微卫星用于凡纳滨对虾育种过程中亲权分析及遗传多样性的变化监测

利用7个微卫星标记分析了6个凡纳滨对虾家系的亲本（G0）及其后代（G1）的基因型分离情况，同时对G0和G1的所有座位期望杂合度进行配对比较分析，并且通过对G1群体每个位点的F-statistics分析检验群体的遗传分化，以期对凡纳滨对虾育种进行遗传监测。结果表明：共检测到44个等位基因。G0和G1的平均每个座位的等位基因数目分别为6．14和6．27，平均期望杂合度为0．786和0．733，平均多态性信息含量为0．709和0．695。7个微卫星座位的累计排除概率为0．99，并且在有亲本存在的情况下，能够将6个家系分开。G0与G1的所有座位期望杂合度的配对比较分析结果表明G0平均期望杂合度要显著高于G1（P〈0．01）。G1各座位的遗传分化指数FST，在0．2703～0．4654，平均分化系数为0．3584。说明亚群间属于高度遗传分化。最后，根据6个家系的遗传距离，利用UPGMA法对G1个体聚类分析，结果表明亲缘关系较近的家系A和B以及C和D的相似系数很高分别各聚为一类，E和F分别聚为一类。

微卫星多重PCR在水生动物亲权分析中的研究进展

微卫星标记作为共显性标记具有分布广泛、中性遗传的特点,在群体遗传结构分析和亲子鉴定(即亲权鉴定)方面已有了广泛应用,通过微卫星标记技术可以清楚有效地分析子代的遗传背景。本文就目前微卫星多重PCR在水生动物亲权关系分析、系谱认证方面的研究进展进行了综述。

应用微卫星标记分析野生中国明对虾的亲权关系

利用5个高度多态性的微卫星座位(Fc04、Fc06、Fc18、Fc24、Fc27),分析了不同年份中建立的10个野生中国明对虾家系中的雌性亲虾及其后代基因型分离的情况,表明每个家系中只有一个雄性野生中国明对虾对子代的遗传有贡献。从其中3个家系的雌性亲虾纳精囊中提取了雄虾精子DNA,微卫星标记显示各家系的子代个体均有一个等位基因与雄性亲虾的基因型相符,且符合孟德尔遗传规律,这为野生中国明对虾雌虾在繁殖季节一对一的繁殖行为提供了遗传学的证据。用UPMGA的方法随机对3个家系的40尾子代个体进行聚类分析,每个家系都能被单独聚成一类。上述工作表明微卫星标记在对虾育种中作为一种有效的亲子关系分析工具,在种群的遗传结构、亲缘关系、繁殖行为等方面具有广阔的应用前景。

尼罗罗非鱼(♀)×萨罗罗非鱼(♂)F_1家系亲权关系微卫星分析

利用尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）第2代遗传连锁图谱标记，对3组不同尼罗罗非鱼（♀）×萨罗罗非鱼（Sarotherodon melanotheron）（♂）杂交F1家系内亲权关系进行分析。结果显示，86个微卫星位点中共筛选出20个在尼罗罗非鱼、萨罗罗非鱼中存在差异的扩增位点，含13个种间特异性和7个共享带差异位点。尼萨杂交F1中，平均等位基因2.90，平均多态信息含量0.439，位点多态性较高。3个尼萨杂交F1家系组间遗传距离0.362~0.504，组内个体间遗传距离0.245~0.316，组内遗传距离明显小于组间。利用3个种间特异位点组合，可对3个不同家系组父、母本个体进行鉴别。通过对各组亲本与子代位点基因型分析，家系A、B和C组分别使用4、8和12个特异位点组合进行亲权鉴定，累积排除概率分别为99.99%、99.99%、99.91%，家系A、B组分别含3个半同胞家系，家系C组含2对非同胞或4个半同胞家系。

微卫星DNA标记在大口黑鲈亲权鉴定中的应用

【目的】探讨微卫星DNA标记在大口黑鲈(Micropterus salmoides)亲权鉴定中的可行性,为大口黑鲈家系选育的系谱精确鉴定和选育效果评价提供依据。【方法】选择12个多态信息含量较高的微卫星DNA位点,以人工选育建立的大口黑鲈5个全同胞家系为试验材料,采用Cervus 3.0进行亲权分析,并根据家系内个体间的遗传距离进行UPGMA聚类分析。【结果】所选的12个微卫星DNA多态位点在102个子代中的平均等位基因数(A)为3,平均观测杂合度(Ho)为0.594 8,平均期望杂合度(He)为0.545 7,平均多态信息含量(PIC)为0.475 9。Cervus3.0亲权分析表明,在置信度为95%时,使用12个和10个位点,模拟和实际分析的判别成功率分别为96%和98%,87%和91%;而置信度为99%时,分别为78%和92%,64%和86%;在置信度为99%和95%时,判别准确率皆在90%以上。从12个位点中挑选10个多态信息含量高的微卫星DNA位点,即可将102个子代完全准确地聚为5个群体。亲权分析结果与聚类分析结果一致。【结论】所选用的12个微卫星位点可用于大口黑鲈亲权鉴定研究,其判定成功率和准确率较高,结果可靠。

基于亲权鉴定的千岛湖社鼠家群遗传结构与亲缘关系特征研究

于2009年7月至2010年11月,对浙江千岛湖两个岛屿上的社鼠(Niviventer confucianus)种群进行标志重捕,并采用8个高多态性的微卫星位点,对两个岛屿的社鼠种群进行家群分析和亲权鉴定,探讨了社鼠家群的亲缘关系特征。结果显示,8个微卫星位点能可靠地对两个岛屿社鼠种群进行亲权鉴定,A岛已确定亲缘关系的71只社鼠分为12个家群,家群中的个体数最多达到19个,B岛已确定的49只社鼠个体共分为11个家群,家群中的个体数最多达到14个。家群内部成员之间的亲缘关系表现为配对繁殖的个体对间亲缘系数最小,揭示了社鼠倾向于选择亲缘关系较远的异性作为配偶。家群中雄性后代个体之间与雌性个体之间的亲缘关系相比,两岛表现情况相反,该结果暗示两岛屿上社鼠扩散行为可能有所不同。通过计算与同一雄性(或同一雌性)交配的个体间的亲缘系数,发现两个岛屿上的社鼠在与不同异性交配时也存在选择性,即避免选择亲缘关系较近的异性作为混交的对象。