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禽流感H5和H9亚型基因探针的制备 被引量:3
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作者 方浩 宋念华 +2 位作者 姚志伟 熊元林 王松太 《湖北农业科学》 北大核心 2007年第2期190-193,共4页
参照GeneBank数据库上H5N1和H9N2 AIV的HA基因序列,选取保守区域,设计了两对引物,分别用于扩增HA基因,产物纯化回收得到180bp和285bp cDNA片段,采用随机引物法Digxigenin-11-dUTP标记得到探针H5PR和H9PR,通过斑点杂交检测,结果表明探针... 参照GeneBank数据库上H5N1和H9N2 AIV的HA基因序列,选取保守区域,设计了两对引物,分别用于扩增HA基因,产物纯化回收得到180bp和285bp cDNA片段,采用随机引物法Digxigenin-11-dUTP标记得到探针H5PR和H9PR,通过斑点杂交检测,结果表明探针的灵敏度高和特异性好,可以进行相关性试验。 展开更多
关键词 禽流感病毒 斑点杂交 地高辛探针 制备 H5亚型基因 H9亚型基因
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蛋白激酶Cξ亚型基因及UrotensinⅡ基因中各有一个单核苷酸位点与中国北方汉族人群2型糖尿病相关 被引量:18
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作者 孙红霞 杜玮南 +10 位作者 左瑾 吴国栋 史贵彬 沈岩 强伯勤 姚志建 杭建梅 王姮 黄薇 陈竺 方福德 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期223-227,共5页
目的采用单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)标记,在以往中国北方汉族人群2型糖尿病相关基因定位区域(1p36.33-p36.23)内寻找疾病易感基因位点。方法通过生物信息学方法在公共SNP数据库中查找定位区域内10个候选基因中... 目的采用单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)标记,在以往中国北方汉族人群2型糖尿病相关基因定位区域(1p36.33-p36.23)内寻找疾病易感基因位点。方法通过生物信息学方法在公共SNP数据库中查找定位区域内10个候选基因中的23个SNP位点,用单碱基延伸反应(singlebaseextension,SBE)法对北方汉族人群散发2型糖尿病患者(192例)及对照组(172例)进行分型及病例-对照关联分析。结果23个SNP位点中有8个为中国北方人群常见SNP位点;对病例组和对照组分型分析显示,位于蛋白激酶Cξ亚型(PRKCZ)基因中的一个位点(rs436045)及urotensinⅡ(UTS2)基因中的一个位点(rs228648),其等位基因频率在两组的差异具有统计学意义(P<0.05)。结论上述两个SNP位点可能和中国北方汉族人群2型糖尿病相关,以上结果为进一步研究上述两个位点所在的基因与2型糖尿病的关系提供了理论依据。 展开更多
关键词 慢白激酶Cζ亚型基因 UROTENSIN 基因 中国 北方汉族人群 单核苷酸多态性标记 2型糖尿病 病例-对照关联分析
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利用基因芯片技术筛选HIV-1F亚型基因限制性显示探针 被引量:3
3
作者 李凌 马文丽 +2 位作者 祝骥 石嵘 郑文岭 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期564-567,共4页
为筛选限制性显示技术制备的HIV 1F亚型基因探针 ,应用基因芯片打印仪将其有序地打印在玻片上制备基因芯片 .在随机引物延伸的过程中进行HIV样品的荧光标记 ,然后与芯片进行杂交 .杂交后清洗玻片并干燥 ,对芯片进行扫描 ,分析各探针的... 为筛选限制性显示技术制备的HIV 1F亚型基因探针 ,应用基因芯片打印仪将其有序地打印在玻片上制备基因芯片 .在随机引物延伸的过程中进行HIV样品的荧光标记 ,然后与芯片进行杂交 .杂交后清洗玻片并干燥 ,对芯片进行扫描 ,分析各探针的杂交信号 .从中筛选了 14个基因片段作为芯片下一步研究的探针 .实验证明 。 展开更多
关键词 基因芯片技术 筛选 HIV-1F亚型基因 限制性显示探针 DNA微阵
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Beta肾上腺素能受体3种亚型基因的5位点SNP基因型的组合分布 被引量:1
