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恶性胸膜间皮瘤中EFEMP1基因mRNA的表达及其临床病理学意义
1
作者
杨娜
李彬
+3 位作者
李素芬
王唯斯
自加吉
熊伟
《生物技术通讯》
CAS
2020年第4期455-460,共6页
目的:探讨人表皮生长因子含纤蛋白样胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因mRNA表达量与恶性胸膜间皮瘤(MPM)临床病理之间的相关性及其预后意义。方法:利用Oncomine数据库对非肿瘤组织与MPM组织中EFEMP1基因的mRNA表达量进行比较分析;采用R3.6.3软...
目的:探讨人表皮生长因子含纤蛋白样胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因mRNA表达量与恶性胸膜间皮瘤(MPM)临床病理之间的相关性及其预后意义。方法:利用Oncomine数据库对非肿瘤组织与MPM组织中EFEMP1基因的mRNA表达量进行比较分析;采用R3.6.3软件下载美国公共癌症基因数据库(TCGA)中MPM数据集并分析EFEMP1基因mRNA表达的病理相关性;采用基因表达谱动态分析(GEPIA)构建Kaplan-Meier生存模型,探究EFEMP1基因mRNA表达量对MPM患者预后的影响;使用cBioportal进行EFEMP1基因相关性的可视化分析。结果:EFEMP1基因mRNA在正常组织中低表达,在MPM组织中高表达;EFEMP1基因mRNA表达水平与MPM的T分期(P=0.046)、病理类型(P=0.031)及组织学诊断类型(P=0.031)具有显著相关性;在MPM患者中,EFEMP1基因mRNA表达量与患者的总生存率和无疾病进展生存率均无显著相关性(logrank P>0.05)。基因表达相关性分析结果表明,UGP2、RRAS2、ANXA3、UPK1B、ADH6、XPC与EFEMP1基因表达量呈显著性正相关(P<0.05),TCF4、NFATC4、SMTN与EFEMP1基因表达量呈显著性负相关(P<0.05)。结论:EFEMP1基因有望作为MPM诊断和治疗的潜在靶点,但EFEMP1基因mRNA表达量不是判断MPM患者预后的有效指标。
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关键词
恶性胸膜间皮瘤
人表皮
生长因子
含
纤
蛋白
样
胞外基质
蛋白
1(
efemp
1)
基因
纤
蛋白
3
数据挖掘
病理意义
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职称材料
题名
恶性胸膜间皮瘤中EFEMP1基因mRNA的表达及其临床病理学意义
1
作者
杨娜
李彬
李素芬
王唯斯
自加吉
熊伟
机构
大理大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室
大理大学基础医学院病理学教研室
云南省高校临床生物化学检验重点实验室
出处
《生物技术通讯》
CAS
2020年第4期455-460,共6页
基金
国家自然科学基金(81560458,31601155,31760331)
云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(2017HB077)
+1 种基金
云南省万人计划青年拔尖人才项目(2019)
云南省高校病理学与病理生理学硕士研究生导师团队项目(2019)。
文摘
目的:探讨人表皮生长因子含纤蛋白样胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因mRNA表达量与恶性胸膜间皮瘤(MPM)临床病理之间的相关性及其预后意义。方法:利用Oncomine数据库对非肿瘤组织与MPM组织中EFEMP1基因的mRNA表达量进行比较分析;采用R3.6.3软件下载美国公共癌症基因数据库(TCGA)中MPM数据集并分析EFEMP1基因mRNA表达的病理相关性;采用基因表达谱动态分析(GEPIA)构建Kaplan-Meier生存模型,探究EFEMP1基因mRNA表达量对MPM患者预后的影响;使用cBioportal进行EFEMP1基因相关性的可视化分析。结果:EFEMP1基因mRNA在正常组织中低表达,在MPM组织中高表达;EFEMP1基因mRNA表达水平与MPM的T分期(P=0.046)、病理类型(P=0.031)及组织学诊断类型(P=0.031)具有显著相关性;在MPM患者中,EFEMP1基因mRNA表达量与患者的总生存率和无疾病进展生存率均无显著相关性(logrank P>0.05)。基因表达相关性分析结果表明,UGP2、RRAS2、ANXA3、UPK1B、ADH6、XPC与EFEMP1基因表达量呈显著性正相关(P<0.05),TCF4、NFATC4、SMTN与EFEMP1基因表达量呈显著性负相关(P<0.05)。结论:EFEMP1基因有望作为MPM诊断和治疗的潜在靶点,但EFEMP1基因mRNA表达量不是判断MPM患者预后的有效指标。
关键词
恶性胸膜间皮瘤
人表皮
生长因子
含
纤
蛋白
样
胞外基质
蛋白
1(
efemp
1)
基因
纤
蛋白
3
数据挖掘
病理意义
Keywords
malignant pleural mesothelioma
epidermal growth factor containing fibulin like extracellular matrix protein
1
(
efemp
1
)gene
fibulin3
data mining
pathological significance
分类号
R730.4 [医药卫生—肿瘤]
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
恶性胸膜间皮瘤中EFEMP1基因mRNA的表达及其临床病理学意义
杨娜
李彬
李素芬
王唯斯
自加吉
熊伟
《生物技术通讯》
CAS
2020
0
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已选择
0
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参考文献
引证文献
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