宫颈癌及癌前病变的全基因组表达谱分析及下调表达候选基因鉴定

目的探讨维吾尔族妇女宫颈癌组织特异的下调表达基因谱,建立基于下调表达基因的宫颈癌早期诊断方法。方法收集维吾尔族妇女宫颈病变新鲜组织标本72例,其中宫颈鳞癌(cervical squamous cell carcino-ma,CSCC)25例,宫颈内上皮瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)22例,正常宫颈组织(normal cervix,NC)25例。选择20例组织标本(CSCC 7例,CINⅢ6例,NC 7例),提取组织RNA,通过人类全基因组表达谱芯片及生物信息分析,筛选宫颈癌及癌前病变(CIN)特异性下调表达候选基因。通过对CSCC与正常对照(NC)组的基因差异表达谱进行比较分析,选取10种差异表达倍数较高的候选基因,利用72例宫颈病变组织RNA,对10种下调表达候选基因的表达水平进行半定量RT-PCR鉴定,确定宫颈癌及癌前病变与该基因表达水平变化的关系。结果以2倍及以上表达差异为量化标准,有下调表达候选基因112种。72例宫颈病变组织RNA的半定量RT-PCR筛查分析,发现在CSCC与正常对照组之间,FOSB、DNASE1L3、SCARA5、EGR1、ABI3BP、FOS、KLF4、RHOB、IER2和ID4等10种下调表达基因的差异均有统计学意义(P<0.05)。DNASE1L3、EGR1、FOS、KLF4和IER2等5种基因的表达水平差异在CIN与正常对照组之间有统计学意义(P<0.05),但是除了FOS基因外,其余4种基因表达在CSCC与CIN组之间无差异(P>0.05)。结论维吾尔族妇女宫颈癌发病进程可能与一系列基因的下调表达密切相关,而DNASE1L3、EGR1、FOS、KLF4和IER2等5种基因的表达水平变化可能成为宫颈癌早期预警指标。

肾精亏虚证老年性痴呆差异基因表达分析

目的：基于人类全基因表达谱芯片高通量测序技术,分析肾精亏虚证老年性痴呆发病机制与差异基因表达的相关性。方法：在辽宁中医药大学附属医院和上海中医药大学附属龙华医院门诊选择60岁以上16例肾精亏虚证AD患者,对照组为同龄健康状态老年人12例,男女各半。清晨取静脉血5 m L,加入百泰克生产血液总RNA快速提取试剂盒,-70℃保存。统一干冰冷冻寄送北京博奥生物有限公司,利用Affymetrix公司的Human Gene Expression Array基因表达谱芯片,分析两组基因差异表达。结果：肾精亏虚证AD患者特异性表达的探针有308个,对应247个基因（FC≥1.5,q-value≤5%）,其中上调基因228个,下调基因19个。实时定量PCR验证了其中差异最大的9个基因的表达。结论：肾精亏虚证AD的发病机制之一与人类基因表达谱中9个差异表达基因调控有关。

“异病”(原发性骨质疏松症和老年性痴呆)“同证”(肾精亏虚证)患者差异表达基因的同源性分析

目的:通过人全基因表达谱芯片检测肾精亏虚证老年性痴呆和原发性骨质疏松症患者差异表达基因,对差异表达基因的同源性进行分析,探寻肾精亏虚证的分子生物学机制。方法:利用Affymetrix公司的Human Gene Expression Array基因表达谱芯片,分别检测16例肾精亏虚证原发性骨质疏松症和16例肾精亏虚证老年性痴呆患者的差异表达基因,分析两组差异表达的基因。结果:肾精亏虚证原发性骨质疏松症和肾精亏虚证老年性痴呆两组患者呈现131个共表达的差异基因,其中显著共表达的上调基因是S100P(S100钙结合蛋白P),显著共表达的下调基因是CX3CR1(C-X3-C趋化因子受体1)。结论:'肾精亏虚证'的老年性疾病(原发性骨质疏松症和老年性痴呆)患者差异基因表达存在'共性',提示'肾精亏虚证'的分子生物学基础与此'共性'有关,而这一'共性'主要体现在干细胞及其微环境相关的基因表达异常。