HER-2低表达的非特殊型浸润性乳腺癌的临床病理特征与腋窝淋巴结转移的危险因素分析

目的探讨人类表皮生长因子受体2(HER-2)低表达的非特殊型浸润性乳腺癌(IBC)的临床病理特征,并分析腋窝淋巴结(ALN)转移的相关危险因素。方法回顾性分析2018年1月至2022年12月在绍兴市妇幼保健院确诊为HER-2阴性的111例非特殊型IBC患者的临床病理资料。其中HER-2免疫组化(IHC)判读为1+或2+且荧光原位杂交未扩增者归为HER-2低表达组(77例),HER-2 IHC判读为0者归为HER-20表达组(34例)。比较两组患者临床病理特征,并采用多因素logistic回归分析影响ALN转移的危险因素。结果HER-2低表达组患者年龄(52.8±10.9)岁、肿瘤大小通常≤2.5 cm、主要位于外上象限、以临床分期Ⅰ/Ⅱ期和组织学Ⅱ级为主。HER-2低表达组患者雌激素受体、孕激素受体、雄激素受体(AR)阳性率及Luminal B型占比均高于HER-20表达组,差异均有统计学意义(均P<0.05)。HER-2低表达组患者ALN转移与肿瘤大小(>2.5 cm)、AR阴性表达状态、Ki-67高表达(≥20%)、Luminal B型、临床分期(Ⅱ/Ⅲ期)均有关(均P<0.05);HER-20表达组患者ALN转移仅与临床分期(Ⅱ/Ⅲ期)有关(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示AR阴性表达状态和Luminal B型是影响HER-2低表达组患者ALN转移的危险因素(均P<0.05)。结论HER-2低表达患者具有一定的临床病理特征,激素受体表达状态和分子分型特点均有别于HER-20表达患者,其ALN转移关联的危险因素包括AR阴性表达状态和Luminal B型。

依硫磷酸调控人类基因表达谱的预测及生物信息学分析

本研究对依硫磷酸调控人类基因表达谱进行生物信息学分析,预测其可能具有的新生物学作用,为深入研究依硫磷酸的药理学作用及方法提供指导。以依硫磷酸(amifostine)为关键词,在互联网开放性数据库包括GEO、Affymetrix基因芯片表达数据库、人类基因组数据库(GenBank)、基因表达数据库SAGE、GeneCard、InterPro、ProtoNet、UniProt和BLOCKS中搜索,并进一步对筛选出的基因表达数据库进行有效性检验、基因表达差异和聚类分析。结果表明,仅在GEO数据库中筛选出1个与依硫磷酸相关的基因表达谱数据库(accession:GSE3212)。有效性检验及基因表达差异分析显示,依硫磷酸处理K562细胞后,分类全基因组仅2.14%(460/192000)的基因在转录水平的表达具有显著差异(p<0.01)。基因注释分析表明,460条差异基因中有139条为已知基因,其中77条表达上调,62条表达下调;13条为依硫磷酸处理后新表达的基因,5条为依硫磷酸处理后表达完全受抑的基因。聚类分析显示,139条基因分属11大类,主要生物学功能与造血及免疫调控、凋亡和细胞周期相关。结论 :生物信息学方法可用于依硫磷酸基因表达谱分析。依硫磷酸对人类基因表达谱具有调控作用,可能对造血及免疫、凋亡和细胞周期等生物学过程具有重要影响,需进一步在实验水平加以验证。

