B族链球菌基因cpsG抑制人类宫颈癌细胞增殖的研究

目的 探讨B族链球菌基因cpsG影响人类宫颈癌细胞增殖的作用及其机制。方法 通过人工合成方法将cpsG的读码框序列(ORF)融合HA标签连接到质粒pLVX-mCMV-ZsGreen的限制性内切酶EcoRⅠ和BamHⅠ之间构建稳定表达cpsG人类宫颈癌细胞系。通过CCK8和集落形成实验进行生长曲线和集落形成能力分析,检测cpsG对人类宫颈癌细胞体外生长能力的影响。通过高通量RNA测序进行基因表达水平的定量分析,分析cpsG对人类宫颈癌细胞转录组学的影响,包括基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析和融合基因分析。结果 成功构建稳定表达cpsG人类宫颈癌细胞系之后,CCK8和集落形成实验显示cpsG基因抑制人类宫颈癌细胞体外生长。高通量RNA测序技术发现cpsG能够显著调控人类宫颈癌细胞部分基因的转录能力;GO分析和KEGG分析发现cpsG调节了人类宫颈癌细胞中部分基因的功能和信号通路。主要通过上调DSC3、IGFBP4、PLCL1和下调KRT6A、COL8A1、KRT17等基因的转录,从而抑制G蛋白偶联受体活性、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路和激活脂肪酸降解、p53信号通路。结论 cpsG可能影响了人类宫颈癌细胞中部分基因的融合,主要影响了B3GAT3-ATP8、LEPROT-LEPR、MRPS6-SON融合基因的形成。

B族链球菌基因cpsG影响人类宫颈癌细胞蛋白组学分析

目的探讨B族链球菌基因cpsG影响人类宫颈癌细胞蛋白组学。方法通过人工合成的方法将cpsG的读码框序列(ORF)融合HA标签连接到质粒pLVX-mCMV-ZsGreen的限制性内切酶EcoRI和BamHI之间构建稳定表达cpsG人类宫颈癌Hela细胞系。提取rLV组和rLV-cpsG组的总蛋白质,并通过12%SDS-PAGE电泳分析后,进行非标记(Label-free)蛋白质酶解肽段质谱分析。结果经蛋白质酶解肽段质谱分析显示,rLV组鉴定出3552个蛋白,rLV-cpsG组鉴定出3702个蛋白;与rLV组相比,rLV-cpsG组中上调的蛋白为229个,下调的蛋白为225个。GO分析结果显示,细胞组分主要包括膜完整性、细胞核、核糖体;分子功能主要包括蛋白结合、ATP结合、GTP结合、DNA结合、RNA结合;生物过程主要包括翻译、代谢、蛋白磷酸化、跨膜。KEGG通路富集分析显示,Cellular Processes通路主要包括细胞生长与凋亡(179个)、细胞活力(72个)、真核细胞群(140个)、转运和代谢(270个);Environmental Information Processing通路有膜转运(11个)、信号转导(324个);Genetic Information Processing通路有复制与修复(51个)、转录(133个)、翻译(328个);Human Diseases通路有癌症(258个);Metabolism通路有氨基酸代谢(110个)、糖代谢(144个);Organismal Systems通路包括内分泌系统(174个)。蛋白质-蛋白质相互作用结果显示,下调的蛋白互作网络主要包括prot1(MGST1)∶prot2(GCLC)、prot1(MGST1)∶prot2(MYH10)、prot1(MGST1)∶prot2(UGDH)、prot1(MGST1)∶prot2(GCLM)、prot1(PKP2)∶prot2(CDH2)、prot1(PKP2)∶prot2(A8K2T7);上调的蛋白互作网络主要包括prot1(SLC7A2)∶prot2(TXN)、prot1(SLC7A2)∶prot2(KYNU)、prot1(SLC7A2)∶prot2(MCAT)、prot1(SLC7A2)∶prot2(JUNB)、prot1(SLC7A2)∶prot2(BOLA2)、prot1(SLC7A2)∶prot2(FN1)。结论B族链球菌基因cpsG影响了人类宫颈癌细胞的蛋白组学,该研究为明确cpsG在人类宫颈癌细胞中发生作用机制及其临床应用提供了基础资料。

