基于RAPD的MCID法快速鉴定不结球白菜品种和遗传多样性分析

不结球白菜是长江中下游地区蔬菜周年供应的主栽品种,在种质资源保护和开发利用过程中,品种鉴定的难度随着市场上品种的增多而增加。利用基于DNA分子标记的人工绘制品种鉴别图(manual cultivar identification diagram,MCID)方法对笔者所在单位收集和保存的34份不结球白菜种质材料进行鉴定,同时进行NTSYS-pc遗传多样性分析。结果表明,利用筛选出的5对RAPD引物扩增出的多态性谱带即可构建34份不结球白菜的品种鉴定图,该图可以快速地筛选出某品种鉴定所需要的引物及需要参考的特征性谱带,具有较高的可操作性和实用性。聚类结果表明,34份不结球白菜种质材料与品种的聚类模式基本符合其农艺性状表现和遗传背景。研究结果可为不结球白菜品种鉴定和种质创新提供了科学依据,对不结球白菜种质资源的保护、研究及品种的早期鉴定具有重要意义。

基于MCID法的萝卜品种快速鉴定

应用基于DNA分子标记的人工绘制植物品种树形鉴别图法(Manual cultivar identification diagram,MCID)对来源于中国各地的20个萝卜品种进行了鉴定。结果表明,通过设计筛选出的4个RAPD随机引物和4次PCR扩增、统计凝胶电泳谱带,并人工绘制品种树形鉴别图,即可将20个萝卜品种在分子水平上进行快速区分。

利用基于SSR标记的MCID法鉴定72个柿地方品种

应用基于SSR分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(MCID,manual cultivar identification diagram)对来源于中国各地的72个柿地方品种进行了鉴定。结果表明,利用筛选出的6对引物进行PCR扩增、再统计凝胶电泳特征性谱带,最后人工绘制出品种树形鉴别图,可将72个柿地方品种在分子水平上进行快速区分。同时利用NTSYS-2.10e软件进行聚类分析,通过聚类分析树状图直观了解各品种间的遗传关系,在遗传相似系数为0.62左右时,可以分为3个类群。所得的MCID图比聚类树更具直观性与实用性,通过查阅MCID图可以快速获得鉴别这些地方品种所需要的引物以及依据的多态性谱带。这对柿种质资源的鉴定及促进柿产业的持续发展具有积极的意义。

基于SSR标记的MCID法鉴定中国自主选育的葡萄品种

葡萄品种鉴定是葡萄种质资源研究、保存和新品种保护的基础,是确保引种安全性和可靠性的重要保障。传统的鉴定方式难以有效地从繁多的葡萄品种中快速鉴别,且易受环境和主观因素的影响。本研究利用9对SSR引物,应用基于SSR分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(MCID,Manual cultivar identification diagram)对中国自主选育的308个葡萄品种进行鉴定。结果表明,用8对引物就可以在分子水平上对308个中国自育葡萄品种进行区分,根据鉴定图可快速地找到鉴别某两个品种所需的引物和多态性条带长度。同时对这些品种进行了遗传多样性分析,了解各品种间的遗传关系,研究表明308个品种可分为9个类群。这为今后我国葡萄品种鉴定、品种保护提供参考依据,对我国葡萄产业的发展具有积极影响。

基于SSR标记的MCID法鉴定72个酿酒葡萄品种

葡萄品种繁多,表型现象不明显,同名异物或同物异名现象时有发生,品种的精准鉴定异常重要。本文利用8对引物的SSR指纹图谱通过NTSYS-2.10e软件对来源于不同国家及地区的72个酿酒葡萄品种进行了聚类分析,所得的聚类树状图直观反映了各品种间的遗传关系。在遗传相似系数为0.52左右时,可以分为4个类群。同时也发现聚类结果无法显示特定的引物和多态性标记等可用于品种鉴定参考的信息,限制了分子标记在品种鉴定中的实际应用。本文同时利用基于SSR分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(MCID),通过筛选出的6对引物的多态性指纹图谱,绘制了这些品种的鉴定图(CID),成功将72个酿酒品种进行区分。从CID图上可以找到任意2个或多个品种间进行区分与鉴定的引物以及依据的多态性条带。这对酿酒葡萄品种鉴定、新品种保护及促进酿酒葡萄产业的持续发展具有重要作用。

