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草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析
被引量:
2
1
作者
段盛文
刘正初
+3 位作者
郭刚
冯湘沅
郑科
成莉凤
《湖北农业科学》
北大核心
2009年第9期2052-2054,2098,共4页
通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系。通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16~23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片...
通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系。通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16~23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片段进行聚类分析。结果表明,8株菌株分别属于地衣芽孢杆菌、梭状芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌以及多粘类芽孢杆菌;基于16S rDNA序列与ITS-RFLP所获得的聚类结果基本一致,菌株1251与菌株1172-1聚为一类,其余聚为一类,但种内聚类存在一定的差异,可能与不同类型的序列进化程度有关,8株菌株的16SrDNA序列的相似性为78.66%;AluⅠ、HinfⅠ、Sau3AⅠ、TaqⅠ4种限制性内切酶对参试的8株草本纤维提取用产芽孢菌株的ITS进行酶切,各获得0~4条100~440bp的酶切产物。
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关键词
草本纤维
产芽孢菌株
PCR-16S
RDNA
ITS-RFLP
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职称材料
题名
草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析
被引量:
2
1
作者
段盛文
刘正初
郭刚
冯湘沅
郑科
成莉凤
机构
中国农业科学院麻类研究所
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2009年第9期2052-2054,2098,共4页
基金
国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA21201-14)
文摘
通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系。通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16~23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片段进行聚类分析。结果表明,8株菌株分别属于地衣芽孢杆菌、梭状芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌以及多粘类芽孢杆菌;基于16S rDNA序列与ITS-RFLP所获得的聚类结果基本一致,菌株1251与菌株1172-1聚为一类,其余聚为一类,但种内聚类存在一定的差异,可能与不同类型的序列进化程度有关,8株菌株的16SrDNA序列的相似性为78.66%;AluⅠ、HinfⅠ、Sau3AⅠ、TaqⅠ4种限制性内切酶对参试的8株草本纤维提取用产芽孢菌株的ITS进行酶切,各获得0~4条100~440bp的酶切产物。
关键词
草本纤维
产芽孢菌株
PCR-16S
RDNA
ITS-RFLP
Keywords
herbaceous
sporeformers
PCR-16S rDNA
ITS-RFLP
分类号
Q939.124 [生物学—微生物学]
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析
段盛文
刘正初
郭刚
冯湘沅
郑科
成莉凤
《湖北农业科学》
北大核心
2009
2
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