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作者 谢正祥 牛永红 +2 位作者 马厚勋 李章勇 殷跃辉 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第1期99-103,共5页
用 DNA提取试剂盒抽提 338例受试者外周血 DNA,用聚合酶链反应 -限制性片段长度多态性及等位基因特异性 PCR技术获得 Beta- AR3种亚型基因的 5个位点的 SNP基因型。用聚类分析技术获得了 338例受试者的 Beta- AR3种亚型基因的 5个位点的... 用 DNA提取试剂盒抽提 338例受试者外周血 DNA,用聚合酶链反应 -限制性片段长度多态性及等位基因特异性 PCR技术获得 Beta- AR3种亚型基因的 5个位点的 SNP基因型。用聚类分析技术获得了 338例受试者的 Beta- AR3种亚型基因的 5个位点的 SNP基因型组合的自然分布特征 ,共发现了 6 7种组合类型。SNP基因型组合的自然分布的前 5位有 :(1) B1- AR S/ S4 9+B1- AR R/ R389+B2 - AR R/ G16 +B2 - AR Q/ E2 7+B3- AR W/W6 4有 4 0人 ,出现概率为 11.83%。 (2 ) B1- AR S/ S4 9+B1- AR R/ R389+B2 - AR R/ G16 +B2 - AR Q/ Q2 7+B3- ARW/ W6 4有 33人 ,出现概率为 9.76 %。 (3) B1- AR S/ S4 9+B1- AR R/ G389+B2 - AR R/ G16 +B2 - AR Q/ Q2 7+B3-AR W/ W6 4有 19人 ,出现概率为 5 .6 2 %。 (4) B1- AR S/ S4 9+B1- AR R/ G389+B2 - AR R/ G16 +B2 - AR Q/ E2 7+B3- AR W/ W6 4有 16人 ,出现概率为 4 .74 %。 (5 ) B1- AR S/ G4 9+B1- AR R/ R389+B2 - AR R/ G16 +B2 - AR Q/E2 7+B3- AR W/ W6 4有 13人 ,出现概率为 3.85 %。总样本与女、男亚组间及女、男亚组间的 SNP的组合分布间具有较好的相关性。 展开更多
关键词 Beta肾上腺素能受体 亚型基因 5位点 SNP基因 组合分布 单核苷酸多态性
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蛋白激酶Cξ亚型基因多态性与2型糖尿病的相关性
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作者 秦蕾 吴雪霁 +5 位作者 成金罗 沈默宇 杜云峰 王劲松 周金意 周玲 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期784-786,共3页
目的研究中国东南方汉族人群2型糖尿病家系的蛋白激酶Cξ亚型基因多态性,探讨其与2型糖尿病(T2DM)易感性的关系。方法应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,对来自T2DM家系成员、无家族史的T2DM患者及正常对照的... 目的研究中国东南方汉族人群2型糖尿病家系的蛋白激酶Cξ亚型基因多态性,探讨其与2型糖尿病(T2DM)易感性的关系。方法应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,对来自T2DM家系成员、无家族史的T2DM患者及正常对照的该基因rs381664位点进行基因分型。结果rs381664位点基因型、等位基因频率在各组人群中分布差异无统计学意义。按年龄分层显示在家系大于50岁人群组中,突变型CC/CT型为保护性因素[OR95%CI=0.541(0.323-0.905)]。按BMI分层分析糖尿病相关生物学指标显示,在家系内对照组超重者和病例组肥胖者中,均发现携带TT基因型个体的胰岛素抵抗指数显著高于携带CC/CT型个体(P〈0.05)。结论蛋白激酶Cξ亚型基因rs381664位点多态性与胰岛素抵抗存在相关性,在50岁以上人群的T2DM发生中可能起到一定作用。 展开更多
关键词 2型糖尿病 家系 胰岛素抵抗 蛋白激酶Cξ亚型基因
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日本血吸虫(中国大陆株)14-3-3信号转导蛋白epsilon亚型基因[Parasitol1]真核表达重组质粒的构建及序列分析
6
作者 唐小牛 汪学龙 +1 位作者 沈继龙 陈文魁 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第3期220-222,227,共4页