DNA标记在植物品种鉴定上的应用现状

为了全面地了解DNA指纹在品种鉴定上的利用现状,更重要的是促进DNA指纹技术切实有效的应用于植物品种鉴定,本研究归纳了目前开发出的可用于植物品种鉴定的DNA指纹技术,指出已有的DNA指纹品种鉴定技术的优势与不足,总结了DNA指纹应用于品种鉴定的分析措施,并认为受限于缺乏可以将DNA指纹转化为植物鉴定信息的理想措施,所以DNA标记还未真正有效地应用于生产实践中,因此提出一种基于DNA指纹的人工绘制品种鉴定简图(MCID)法是很重要的,本研究也重点阐述了MCID法的实施过程。

基于SSR荧光标记的MCID快速鉴定13个湖北茶树品种

【目的】通过人工绘制品种鉴别图(Manual cultivar identification diagram,MCID)快速区分鉴别湖北茶树品种,为湖北茶树种质资源评价、品种保护及苗木纯度早期鉴定提供技术支持。【方法】以湖北省13个优良茶树品种为材料,利用30对均匀分布于遗传连锁图谱上的SSR荧光引物进行PCR扩增,并用荧光标记毛细管电泳检测扩增产物以筛选出核心引物,利用MCID法构建CID图谱。【结果】30对SSR引物共扩增出145个等位基因,各引物等位基因数为3~9个,平均每对引物为4.83个;共检测到194个基因型,各引物检测出的基因型为3~12个,平均每对引物6.47个;多态性信息量(PIC)为0.29~0.85,平均为0.58。13个茶树品种的Nei’s遗传距离为0.19~0.44。基于Nei’s遗传距离,采用Neighbor-Joining(NJ)法可将13个品种分为三大类(Nei’s遗传距离为0.16),结果表明地理来源相同的品种可能因为具有相似的遗传背景而聚在一起,也可能因为亲本来源不同而存在明显的遗传差异。利用筛选出的3对核心引物(TM547、TM552和TM107)可快速鉴别所有参试品种,通过MCID法构建的CID图谱可直观看出各参试茶树品种鉴定所需要的引物及其对应的基因型。【结论】基于SSR荧光标记的茶树品种MCID鉴定方法具有快速、准确、高效的特点,可用于湖北茶树良种知识产权保护、苗期鉴定及品种区分。

基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源

种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进行PCR扩增,应用MCID法构建冬瓜品种鉴定图。结果表明,利用7对引物扩增的特征性谱带能够将冬瓜品种在分子水平上区分开,同时能够构建40份冬瓜种质资源的品种鉴定图。利用Ntsys2.10e软件进行聚类分析,在遗传相似系数0.77处,将冬瓜资源分为3个类群。品种鉴定图能够快速地找到区分品种的引物,比聚类图更加直观。基于EST-SSR标记的MCID法是一种有效的冬瓜资源鉴定方法。本研究对冬瓜资源鉴定具有重要意义。

基于RAPD标记竹节参及其近缘植物的品种鉴别

目的建立竹节参及其近缘人参属植物种间快速鉴别体系。方法采用RAPD技术获得DNA指纹图谱,根据图谱中特异性条带,绘制人工绘制品种鉴定图(MCID)。结果从16条随机引物中筛选出能稳定扩增并且具有特异性条带的4条引物构建DNA指纹图谱,共扩增出46条带,其中多态性条带42条,多态性比率为91.30%。利用其中的多态性条带,绘制出图谱关系分析图,构成竹节参及其近缘植物的人工绘制品种鉴定图。结论该方法快速简单,结果直观可靠,为竹节参及近缘品种的初步鉴别提供了一种有效可行的方法。

巨峰系葡萄主栽品种的SRAP遗传多样性分析与MCID法快速鉴定

为探讨巨峰系葡萄种质的遗传关系,该研究利用SRAP标记对24个巨峰系葡萄品种进行遗传多样性分析,并应用人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法建立品种鉴定图(CID)。筛选出12对引物对24个巨峰系葡萄品种进行PCR扩增,共扩增出126个条带,其中多态性条带99条,多态性比率为78.57%。各引物观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon's信息指数(I)的平均值分别为1.7857、1.3581、0.2176和0.3388。24个巨峰系葡萄品种的遗传相似系数(Genetic Similarity Coefficient,GS)在0.6190~0.9603,变幅为0.3413。表明24个巨峰系葡萄品种间的遗传差异较小。利用UPGMA构建24个巨峰系葡萄种质资源的聚类树状图,在遗传相似系数为0.72处可将24个巨峰系葡萄品种分为3组,第Ⅰ组有22个品种,第Ⅱ组为奥林匹亚,第Ⅲ组为黑丰。利用6对引物扩增的多态性谱带构建了24个巨峰系葡萄品种的CID图,利用此图可以找出区分任意2个品种的引物,为巨峰系葡萄品种鉴定提供科学依据。