新生儿人双埃柯病毒的检测及遗传特性分析

目的:了解人双埃柯病毒(human parechovirus,HPeV)在新生儿中的流行情况。方法:采集新生儿血液、粪便及鼻咽分泌物样本各95份,共计285份样本。将其中45份新生儿粪便样本分为5组,利用病毒宏基因组学方法进行文库构建,再经高通量测序检测HPeV。通过Geneious软件拼接获取HPeV全基因组,并对该毒株进行遗传特性解析。依据HPeV衣壳蛋白序列设计巢氏PCR引物,利用巢氏PCR对285份样本进行流行病学调查。结果:5个文库分别检测出248534、277432、398756、475408、130634条病毒序列,将原始数据上传至NCBI序列读长档案(sequence read archive,SRA)数据库;在文库newbornfeces41获得一株HPeV全基因组,经鉴定属于HPeV-1,重组分析显示该毒株由HPeV-1和HPeV-5重组产生,命名为newborn_zjlh;HPeV流行病学调查显示6份粪便样本阳性,血液及鼻咽分泌物样本检测均为阴性。结论:本研究显示HPeV可在新生儿中流行,主要是肠道感染。