老年慢性心力衰竭患者血清人类母系表达基因3的水平与预后的相关性研究

目的探讨老年慢性心力衰竭(chronic heart failure,CHF)患者血清人类母系表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)表达与预后的相关性。方法回顾性分析2019年1月~12月保定市第二医院收治的118例CHF患者的临床资料。比较NYHA分级Ⅱ级和Ⅲ级患者的血清肌酸激酶同工酶(creatine kinase isoenzyme-MB,CKMB)、心肌肌钙蛋白I(cardiac troponin I,cTnI)、B型尿钠肽(B-type natriuretic peptide,BNP)、MEG3表达、左室收缩末期内径(left ventricular end-systolic dimension,LVESD)、左室舒张末期内径(left ventricular end-diastolic dimension,LVEDD)、左室射血分数(left ventricular ejection fractions,LVEF)。采用Spearman相关性分析上述指标与心功能分级的相关性。根据患者随访12个月期间是否出现心脏事件分为预后不良组和预后良好组,比较两组临床资料,采用多因素Logistic回归分析确定预后影响因素,绘制血清MEG3表达预测老年CHF预后的ROC曲线。结果与心功能Ⅱ级相比较,心功能Ⅲ级患者血清CK-MB(57.70±5.46 IU/L vs 68.19±6.53 IU/L),cTnI(1.95±0.47 ng/L vs 2.37±0.63 ng/L),BNP(336.43±67.38 pg/ml vs 581.21±98.73 pg/ml),MEG3表达(7.32±2.25 vs 11.65±3.09)及LVESD(39.63±7.28 mm vs 44.18±8.4 mm),LVEDD(53.05±8.78 mm vs 58.73±9.02 mm)升高,LVEF(43.19%±5.66%vs 37.55%±5.94%)降低,差异具有统计学意义(t=2.690~12.932,均P<0.05)。经Spearman相关分析,心功能分级与CK-MB,cTnI,BNP,MEG3表达及LVESD,LVEDD均呈显著正相关(r=0.339~0.472,均P<0.05),与LVEF呈显著负相关(r=-0.443,P<0.05)。与预后良好组相比,预后不良组患者中年龄71~80岁占比(32.93%vs 55.56%)和NYHA分级Ⅲ级占比(65.85%vs 88.89%),血清CK-MB(56.91±6.76 IU/L vs 84.84±9.79 IU/L),cTnI(1.87±0.44 ng/L vs 3.14±0.87 ng/L),BNP(320.91±74.13 pg/ml vs 956.53±121.72 pg/ml),MEG3表达(7.19±2.04 vs 17.96±4.81)和LVESD(36.75±7.79 mm vs 57.06±10.05 mm),LVEDD(52.59±7.11 mm vs 67.67±9.46 mm)升高,LVEF(42.38%±5.93%vs 31.56%±4.43%)降低,差异均有统计学意义(χ^(2)=5.345,6.716,t=7.876~27.650,均P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,年龄(OR=3.615,95%CI:1.189~10.991),NYHA分级(OR=3.911,95%CI:1.324~11.553),血清CK-MB(OR=3.554,95%CI:1.397~9.041),cTnI(OR=4.193,95%CI:1.583~11.106),BNP(OR=2.842,95%CI:1.319~6.124),MEG3表达(OR=5.003,95%CI:1.297~19.298),LVEF(OR=0.396,95%CI:0.184~0.876)是预后影响因素(均P<0.05)。血清MEG3表达预测CHF预后的曲线下面积0.874(95%CI:0.778~0.948),当血清MEG3表达=12.52×2-△△Ct时,敏感度与特异度最高,分别为0.869,0.724。结论年龄、NYHA分级、血清CK-MB,cTnI,BNP,MEG3表达及LVEF是CHF患者的预后影响因素,积极检测血清MEG3表达有利于预测患者预后。

从黑猩猩与人类的表达看语言的产生

语言是最重要的表达思想感情的工具。黑猩猩和我们人类无论在外形体态上还是在表达方式上,都存在着惊人的相似。同时,人类的某些特点和机能是黑猩猩无法企及的。从黑猩猩和人类表达方式的比较中,我们可以分析出语言产生的条件:1.外部条件。2.人类选择声音作为表达方式。3.符号化。

意识焦点与人类表达

语言是一个音义结合的符号系统,是人类最重要的交际工具和思维工具。但在语言产生之初,语音和语义究竟是通过何种方式结合,人类又是怎样表达思想情感的呢?可通过意识焦点这一工具对上述问题进行分析。

CD4^(+)T细胞计数及单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率在预测老年脓毒症患者预后中的价值

