应用遗传算法相似性程序(GASP),以作用于I型人类免疫缺陷病毒(humanimmun-odeficiency virustype1,HIV-1)整合酶(IN)的二酮酸类(diketoacids,DKAs)抑制剂构建药效团模型.所选训练集分子均具有可靠的类药性特征及DKAs药效团特征.尝试将...应用遗传算法相似性程序(GASP),以作用于I型人类免疫缺陷病毒(humanimmun-odeficiency virustype1,HIV-1)整合酶(IN)的二酮酸类(diketoacids,DKAs)抑制剂构建药效团模型.所选训练集分子均具有可靠的类药性特征及DKAs药效团特征.尝试将抑制剂与药效团叠合后的构象和抑制剂与IN的对接构象进行叠合,得到药效团模型与分子对接构象中IN残基的相对位置,并基于抑制剂的药效团模型特征与周围IN氨基酸残基位置的匹配情况进行药效团特征的修改.所得最优药效团由1个疏水特征、3对氢键特征和1个氢键供体特征组成.该药效团的命中物质量(goodness of hit,GH)为0.56,产出率(Y)达63.6%,假阳性率(FP)为0.41%.该药效团具有较好的置信度,产出率较高而假阳性率较低,可用于数据库搜索发现新的具有DKAs药效团特征的活性化合物,也可为先导化合物的改造提供帮助.展开更多
文摘应用遗传算法相似性程序(GASP),以作用于I型人类免疫缺陷病毒(humanimmun-odeficiency virustype1,HIV-1)整合酶(IN)的二酮酸类(diketoacids,DKAs)抑制剂构建药效团模型.所选训练集分子均具有可靠的类药性特征及DKAs药效团特征.尝试将抑制剂与药效团叠合后的构象和抑制剂与IN的对接构象进行叠合,得到药效团模型与分子对接构象中IN残基的相对位置,并基于抑制剂的药效团模型特征与周围IN氨基酸残基位置的匹配情况进行药效团特征的修改.所得最优药效团由1个疏水特征、3对氢键特征和1个氢键供体特征组成.该药效团的命中物质量(goodness of hit,GH)为0.56,产出率(Y)达63.6%,假阳性率(FP)为0.41%.该药效团具有较好的置信度,产出率较高而假阳性率较低,可用于数据库搜索发现新的具有DKAs药效团特征的活性化合物,也可为先导化合物的改造提供帮助.
文摘整合酶抑制剂(integrase inhibitors,INSTIs)是治疗人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染者的最新一类药物。自2007年以来,已经有5种INSTIs上市:拉替拉韦(Raltegravir,RAL)、艾维雷韦(Elvitegravir,EVG)、多替拉韦(Dolutegravir,DTG)、比克替拉韦(Bictegravir,BIC)和卡博特韦(Cabotegravir,CAB),这些药物均获得美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)批准用于HIV感染者的起始抗逆转录病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)。与其他类型抗病毒药物相比,INSTIs具有更好的疗效性及耐受性,因此全球众多国家把包含INSTIs的治疗方案列为HIV抗病毒治疗的优选方案。近年来,随着INSTIs的广泛使用,一些研究数据表明,INSTIs可能存在一些不良反应,比如出现中枢神经系统症状、血脂代谢异常、体重增加、肝肾功能异常等。本综述总结了目前用于成人HIV感染者的INSTIs,强调了5种INSTIs的临床疗效及其不良反应。