人猿超科和旧大陆猴7种高等灵长类FKN全基因序列的测定及进化分析

测定人猿超科(人、黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩和长臂猿)和旧大陆猴(猕猴和叶猴)7种高等灵长类FKN全基因序列,探讨其系统进化分析。用简并引物PCR(Degenerated PCR)法分别扩增FKN的3个外显子,其产物经琼脂糖凝胶回收、纯化后测序,然后用BioEdit软件剪切拼接FKN基因全序列,用DNAStar比对后比较基因和氨基酸序列同源性,Mega软件重构FKN基因进化树,应用Datamonkey分析FKN的负选择位点。序列分析发现人猿超科较旧大陆猴FKN基因除了有散在的点突变外,还有一明显的30bp的核苷酸缺失突变;人FKN基因序列与黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩、长臂猿、猕猴和叶猴的同源性分别是99.2%、98.4%、98.1%、96.5%、95.9%和93.8%,由此推导的氨基酸序列同源性分别是98.5%、98.0%、97.7%、94.7%、93.7%和90.5%;FKN基因进化树表明人与黑猩猩关系更近,FKN基因进化和通常认为的物种进化一致;Datamonkey分析结果显示FKN存在3个负选择位点53Q、84D、239N。成功获得人、黑猩猩、大猩猩、红毛猩猩、长臂猿、猕猴和叶猴7种高等灵长类物种FKN全基因序列,为后续探讨FKN在高等灵长类物种进化过程中免疫学功能演变及其结构与功能的关系奠定基础。

利用指骨弯曲程度推断化石人猿超科成员移动行为方式的新方法:以禄丰古猿为例

长久以来,指骨弯曲程度都被用来推断化石灵长类移动行为方式。此前已有一些方法被提出并用于定量化比较指骨弯曲程度,包括半径弯曲程度法(radius of curvature)、夹角法(included angle,IA)、标准化矩臂弯曲程度法(normalized curvature moment arm,NCMA)以及高精度多项式曲线拟合法(high-resolution polynomial curve fitting,HR-PCF)。然而,在对指骨弯曲程度进行定量化的过程中,这些方法都显示出了理论或技术上的局限性。因此,在运用这些方法之前,应当谨慎考虑其适用性和精确程度对分析结果所产生的影响。鉴于此,为了避免先前方法中存在的问题并更加精确地定量描述指骨弯曲程度,本文介绍了一种新方法作为替代。该方法基于对指骨侧视图背侧轮廓曲线几何形态测量学标志点数据的四阶多项式曲线拟合,称为几何形态测量学—多项式曲线拟合法(4th order polynomial curve fitting on geometric morphometric landmark data,GM-PCF)。它以标准化指骨曲线高度(normalized phalangeal curve height,NPCH)作为指骨弯曲程度的定量指标,并且可以将平均标准化指骨曲线进行可视化以用于其弯曲程度的直观对比。此外,它还可以提供在解释指骨弯曲程度的功能意义中非常关键的指骨(背侧轮廓曲线)长度比例信息。GM-PCF还能够分析化石中常见的不完整的指骨。为了检验新方法的适用性,我们从现生类人猿(anthropoids)中选取了15个涵盖灵长类大部分移动行为方式的类群作为参考样本,采用GM-PCF方法对其指骨弯曲程度进行了定量分析,结果表明标准化指骨曲线高度(NPCH)对灵长类移动行为方式有很好的指示意义,配合指骨曲线长度,还可以更进一步了解树栖四足行走(arboreal quadrupedalism)、悬垂(suspension)与摆荡(brachiation)等行为与灵长类体型大小的关系。作为个案,我们采用新方法对中国中新世的两种禄丰古猿(禄丰禄丰古猿Lufengpithecus lufengensis和蝴蝶禄丰古猿Lufengpithecus hudienensis)的指骨弯曲程度与参考样本进行了对比,并根据对比结果对其最为可能的移动行为方式偏好进行了推断。