目的探讨CD4^(+)T细胞计数及单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率在预测老年脓毒症患者预后的价值。方法109例老年脓毒症患者,分为死亡组(33例)、存活组(76例),比较两组免疫功能指标,如CD3^(+)T细胞计数、CD4^(+)T细胞计数、CD4^(+)/CD8^(+)T细胞比值及单核细胞人白细胞DR抗原表达率的差异并进行影响90 d内死亡因素的logistic回归及ROC曲线分析潜在指标预测90 d内死亡结局的准确性。结果死亡组治疗第1天及第7天CD3^(+)T细胞计数、CD4^(+)T细胞计数、单核细胞人白细胞DR抗原表达率均显著低于存活组(P<0.05)。入院后第1天CD4^(+)T细胞计数及单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率并不是脓毒症90 d死亡的独立危险因素,而治疗第7天时CD4^(+)T细胞计数及单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率是90 d死亡的独立危险因素并能够有效预测90 d死亡风险。CD4^(+)T细胞计数(AUC=0.847,95%CI:0.774~0.920)的预测最佳截断值为197.0 cells/μL,单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率(AUC=0.898,95%CI:0.829~0.966)预测最佳截断值为40.5%。单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率的准确性高于CD4^(+)T细胞计数,CD4^(+)T细胞计数联合单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率(AUC=0.928,95%CI:0.883~0.974)预测特异性高于单个参数。结论老年脓毒症患者治疗第7天时CD4^(+)T细胞计数及单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率是90 d死亡的独立危险因素,两者均为90 d死亡的有效预测指标,CD4^(+)T细胞计数及单核细胞人类白细胞抗原⁃DR表达率可以作为改善脓毒症预后的早期干预靶标。

血清DNMT1和lncRNA MEG3表达水平与帕金森病的关联性研究

目的探讨血清DNA甲基转移酶1(DNMT1)、长链非编码RNA人类母系表达基因3(lncRNA MEG3)表达水平与帕金森病(PD)的关联性。方法招募2020年3月至2023年1月青海红十字医院神经内科收治的PD患者106例作为PD组,另选择同期健康体检者103名作为对照组。比较两组的临床资料,分析PD患者血清DNMT1、lncRNA MEG3表达水平与临床指标的相关性。采用多因素logistic回归分析影响PD发生的因素,采用受试者工作特征(ROC)曲线评估血清DNMT1、lncRNA MEG3水平对PD的诊断价值。结果PD组血清DNMT1水平高于对照组,总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)及lncRNA MEG3水平低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,PD患者血清DNMT1水平与TC、TG、LDL-C水平呈负相关(P<0.05),与统一帕金森病评定量表(UPDRS)Ⅰ评分、UPDRSⅡ评分、UPDRSⅢ评分、Hoehn-Yahr(H-Y)分期呈正相关(P<0.05)。lncRNA MEG3水平与TC、TG、LDL-C水平呈正相关(P<0.05),与UPDRSⅠ评分、UPDRSⅡ评分、UPDRSⅢ评分、H-Y分期呈负相关(P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,较高的血清DNMT1水平是促进PD发生的独立危险因素(P<0.05),较高的lncRNA MEG3水平是抑制PD发生的独立保护因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清DNMT1、lncRNA MEG3水平具有诊断PD的应用价值(P<0.05),且联合两指标可进一步提高诊断效能[AUC(95%CI)=0.906(0.865~0.947)],灵敏度和特异度分别为80.21%和89.34%。结论PD患者血清DNMT1呈高表达,lncRNA MEG3呈低表达,二者联合检测有助于临床诊断PD。

乳腺癌标本中BRCA-1蛋白表达与HER-2基因的临床意义

目的探讨乳腺癌标本中乳腺癌易感基因1（BRCA-1）和原癌基因人类表达生长因子受体2（HER-2）与疾病的相关性。方法选择百色市人民医院2013年1～12月乳腺外科手术切除患者85例,BRCA-1采用免疫组化法检测,HER-2采用荧光复位杂交检测。比较BRCA-1基因和HER-2在不同病理类型和是否有淋巴结转移患者中的差异。结果 BRCA-1基因在85例乳腺癌病理标本中,导管内癌阳性率为62.3%（5/8）,浸润性导管癌阳性率为77.3%（54/70）,乳腺髓样癌阳性率为71.4%（5/7）,差异无统计学意义（P〉0.05）。BRCA-1基因在有淋巴转移患者中阳性率为62.9%（22/35）,无淋巴结转移患者阳性率为82.5%（33/40）,差异有统计学意义（P〈0.05）。HER-2基因在85例乳腺癌病理标本中,阳性检出率为48.2%（41/85）;有淋巴转移患者阳性率为88.6%（31/35）例,无淋巴结转移患者阳性率为25.0%（10/40）,差异有统计学意义（P〈0.05）。结论 BRCA-1基因、HER-2基因与乳腺癌的发生、发展有密切的关系,对早期预防、诊断、治疗乳腺癌有重要意义。

