的血浆脂蛋白(a)水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论内蒙古地区携带apo(a)PNR(TTTTA)5等位基因的汉族人群发生乳腺癌的风险率可能相对较小。

蒙古族人群载脂蛋白(a)五核苷酸重复序列基因多态性与冠心病发生的相关性研究

目的:研究载脂蛋白(a)5'调控区(TTTTA)n五核苷酸重复序列(PNR)基因多态性在内蒙古地区蒙古族健康人群及冠心病(CHD)病人中的分布特点。方法:采用PCR-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法检测66例蒙古族健康人群及71例蒙古族冠心病病人的apo(a)的PNR基因多态性。结果:冠心病病人血浆Lp(a)、TG水平高于正常对照组,而HDL-C水平则低于正常对照组;冠心病病人组检测出(TTTTA)序列重复次数为5、8、9共3种等位基因,并检测出5/8、5/9、8/8、8/9、9/9共5种基因型。正常对照组检测出(TTTTA)序列重复次数为5、7、8、9共4种等位基因,检测出5/8、5/5、7/9、8/8、8/9、9/9共6种基因型。两组人群均以重复次数为8和基因型8/8分布频率最高;冠心病病人与正常对照apo(a)PNR比较发现各等位基因及基因型频率间均无显著性差异;冠心病病人基因型8/8与8/9间的血浆脂蛋白(a)水平比较无显著性差异。结论:蒙古族人群apo(a)PNR基因多态性可能与冠心病发生的不存在直接的相关性。

血浆脂蛋白(a)水平及apo(a)五核苷酸重复序列基因多态性相关性研究

lp(a)是动脉粥样硬化发生发展的独立危险因子.血浆lp(a)水平及apo(a)基因五核苷酸重复序列(TTTTA)(pen-tanucleotide repeat,PNR)的多态性与冠心病、心肌梗死、脑卒中及肿瘤的发生发展均具有相关性.

蒙古族人群载脂蛋白(a)五核苷酸重复序列基因多态性与脑梗死的关系

目的研究载脂蛋白(a)[apo(a)]5′调控区(TTTTA)n五核苷酸重复序列(PNR)基因多态性在内蒙古地区蒙古族脑梗死患者中的分布特点。方法采用聚合酶链反应-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PCR-PAGE)方法检测66例蒙古族健康人群及67例蒙古族脑梗死患者的apo(a)的PNR基因多态性。结果脑梗死患者血浆脂蛋白(a)[Lp(a)]、三酰甘油(TG)水平明显高于健康对照组,高密度脂蛋白-C(HDL-C)水平明显低于健康对照组;脑梗死患者组检测出(TTTTA)序列重复次数为5、8、9共3种等位基因,5/5、5/8、5/9、8/8、8/9、9/9共6种基因型;健康对照组检测出(TTTTA)序列重复次数为5、7、8、9共4种等位基因,5/8、5/5、7/9、8/8、8/9、9/9共6种基因型。两组人群均以重复次数为8和基因型8/8分布频率最高;脑梗死组与健康对照组apo(a)PNR比较发现各等位基因及基因型频率间差异无统计学意义;脑梗死组基因型8/8与8/9间的血浆Lp(a)水平比较差异无统计学意义。结论蒙古族人群apo(a)PNR基因多态性可能与脑梗死发生不存在直接的相关性。

载脂蛋白B基因四核苷酸串联重复序列(TTTA)n遗传多态性研究

采用聚合酶链反应—变性凝胶高压电泳结合银染技术及基因序列方法 ,确认载脂蛋白B基因四核苷酸串联重复 (TTTA)n基因型 ,研究中国汉族人载脂蛋白B基因四核苷酸串联重复序列 (TTTA)n遗传多态性特征。结果 :汉族人群中 ,共检出载脂蛋白B四核苷酸串联重复序列 (TTTA)n有 3种等位基因和 6种基因型。基因型为 12 8/12 8,12 8/13 8,12 8/14 8,13 8/13 8,13 8/14 8,14 8/14 8,其频率分别为 0 0 0 5 ,0 0 89,0 0 10 ,0 816 ,0 0 75 ,0 0 0 5 ;等位基因为 12 8,13 8和 14 8,其频率分别是 0 0 5 5 ,0 898和 0 0 47,与美国高加索人相应的频率比较 ,两者的差异具有显著性 (P <0 0 1) ;结果说明 :载脂蛋白B基因四核苷酸串联重复 (TTTA)