人猿超科较旧大陆猴Fractalkine基因存在30bp缺失突变

观察Fractalkine从旧大陆猴向人猿超科进化过程中基因的进化规律,为研究Fractalkine基因的进化和免疫学功能演变关系提供理论和实验基础,先用简并引物PCR(Degenerated PCR)法分别扩增Fractalkine的3个外显子,其产物经琼脂糖凝胶回收、纯化后测序,然后用BioEdit,Clustal及DNAStar软件拼接、分析各物种间基因序列的差异.发现人猿超科较旧大陆猴Fracta-lkine基因除了有散在的点突变外,在其粘蛋白样区还有一明显的30个核苷酸的缺失突变,并对突变的可能机制及其对Fractalkine可能的功能影响进行讨论.

化石人猿超科成员指趾骨弯曲程度与位移行为

灵长类近节指趾骨的弯曲程度被认为是树栖性和悬垂位移行为的一个重要指标。几何形态测量学—多项式曲线拟合法(GM-PCF)提供了一种更加精准的指趾骨弯曲程度的定量化指标,以剔除指趾骨大小因素之后的标准化曲线高度(NPCH)作为其弯曲程度的指标,配合指趾骨的曲线长度,可以更加全面地定量分析灵长类指趾骨弯曲程度与位移行为的对应关系。尤其是涵盖灵长类大部分位移行为方式的15个类群、328个个体、5000余件指趾骨的参考样本,基本可以满足各种化石灵长类指趾骨弯曲程度分析和位移行为方式重建的需求。本文总结了发现有完整第Ⅱ-Ⅴ近节指趾骨化石材料的人猿超科成员的颅后骨骼形态适应及位移行为的重建,并运用GM-PCF对这些指趾骨化石的弯曲程度进行了对比分析,以通过指趾骨弯曲程度重建人猿超科成员的位移行为适应,并可为这些人猿超科成员位移行为的完整演化图景增加新的认识。

SRY基因在人猿超科和旧大陆猴中具有不同的进化规律

通过ＰＣＲ扩增、测序，得到了白臀叶猴和红面猴的ＳＲＹ基因全序列。结合现有的灵长类其他物种序列进行分析，验证了ＨＭＧ盒的保守性。通过构建系统发育树，比较旧大陆猴和人猿超科两个类群内和类群间ＨＭＧ盒侧翼序列Ｋａ／Ｋｓ的比率。有趣的是，人猿超科两物种比较呈现较高的Ｋａ／Ｋｓ比值，但在旧大陆猴中及旧大陆猴与狨猴间的Ｋａ／Ｋｓ比值显著低于人猿超科的，呈现很不同的格局。同时，对于ＨＭＧ盒序列，Ｋａ／Ｋｓ比值在人猿超科中也有明显的上升趋势。结果表明，人猿超科中异义替换率高于同义替换率的现象（正选择）不是灵长类中近缘物种间的现象，也不是灵长类中的系统偏差，而可能与基因的功能变化有关。同时，正选择作用于ＳＲＹ基因可能始于人猿超科分化的初期。

腊玛古猿和西瓦古猿的形态特征及其系统关系——下颌骨的形态与比较

本文通过禄丰腊玛古猿和西瓦古猿的下颌骨与现代大猿类和其它同时代的古猿及南方古猿类的下颌骨的比较得出:禄丰的两类古猿有不少特征与猩猩相似,因此它们可能与猩猩有较密切的关系,两类古猿可能是同一类型的雌雄个体。但另一方面,禄丰腊玛古猿又显示出一些与南方古猿相似的性状,因而另一种可能是腊玛古猿是与西瓦古猿不同的类型,它比西瓦古猿更接近于人猿的共同主干。