脾气虚证患者基因差异表达研究

目的:研究慢性胃炎脾气虚证的特征性基因差异表达谱。方法:慢性胃炎脾气虚证患者及健康志愿者各选4例,镜下取胃黏膜组织,提取总RNA,一一配对制作基因芯片,采用荧光比值、生物信息学、双侧t检验等方法比较分析;实时荧光定量PCR检测相关基因。结果:差异表达基因54条,72.2%下调;其中与营养物质代谢和免疫调节相关差异表达基因45条,71.1%下调;差异基因中有4条基因P<0.05,为显著差异表达基因;实时定量PCR检测差异基因5条,4条与芯片结果一致。结论:慢性胃炎脾气虚证具有特征性的基因差异表达图谱,主要表现为与营养物质代谢及免疫调节相关基因呈下调趋势。

2.2kb乙型肝炎病毒剪接特异性蛋白对Huh7细胞基因表达的影响

目的研究单剪接及双剪接型2.2 kb乙型肝炎病毒基因编码剪接特异性蛋白(分别为TPss及TPds)对Huh7细胞基因表达的影响,探讨其可能的致病机制。方法PCR扩增TPss及TPds编码序列并克隆入pcDNA3.1/HisC。采用FuGENE6将重组表达载体及相应空载体分别瞬时转染Huh7细胞,Trizol抽提细胞总蛋白与总RNA。以Westernblot检测目的蛋白的表达,通过Affymetrix Genechip U133 plus 2.0人类基因表达谱芯片检测Huh7肝细胞基因转录的变化并以半定量RT-PCR进一步验证。结果成功构建重组真核表达载体pcDNA3.1/HisC-TPss及pcDNA3.1/HisC-TPds,在Huh7细胞中能分别表达TPss(单剪接)及TPds(双剪接)蛋白。TPss蛋白导致Huh7细胞DGKβ(diacyl-glycerol kinase beta)等4个基因转录上调,ZNF652(zinc finger protein 652)等5个基因转录下降;TPds蛋白导致细胞MTSS1(Metastasis suppressor 1)等3个基因转录上调,WARS2基因(Tryptophanyl tRNA synthetase 2)转录下降。结论2.2 kb乙型肝炎病毒基因组剪接体编码剪接特异性蛋白可能影响肝细胞骨架的重塑、细胞内物质代谢等方面,与肝细胞的增生、迁移及代谢异常密切相关。

胃癌组织ATP1 A2的表达及机制探讨

目的观察胃癌组织ATP酶α2亚基(ATP1A2)表达情况,探讨其与黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子通路、细胞外基质相关信号通路的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载并预处理胃癌RNASeq V2数据、从人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库下载胃癌样本数据集GSE62254的series matrix数据,通过TCGA数据集纳入胃癌患者293例,通过GEO数据集纳入胃癌患者300例。根据表达谱数据,将胃癌组织ATP1A2表达由低到高排序,按33%、67%者将数据三等分,低于33%者为低表达,高于67%者为高表达,两者之间为中表达。分析不同ATP1A2表达与胃癌患者临床病理参数的关系,比较低、中、高表达者中位生存时间,利用基因集富集分析方法预测ATP1A2相关的基因通路。结果 TCGA数据集纳入的293例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为95、99、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄无关(P均>0.05),与T分期、N分期、p TNM分期及组织分化程度有关(P均<0.05);ATP1A2低、中、高表达者中位生存时间分别为70、36.9和26个月,三者间比较P<0.01。GEO数据集纳入的300例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为99、102、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄、T分期、N分期、p TNM分期及Lauren分型均有关(P均<0.05);ATP1A2高表达者的中位生存时间为31个月,较低表达和中表达者中位生存时间明显延长(P<0.01)。ATP1A2高表达富集了黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等相关的基因通路(P<0.05或<0.01)。结论胃癌组织中ATP1A2高表达,其高表达预示患者预后不良;ATP1A2高表达导致黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等基因通路异常可能是其作用机制。