目的 构建日本血吸虫中国大陆株 14 - 3- 3信号转导蛋白epsilon亚型基因真核表达重组质粒 pBK -Sj14 - 3- 3,为进一步对重组蛋白的融合表达及保护性免疫的研究提供条件。方法 根据日本血吸虫 14 - 3- 3蛋白的核苷酸序列 ,设计合成一... 目的 构建日本血吸虫中国大陆株 14 - 3- 3信号转导蛋白epsilon亚型基因真核表达重组质粒 pBK -Sj14 - 3- 3,为进一步对重组蛋白的融合表达及保护性免疫的研究提供条件。方法 根据日本血吸虫 14 - 3- 3蛋白的核苷酸序列 ,设计合成一对引物 ,以日本血吸虫中国大陆株成虫总RNA为模板 ,用RT -PCR法合成日本血吸虫中国大陆株 14 - 3- 3蛋白epsilon亚型基因cDNA片段。将其克隆入 pGEM -T载体 ,经双酶切及PCR鉴定后 ,再亚克隆入 pBK -CMV真核表达质粒 ,构建重组质粒 pBK -Sj14 - 3- 3,转化到大肠杆菌BL2 1感受态细胞 ,提取重组质粒双酶切鉴定并进行序列分析。 结果 RT -PCR产物、pGEM -T -Sj14 - 3- 3及 pBK -Sj14 - 3- 3分别经双酶切均获得一特异性基因片段 经测序分析后该片段具有一个 75 3bp完整开放阅读框 (openreadingframe ,ORF) ,由此推导的氨基酸序列具有多种蛋白激酶的磷酸化位点。 结论 成功地构建了日本血吸虫中国大陆株 14 - 3- 3信号蛋白epsilon亚型基因真核表达重组质粒 ,并对其核苷酸序列及推导的氨基酸序列蛋白激酶磷酸化位点进行分析。 展开更多
关键词 日本血吸虫 14—3—3信号转导蛋白 epsilon亚型基因 真核表达 重组质粒 构建 序列分析
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杭州市规模化养殖场湖羊芽囊原虫的PCR检测与基因亚型鉴定
7
作者 邓朴明 赵慧钢 +6 位作者 余复昌 石团员 孙洪超 周炜 周芷锦 赵爱云 齐萌 《畜牧与饲料科学》 2024年第2期103-108,共6页
[目的]掌握杭州市规模化养殖场中湖羊芽囊原虫的感染情况和基因亚型分布。[方法]从杭州市4个规模化养殖场采集167份湖羊的新鲜粪便样本,提取粪便全基因组DNA;基于小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因,对粪便DNA样本进行PCR扩增,对阳性产物进... [目的]掌握杭州市规模化养殖场中湖羊芽囊原虫的感染情况和基因亚型分布。[方法]从杭州市4个规模化养殖场采集167份湖羊的新鲜粪便样本,提取粪便全基因组DNA;基于小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因,对粪便DNA样本进行PCR扩增,对阳性产物进行测序;经序列比对鉴定芽囊原虫基因亚型,构建系统进化树解析其遗传进化关系。[结果]167份样本中,检测出芽囊原虫阳性样本18份,感染率为10.78%(18/167);3个养殖场呈芽囊原虫阳性,感染率依次为21.43%(3/14)、21.21%(14/66)和2.13%(1/47),1个养殖场未检测出芽囊原虫;不同养殖场之间湖羊芽囊原虫的感染率存在极显著(P<0.01)差异。鉴定出7个芽囊原虫基因亚型,分别为ST7(n=1)、ST10(n=9)、ST21(n=3)、ST23(n=1)、ST24(n=2)、ST26(n=1)、ST30(n=1),以ST10亚型为优势感染亚型(9/18,50.00%);基于芽囊原虫SSU rRNA基因的系统进化树分析发现,6种基因亚型序列聚类形成1个大群,其中ST10和ST23聚类形成亚群,ST21、ST26和ST30聚类形成亚群,ST24聚类形成亚群;而ST7聚类形成另外1个群。[结论]杭州市湖羊芽囊原虫感染较常见,其基因亚型存在遗传多样性。研究结果为我国绵羊芽囊原虫的感染情况调查提供了基础数据。 展开更多
关键词 芽囊原虫 检测 鉴定 基因亚型 湖羊
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陕西奶牛源微小隐孢子虫的基因亚型鉴定及其遗传进化分析
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作者 张迎锐 王占宏 +4 位作者 丰嘉怡 赵永攀 陈超 李韬 张智鹏 《家畜生态学报》 北大核心 2024年第10期72-76,共5页
隐孢子虫是一种寄生于人和多种动物消化道的人兽共患寄生性原虫,可通过污染食物、水源等感染宿主,常引起宿主水样腹泻,甚至死亡。微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)是隐孢子虫属中致病力较高的种类之一,有研究表明,C.parvum的致病... 隐孢子虫是一种寄生于人和多种动物消化道的人兽共患寄生性原虫,可通过污染食物、水源等感染宿主,常引起宿主水样腹泻,甚至死亡。微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)是隐孢子虫属中致病力较高的种类之一,有研究表明,C.parvum的致病力与其gp60基因亚型有强相关性。因此,本研究基于gp60基因位点并应用分子生物学方法对分离自陕西奶牛源微小隐孢子虫进行基因亚型鉴定和遗传进化分析。结果表明,该研究中奶牛源C.parvum分离株(SX-1)属于Ⅱd亚型家族,基因亚型为ⅡdA19G1,与GenBank中MH049734、MN304768、MT156342和AY738194等参考分离株同归于一个大支,均属于Ⅱd亚型家族。该研究所获得的结果表明C.parvum在陕西省奶牛中分布广泛且具有遗传多样性,对做好犊牛腹泻疾病的精准防控具有重要意义,可为陕西奶牛源C.parvum有效防控策略的制定提供理论基础和数据支撑。 展开更多
