银川市下呼吸道感染住院患儿中人鼻病毒的流行病学及临床特征分析

目的:回顾性分析银川市下呼吸道感染患儿中人鼻病毒的流行病学及临床特征,为儿童预防人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)及临床诊疗提供理论依据。方法:采集2018至2019年因下呼吸道感染就诊于银川市妇幼保健院儿科的989例住院患儿的下呼吸道分泌物,采用多重PCR方法检测标本中病毒检出情况,分析人鼻病毒病例的基本情况、临床特征及实验室检查指标。结果:本研究989例下呼吸道感染患儿中,HRV总检出率为38.3%,HRV单纯感染率为9.5%,混合其他病毒感染率为28.9%;感染HRV的男患儿有221例(58.3%),女患儿有158例(41.7%);HRV感染常年都有发生,但主要流行在夏季和秋季;HRV感染患儿87.3%被诊断为肺炎,13.7%为支气管和毛细支气管炎;90.2%的感染患儿为小于6岁的儿童。HRV感染和非HRV感染患儿相比,HRV感染组发热和呕吐症状明显(P<0.05),而咳嗽、喘息、喘憋、闻及喘鸣音等临床特征方面没有统计学差异(P>0.05),在实验室检查指标分析中,血红蛋白、红细胞计数、谷草转氨酶、谷丙转氨酶以及乳酸酶含量均存在明显差异(P<0.05);结论:HRV是银川地区常见的下呼吸道感染病原体,6岁以下儿童极易感染,以发热为主要症状,且HRV感染会引发肺炎、支气管炎及毛细支气管炎下呼吸道感染疾病;HRV常与其他病毒混合感染;具有以夏、秋季为感染高峰的明显的季节性流行。

人鼻病毒感染的临床和分子流行病学研究进展

人鼻病毒感染是一种常见的呼吸道病毒感染,对人鼻病毒感染进行临床和分子流行病学研究对于预防和控制疾病具有重要意义。本文主要就人鼻病毒的基本特征、传播途径以及临床表现,并重点关注其分子流行病学研究的研究进展进行综述。

儿童哮喘急性发作与人鼻病毒相关基因的生物信息学分析

目的运用生物信息学方法探究人鼻病毒(HRV)诱发儿童哮喘急性发作的机制,寻找潜在的治疗靶点。方法在基因表达综合数据库(http://www.ncbi.nlm.nih/gov/geo)中下载GSE30326数据集的原始数据,运用R语言进行数据预处理并筛选出GSE30326数据集中确认HRV感染的儿童哮喘急性发作及临床缓解期的差异表达基因(DEGs)。对DEGs进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,构建DEGs编码的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,挖掘其中的核心基因与功能模块。结果GSE30326数据集中共筛选出327个DEGs,包括318个上调基因和9个下调基因。GO分析显示,DEGs富集于抗病毒防御反应、固有免疫反应调节、Ⅰ型干扰素信号通路等生物过程,单链和双链RNA黏附、G蛋白偶联受体和趋化因子受体结合、2’,5’-寡腺苷酸合成等分子功能,内吞小体、浆膜外侧等细胞组分。KEGG通路富集分析显示,DEGs主要富集于NOD样受体信号通路、Toll样受体信号通路、RIG-1样受体信号通路、细胞因子受体间相互作用、趋化因子信号通路、抗原提呈、细胞黏附分子、Jak-STAT信号通路、内吞作用等。DEGs编码蛋白构建的PPI网络包含185个节点和958条交互线,其中最大的功能模块共包含30个节点、373条交互线。对这30个节点的基因进行GO分析显示,DEGs主要富集于Ⅰ型干扰素信号通路、抗病毒防御反应、病毒基因组复制的负调节等生物过程。PPI网络中具有5个较高拓扑评分的节点,即核心基因,分别为2’,5’-寡聚腺苷酸合成酶2(OAS2)、干扰素调节因子7(IRF7)、信号转导及转录激活因子1(STAT1)、2’,5’-寡聚腺苷酸合成酶3(OAS3)、2’,5’-寡聚腺苷酸合成酶样蛋白(OASL)。结论NOD样受体信号通路、Toll样受体信号通路、GIR-I样受体信号通路等参与HRV诱发的儿童哮喘急性发作。此外,OAS2、IRF7、STAT1、OAS3、OASL作用于干扰素或其下游效应通路,可能在机体抗HRV感染中发挥重要作用,有望成为新的治疗靶点。