汉族人群载脂蛋白CII基因二核苷酸串联重复序列(TG)n(AG)m及(AG)m多态性

采用套式聚合酶链反应结合变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染技术 ,并构建载脂蛋白CII (ApoCII)基因二核苷酸串联重复序列 (TG)n(AG)m及 (AG)m序列等位基因梯阶标准 ;检测正常汉族人群基因型和等位基因频率分布 ,检出 36种 (TG)n(AG)m序列基因型、12种等位基因。等位基因为 17、18、2 6～ 35 ,其频率分别为 0 0 6 1、0 0 11、0 0 0 2、0 0 0 2、0 0 5 4、0 2 5 5、0 372、0 0 84、0 0 2 6、0 0 39、0 0 5 2、0 0 4 1。检出 7种 (AG)m序列基因型、4种等位基因。等位基因为 6、7、8、9,其频率分别为 0 0 0 2、0 15 2、0 812、0 0 34。与欧洲白种人比较 ,ApoCII基因二核苷酸串联重复序列 (TG)n(AG)m及 (AG)m序列等位基因频率分布均具有明显的种族差异性 (P <0 0 1,P <0 0 1)。

汉族人群载脂蛋白CII基因二核苷酸串联重复序列(TG)n(AG)m及(AG)m序列的遗传多态性(英文)

目的:研究汉族人群载脂蛋白CII基因二核苷酸串联重复序列(TG)n(AG)m及(AG)m序列多态性。方法:采用套式聚合酶链反应结合变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染技术,并构建了载脂蛋白CII(ApoCII)基因二核苷酸串联重复序列(TG)n(AG)m及(AG)m序列等位基因梯阶标准,检测了231例汉族人群健康体检者基因型和等位基因频率分布。同时测定了等位基因28的序列。结果:检出36种(TG)n(AG)m序列基因型、12种等位基因。等位基因为17,18,26-35,其频率分别为0.061,0.011,0.002,0.002,0.054,0.255,0.372,0.084,0.026,0.039,0.052,0.041。检出7种(AG)m序列基因型、4种等位基因。等位基因为6,7,8,9,其频率分别为0.002,0.152,0.812,0.034。与欧洲白种人比较,ApoCII基因二核苷酸串联重复序列(TG)n(AG)m及(AG)m序列等位基因频率分布均具有显著的差异性(χ2=341.47,P<0.01;χ2=56.05,P<0.01)。结论:载脂蛋白CII基因二核苷酸串联重复序列(TG)n(AG)m及(AG)m序列具有明显的种族差异性,了解汉族人群该序列的遗传特点,是研究其与疾病相关性的基础和前提。

二核苷酸重复多态性的非同位素检测及其在基因诊断中的应用

本文报道了一种检测二核苷酸重复多态性的简便的非同位素法，利用重复序列两侧的特异引物进行ＰＣＲ扩增，产生的等位片段在薄层变性聚丙烯酰胺凝胶电泳上分离，再用灵敏的银染法显色。该方法不需要标记ＰＣＲ产物，简便、快速，分辨率可达１ｂｐ，并可用多对引物同时进行多重ＰＣＲ分析。用此方法对ＤＭＤ家系成员ｄｙｓｔｒｏｐｈｉｎ基因的５＇－脑型外显子上游区和３＇－非翻译区的两个（ＣＡ）ｎ位点进行了扩增片段长度多态性分析，表明它是连锁分析和基因诊断的一种方便有效的新技术。