灵长类CCR5基因的序列进化与系统发育研究

对白颊长臂猿和白臀叶猴的β－趋化因子受体ＣＣＲ５基因进行全序列测定，并与人、黑猩猩、大猩猩，恒河猴，食蟹猴，豚尾猴，阿拉伯狒狒的ＣＣＲ５基因序列进行比较后发现，这些灵长类的ＣＣＲ５基因序列之间以及蛋白质序列之间具有很高的相似性。采用ＰＡＵＰ３．１．１（简约法）和ＭＥＧＡ１．０２（ＮＪ法）对ＤＮＡ序列数据进行聚类分析，得到了这几种灵长类的分子系统树。两种方法得到的分枝结构完全一致。

元谋蝴蝶、腊玛古猿头骨化石的初步研究

该文是对最近出土的元谋蝴蝶腊玛古猿头骨化石研究的第一篇论文。作者认为,这具古猿头骨化石在我国上新世地层中属首次发现,它在人类起源的研究中有着重要的学术价值,在对这具古猿头骨化石和其他古猿类化石以及现代大猿进行了对比研究之后,文章指出,元谋蝴蝶腊玛古猿比其他古猿更接近人类,它很可能是人类的直系祖先的代表类型。结合距今170万年的“元谋人”以及旧石器和新石器时期猿人向智人演变的发展线索可知,中国大陆上可能存在着从猿到人的整个发展进化系列,这个系列似乎连续不断,而中国南部很可能正是这条进化链中各个环节的代表。

能人：奥杜威月夜中耀眼的星

何以为人幻想这样的场景:深邃的月夜,星罗棋布的光点似乎伴随着某种节奏忽闪忽暗于天际,习习凉风下,你一人静坐于原野之上,此时我们最适合做一名哲学家来思考:我是谁?我从何处来?要到何处去?而百万年前的古人类,他们可曾同样也有属于自己的璀璨星月。或许大家多少了解一些生物进化论的知识,知道人是从一类古老的猿类演变而来的,与猿类同属于脊椎动物亚门下的哺乳纲灵长目。

《人类所在的动物目》评介

万物之灵的人类属于动物分类学中的灵长目。因而,灵长目不可避免地成为其中最富智慧的成员最感兴趣的一类动物。没有任何一类其他动物有这么多人来研究,也没有任何一种现生动物研究得象人类那样清楚。积累的研究成果形成了许多被广泛接受的习惯认识,也留下了许多争论的题目。现代科学技术的进步为深入地研究灵长类提供了许多新方法。这些新方法的应用,有时加强了固有的信念,有时使得在新领域的研究者向传统概念发出挑战。

《猿和人的祖先的新解释》

在古人类学领域中,人类的起源是最引人注意和感兴趣的问题。近百年来围绕着人类最早祖先的探索,经常发生激烈的争论。在本世纪七十年代的最后几年,人类起源的分子生物学观点和古生物学观点又产生了很大的分歧。 1980年7月2—4日,在召开第八届国际灵长类学会议的前夕,在意大利佛罗伦萨举行了一次题为“猿和人的祖先的中新世化石及新解释”的国际性小型学术讨论会,有人类学家、解剖学家、

云南元谋古人类考古发掘又一重大成果

今年三月,由云南省博物馆、楚雄州文管所、元谋县元谋人陈列馆联合组成的古人类考古发掘队,在元谋县小河地区蝴蝶梁子腊玛古猿化石出土的地方,又发掘出一具头骨化石。这具头骨化石出自离地表2.4米深的紫红色砂质土层中,与其共生的动物化石有长臂猿、上新猿、三趾马、大唇犀等近百种,据此可知头骨化石的时代为上新世,距今三、四百万年。头骨化石面颅保存良好,基本未变形。

消息和动态

一、中新世和上新世的人猿超科的各种类型在分类上传统总括为森林古猿亚科 (simons and Pilbeam,1965)。最近有人主张把它分为两个亚科(de Bonis,1983),更有人提出分为两个科和四个亚科(Gantt,1983)。目前大多数古人类学家认为中新世的人猿超科成员至少可分为两类,一类为从早中新世到中中新世的原始的牙齿釉质薄的各个种,分布于东非、欧洲、可能还有亚洲;