人鼻病毒3C蛋白酶基因的克隆、表达、纯化及活性

目的获得重组3C蛋白酶,开发一种新型的基因工程工具酶。方法通过RT-PCR方法获得人鼻病毒3C蛋白酶基因,克隆入表达载体pBV220,构建非融合表达载体pBV220-3C,转化大肠杆菌BL21(Gold)进行表达。表达产物经变性阳离子交换层析纯化后复性,再经Superdex-75凝胶过滤进一步纯化,获得的3C蛋白酶在4℃条件下,酶切融合蛋白IL-11,进行活性测定。结果3C蛋白酶在大肠杆菌中获得了稳定、高效表达,表达量约占菌体总蛋白的25%,以包涵体形式存在。经过纯化、复性,纯度达90%以上,获得的3C蛋白酶能够有效切割含3C酶切位点的融合蛋白。结论已成功开发了一种新型的基因工程工具酶。

重症急性呼吸道感染患儿中人鼻病毒分型检测及流行病学分析

目的:调查重症急性呼吸道感染患儿中人鼻病毒(HRV)的感染情况,初步了解不同型别HRV流行病学和临床特点。方法:收集2008年5月至2010年3月北京儿童医院重症急性呼吸道感染住院患儿鼻咽抽吸物样本259份,采用巢式PCR法,先用鼻病毒5′UTR引物筛查样本中该病毒总的感染情况,再用针对VP4-VP2区域的引物对阳性样本进行分型检测;同时对阳性样本进行其他常见呼吸道病毒共感染检测与流行病学及临床特点分析。结果:259例样本中,5′UTR初筛HRV阳性89例(34.4%),与其他常见呼吸道病毒存在共感染54例(60.7%);可通过VP4-VP2分型测序确定39例HRV-A(48.1%)、4例HRV-B(4.9%)、38例HRV-C(46.9%);HRV-A感染率最高的季节分布是秋季;HRV-A和HRV-C型感染者在临床特点上无明显差别。结论:HRV是儿童重症急性呼吸道感染的重要病原之一,新发现的HRV-C基因型感染率与HRV-A相似,但HRV在儿童重症急性呼吸道感染中的病原学意义还须进一步确认。

自剪切重组麦芽糖结合蛋白-人鼻病毒3C蛋白酶融合蛋白在大肠杆菌表达系统中表达、纯化及活性检测

目的利用大肠杆菌表达系统高效表达一种可以自剪切的重组的麦芽糖结合蛋白-人鼻病毒3C蛋白酶融合蛋白酶,获得一种可溶性好、酶切特异性强,且在低温下仍保持酶活性的新型基因工程工具酶。方法将编码人鼻病毒3C蛋白酶的遗传微粒克隆入表达载体pRSF-duet,转化大肠杆菌BL21(DE3),经镍柱亲和层析纯化得到人鼻病毒3C蛋白酶。通过自身体内酶切实验进行活性检测。结果人鼻病毒3C蛋白酶在大肠杆菌表达系统中得到了高效的表达,并可特异性识别及剪切人鼻病毒3C蛋白酶酶切位点。结论获得了新型的基因工程工具酶。