基质金属蛋白酶-9基因二核苷酸重复序列多态标志ACn多态与2型糖尿病蛋白尿肾病相关

目的探讨基质金属蛋白酶-9(MMP-9)基因二核苷酸重复序列多态标志ACn与中国人2型糖尿病蛋白尿肾病的相关性。方法收集中国人2型糖尿病合并及非合并肾病患者245例,其中非肾病组(Non-DN) 78例,微量蛋白尿肾病组(DN-1)129例。显著蛋白尿肾病组(DN-2)38例；非糖尿病对照组83例。采用荧光染料FAM标记引物5′末端．将聚合酶链反应(PCR)产物进行变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,采用基因片段分析法检测个体MMP-9基因ACn的基因型,比较各组间基因型和等位基因频率。结果①共发现9种等位基因,ACn重复数目为16至24。其中以AC21等位基因最为常见,其他等位基因频率大小顺序依次为AC19＞AC20＞AC18。②DN-2组的AC18等位基因频率为11．8%,显著高于Non—DN组的3．8%(P=0．042,OR=3．7．95%CI 1．2～11．4)。③DN-1组的AC20等位基因频率为23．7%,显著低于Non—DN组的13．9%(P=0．016,OR=2．0,95%CI 1．1～3．6)。结论中国人MMP-9基因(AC)n重复数16至24,最常见等位基因为AC21。AC18等位基因可能是糖尿病发生显著蛋白尿肾病的风险因子．而AC20等位基因可能是防止糖尿病微量蛋白尿肾病发生的保护因子。因此,MMP-9基因微卫星多态可能是中国人2型糖尿病肾病的遗传标志。

5个五核苷酸Y-STR基因座在河南汉族群体中的遗传多态性

目的:调查Y染色体上5个五核苷酸Y-STR基因座DYS446、DYS447、DYS463、DYS588和DYS643在河南汉族群体中的遗传多态性,评价其法医学应用价值。方法:收集403名河南汉族无关男性个体血样,检测上述5个基因座,进行等位基因分型及遗传统计分析。结果:5个Y-STR基因座分别检出了11、9、7、9和6个等位基因,其中DYS446和DYS447基因多样性(GD)达0.815 14和0.843 96,DYS463和DYS643的GD达0.777 18和0.720 60。共检测到311种单体型,其中261种单体型仅出现1次,个体识别力(DP)和单体型多样性(HD)分别为0.995 45和0.997 93,单体型辨别能力(DC)为0.771 71。结论:5个基因座组成的单体型在河南汉族群体中具有较高的遗传多态性,对于法医学实践应用和人类遗传学研究具有重要意义。

水稻中富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点(LRR-NBS)基因家族的生物信息学分析

采用HMM(HiddenMarkovModel) ,对源于日本晴的粳稻 (国际水稻测序计划 ,IRGSP)基因组和 9311的籼稻基因组 (北京华大 ,BGI)的蛋白质数据库进行了搜索 ,分别获得了 32 5和 344个富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点 (leucinerichrepeat-nucleotidebindingsite ,LRR -NBS)类的抗病基因的蛋白序列 ,并得到了与这些蛋白相应的cDNA序列。对粳稻蛋白功能结构域的分析表明 ,多个蛋白具有与植物防卫反应相关的结构域 ,还发现多个蛋白中存在着与转座 /反转座酶或蛋白所具有的结构域。对 2套数据同源性分析表明 ,粳稻中 4 8个基因在籼稻中可以确定存在orthologs基因 ,且几乎所有的粳稻基因在籼稻中都存在高度同源的对应基因。对这些蛋白的表达情况进行了EST库搜索 ,确定粳稻和籼稻中分别有 95和 79个蛋白表达。对粳稻和籼稻的所有LRR NBS类蛋白的NBS结构域氨基酸序列进行了多序列比对和系统进化分析 ,在粳稻中可以确定为 2 6 3个簇 ,这些簇大多只含 1个基因 ,是一个冗余度不高的基因家族。且除了个别族外 。

