344例健康人基因组中人内源性逆转录病毒K103、K11、K113和K115基因分布

目的 明确人内源性逆转录病毒(HERV)-K103、HERV-K11、HERV-K113和HERV-K115基因在我国健康人群基因组中的插入率,并分析其在不同民族、性别、年龄之间的分布。方法 选择2022年1月-2023年4月在宿迁市第一人民医院体检以及新疆某部队官兵及家属344名健康体检人群为研究对象。收集体检人群的外周血淋巴细胞富集液(PBMC)样本,提取基因组DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增及核酸电泳检测,判断样本基因组中HERV-K103、HERV-K11、HERV-K113和HERV-K115基因插入状况,分析其在不同民族、性别、年龄的分布是否存在差异。结果 在本研究所收集的344份健康人PBMC样本中,HERV-K103、HERV-K11、HERV-K113和HERV-K115插入率分别为18.31%、82.56%、31.98%和10.17%。HERV-K11在汉族的插入率为96.77%高于维吾尔族(45.83%)(P<0.05);HERV-K115在汉族的插入率为4.84%,低于维吾尔族(23.96%)(P<0.05);HERV-K103和HERV-K113的插入率在汉族和维吾尔族间无统计学差异。HERV-K103、HERVK11、HERV-K113和HERV-K115在不同年龄、性别之间的分布无统计学差异。结论 首次阐明HERV-K103、HERV-K11、HERV-K113和HERV-K115基因在我国汉族和维吾尔族健康人基因组中的频率分布,为进一步研究其与癌症、自身免疫性疾病和病毒感染的相关关系奠定基础。

新的含有11q13.5HERV-Wgag序列的内含子转录子的鉴定

目的:鉴定位于染色体11q13.5的含有HERV-Wgag序列的内含子转录子,探讨这一新的转录子对宿主基因PTD015选择性剪切的调控作用。方法:采用半巢式PCR和降落PCR扩增目的片段,克隆、测序、构建载体、转染JEG3细胞,采用实时PCR检测PTD015选择性剪切mRNA的水平。结果:鉴定了一个位于基因PTD015第二内含子上长1739bp的转录子,该转录子包含755bp11q13.5HERV-Wgag序列、527bp5′长末端重复序列和11q13.5HERV-W5′端457bp片段。此内含子反义转录子质粒的转染使JEG3细胞PTD015选择性剪切mRNA的水平明显降低。结论:源于基因PTD015第二内含子含有HERV-Wgag序列的反义转录子可调节宿主基因PTD015的选择性剪切。