目的对青海省2016-2017年手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）人肠道病毒A组71型（human enterovirus group A type71，EV—A71）的基因特征进行分析。方法对青海省2016-2017年采集的HFMD标本，用荧光定量逆转录-聚合酶链...目的对青海省2016-2017年手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）人肠道病毒A组71型（human enterovirus group A type71，EV—A71）的基因特征进行分析。方法对青海省2016-2017年采集的HFMD标本，用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（reverse transcription．polymerase chain reaction，RT—PCR）方法进行筛查，对EV—A71阳性标本进行病毒分离，对分离到的病毒提取核酸，用RT—PCR方法对VPl编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析，并与EV．A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果青海省2016-2017年共分离到114株EV-A71，均为C4基因亚型中的C4a进化分支。在亲缘性关系树中显示，又进一步分属2个不同的小分支。2016-2017年青海省流行的不同传播链上EV—A71与我国其他省流行的EV-A71基因亲缘关系较为接近。结论青海省2016-2017年流行的EV—A71以C4a为绝对优势基因亚型，未监测到其他基因型病毒。青海省EV—A71不是独立进化的，而是与我国其他地区流行的EV—A71共同进化。展开更多
目的对青海省2013年手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD）的病原谱和人肠道病毒A组71型（Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_（A71））的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链...目的对青海省2013年手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD）的病原谱和人肠道病毒A组71型（Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_（A71））的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）方法进行筛查,对HEV_（A71）阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEV_（A71）各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果对青海省2013年分离的62株HEV_（A71）进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5%-100.0%和99.0%-100.0%。与其他各基因型和基因亚型的HEV_（A71）代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEV_（A71）分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C_（4a）进化分支。与2008年、2012年在青海省分离的HEV_（A71）在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8%-97.5%和99.0%-99.7%。结论2013年,C_（4a）亚型HEV_（A71）在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行。展开更多
文摘目的对青海省2016-2017年手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）人肠道病毒A组71型（human enterovirus group A type71，EV—A71）的基因特征进行分析。方法对青海省2016-2017年采集的HFMD标本，用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（reverse transcription．polymerase chain reaction，RT—PCR）方法进行筛查，对EV—A71阳性标本进行病毒分离，对分离到的病毒提取核酸，用RT—PCR方法对VPl编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析，并与EV．A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果青海省2016-2017年共分离到114株EV-A71，均为C4基因亚型中的C4a进化分支。在亲缘性关系树中显示，又进一步分属2个不同的小分支。2016-2017年青海省流行的不同传播链上EV—A71与我国其他省流行的EV-A71基因亲缘关系较为接近。结论青海省2016-2017年流行的EV—A71以C4a为绝对优势基因亚型，未监测到其他基因型病毒。青海省EV—A71不是独立进化的，而是与我国其他地区流行的EV—A71共同进化。
文摘目的对青海省2013年手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD）的病原谱和人肠道病毒A组71型（Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_（A71））的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）方法进行筛查,对HEV_（A71）阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEV_（A71）各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果对青海省2013年分离的62株HEV_（A71）进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5%-100.0%和99.0%-100.0%。与其他各基因型和基因亚型的HEV_（A71）代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEV_（A71）分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C_（4a）进化分支。与2008年、2012年在青海省分离的HEV_（A71）在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8%-97.5%和99.0%-99.7%。结论2013年,C_（4a）亚型HEV_（A71）在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行。