200例CDHR3基因单核苷酸多态性与人鼻病毒所致婴幼儿下呼吸道感染的关系

目的探讨CDHR3基因单核苷酸多态性与人鼻病毒(human rhinoviruses,HRV)所致儿童急性下呼吸道感染的关系。方法收集2012年1月至2014年11月因HRV所致急性下呼吸道感染的患儿鼻咽抽吸物,提取RNA逆转录后,采用PCR方法扩增CDHR3基因片段,测序后进行rs6967330位点基因分型。利用PCR的方法扩增HRV的VP4基因进行测序分型,实时荧光定量PCR方法进行HRV载量测定,并回顾性分析rs6967330位点与患儿临床特征的相关性。结果共纳入200例患儿,其中AA/AG基因型30例(15. 0%),GG基因型170例(85. 0%)。HRV所致急性下呼吸道感染患儿中,AA/AG基因型与GG基因型相比更容易出现喘息症状(86. 7%vs 57. 1%,P=0. 002),而且更易致重症肺炎(30. 0%vs 11. 2%,P=0. 018),一级亲属也更多具有特应性疾病病史(16. 7%vs 5. 88%,P=0. 039)。Logistic回归分析发现rs6967330 A是HRV感染患儿喘息(OR:4. 585,95%CI:1. 446～14. 541,P=0. 010)及发展为重症病例(OR:3. 379,95%CI:1. 009～11. 315,P=0. 048)的危险因素。而HRV病毒亚型及载量在不同基因型间差异没有统计学意义。结论 CDHR3基因单核苷酸多态性位点rs6967330可能与HRV感染后的重症及喘息相关。

人鼻病毒致重症肺炎1例

人鼻病毒（human rhinovirus,HRV）是小核糖核酸病毒科中的一种RAN病毒,因为这种病毒特别适应在鼻腔中生长,故被称为＂鼻病毒＂。急性呼吸道疾病中30%～50%都与人鼻病毒有关,目前发现人鼻病毒逐渐在下呼吸道感染患者中检测到,但主要出现在小婴儿,学龄儿童,老人和具有慢性疾病、癌症或免疫缺陷及移植后患者中。本文报道北京协和医院收住的1例成人人鼻病毒感染引起的重症肺炎病例。

人鼻病毒与ICAM-1在儿童哮喘中的相关性研究

目的分析人鼻病毒与ICAM-1在儿童哮喘中的相关性研究,探究其人鼻病毒引发哮喘的发病机制,进而为疾病的治疗找出有效的方法。方法入选本次研究中的50例哮喘患儿其入选时间为我院2015年10月—2016年4月,将其设为观察组,选取同期并未出现过敏性疾病和寄生虫感染,此外6个月未选择糖皮质激素以及免疫调节剂的40例儿童,将其设为对照组。随后对两组受检儿童选择ELISA法(酶联免疫法)对HRV感染情况进行检查,随后按照检验结果将患儿分为阳性组以及阴性组,同时选择ELISA法(酶联免疫法)对其进行ICAM-1浓度检查。结果观察组和对照组儿童通过检测后,两组HRV阳性率经对比产生统计学意义,而观察组中HRV阴性以及HRV阳性患儿的ICAM-1浓度水平经对比产生统计学意义。结论儿童哮喘的人鼻病毒感染率和正常儿童相比较而言,前者显著提升,同时阳性患儿的ICAM-1浓度较高,由此能够看出HRV感染会引发儿童哮喘,HRV可提升ICAM-1浓度,进而引发哮喘。