关键词 微小隐孢子虫 基因亚型 遗传进化分析 奶牛 陕西
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广州市花都区某医院妇科门诊HPV感染基因亚型情况分析
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作者 黎思毅 胡汉斌 +3 位作者 罗雪平 黄炜玮 朱冬云 陈昕谊 《现代医院》 2024年第5期803-805,809,共4页
目的分析某院受检女性人乳头状瘤病毒(HPV)感染的基因分型类型及其感染特征。方法采用PCR+反向点杂交技术检测28种HPV基因亚型。结果HPV感染率24.15%,HR和LR占比前五为:HPV52、16、53、58、39,和HPV61、81、54、42、44。单一感染占比68.... 目的分析某院受检女性人乳头状瘤病毒(HPV)感染的基因分型类型及其感染特征。方法采用PCR+反向点杂交技术检测28种HPV基因亚型。结果HPV感染率24.15%,HR和LR占比前五为:HPV52、16、53、58、39,和HPV61、81、54、42、44。单一感染占比68.97%、2重感染占比20.72%,多重感染型别组合无明显差异。各年龄组HPV总体感染率最高为≤25岁组,其次是≥66岁、56~65岁组,各年龄组HPV总体、单一及多重感染率整体呈现近似“U”形变化曲线。结论某院妇科门诊就诊人群HPV感染以单一感染为主,多为青中年群体。HPV基因亚型具有种群或地区分布的特点。HPV感染率为24.15%,最常见HPV 52、16及53,均属高危型,HPV感染三个高峰年龄段为≤25岁、56~65岁和≥66岁。 展开更多
关键词 人乳头状瘤病毒 基因亚型 杂交
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广西≥50岁男性新报告人类免疫缺陷病毒感染者的基因亚型及治疗前耐药分析 被引量:1
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作者 方宁烨 韦文翠 +17 位作者 李剑军 岑平 冯献湘 阳冬 唐凯玲 梁淑家 邵玉兰 陆华湘 江河 孟琴 刘帅凤 朱秋映 陈欢欢 蓝光华 阳世雄 周丽芳 莫靖林 葛宪民 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期399-404,共6页
目的 分析广西≥50岁男性新报告人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者的基因亚型及治疗前耐药情况。方法 采用分层随机抽样法,选取广西14个城市2020年1至6月新报告≥50岁男性HIV感染者,采用巢式逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因片段进行测序... 目的 分析广西≥50岁男性新报告人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者的基因亚型及治疗前耐药情况。方法 采用分层随机抽样法,选取广西14个城市2020年1至6月新报告≥50岁男性HIV感染者,采用巢式逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因片段进行测序,分析耐药突变位点及耐药程度。结果 共615例HIV感染者纳入分析,CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC 3种主要亚型的构成比分别为57.4%(353/615)、17.1%(105/615)和22.4%(138/615)。核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、非NRTI(NNRTI)和蛋白酶抑制剂发生耐药位点突变例数分别为8例(1.3%)、18例(2.9%)和0例。NRTI和NNRTI位点突变率最高的分别为M184V(0.7%)和K103N(1.8%)。22例(3.6%)至少对任意一类逆转录酶抑制剂产生耐药,其中,对NRTI耐药4例(0.7%)、NNRTI耐药14例(2.3%),同时产生耐药4例(0.7%);对蛋白酶抑制剂未产生耐药。NNRTI治疗前耐药率高于NRTI(2.9%比1.3%;χ^(2)=3.929,P=0.047)。拉米夫定、齐多夫定、替诺福韦、阿巴卡韦、利匹韦林、依非韦伦、奈韦拉平和洛匹那韦/利托那韦的治疗前耐药所占比例分别为0.8%、0.3%、0.7%、1.0%、1.3%、2.8%、2.9%和0。结论 CRF01_AE、CRF07_BC和CRF08_BC为2020年广西新报告≥50岁男性HIV感染者主要流行毒株,其治疗前耐药仍处于低度流行水平。 展开更多
