鼻病毒A21基因型的划分及全基因组特征分析

人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是导致儿童急性呼吸道感染的主要病毒之一。最近的研究报道发现HRV-A21可导致危重症急性呼吸道感染。本研究将2013~2015年河北省发热呼吸道症候群哨点监测病例中获得的一株HRV-A21病毒标本(本课题组之前的研究已获得VP4/2区序列),结合从GenBank数据库下载的全球98株HRV-A21代表株,基于VP4/2区构建亲缘性关系树。本研究首次将HRV-A21划分为A、B、C、D、E五个基因型,其中E基因型进一步划分为E1、E2和E3亚型,并发现E1、E2和E3亚型在年代分布上呈现出一定的时间进化趋势。我国流行的HRV-A21以C和E基因型为主。基于VP1区划分基因型的结果与VP4/2区相似。本研究进而对这一株HRV-A21进行了全基因组序列测定,并结合GenBank数据库下载的HRV-A21全基因组序列,对HRV-A21进行基因亲缘性关系分析、氨基酸变异和糖基化位点分析。结果显示VP2区、VP3区、VP1区和3D区都属于高变区,但变异程度VP1区>VP2区>VP3区>3D区,同时发现了保守的14个N-糖基化位点和26个O-糖基化位点,和新增的5个N-糖基化位点和5个O-糖基化位点。本研究在GenBank数据库的基础上结合本课题组获得的一株HRV-A21序列,对HRV-A21进行基因型和基因亚型的划分,对HRV-A21在全球和我国部分地区的分布情况和流行特点进行了初步的分析,并对HRV-A21全基因组序列特征进行了分析,丰富了HRV-A21基因数据库,为HRV-A21诊断、分子流行病学等的研究以及疾病的防控和治疗提供了基础数据。

鼻病毒A21型人群血清中和抗体分布特点

目的既往研究发现鼻病毒（human rhnivirus，HRV）21型可导致人重症感染和死亡，其抗原位点发生变异，为深入揭示其病原学意义，本研究分析了HRVA21在人群的血清中和抗体分布特点。方法用人宫颈癌细胞H1-HeLa从临床样本中分离HRVA21毒株。病毒经纯化后进行基因组序列的鉴定和滴度测定。用固定病毒稀释血清方法测定不同年龄组健康人群血清中和抗体水平。结果获得了HRVA21病毒毒株，其基因组序列与来源的样本中序列同源性100%。在379份血清中，以0～5岁、5～14岁、15～25岁、26～45岁、46～60岁和60岁以上分为6组，HRVA21中和抗体阳性率分别为21.7%、14.1%、28.2%、25.4%、27.9%和20.7%。仅〉5～14岁和15～25岁组间HRVA21中和抗体阳性率差异有统计学意义（χ^2＝4.68454, P＝0.03044），两组中和抗体滴度几何均数也差异有统计学意义（P＝0.0313）。结论HRV-A21在不同年龄组人群中血清中和水平均较低，提示其低水平流行及人群高易感性。