儿童哮喘急性发作时人鼻病毒感染率的临床刍议

探讨人鼻病毒所致哮喘的发病机制,为寻找该病的病因及发病机制提供依据。方法通过便利抽样法选取2015年10月—2016年4月于溧阳市人民医院儿科住院治疗的哮喘急性发作期患儿92例作为试验组,同时选取同期健康儿童30名作为对照组。采用酶联免疫法检测血清中的HRV感染情况。以HRV检测结果将试验组分为HRV阳性组和HRV阴性组。结果试验组中HRV阳性者为64例,阳性率为69.57%;HRV阴性者为28例(30.43%)。对照组未检测出HRV阳性者,试验组阳性率显著高于对照组(P<0.01)。试验组HRV阳性的血白细胞计数(15.78±3.89)109/L、中性粒细胞比例(0.98±0.01)、CRP浓度(14.32±2.11)mg/L和平均住院天数(9.54±3.20)d与HRV阴性[(9.88±2.67)×10~9/L、(0.52±0.22)、(9.56±3.23)mg/L、(6.21±2.40)d]相比后,差异有统计学意义(P<0.01)。结论哮喘发作期患儿人鼻病毒感染率明显高于正常儿童,提示HRV感染与哮喘的急性发作有关。

喜炎平注射液对人鼻病毒感染小鼠的抗病毒作用研究

目的观察喜炎平注射液对人鼻病毒致小鼠感染的抗病毒作用。方法采用人鼻病毒感染小鼠作为模型,测定不同浓度喜炎平注射液对感染小鼠病死率及平均生活日的影响;测定其对感染小鼠气管—肺脏匀浆中的病毒滴度的影响,观察其抗病毒的能力。结果在观察的时间内,喜炎平注射液中剂量组与模型组比较,可显著减少病死率;与模型组相比,喜炎平可显著延长动物平均生存时间;喜炎平不同剂量组对病毒感染小鼠的肺脏病变均有不同程度的改善作用;喜炎平注射液可明显降低气管—肺脏组织匀浆中病毒滴度。结论喜炎平注射液具有抗人鼻病毒的治疗作用,在体内可有效抑制人鼻病毒增殖,能减轻受试动物呼吸道病变,提高存活率,不良反应很低,为进一步临床推广应用提供了实验依据。

黄石市儿童急性下呼吸道人鼻病毒感染流行病学特点及相关危险因素分析

目的探究黄石市儿童急性下呼吸道人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)感染的流行病学特点及相关危险因素。方法将黄石市中心医院2016年1月至2016年12月收治的2326例急性下呼吸道感染患儿纳入本研究,采集患儿的鼻咽抽吸物,采用逆转录聚合酶链反应检测呼吸道病毒[呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV),副流感病毒(parainfluenza virus,PIV)1、2、3型(PIV-1、PIV-2、PIV-3),流感病毒(influenza virus,IV)A、B型(IV-A、IV-B),腺病毒(adenovirus,ADV),人偏肺病毒(human metapneumovirus,h MPV),博卡病毒(human bocavirus,HBo V),肺炎支原体(mycoplasma pneumoniae,MP),HRV]。收集同期黄石市的平均气温、总降水量、平均湿度、总日照时间及平均风速等气象信息。分析HRV的流行病学特点及发病的相关危险因素。结果至少存在1种病原体阳性的患儿有1446例(62.2%),其中发病率最高的病原体为MP,其次为RSV、HRV、HBo V、PIV-3、h MPV、ADV、PIV-1、IV-A、PIV-2。所有检出病毒病原体的患儿中,共有HRV感染272例,其中单一HRV感染71例(26.1%),混合感染201例(73.9%);合并感染中最常见的是MP、HBo V及RSV感染。13~36个月患儿HRV的检出率最高,与其他年龄段患儿相比具有显著差异(P<0.05)。HRV感染患儿在3岁以内达到215例,占总感染人数的79.0%。HRV感染好发于夏、秋两季;HRV的检出率与当月平均气温呈显著正相关,与降水量、湿度及平均风速无显著相关性。结论 HRV是黄石市儿童急性下呼吸道感染的主要病原体之一。HRV感染好发于夏、秋两季,其发病率可能与气温有关。