关键词 人类免疫缺陷病毒 基因亚型 治疗前耐药
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2388例女性14种高危型HPV基因亚型感染状况及HPV型别与宫颈病变相关性分析 被引量:2
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作者 周庆云 王星 +2 位作者 郝广曙 张登才 李波 《甘肃医药》 2023年第5期417-419,共3页
目的:研究2388例女性感染14种高危型HPV的年龄、基因亚型分布,对比不同HPV感染类型与相应的宫颈病理活检结果,为女性宫颈癌筛查制定更科学的筛查流程提供理论依据,并为后续治疗提供参考。方法:采用Cobas 4800核酸提取和扩增仪,对2388例... 目的:研究2388例女性感染14种高危型HPV的年龄、基因亚型分布,对比不同HPV感染类型与相应的宫颈病理活检结果,为女性宫颈癌筛查制定更科学的筛查流程提供理论依据,并为后续治疗提供参考。方法:采用Cobas 4800核酸提取和扩增仪,对2388例女性宫颈脱落细胞进行14种高危型HPV基因亚型检测,并对189例高危型HPV阳性结果人群进行宫颈组织病理活检,两者进行相关性分析,研究不同型别HPV与宫颈病变程度的相关性。结果:各年龄组间HR-HPV感染阳性率差异无统计学意义(P>0.05),随着病变程度增加,HPV16型感染率升高,差异有统计学意义(P<0.05),混合型感染随着病变程度增加,感染率下降,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:感染HPV16型是宫颈癌前病变及宫颈癌的重要因素,对其单独分型具有重要的临床价值。 展开更多
关键词 HPV检测 基因亚型 宫颈病变
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甘肃某牛场隐孢子虫引起犊牛腹泻的虫种鉴定及亚型分析 被引量:2
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作者 马忠 马燕玲 +5 位作者 张继维 马玉珍 王树青 徐万祥 王春梅 王铭 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第3期164-172,共9页
新生犊牛腹泻(NCD)严重影响犊牛的健康,给养殖业造成巨大的经济损失。隐孢子虫病是引起NCD的重要原因之一,但是由隐孢子虫引起的NCD疾病暴发的报道还非常少。2022年9月,甘肃省武威市某奶牛场1月龄以内犊牛发生严重腹泻,并伴有部分犊牛... 新生犊牛腹泻(NCD)严重影响犊牛的健康,给养殖业造成巨大的经济损失。隐孢子虫病是引起NCD的重要原因之一,但是由隐孢子虫引起的NCD疾病暴发的报道还非常少。2022年9月,甘肃省武威市某奶牛场1月龄以内犊牛发生严重腹泻,并伴有部分犊牛死亡。为弄清犊牛腹泻是否由隐孢子虫引起,本研究对该牛场1月龄以内腹泻和非腹泻犊牛分别采集10份样品,应用显微镜检和套氏PCR方法对犊牛粪便样品进行了检测。结果显示,应用显微镜检方法检出10份隐孢子虫阳性样品;应用PCR方法检出14份阳性样品,包括8份腹泻样品和6份非腹泻样品。PCR方法隐孢子虫总的感染率为70.0%,其中腹泻犊牛的感染率为80.0%,非腹泻犊牛的感染率为60.0%。对所有PCR阳性样品进行测序分析,均为微小隐孢子虫。进一步对14份C.parvum阳性样品进行gp60基因扩增和亚型鉴定,13份样品测序成功,均为IIdA19G1亚型。本研究首次在甘肃省发现隐孢子虫引起犊牛腹泻的暴发,研究结果对深入了解该地区犊牛腹泻的病因,做好腹泻疾病的精准防控具有重要意义。 展开更多
关键词 微小隐孢子虫 犊牛 甘肃 腹泻 基因亚型
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基因Ⅶ.2亚型新城疫病毒反转录数字PCR检测方法的建立与应用
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作者 王静静 克军宏 +3 位作者 于晓慧 彭真奇 邢安琪 刘华雷 《中国动物检疫》 CAS 2023年第5期82-87,共6页