肾精亏虚证老年性痴呆差异基因表达分析

目的：基于人类全基因表达谱芯片高通量测序技术,分析肾精亏虚证老年性痴呆发病机制与差异基因表达的相关性。方法：在辽宁中医药大学附属医院和上海中医药大学附属龙华医院门诊选择60岁以上16例肾精亏虚证AD患者,对照组为同龄健康状态老年人12例,男女各半。清晨取静脉血5 m L,加入百泰克生产血液总RNA快速提取试剂盒,-70℃保存。统一干冰冷冻寄送北京博奥生物有限公司,利用Affymetrix公司的Human Gene Expression Array基因表达谱芯片,分析两组基因差异表达。结果：肾精亏虚证AD患者特异性表达的探针有308个,对应247个基因（FC≥1.5,q-value≤5%）,其中上调基因228个,下调基因19个。实时定量PCR验证了其中差异最大的9个基因的表达。结论：肾精亏虚证AD的发病机制之一与人类基因表达谱中9个差异表达基因调控有关。

基于TCGA、THPA、GEO数据库挖掘PTTG1在乳腺癌中的表达及预后意义

目的:通过对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)、人类蛋白组图谱(The Human Protein Atlas,THPA)和人类肿瘤相关的基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库的数据挖掘,探索垂体肿瘤转化基因1(pituitary tumor-transforming gene 1,PTTG1)在乳腺癌中的表达及预后意义。方法:从TCGA、THPA和GEO数据库提取PTTG1在乳腺癌及正常组织中mRNA和蛋白水平的变化和患者临床病理资料,GEO在线预后分析数据库Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com)检索PTTG1乳腺癌预后的相关性。结果:在数据库中,PTTG1 mRNA和蛋白水平在乳腺癌队列中表达显著高于正常乳腺组织(P<0.01);PTTG1 mRNA在不同的分子亚型中表达存在显著差异(P<0.05);PTTG1 mRNA在ER和PR阳性乳腺癌患者组织中表达显著低于ER和PR阴性乳腺癌患者(P<0.05);PTTG1 mRNA在进展期乳腺癌患者组织中表达显著高于早期乳腺癌患者(P<0.05);PTTG1 mRNA随着乳腺癌患者组织学分级程度升高而降低(P<0.05)。PTTG1低表达乳腺癌患者的预后显著好于其高表达患者(P<0.001);PTTG1高表达的ER和PR阳性、HER-2阴性乳腺癌患者的预后均显著差于其低表达者(P<0.05)。PTTG1高表达乳腺癌样本富集到细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路、细胞周期、自然杀伤细胞介导细胞毒性、Toll样受体信号通路和T细胞受体信号通路等相关基因集。结论:PTTG1 mRNA和蛋白在乳腺癌组织中高表达,PTTG1 mRNA表达与乳腺癌预后相关且在不同分子分型的乳腺癌中具有不同的预后监测意义,可以作为乳腺癌预后判断的标志物。

宫颈癌及癌前病变的全基因组表达谱分析及下调表达候选基因鉴定

目的探讨维吾尔族妇女宫颈癌组织特异的下调表达基因谱,建立基于下调表达基因的宫颈癌早期诊断方法。方法收集维吾尔族妇女宫颈病变新鲜组织标本72例,其中宫颈鳞癌(cervical squamous cell carcino-ma,CSCC)25例,宫颈内上皮瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)22例,正常宫颈组织(normal cervix,NC)25例。选择20例组织标本(CSCC 7例,CINⅢ6例,NC 7例),提取组织RNA,通过人类全基因组表达谱芯片及生物信息分析,筛选宫颈癌及癌前病变(CIN)特异性下调表达候选基因。通过对CSCC与正常对照(NC)组的基因差异表达谱进行比较分析,选取10种差异表达倍数较高的候选基因,利用72例宫颈病变组织RNA,对10种下调表达候选基因的表达水平进行半定量RT-PCR鉴定,确定宫颈癌及癌前病变与该基因表达水平变化的关系。结果以2倍及以上表达差异为量化标准,有下调表达候选基因112种。72例宫颈病变组织RNA的半定量RT-PCR筛查分析,发现在CSCC与正常对照组之间,FOSB、DNASE1L3、SCARA5、EGR1、ABI3BP、FOS、KLF4、RHOB、IER2和ID4等10种下调表达基因的差异均有统计学意义(P<0.05)。DNASE1L3、EGR1、FOS、KLF4和IER2等5种基因的表达水平差异在CIN与正常对照组之间有统计学意义(P<0.05),但是除了FOS基因外,其余4种基因表达在CSCC与CIN组之间无差异(P>0.05)。结论维吾尔族妇女宫颈癌发病进程可能与一系列基因的下调表达密切相关,而DNASE1L3、EGR1、FOS、KLF4和IER2等5种基因的表达水平变化可能成为宫颈癌早期预警指标。