株洲地区一起人鼻病毒感染暴发的状况分析

目的回顾性分析株洲地区2020年5—6月新型冠状病毒肺炎防控期间人鼻病毒(human rhinovirus,HRV)呼吸道感染的流行状况,为今后控制HRV暴发流行提供科学参考。方法对湖南中医药高等专科学校附属第一医院收治出现相关临床症状的患者进行流行病学调查,获取的564份标本进行实时荧光定量PCR检测HRV核酸载量,同时HRV阳性患者进行其他5项常见呼吸道病毒核酸定性检测。结果①检出HRV阳性病例242例(1~17岁),男136例、女106例,男、女阳性率差异无统计学意义(χ^(2)=0.050,P>0.05)。不同年龄组比较,12岁及以下儿童HRV阳性率较高,差异具统计学意义(χ^(2)=8.971,P<0.05),其中1~5岁阳性患者在相应年龄段中检出率最高,为51.28%。6~12岁阳性患者最多,占阳性总数的80.17%。②HRV阳性患者临床首发症状以发热为主(78.10%,189/242),且出现症状2~3 d采样进行HRV核酸检测的阳性率最高(68.18%,165/242)。③合并感染的病毒类型以呼吸道腺病毒为主(58.33%,49/84),其次为呼吸道合胞病毒(26.19%,22/84),且合并感染者HRV病毒载量比单独感染者高(Z=-11.907,P<0.001)。结论此次株洲地区HRV疫情以小学生为主要感染群体,且患者以发热为主要发病症状,合并其他呼吸道病毒感染时患者HRV病毒载量差异可为病情评估提供帮助。

一起学校人鼻病毒感染聚集性疫情流行病学和临床特征分析

目的分析重庆市某校人鼻病毒感染暴发疫情流行病学及临床特征,以期为今后此类疫情暴发处理提供参考。方法回顾性搜集2020年5—6月在学校暴发疫情呼吸道感染的患者资料,包括流行病学调查、临床表现、实验室检查、处置措施等。结果首例患者5月25日发病,末例5月31日发病,经过7 d最长潜伏期无新发患者。本次疫情为同一班68名同学中的31例发病,罹患率为45.59%(31/68),25例为住宿生,且24例居住在宿舍楼第一层;患者症状较轻,多为上呼吸道感染症状,其中咽痛26例(83.87%,26/31);发热17例(54.84%,17/31),体温最高38.1℃;咳嗽15例(48.39%,15/31),流涕14例(45.16%,14/31);31例患者实验室检测人鼻病毒核酸阳性24例,阳性率77.42%(24/31),其余实验室检查及呼吸道病毒核酸检测阴性;所有患者经过隔离对症治疗后均病情好转。结论该起疫情为重庆市首起由实验室确诊的人鼻病毒引起的普通感冒暴发疫情;本次疫情患者病情较轻,未造成更大范围的播散;加强学校学生住宿环境的消毒、患者居家隔离、注意个人卫生是防控人鼻病毒引起的上呼吸道感染疫情的关键措施。

宁海县2019年一起学校人鼻病毒感染疫情的流行病学调查

目的调查一起学校不明原因咳嗽、打喷嚏、鼻炎疫情的病原及疾病传播的危险因素,提出针对性的防控措施。方法2019年9月20日在宁海县某学校开展不明原因咳嗽、打喷嚏、鼻炎疫情的流行病学调查及处置,制定病例定义搜索病例,采用统一的流行病学个案调查表进行现场调查,描述病例的分布特征,采集病例咽拭子标本进行病原检测。结果本次疫情共搜索到病例59例,均为学生,分布在3个班级,其中711班25例(42.4%),710班18例(30.5%),709班16例(27.1%);罹患率分别为55.6%(25/45)、40.9%(18/44)、37.2%(16/43);发病高峰在9月18—21日,临床症状以咳嗽、流涕、咽痛为主;采集病例咽拭子标本10份,反转录-聚合酶链式反应检测人类鼻病毒遗传群C(H R V-C)阳性8份;与病例邻桌、与病例玩耍是引起本次疫情传播的危险因素。结论本次疫情为一起由HRV-C感染导致的暴发疫情,危险因素为密切接触。