基因Ⅶ型新城疫病毒(NDV)是严重危害我国家禽养殖业健康发展的主要病原之一。国家新城疫参考实验室监测表明,目前国内NDV流行毒株已由基因Ⅶ.1.1亚型转变为Ⅶ.2亚型。为实现基因Ⅶ.2亚型NDV的快速检测和精准定量,针对其国内流行毒株F基... 基因Ⅶ型新城疫病毒(NDV)是严重危害我国家禽养殖业健康发展的主要病原之一。国家新城疫参考实验室监测表明,目前国内NDV流行毒株已由基因Ⅶ.1.1亚型转变为Ⅶ.2亚型。为实现基因Ⅶ.2亚型NDV的快速检测和精准定量,针对其国内流行毒株F基因保守区域设计了特异性引物和探针,建立了一种可快速检测基因Ⅶ.2亚型NDV的反转录数字PCR(RT-dPCR)方法,并评估了该方法的敏感性、特异性和重复性。结果显示:建立的RT-dPCR方法检测下限为1.30 copies/μL,敏感性较高;特异性强,与基因Ⅵ型、Ⅻ型NDV以及其他常见禽病病毒(禽流感病毒、鸡传染性支气管炎病毒、传染性喉气管炎病毒和禽腺病毒)无交叉反应;重复性试验变异系数为2.6%,小于3%,重复性好。利用本方法对从活禽市场采集的200份鸡口咽/泄殖腔拭子样品进行检测,发现检测结果与病毒分离鉴定结果一致。结果表明,本研究建立的RT-dPCR方法具有良好的敏感性、特异性、重复性和准确性,可用于基因Ⅶ.2亚型NDV的快速检测和精准定量,同时也为其核酸标准物质的研制奠定了基础。 展开更多
关键词 新城疫病毒 基因Ⅶ.2亚型 反转录数字PCR 性能评估
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乌鲁木齐市男性尿道炎患者人乳头瘤病毒感染基因亚型分布特点 被引量:1
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作者 张天一 马筱洁 +4 位作者 王黎 刘健 周亚萍 马莉 伏建峰 《中国性科学》 2023年第9期45-48,共4页
目的检测分析乌鲁木齐市男性尿道炎患者人乳头瘤病毒(HPV)感染情况及其基因亚型分布特点。方法选取2018年9月至2021年12月新疆军区总医院诊治的男性尿道炎患者作为研究对象,获取其分泌物标本,采用聚合酶链反应-反向点杂交法进行HPV-DNA... 目的检测分析乌鲁木齐市男性尿道炎患者人乳头瘤病毒(HPV)感染情况及其基因亚型分布特点。方法选取2018年9月至2021年12月新疆军区总医院诊治的男性尿道炎患者作为研究对象,获取其分泌物标本,采用聚合酶链反应-反向点杂交法进行HPV-DNA分型检测。结果673例受检者中268例检测为HPV阳性,总感染率为39.82%。在阳性标本中,共检出22种基因亚型,前6位的HPV基因亚型分别为HPV6(27.14%)、HPV11(17.08%)、HPV16(9.30%)、HPV52(5.78%)、HPV51(5.03%)和HPV58(4.77%)。不同年龄段HPV感染者中,20~<40岁感染191例(71.27%)。不同感染类型中,单一亚型感染160例(59.70%),2种亚型感染78例(29.10%),3种及以上亚型感染30例(11.20%),单一亚型感染明显高于多重亚型感染。在多重亚型感染中,以高低危混合感染为主。结论新疆乌鲁木齐市男性尿道炎患者HPV感染高发于20~<40岁年龄段,低危感染亚型以HPV6、11为主,高危感染亚型以HPV16、52、51、58为主。 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 尿道炎 基因亚型 男性
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淮北市HCV感染者基因亚型分布特征及1b型天然耐药突变分析
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作者 木朝宇 张晓梅 +2 位作者 范德胜 刘培明 姚慧琳 《蚌埠医学院学报》 CAS 2023年第2期260-263,共4页
目的:分析淮北市HCV感染病人基因亚型分布特征及1b型天然耐药突变情况,为HCV临床抗病毒治疗和感染防控提供依据。方法:选取2019-2022年就诊于淮北矿工总医院住院的HCV感染者(未经任何DAAs治疗)HCV-RNA阳性血清样本,抽提RNA后逆转录,采... 目的:分析淮北市HCV感染病人基因亚型分布特征及1b型天然耐药突变情况,为HCV临床抗病毒治疗和感染防控提供依据。方法:选取2019-2022年就诊于淮北矿工总医院住院的HCV感染者(未经任何DAAs治疗)HCV-RNA阳性血清样本,抽提RNA后逆转录,采用巢式PCR扩增NS5B、NS5A及NS3/4A区域基因序列,产物送交测序公司测序。采用Mega11.0软件对测序结果进行序列比对分析。结果:结果HCV 1b型(68.63%)为主要亚型,2a型次之(29.41%),此外检出3a型2例(1.96%)。HCV亚型的分布与性别、年龄无明显相关(P>0.05),1b型多见于≥55岁年龄组中。RASs主要类型为:NS5B区C316N(100.00%);NS5A区Q54H(40.47%),Y93H(19.05%);NS3/4A区Q86P(30.88%),I71V+Q86P(19.12%),V170I+Q86P(14.71%)及T72I/A+Q86P(13.24%)。其中突变频率较高的RASs依次为:C316N(100.00%)、Q54H(60.00%)、Q86P(53.78%)、Y93H(33.33%)、I71V/S(15.97%)。结论:淮北市HCV以1b亚型为主,2a型次之,首次检出3a型。1b型天然耐药突变以NS3/4A区为主,NS5A区次之,NS5B区较单一。提示HCV感染者DAAs治疗前应进行亚型及RASs的检测。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒感染 耐药相关突变 基因亚型