急性心肌梗死患者血浆MEG3及UCA1表达水平与冠状动脉病变的相关性

目的探究急性心肌梗死(AMI)患者血浆人类母系表达基因3(MEG3)、尿路上皮癌抗原1(UCA1表达水平与冠状动脉(简称冠脉)病变的相关性。方法 208例AMI患者据患者入院时冠状动脉造影(CAG)Gensini评分分为低分组、中分组及高分组,检测3组患者入院2 h时的血浆MEG3、UCA1基因表达水平和肌酸激酶同工酶(CK-MB)及肌钙蛋白I(cTnI)含量,采用Pearson法分析血浆MEG3、UCA1与Gensini评分、CK-MB及cTnI水平的相关性;比较住院期间发生心血管事件(心律失常、心力衰竭、心绞痛及心血管事件)患者与未发生心血管事件患者的血浆MEG3及UCA1水平,采用Spearman秩相关分析AMI患者住院期间心血管事件与血浆MEG3、UCA1的相关性。结果低、中及高分组患者血浆MEG3、CK-MB、cTnI表达水平比较,AMI低分组<中分组<高分组(P<0.05);3组患者血浆UCA1表达水平比较,低分组>中分组>高分组(P<0.05);经Pearson相关分析,血浆MEG3与Gensini评分、CK-MB、cTnI表达水平呈正相关(r=0.411、0.329、0.342,P<0.05),血浆UCA1表达水平与Gensini评分、CK-MB、cTnI表达水平呈负相关(r=-0.389、-0.307、-0.318,P<0.05);AMI患者中发生心血管事件者血浆MEG3水平均高于未发生者(P<0.05),血浆UCA1水平则低于未发生者(P<0.05);Spearman秩相关结果显示,AMI患者心血管事件的发生与血浆MEG3呈正相关(r=0.315、0.339、0.378、0.422,P<0.05),与血浆UCA1呈负相关(r=-0.419、0.428、-0.405、-0.483,P<0.05)。结论 AMI患者血浆MEG3和UCA1表达水平与冠脉病变严重程度及患者住院期间心血管事件发生均有一定的相关性。

纤维连接蛋白1在胃癌中的表达及临床意义

目的纤维连接蛋白1(FN1)参与癌症发生发展的机制尚不清楚。文章旨在研究FN1在胃癌组织中的表达和临床病理意义,并探讨FN1作用机制。方法采用人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库,下载 GSE54129、GSE29272 和 TCGA 数据分析胃癌与癌旁组织 FN1 的表达。根据 TCGA 表达谱数据及 FN1 表达分为:低表达(<-0.475)、中表达(-0.475~1.036)、高表达(>1.036)。分析 FN1在胃癌组织中的表达和临床病理关系;应用 TCGA数据和Kaplan Meier在线分析FN1的表达水平与胃癌患者的预后关系;TCGA数据采用基因集富集分析(GSEA)方法预测FN1的相关通路。结果 FN1低、中、高表达的中位生存时间分别为 63.5、55.7和 39.4个月,低表达和高表达者中位生存时间差异具有统计学意义(P<0.01)。Kaplan-Meier Plotter 在线数据集分析结果显示,FN1 高表达者中位生存时间短于低表达者(P< 0.01),即FN1表达越高,预后越差。FN1的表达是胃癌患者的独立预后因素(HR=0.480,95%CI:0.336~0.686)。FN1高表达样本富集到KRAS(FDR=0.0025)、P53(FDR=0.0052)、TGF-β(FDR=0.0052)、细胞黏附(FDR=0.0)、细胞外基质(FDR=0.0043)、骨架蛋白调控(FDR=0.0057)等基因集(P均<0.01)。结论 FN1的高表达是胃癌预后不良的因素,可作为预测胃癌转移和预后的有效生物标志物。FN1高表达导致KRAS、P53、TGF-β、ECM、细胞黏附和细胞骨架蛋白调节通路异常可能是其作用机制。