婴幼儿呼吸道合胞病毒和人鼻病毒感染所致急性下呼吸道感染特征及预后分析

目的 探讨婴幼儿呼吸道合胞病毒(RSV)和人鼻病毒(HRV)引起的急性下呼吸道感染的临床特征及预后分析。方法 回顾性分析2012-01至2017-12武警特色医学中心收治急性下呼吸道感染的婴幼儿患者138例。根据病毒感染情况分为单纯RSV感染组、单纯HRV感染组、RSV和HRV合并感染组。比较三组急性下呼吸道感染的临床特征,并分析婴幼儿期呼吸道病毒感染与6~8岁时复发性喘息、哮喘发生的关系。结果 共纳入138例患儿,其中84例单纯RSV感染、20例单纯HRV感染和34例合并感染。单纯RSV感染的婴幼儿年龄最小[(5.64±2.16)个月],呼吸衰竭比例最高(25.00%),对吸氧的需求最高(25.00%),差异均有统计学意义(均P<0.05)。末次随访时单纯RSV感染组、单纯HRV感染组和合并感染组反复喘息发生率依次为39.29%、20.00%和35.29%,哮喘发生率依次为7.14%,10.00%,11.76%,差异均无统计学意义。婴幼儿单纯RSV组中,有哮喘家族史患儿6~8岁期间发生反复喘息的比例(87.50%)高于无家族史者(23.08%),差异有统计学意义(P<0.001)。结论 单纯RSV感染婴幼儿具有更高呼吸衰竭比例,存在有哮喘家族史的RSV感染患儿6~8岁时发生反复喘息的概率较高。

PCR-荧光探针法检测婴幼儿和儿童人鼻病毒的初步评估

目的通过PCR-荧光探针法和Sanger测序法检测呼吸道感染婴幼儿和儿童人鼻病毒(HRV)的感染情况,以评估PCR-荧光探针法的病毒检测能力,并分析HRV载量对患儿临床指标的影响。方法收集2019年5—7月在遵义医科大学第三附属医院住院收治的具有呼吸道感染症状的175例患儿的鼻咽拭子标本,采用PCR-荧光探针法和Sanger测序法检测HRV感染情况并分析HRV载量对婴幼儿和儿童临床指标的影响。结果PCR-荧光探针法检出阳性标本51份(51/175,29.14%),阴性标本124份(124/175,70.86%)。Sanger测序法检出阳性标本48份(48/175,27.43%),阴性标本127份(127/175,72.57%)。与Sanger测序法相比,PCR-荧光探针法检测HRV的灵敏度和特异度分别为100.00%和97.64%,阳性预测值和阴性预测值分别为94.12%和100.00%,一致率为95.80%。两种方法对HRV的检出率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。高载量病毒组和低载量病毒组住院天数、入院前最高体温、发热天数、白细胞计数、淋巴细胞百分比及降钙素原比较,差异均无统计学意义(P>0.05),超敏C反应蛋白比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论PCR-荧光探针法检测HRV灵敏度高、特异度高、检测周期短、费用较低且操作简便快捷,可在临床检测HRV中广泛推广。此外,高载量HRV的婴幼儿和儿童的超敏C反应蛋白水平较低载量HRV的婴幼儿和儿童更高。

人鼻病毒3C蛋白酶在大肠杆菌中的表达、纯化及活性分析

人鼻病毒3C蛋白酶具有高特异性,且在低温条件下具有较高酶活,目前已被商品化.在大肠杆菌中利用麦芽糖结合蛋白(MBP)作为融合标签可促进人鼻病毒3C蛋白酶的可溶性表达.将人鼻病毒3C蛋白酶的DNA编码序列克隆到pRK792载体上,然后导入到大肠杆菌BL21(DE3),进行诱导表达,获得MBP-LEVLFQGP-6x His-人鼻病毒3C蛋白酶融合蛋白,随后通过Ni柱亲和纯化获得目的蛋白.用该产物切割纯化的MBP-LEVLFQGP-6x His-木聚糖酶融合蛋白,可获得木聚糖酶并用底物平板检测其活性.实验结果表明人鼻病毒3C蛋白酶能够在大肠杆菌中表达,并且能特异性地在其底物识别序列进行切割,从而移除MBP标签,获得仅带有6x His的人鼻病毒3C蛋白酶.该酶可以特异性地去除木聚糖酶融合蛋白中的MBP标签,获得有活性的木聚糖酶.利用MBP标签能够促进人鼻病毒3C蛋白酶可溶性表达,且人鼻病毒3C蛋白酶的活性不受影响,有利于一些不稳定的蛋白在低温下的标签去除和纯化.

