根管感染中产甲烷古细菌基于mcrA序列的系统发育分析

目的:分析根管感染中产甲烷古细菌的多样性,建立基于功能基因--甲基辅酶M还原酶(methyl coenzyme M reductase,MCR)基因α亚基(mcr A)的系统发育树。方法:利用一对特异性引物选择性扩增感染根管中产甲烷古细菌的mcr A片段,在此基础上建立mcr A克隆文库。通过蓝白斑筛选的方法,筛选出阳性重组克隆子,进一步通过基因测序获得重组克隆子中的插入片段mcr A序列。利用Clustalx和Mega 4软件包分析mcr A序列,对其进行同源性比较和系统发育学分析。结果:4例根管样本的其中1例检出了产甲烷古细菌;构建了基于mcr A序列的系统发育树。随机选出的8个mcr A克隆片段高度同源,均为类口腔甲烷短杆菌序列型。结论:本例根管感染中产甲烷古细菌的多样性局限于类口腔甲烷短杆菌序列型。