五个绵羊群体KAP11-1基因核苷酸序列变异分析

为了分析绵羊KAP11-1基因的核苷酸序列变异,采用PCR-SSCP方法和DNA测序技术检测了欧拉羊、甘肃高山细毛羊、滩羊、湖羊和青海细毛羊5个群体(749只个体)KAP11-1基因的单核苷酸多态性,同时分析了等位基因频率、遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量等群体遗传特征。结果表明,5个绵羊群体的KAP11-1基因中共检测到c.93C/T、c.240G/A、c.285C/G/A和c.331A/G 4个单核苷酸多态位点,且c.331A/G为非同义突变。等位基因A在5个群体中出现的频率最高(87.70%),为优势等位基因,其次为等位基因B(基因频率为11.03%),等位基因C和D的频率最低(分别为0.53%和0.74%)。群体遗传学分析结果表明,滩羊KAP11-1基因的遗传杂合度、有效等位基因数和多态信息含量均高于其余4个群体。KAP11-1基因作为羊毛经济性状的主要候选基因之一,其核苷酸序列的变异导致KAP11-1中相应氨基酸的改变,最终可能会影响羊毛纤维的结构和羊毛主要经济性状。

雌激素受体α基因TA重复序列多态性与原因不明月经过少的关系

目的:研究雌激素受体a(estrogen receptor a,ERa)基因二核苷酸重复序列多态性与原因不明月经过少关系。方法:选择西南地区的100名月经正常者作为对照组,100名原因不明月经过少患者为病例组。同时对她们雌激素受体基因上游的高变区二核苷酸(TA)重复序列进行纯化、克隆和序列分析,阐明该重复序列的重复多态性在实验组与对照组当中的分布情况及与原因不明月经过少的关系。结果:共分离出7种等位基因,其(TA)n重复数目为11至17,对照组中最常见的等位基因为TA14,正常组和病例组的(TA)n重复序列等位基因的分布频率不同,差异有显著性(χ2=13.412,P=0.037)。再用Fisher's确切概率法比较两组病人各等位基因的分布频率,病例组TA13等位基因频率高于对照组,差异有显著性(P=0.006),TA15等位基因频率低于对照组,差异有显著性(P=0.033)。结论:ERa基因TA多态性与原因不明月经过少有关,TA13等位基因可能是原因不明月经过少的危险因素;TA15等位基因可能是其保护因素。

雌激素受体β基因CA重复序列多态性与原因不明月经过少的关系

目的:研究雌激素受体β(Estrogen receptor β,ERβ)基因CA重复序列多态性与原因不明月经过少关系。方法:选择西南地区的100名月经正常人作为正常对照组,100名原因不明月经过少患者作为病例组。同时对人ERβ基因5号内含子的高变区CA重复序列进行纯化、克隆和序列分析,阐明该CA重复序列多态性在实验组与对照组当中的分布情况及与原因不明月经过少的关系。结果:共分离出9种等位基因,其(CA)n重复数目为16～24。正常组和病例组的等位基因的分布频率差异无显著性(χ2=7.155,P=0.520)。以重复次数n≤20作为SS型,n>20为LL型。SS基因型频率实验组为66%,对照组为51%,OR值:1.865倍(95%CI:1.055～3.298)。再比较两组病人SS型和LL等位基因型的分布频率,差异有显著性(χ2=4.634,P=0.031)。结论:ERβ基因CA重复序列多态性与原因不明月经过少有关,SS型等位基因型可能是原因不明月经过少的危险因素。

抗禾谷孢囊线虫基因中核苷酸结合位点区(NBS)-亮氨酸重复序列区(LRR)的克隆与序列分析

根据源于节节麦抗禾谷孢囊线虫基因Cre3及已经克隆的NBS-LRR类植物抗病基因的NBS与LRR区保守序列分别设计特异引物,从易变山羊草基因组中PCR扩增得到两个扩增条带,它们的大小分别约为530bp和1200bp.经克隆测序发现,这两个序列分别长为532bp和1175bp,且是连续的.它们有32bp的共同序列,总长为1675bp,包含了一个NBS-LRR区和一个不完整的开放阅读框,没有起始密码子、终止密码子和内含子结构.它编码一个557个氨基酸的蛋白质,分子量(Mr)为63.537×103,含有NBS区保守模体ILDD,ESKILVTTRSK,KGSPLAARTVGG,RRC-FAYCS,EGF,以及LRR区的保守模体aXXLXXLXXL.它与Cre3的核苷酸和氨基酸同源性分别为87.8%和77%,可能是一个抗禾谷孢囊线虫基因.