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鲁西地区门诊男性就诊者人乳头瘤病毒基因亚型分析
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作者 程尚 赵士凯 +1 位作者 赵昌波 赵守国 《中国性科学》 2023年第8期16-19,共4页
目的了解鲁西地区男性人乳头瘤病毒(HPV)感染和基因亚型分布情况。方法采用HPV基因分型技术对鲁西地区1489例男性患者进行HPV检测,阳性者进行基因亚型分析。结果1489例患者中,HPV总阳性率为69.64%。阳性患者多为单一感染,其中尖锐湿疣者... 目的了解鲁西地区男性人乳头瘤病毒(HPV)感染和基因亚型分布情况。方法采用HPV基因分型技术对鲁西地区1489例男性患者进行HPV检测,阳性者进行基因亚型分析。结果1489例患者中,HPV总阳性率为69.64%。阳性患者多为单一感染,其中尖锐湿疣者占65.57%,多为单纯低危型感染,而无症状者多为单纯高危型感染。基因亚型分析提示低危型以6、11型为主,高危型以16、59、52为主。二、四、九价疫苗覆盖率分别为4.63%、47.64%及54.97%。不同年龄阶段均存在HPV感染,感染阳性率最高的年龄段为>60岁及≤20岁。结论在我国经济欠发达地区,男性HPV感染率较高,且各年龄段均有涉及。明确本地区男性HPV感染情况和亚型分布,加强HPV筛查及宣传工作,对本地区男性相关疾病及女性伴侣的宫颈癌等疾病的防治都具有重要意义。 展开更多
关键词 男性 人乳头瘤病毒 尖锐湿疣 基因亚型 鲁西地区
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妇科门诊女性HPV感染率和基因亚型分布与宫颈病变关系研究 被引量:1
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作者 郭慧芳 李兴坚 +2 位作者 张攀 何丰利 刘正华 《实用妇科内分泌电子杂志》 2023年第3期12-14,共3页
目的研究妇科门诊女性人乳头瘤病毒(HPV)感染率和基因亚型分布与宫颈病变之间的关系。方法选取576例接受HPV检测、宫颈薄层液基细胞学(TCT)检查的女性病例,针对检查异常者开展阴道镜活检确诊,统计HPV感染率,对HPV亚型分布情况进行统计,... 目的研究妇科门诊女性人乳头瘤病毒(HPV)感染率和基因亚型分布与宫颈病变之间的关系。方法选取576例接受HPV检测、宫颈薄层液基细胞学(TCT)检查的女性病例,针对检查异常者开展阴道镜活检确诊,统计HPV感染率,对HPV亚型分布情况进行统计,分析高危型HPV分布与宫颈病变之间的关系。结果576例患者中确定存在HPV感染者共计123例,HPV感染率为21.35%;HPV感染者的基因亚型分布中HPV 52、HPV 16、HPV 58的感染率占前3位。患者中存在宫颈病变者共计28例,占比4.86%,其中宫颈上皮内瘤变(CIN)Ⅰ病例10例,CINⅡ病例9例,CINⅢ病例6例,鳞状细胞癌(SCC)病例3例;相比CINⅠ而言,CINⅡ、CINⅢ、宫颈癌的HPV感染率更高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论妇科门诊女性HPV感染率相对较高,高危型HPV感染与宫颈病变等级存在密切关系,临床加强HPV感染人群的早期宫颈病变筛查极为重要。 展开更多
关键词 妇科门诊 人乳头瘤病毒感染 基因亚型分布 宫颈病变
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六株鹅源新城疫病毒全基因序列分析及对雏鹅的致病性
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作者 张丹琳 王超 +2 位作者 朱婉君 张济培 陈济铛 《广东畜牧兽医科技》 2024年第5期61-69,共9页
为了解广东地区鹅源新城疫病毒(NDV)遗传进化及致病性情况,于2019年从广东肇庆、佛山地区疑似NDV感染鹅的组织病料中进行鹅源NDV分离鉴定并选取一株MDT最小的毒株进行病毒对雏鹅的致病性试验。结果显示:共分离6株Ⅻb亚型鹅源NDV毒株,6... 为了解广东地区鹅源新城疫病毒(NDV)遗传进化及致病性情况,于2019年从广东肇庆、佛山地区疑似NDV感染鹅的组织病料中进行鹅源NDV分离鉴定并选取一株MDT最小的毒株进行病毒对雏鹅的致病性试验。结果显示:共分离6株Ⅻb亚型鹅源NDV毒株,6株毒株间核苷酸和氨基酸相似性最高,但与基因Ⅶ型、La Sota等常用疫苗株相似性较低。F蛋白和HN蛋白部分功能位点氨基酸残基出现不同程度的变异。致病性试验结果表明基因Ⅻb亚型Goose/GD/F424/2019毒株对雏鹅有较强的致病性,死亡率高达87.5%,并出现脾脏肿大,呈“树枝状”样充血、腺胃乳头出血、十二指肠黏膜出血、胰脏变性出血、脑组织充血及水肿等典型病理变化症状。研究表明:从广东地区分离的6株鹅源NDV均是Ⅻb亚型且对雏鹅有较强的致病性,为进一步研究广东地区鹅源NDV流行、进化及相关疾病的防控奠定基础。 展开更多
