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白鲜皮“异病同治”皮炎、湿疹和银屑病的作用机制预测 被引量:4
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作者 邓嘉林 钱亚云 杨妞妞 《实用临床医药杂志》 2023年第15期108-114,119,共8页
目的通过网络药理学和分子对接技术分析白鲜皮“异病同治”皮炎、湿疹、银屑病的分子靶点及其相关作用机理。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选白鲜皮的主要活性成分,并运用STP数据库预测有效成分的作用靶点。借... 目的通过网络药理学和分子对接技术分析白鲜皮“异病同治”皮炎、湿疹、银屑病的分子靶点及其相关作用机理。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选白鲜皮的主要活性成分,并运用STP数据库预测有效成分的作用靶点。借助TTD、OMIM、DrugBank、GeneCards、DisGeNET数据库获取治疗皮炎、湿疹、银屑病的有关靶点,借助Venny软件获取皮炎、湿疹、银屑病的相同靶点以及与白鲜皮有效成分作用靶点的交集靶点。利用Cytoscape绘制网络图,STRING数据库构建白鲜皮治疗皮炎、湿疹、银屑病的相同靶基因的蛋白互作网络图。运用Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并运用R语言进行可视化处理。通过Discovery Studio 2019 Client、AutoDock Tools、PyMOL进行分子对接和可视化。结果经筛选白鲜皮有效成分15个,与皮炎、湿疹、银屑病相同靶点的交集靶点共64个。白鲜皮活性成分治疗皮炎、湿疹、银屑病的核心靶点依次为肿瘤坏死因子(TNF)、Toll样受体4(TLR4)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、信号转导和转录激活因子1(STAT1)等。核心通路为高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、白细胞介素17(IL-17)、酪氨酸激酶-信号传导及转录活化因子(JAK-STAT)信号通路等。结论白鲜皮可能通过IL-17、JAK-STAT、AGE-RAGE等多个通路作用于TNF、TLR4、VEGFA等多个靶点,从而在皮炎、湿疹、银屑病中起到抗炎止痒的作用。 展开更多
关键词 白鲜皮 皮炎 湿疹 银屑病 网络药理学 分子对接 交集靶点 信号通路
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川龙抑癌汤治疗前列腺癌的作用机制探讨 被引量:2
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作者 李文骥 胡芳 徐魏 《实用临床医药杂志》 CAS 2022年第5期18-23,29,共7页
目的基于网络药理学探讨川龙抑癌汤治疗前列腺癌的作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选灵芝、莪术、红花、三七粉、大青叶的有效成分,利用PubChem、Swiss ADME在线网站筛选川足、地龙的有效成分,并通过SwissTargetPrediction在线网站预... 目的基于网络药理学探讨川龙抑癌汤治疗前列腺癌的作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选灵芝、莪术、红花、三七粉、大青叶的有效成分,利用PubChem、Swiss ADME在线网站筛选川足、地龙的有效成分,并通过SwissTargetPrediction在线网站预测上述中药活性成分的潜在靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb数据库检索出前列腺癌的相关靶点,运用Venn在线软件获取川龙抑癌汤与前列腺癌的共同靶点,通过Cytoscape 3.8.2软件构建“主要成分-交集靶点”网络图,使用STRING数据库绘制交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,利用Hiplot在线工具对有效作用靶点进行基因本体(GO)功能分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,运用分子对接技术对主要活性成分与关键靶点进行分子对接。结果共获得川龙抑癌汤活性成分149个,川龙抑癌汤与前列腺癌的交集靶点486个,关键靶点包括蛋白激酶(AKT1)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)、细胞肿瘤抗原基因(TP53)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)和血管内皮生长因子A(VEGFA)等,主要成分包括槲皮素、姜黄素和β-谷甾醇等,GO功能分析主要包括转录因子活性、酶活性、受体活性及生物合成过程的调控等方面。KEGG通路分析涉及癌症蛋白聚糖通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、C型凝集素受体信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、TNF信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、程序性细胞死亡蛋白-1/程序性死亡配体-1(PD-1/PD-L1)通路及前列腺癌等癌症通路,分子对接结果显示主要活性成分与关键靶点之间具有很好的结合性。结论川龙抑癌汤治疗前列腺癌的作用是多成分、多靶点、多通路的,本研究为后续的分子生物学实验提供了理论基础。 展开更多
关键词 网络药理学 川龙抑癌汤 前列腺癌 作用机制 姜黄素 通路 交集靶点 蛋白互作(PPI)网络
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