利用GEO数据集分析USP51在胃癌中的表达及临床意义

目的:研究USP51在胃癌中的表达情况,探讨USP51表达与胃癌临床病理参数的相关性并预测USP51表达对胃癌预后评估的临床价值。方法:从人类肿瘤相关基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载胃癌样本数据集GSE62254的series matrix数据,只保留临床资料和生存信息完整的患者病例,共收录胃癌患者295例。分析不同USP51表达与胃癌临床病理参数的相关性,以及对胃癌预后的影响。采用基因集富集分析方法分析和预测受USP51调控的相关基因。结果:USP51表达水平与胃癌患者年龄、T分期、p TNM分期及Lauren分型均有关(P均<0. 05),与胃癌患者性别及N分期无关(P均> 0. 05)。随着USP51表达程度的增加,胃癌患者总生存时间(overall survival,OS)明显缩短(P <0. 001)。USP51高表达富集了黏着斑通路、钙离子信号通路、细胞黏附分子和细胞外基质等相关的基因通路(P <0. 05,FDR <0. 25)。结论:在胃癌中,USP51高表达是一种预后不良因素,推测其可以作为判断胃癌患者预后的有效生物标志物以及治疗靶点。

血清lncRNA MEG3的表达与多囊卵巢综合征患者胰岛素抵抗的关系

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)人类母系表达基因3(MEG3)的表达与多囊卵巢综合征(PCOS)患者胰岛素抵抗(IR)的关系。方法选取2018年7月至2020年8月本院收治的123例PCOS患者为研究对象进行前瞻性分析,根据胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)水平分为IR组(n=54)和非IR组(n=69),另选取同期在本院体检的健康女性85例为对照组。检测各组患者的血脂、血糖水平以及相关激素水平;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测血清中lncRNA MEG3表达水平;通过Logistic回归分析PCOS患者IR发生的影响因素。利用受试者工作特征曲线(ROC)评价血清lncRNA MEG3水平对PCOS患者IR的诊断价值。结果3组中血清lncRNA MEG3表达水平比较,IR组显著低于非IR组和对照组,非IR组显著低于对照组(P<0.05)。Pearson相关分析表明lncRNA MEG3水平与腰臀比(WHR)、甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、空腹胰岛素(FINS)、睾酮(T)、HOMA-IR水平呈负相关(P<0.05),与高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、空腹血糖(FBG)、雌二醇(E_(2))水平呈正相关(P<0.05)。多因素回归分析显示,lncRNA MEG3为PCOS患者发生IR的影响因素(P<0.05)。血清lncRNA MEG3水平预测PCOS患者IR发生的曲线下面积(AUC)为0.946[95%CI(0.889,0.978)],对应的敏感度为98.15%,特异度为85.51%。结论PCOS患者血清中lncRNA MEG3呈低水平表达,且其表达水平与HOMA-IR呈负相关;lncRNA MEG3可能影响PCOS患者IR的发生。

“异病”(原发性骨质疏松症和老年性痴呆)“同证”(肾精亏虚证)患者差异表达基因的同源性分析

目的:通过人全基因表达谱芯片检测肾精亏虚证老年性痴呆和原发性骨质疏松症患者差异表达基因,对差异表达基因的同源性进行分析,探寻肾精亏虚证的分子生物学机制。方法:利用Affymetrix公司的Human Gene Expression Array基因表达谱芯片,分别检测16例肾精亏虚证原发性骨质疏松症和16例肾精亏虚证老年性痴呆患者的差异表达基因,分析两组差异表达的基因。结果:肾精亏虚证原发性骨质疏松症和肾精亏虚证老年性痴呆两组患者呈现131个共表达的差异基因,其中显著共表达的上调基因是S100P(S100钙结合蛋白P),显著共表达的下调基因是CX3CR1(C-X3-C趋化因子受体1)。结论:'肾精亏虚证'的老年性疾病(原发性骨质疏松症和老年性痴呆)患者差异基因表达存在'共性',提示'肾精亏虚证'的分子生物学基础与此'共性'有关,而这一'共性'主要体现在干细胞及其微环境相关的基因表达异常。

以影视人类学之视角浅析电影《冈仁波齐》

电影《冈仁波齐》讲述了芒康县普拉村一行11人一路徒步"磕长头"至拉萨及冈仁波齐山长达2500多公里的朝圣之旅。导演张扬并不是按照商业剧情片、也非一部朝圣的纪录片来创作此电影,在笔者看来,从其纪录内容、拍摄手法和艺术呈现等多个方面看,可以算得上是一部民族志影视作品,本文从让·鲁什的"虚构民族志电影"理论视角出发,浅析本片的拍摄手法与艺术表达。