毛细支气管炎患儿人鼻病毒感染的临床研究

目的分析毛细支气管炎患儿人鼻病毒(HRV)感染的临床特征,探讨过敏因素与HRV感染的关系。方法收集2015年1月至2016年12月大连市妇女儿童医疗中心收治的174例毛细支气管炎患儿的临床资料,将其分为HRV组29例,RSV组108例,比较两组的临床特征。结果 HRV组29例患儿中,男女比例3.1∶1,平均年龄(9.0±3.0)个月;RSV组108例患儿中,男女比例1.5∶1,平均年龄(5.6±2.3)个月。HRV组年龄偏大(P=0.000),热峰略高(P=0.003)。两组患儿在性别、胸部X线片影、并发症方面比较差异无统计学意义(P>0.05)。HRV组患儿合并湿疹比率明显升高(P=0.006),嗜酸性粒细胞计数明显高于RSV组(P=0.006),且家族性哮喘、父母一方罹患过敏性鼻炎多见(P=0.043、P=0.035);父母双方(P=0.050)、二级亲属中过敏性鼻炎比例增高(P=0.054)。两组嗜碱性粒细胞计数比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论 HRV感染与RSV感染的毛细支气管炎临床特征相似,但HRV多发生于年龄稍大的婴幼儿,其热峰稍高于RSV患儿。个人特应性体质及家族哮喘、过敏性鼻炎可增加HRV感染毛细支气管炎的机会。

2021年宁夏2株人鼻病毒A49全基因组基因特征分析

目的 分析2021年宁夏回族自治区银川市人鼻病毒(HRV)A49全基因组序列的遗传特征及变异。方法 2021年1月1日-2021年12月31日对宁夏回族自治区银川市2家流感监测哨点医院收集的2份HRV核酸检测阳性且符合流感样诊断标准的呼吸道感染性疾病患者鼻咽拭子样本进行全基因组测序。在GenBank数据库下载参考序列,使用Mafft软件进行序列比对、MEGA11软件构建亲缘关系进化树,Beast1.10.4软件构建贝叶斯进化树。使用DNAStar软件分析序列的核苷酸(氨基酸)同源性及变异。结果 获得2株HRV全基因组序列均属于HRV A49型。株间核苷酸(氨基酸)同源性为96.9%(99.5%)。719株是HRV单一感染株,感染者为2岁女童,序列全长7 103 bp,CG的含量为38.97%,与源自2021年美国OL961540株亲缘关系最近,核苷酸同源性为99.1%,氨基酸同源性最高的是OL133734、OK254862、MZ629143,为99.8%。847株是HRV和副流感病毒Ⅲ型合并感染株,感染者为3岁女童,序列全长7 038bp,CG的含量为39.61%,与源自我国2017年MW587079株亲缘关系最近,核苷酸(氨基酸)同源性为98.2%(99.5%)。氨基酸变异分析表明,与标准株相比719株存在69个氨基酸位点突变,847株存在66个氨基酸位点突变。719株与氨基酸同源性最高的参考序列OL133734、 OK254862、 MZ629143相比共发生5个位点突变,847株与OL133734、OK254862、 MZ629143、 MW587079相比共发生6个位点突变。结论本研究2株HRV属于A49血清型,VP1、3C、3D编码蛋白区变异较大。