动物细胞系的染色体组型与遗传变异率分析

在建立国内首家犬、猫、猴、鼠传代细胞库，即７种动物肾细胞系（Ｆ－８１、ＣＲＦＫ、ＭＤＣＫ、Ｖｅｒｏ、Ｖｅｒｏ－２、ＭＡ－１０４、ＢＨＫ－２１）的种子库和工作库的基础上，通过细胞染色体组型、Ｇ带核型、染色体数目变异率、结构畸变率分析，了解７种细胞系传代培养不同代次的染色体变异情况。以相应的细胞株皮下接种裸鼠形成肿瘤实验、软琼脂细胞克隆形成率与植物凝集素作用下细胞凝集实验为对照，筛选出无致癌／致瘤性、符合细胞遗传学要求、无传染因子污染的细胞系（Ｆ－８１、ＣＲＦＫ、Ｖｅｒｏ、Ｖｅｒｏ－２）或极低致癌性的ＭＤＣＫ细胞系用于制苗，发现肿瘤细胞系高变异率株可在裸鼠体内快速选育成功。细胞系染色体遗传特征决定致瘤性质并具有种属特异性，得到一些１００％成瘤和１００％不成瘤的细胞株并探讨了与染色体组型的关系。对于肿瘤的发病机理及实验治疗，都是非常好的模型。一些细胞系不仅成瘤而且还可转移（致恶性横纹肌样瘤的ＢＨＫ－２１和Ｖｅｒｏ细胞株），其他致瘤细胞株只成瘤不转移或不明显转移。

核仁磷酸蛋白基因NPM1敲除人宫颈癌细胞株的构建及功能

目的通过CRISPR/Cas9系统定向敲除人类宫颈癌细胞(HELA)的核仁磷酸蛋白1基因(nucleophosmin1,NPM1),探讨敲除对HELA细胞生物学行为的影响。方法利用http://crispr.mit.edusgRNA在线设计工具设计sgRNA,通过T7E1系统筛选合适的sgRNA,将设计好的质粒通过转染的方式转入HELA细胞株,通过博来霉素(zeocin)抗生素进行筛选,通过Westernblot,PCR,基因测序等手段确认敲除细胞系的建立,通过免疫荧光的方式观察敲除细胞株。结果T7E1酶切PCR退火产物之后琼脂糖凝胶结果表明,CRISPR/Cas9系统对HELA细胞基因组进行了切割,并在同源重组时发生了碱基错配;Westernblot结果说明基因敲除后NPM1蛋白表达消失;基因测序的结果表明敲除细胞系建立的成功;免疫荧光的结果表明该细胞系出现异常核仁现象。结论NPM1敲除后细胞核仁异常,可能影响细胞正常生命进程。

Effects of trichostatin A(TSA)on growth and gene expression in HeLa cells

Objective： To investigate the expressions of p53, RB1, Fas, c-fos, Ras, EGFR mRNA in human cervical cancer （HeLa） cell in response to the trichostatin A （TSA）. Methods： We took count of HeLa cells in different incubation times with TSA （0.2μm/L）. The result indicated that HeLa cells changed evidently when HeLa cells were incubated for 36 h. Then, we investigated the genes expression （mRNA levels） of HeLa cells after treatment for 36 h using SYBR green real-time PCR. Results： We demonstrated that trichostatin A （TSA） could make human cervical cancer （HeLa） cell morphological change and induce HeLa cell apoptosis. Furthermore, the data suggest that TSA-induced down-regulation of p53, RB1, Fas, but upregulated c-fos gene expression after treatment for 36 h, and Ras, EGFR did not show obvious response to TSA treatments. Conclusion： TSA has different effects on gene expression.