关键词 鹅源新城疫病毒 基因Ⅻb亚型 遗传进化分析 致病性试验
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捻转血矛线虫疫苗候选抗原H11亚型基因的序列结构及启动子活性分析 被引量:1
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作者 杨怡 段丽君 +3 位作者 张红丽 周前进 陈学秋 杜爱芳 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期929-936,共8页
捻转血矛线虫微粒体氨肽酶H11是有效的疫苗候选抗原,其重组蛋白免疫保护效果可能与基因亚型相关。为分析H11亚型基因的序列结构及启动子活性,本研究扩增并鉴定了H11-1、H11-2亚型基因的开放阅读框(2 937,299 bp),发现其与已知H11 (H11-3... 捻转血矛线虫微粒体氨肽酶H11是有效的疫苗候选抗原,其重组蛋白免疫保护效果可能与基因亚型相关。为分析H11亚型基因的序列结构及启动子活性,本研究扩增并鉴定了H11-1、H11-2亚型基因的开放阅读框(2 937,299 bp),发现其与已知H11 (H11-3)、H11-4亚型氨基酸序列高度同源,具有保守的糖基化位点、跨膜区及微粒体氨肽酶活性中心锌指基序。分段扩增获得了H11-1、H11-2、H11-4亚型基因DNA序列(11 698,17 995,19 804 bp),比对分析发现,与H11(H11-3)基因结构相似,H11-1、H11-2亚型基因均含25个外显子和24个内含子,通过典型的GT…AG结构剪接,对应的外显子大小基本一致,内含子大小各异,同源性低;推测各亚型不是由同一基因选择性剪接形成,但剪接模式相同。运用基因步移技术扩增鉴定了H11-1、H11-2、H11-4亚型基因5′侧翼区(4 606,3 465,2 361 bp),利用pPD95.77载体构建了重组表达载体,通过显微注射将其导入秀丽线虫观察其启动转录活性,结果表明H11-4 5′侧翼区可启动GFP在秀丽线虫除胚胎以外的各时期表达,且表达集中于虫体肠道起始和末端;未检测到H11-1或H11-2 5′侧翼区启动的GFP表达,推测其转录活性或GFP表达较弱。本研究为后续探明H11基因各亚型生物学功能、参与免疫保护机制及高效重组疫苗研究奠定了基础。 展开更多
关键词 捻转血矛线虫 H11亚型基因 5′侧翼区 启动转录活性
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大鼠代谢型谷氨酸受体1亚型基因片段的克隆及其在小脑的表达 被引量:1
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作者 袁芳 王忠诚 +5 位作者 张亚卓 杨慧 高殿帅 首都医科大学2000级博士研究生 蔡青 徐群渊 《中华神经外科杂志》 CSCD 北大核心 2003年第1期43-46,共4页
目的 克隆大鼠代谢型谷氨酸受体 1亚型 (mGluR1 )基因特异片段 ,制备cRNA探针。方法 从Wistar大鼠小脑中提取总RNA ,以RT PCR方法得到预期的 599bp条带 ,将这一片段克隆到pGEM Teasy载体上 ,经酶切鉴定正确后送测序。将重组质粒经限... 目的 克隆大鼠代谢型谷氨酸受体 1亚型 (mGluR1 )基因特异片段 ,制备cRNA探针。方法 从Wistar大鼠小脑中提取总RNA ,以RT PCR方法得到预期的 599bp条带 ,将这一片段克隆到pGEM Teasy载体上 ,经酶切鉴定正确后送测序。将重组质粒经限制性内切酶酶切制备成线性模板 ,通过体外转录的方法合成地高辛标记的mGluR1cRNA正义及反义探针。取成年Wistar大鼠小脑组织进行原位杂交实验 ,以检测探针的可靠性。结果 测序证实用RT PCR的方法获得了mGluR1基因特异片段 ,成功地构建了pGEM TmGluR1重组质粒。根据斑点杂交实验结果计算出正义、反义探针浓度分别为 1 0ng/ μl及 30ng/ μl。原位杂交实验的结果显示 ,用mGluR1反义探针进行杂交的阳性信号主要分布在大鼠小脑蒲肯野氏细胞胞浆 ,用正义探针杂交无阳性信号。结论 本实验克隆了mGluR1基因特异片段 ,并制备了cRNA探针 ,用大鼠小脑进行的原位杂交实验显示 ,此探针灵敏度高 。 展开更多
关键词 大鼠 代谢型谷氨酸受体1 亚型基因片段 小脑 RT-PCR CRNA探针 基因克隆 原位杂交 基因表达 脑损伤
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