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人类肠道病毒74型山东地方株的全基因组序列分析
1
作者
刘晓林
陶泽新
+7 位作者
王海岩
刘尧
宋立志
纪峰
王同展
林小娟
王素婷
徐爱强
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期398-403,共6页
人类肠道病毒(HEV)74型是人类肠道病毒B组(HEV-B)的新成员。为了解其进化和重组特性,本研究对2005年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统分离到的人类肠道病毒74型山东地方株05293/SD/CHN/2005进行了全基因组序...
人类肠道病毒(HEV)74型是人类肠道病毒B组(HEV-B)的新成员。为了解其进化和重组特性,本研究对2005年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统分离到的人类肠道病毒74型山东地方株05293/SD/CHN/2005进行了全基因组序列测定和分析。与GenBank中的另2株HEV74全基因组序列比对,发现在5'NTR和3'NTR区有核苷酸缺失和插入;核苷酸序列的同源性分别为80.8%和80.6%,氨基酸同源性为96%和95.9%。山东株与原型株USA/CA75-10213间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.5%、80.0%和79.7%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.0%和96.2%;山东株与西藏株Rikaze-136间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.9%、78.8%和79.5%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.1%和95.7%。通过系统发生树和同源重组分析,发现该病毒可能与其他HEV-B组肠道病毒间发生重组。
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关键词
人类肠道病毒74型
基因组
重组
急性弛缓性麻痹
原文传递
题名
人类肠道病毒74型山东地方株的全基因组序列分析
1
作者
刘晓林
陶泽新
王海岩
刘尧
宋立志
纪峰
王同展
林小娟
王素婷
徐爱强
机构
山东大学公共卫生学院
山东省疾病预防控制中心山东省传染病预防控制重点实验室
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期398-403,共6页
基金
山东省2012年科学技术发展计划医药卫生项目(2012YD18044)
山东省医药卫生科技发展计划项目课题(2011QZ013)
文摘
人类肠道病毒(HEV)74型是人类肠道病毒B组(HEV-B)的新成员。为了解其进化和重组特性,本研究对2005年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统分离到的人类肠道病毒74型山东地方株05293/SD/CHN/2005进行了全基因组序列测定和分析。与GenBank中的另2株HEV74全基因组序列比对,发现在5'NTR和3'NTR区有核苷酸缺失和插入;核苷酸序列的同源性分别为80.8%和80.6%,氨基酸同源性为96%和95.9%。山东株与原型株USA/CA75-10213间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.5%、80.0%和79.7%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.0%和96.2%;山东株与西藏株Rikaze-136间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.9%、78.8%和79.5%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.1%和95.7%。通过系统发生树和同源重组分析,发现该病毒可能与其他HEV-B组肠道病毒间发生重组。
关键词
人类肠道病毒74型
基因组
重组
急性弛缓性麻痹
Keywords
Human enterovirus
74
Genome
Recombination
Acute flaccid paralysis
分类号
R373.2 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人类肠道病毒74型山东地方株的全基因组序列分析
刘晓林
陶泽新
王海岩
刘尧
宋立志
纪峰
王同展
林小娟
王素婷
徐爱强
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
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