冠心病与宏基因组和代谢组的关系研究进展

人类胃肠道主要是一个细菌生态系统(微生物组),其中包含>100万亿微生物细胞,而肠道微生物在很大程度上是相互依赖的,既依赖于彼此,也依赖于宿主,为了生存和与宿主的共生关系,需要来自其他成员的代谢支持。事实上,人类肠道相关微生物组组成的改变和代谢中伴随的功能改变与多种慢性疾病的发病机制有关。

多国科研人员对人类肠道细菌进行“基因普查”

欧盟资助的“人类肠道宏基因组计划”进行了一项迄今最大的肠道细菌基因研究。本次研究中的肠道细菌样本来源于100多名欧洲人，其中有的人身体健康，有的人肥胖超重，还有的患有肠道疾病，对他们肠道菌群的不同特点进行分析，将有助于对肠道疾病的研究和治疗。结果发现，肠道细菌共有300多万个基因，远远超出人类自身的2万多个基因，这些基因分属1000多种不同的细菌，每个人的肠道中都有其中至少100多种细菌。

人类肠道微生物研究进展

人类微生物组细胞数量是人体细胞的十倍,其中以肠道微生物最为丰富。基于高通量测序等技术的发展开启了人类肠道宏基因组及其与人类宿主关系的研究。研究显示,肠道微生物与机体的系统发育以及糖尿病、肥胖症等疾病密切相关,未来肠道微生物的相关信息有望成为诊断和治疗依据。

2013-23人类微生物组计划和人类肠道宏基因组学项目

2007年底，美国国立卫生研究院（NIH）宣布正式启动“人类微生物组计划”（HMP，又称“人类元基因组计划”），首阶段为期5年，投入I．15亿美元。2007年作为计划启动年，投入820万美元，随后4年，申请者通过竞争的方式获得资助。该计划由美国主导，由多个欧盟国家及日本和中国等十几个国家参加，由国际人类微生物组联盟（IHMC）协调。该计划将使用新一代DNA测序仪进行人类微生物组DNA的测序工作，目标是通过绘制人体不同器官中微生物元基因组图谱，解析微生物菌群结构变化对人类健康的影响。

人体肠道微生物结构变异的宿主遗传调控

虽然宿主遗传因素对肠道微生物多样性和特定类群丰度的影响已经得到很好的证实,但对于宿主遗传因素如何调节肠道微生物的遗传多样性却知之甚少。研究人员对来自荷兰4个队列的9 015名个体的人类遗传变异和肠道微生物结构变异之间的关联进行了Meta分析。引人注目的是,在分泌以GalNAc结尾的A型寡糖抗原的个体中,携带N-乙酰氨基半乳糖(GalNAc)利用基因簇的普氏粪杆菌中结构变异片段的存在率更高,而这一特征由人类ABO和FUT2基因型共同决定。研究人员还在坦桑尼亚队列中验证了这种关联。体外实验证明,GalNAc可用作携带GalNAc代谢途径的普氏粪杆菌的唯一碳水化合物来源。进一步的计算机和体外研究表明,其他ABO相关的物种也可以利用GalNAc,特别是产气柯林斯菌。GalNAc利用基因与宿主的心脏代谢健康相关,特别是在具有黏膜A抗原的个体中。总之,该研究结果表明,人类基因组和细菌宏基因组之间的基因关联可以为互惠的宿主-微生物组关系提供功能性见解。

人类微生物组测序与比较研究

人体微生物群系影响人类的健康,与人类的各种疾病,如肥胖、糖尿病、冠心病、结肠癌等的发生具有密切的关系。近年来,人类微生物组研究日益受到重视。综述人类微生物组的测序和比较研究进展。

大规模宏基因组研究的惊人发现

人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起到了再要的作用。许多疾病都与微生物组失衡有关。肠道菌群的菌种组成是因人而异的，而一项大规模宏基因组进一步揭示了微生物组惊人的复杂性。

我们是九分细菌一分人

我们不是人类,而是人类和微生物的结合体!这个结合体中,微生物与人体自身细胞的比例是9:1。

关注正在兴起的人类微生物组研究

近年越来越多的研究显示,人体健康与人体微生物有着密切的关系。人们逐渐认识到人体中的微生物是人体不可或缺的重要组成部分,在人体的健康和疾病中发挥着重要作用。为此,美国NIH启动了"人类微生物组计划"(Human Microbiome Project,HMP)、欧盟启动了"人类肠道宏基因组计划"(Metagenomics of the Human Intestinal Tract,MetaHIT),中国作为重要的成员也参与其中。本文综述了近年来国内外人体微生物组研究的进展,初步探讨了该领域的发展前景,并对我国开展人类微生物组研究提出了一些政策建议。