雌激素受体基因PvuⅡ和XbaⅠ酶切多态性及其上游TA重复序列多态性与子宫内膜癌关系的研究

目的 研究妇女的雌激素受体 (estrogenreceptor,ER)基因多态性与子宫内膜癌的关系 ,从而了解子宫内膜癌的发病因素及影响预后的因素 ,做到早预防、早诊断、早治疗 ,从而改善预后。方法 选取患者 5 2例 ,平均 5 7 5岁。患者的诊断均经手术病理证实。选取非子宫内膜癌患者 5 2例作为对照组 ,平均 5 9 3岁。所有入选者均未服用过激素类药物。用分子生物学的方法分析内切酶PvuⅡ、XbaⅠ限制性片段长度多态性 (re strictionfragmentlengthpolymorphism ,RFLP) ,观察ER基因多态性在实验组与对照组中的基因型分布。RFLP用Pp(PvuⅡ )和Xx (XbaⅠ )来表示。同时对人雌激素受体基因上游的高变区二核苷酸 (TA)重复序列进行纯化、克隆和序列分析 ,阐明该重复序列的重复多态性在实验组与对照组当中的分布情况及与子宫内膜癌的关系。结果实验组X基因型频率为 6 5 4 % ,对照组为 4 4 2 % ,OR值 :2 38(95 %CI 1 0 8～ 5 2 5 ) ,P =0 0 4 8;P基因型 ,OR值 :1 0 9(95 %CI 0 4 9～ 2 4 3) ,P =0 84。PvuⅡ、XbaⅠ限制性片段长度多态性在两组中均呈多态性分布。另外 ,TA重复序列在两组当中也存在着重复次数多态性。结论 实验人群中依XX >Xx >xx基因型子宫内膜癌发病危险呈递减趋势。

成人多囊肾PCR─核苷酸重复序列的多态分析

成人多囊肾ＰＣＲ─核苷酸重复序列的多态分析温州医学院附属一院潘景业，徐玉兰，俞康，吴建波，沈志坚，胡晓霞成人型多囊肾病（Ａｄｕｌｔｐｏｌｙｃｙｓｔｉｃｋｉｄｎｅｙｄｉｓｅａｓｅ，ＡＰＫＤ）是一种常染色体显性遗传病。发病率高达１／１０００［１］。主要特...

抑郁症患者多巴胺转运体基因可变串联重复序列多态性研究

目的探讨抑郁症患者多巴胺转运体(DAT)基因3'非翻译区域的40 bp可变串联重复序列(VNTR)多态性。方法选取2011年10月—2014年3月就诊于青岛大学附属医院和青岛市精神卫生中心住院及门诊的抑郁症患者116例作为抑郁组,同期选取青岛大学附属医院体检健康者172例作为对照组。应用聚合酶链反应-VNTR多态性分析技术行DAT基因VNTR多态性检测。结果共检测出520、480、440、380、360 bp 5种等位基因,分别为DAT基因的VNTR多态性11、10、9、7.5、7次重复序列。6种基因型分别为:480 bp/480 bp、480 bp/440 bp、520 bp/480 bp、480 bp/380 bp、480 bp/360 bp、440 bp/440 bp。抑郁组和对照组的基因型分布和等位基因频率符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(抑郁组:χ2=1.380,P=0.848;对照组:χ2=0.051,P=0.990)。抑郁组与对照组基因型分布比较,差异有统计学意义(P<0.05);其中两组480 bp/480 bp和480 bp/440 bp基因型比较,差异有统计学意义(χ2=24.375,P<0.001;χ2=4.976,P<0.05)。两组等位基因频率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 DAT基因VNTR多态性可能与抑郁症的发病相关,为进一步的临床研究提供了借鉴。