4株无花果病原真菌分离鉴定与碳源代谢指纹谱分析

无花果果实皮薄多汁,采后易受微生物侵染。分离筛选采后贮藏期间无花果发病部位的病原真菌,结合形态学观察、真菌rDNA内转录间隔区(internal transcribed spacer, ITS)序列分析、系统发育树构建进行研究,并将分离得到的病原真菌回接至健康果实,发现健康果实出现与发病果实相同的病症。最终从无花果叶子和果实上分别分离到4株丝状病原真菌,其中179#为链格孢菌(Alternaria alternata)、180#为气味镰刀菌(Fusarium odoratissimum)、181#为内生炭疽杆菌(Colletotrichum endophyticum)和182#为总枝状毛霉(Mucor racemosus),其中气味镰刀菌、内生炭疽杆菌和总枝状毛霉为无花果中未见报道的病原真菌。利用Biolog微生物鉴定系统对4株病原真菌进行碳源代谢指纹谱分析,发现它们对60种碳源具有相似的代谢特征,包括L-阿拉伯糖、D-纤维二糖和α-环式糊精等56种可利用碳源以及N-乙酰-D-半乳糖胺、N-乙酰-β-D-甘露糖胺、L-海藻糖和D-乳酸甲酯4种不可利用碳源。研究结果旨在为无花果病原真菌的生物学特征以及采后病害防治的研究提供参考依据。

微生物肥料在不同节肥水平下对烟草根际微生物碳代谢指纹的影响

为了探究微生物肥料在节肥条件下对烟草根际微生物功能多样性的影响,应用Biolog-ECO技术,研究了金农肥中肥和德根贝在0%、10%、20%、30%节肥水平下烟草根际微生物碳代谢特征。结果表明,金农肥中肥和德根贝的根际微生物,对4类碳源的利用能力均随节肥量的增加而下降;主成分分析表明,在节肥水平下,金农肥中肥和德根贝的根际微生物对碳源的利用方式不同,金农肥中肥偏好代谢中间产物及次生代谢物,而德根贝偏好糖类、脂肪酸和脂类;金农肥中肥和德根贝的根际微生物群落的丰富度、均匀度、优势度在各节肥水平下均显著高于全量施肥(P<0.05);从减少化肥施用量对根际微生物碳源代谢能力、碳源利用多样性的影响来看,金农肥中肥和德根贝的节肥比例均以不高于20%为宜,且德根贝表现更优。本研究结果为烟草生产上微生物肥料和节肥能力的选择提供了理论依据。

不同放牧强度松嫩草地土壤细菌碳代谢指纹差异

为了探讨放牧强度对松嫩草地土壤细菌功能多样性的影响,利用Biolog-ECO微平板检测技术研究了休牧、适牧、重牧三种不同放牧强度下土壤细菌碳源利用的特征与差异。结果表明:(1)随着培养时间的延长,土壤细菌碳源利用强度逐渐加强并在192h后趋于稳定,证明土壤细菌生物代谢活性逐渐加强;(2)适牧下土壤细菌AWCD、Shannon-Wiener指数、物种丰富度指数、Pielou均匀度指数均最高,休牧次之,重牧最低;(3)适牧处理下的土壤细菌能充分利用碳水化合物、氨基酸、多聚物、酚酸类及胺类等碳源,休牧处理下的土壤细菌对碳水化合物、氨基酸及多聚物能够充分利用,而重牧处理下的土壤细菌只对羧酸类碳源利用有相对优势,三种放牧强度土壤细菌碳代谢指纹顺序为适牧>休牧>重牧;(4)根据RDA分析得出:土壤pH、有机质和全氮是影响松嫩草地土壤细菌碳源利用的主要因素。

连作对烟草根际土壤细菌碳代谢指纹的影响

为了探究连作对烟草根系微生态的影响,采用Biolog技术分析了不同连作年限下烟草根际土壤细菌的碳代谢指纹差异。结果表明:根际土壤细菌对31种碳源的AWCD值随连作年限的增加而下降,与CK相比,连作5,10年后分别下降12.7%,74.0%;但6类不同碳源之间AWCD值降幅差异较大,连作5,10年后,降幅分别为3.7%~52.1%,64.9%~80.3%;主成分分析表明,以糖类、氨基酸类碳源利用为主的细菌数量显著减少是导致碳源总体利用能力下降的主要因素;连作改变了烟草根际细菌的代谢特征,表现为对糖类、氨基酸类碳源利用率下降,对多聚物类碳源利用率增加;连作降低了根际土壤细菌的香浓指数(丰富度)。

3株果实采后葡萄孢属真菌ITS区rDNA序列与碳源代谢指纹图谱分析

从采后贮藏过程中发病的草莓、蓝莓和樱桃果实中分离到3株丝状真菌138#、233#和366#。综合形态学特征观察与ITS区r DNA序列分析结果,可确定3株真菌均为葡萄孢属病原菌(Botrytis)。分子鉴定进化树和碳源代谢聚类分析结果,都得到菌株138#与366#在一个大的分支上,而菌株233#在一个分支上。菌株138#鉴定结果与Botrytis cinerea(KJ937044.1)在同一分支上亲缘性达100%,且与366#亲缘性达99%;菌株233#鉴定结果与Botrytis elliptica(EU519207.1)在同一分支上且亲缘性达100%。95种碳源代谢指纹图谱分析的结果表明,3株葡萄孢属病原菌对吐温80、N-乙酰-D-半乳糖胺、N-乙酰-D-葡萄糖胺和苦杏仁苷等67种碳源的代谢能力相同,包括56种最适碳源、1种可利用碳源和10种不可利用碳源,Biolog系统中鉴定出3株丝状真菌均与B.cinerea Pers.BGA相近,其中菌株233#与B.cinerea的代谢指纹图谱最为相近。

代谢指纹分析及其在食品科学中的应用

代谢指纹分析是代谢组学的重要研究手段之一,它具有快速、高通量、全局分析的特点。文中在总结国内外近几年来有关代谢指纹分析研究开发与应用文献的基础上,对其概念与分类、分析流程及其在营养代谢性标记物研究、物质代谢规律研究、膳食调查与评价、食品原料差异性鉴别、食品质量评价与追溯等方面的应用,并对该技术在食品科学中应用进行了综述。

5株桃、李果实采后褐腐病菌鉴定、rDNA ITS序列与碳源代谢指纹图谱分析

从采后贮藏过程中发病的桃、李果实中分离到5株丝状病原真菌。对其进行形态学特征观察以及核糖体rDNA ITS序列分析和95种碳源代谢指纹图谱分析。结果表明:5株病原真菌均为果生链核盘菌(Monilinia fructicola),其中091#和089#菌与Monilinia fructicola(FJ515894)的亲缘关系较近。5株褐腐病菌对D-果糖、麦芽糖、蔗糖等共56种碳源的代谢能力相同,包括51种最适碳源和5种不可利用碳源,其中Monilinia fructicola 091#与089#的代谢指纹图谱最接近,而Monilinia fructicola 086#、071#、072#的代谢指纹图谱最接近。因此利用rDNA ITS序列和碳源代谢指纹图谱均可区分桃、李果实5株褐腐病菌不同菌株之间的差异,且两种方法具有可比性。

李果实贮藏期间4株病原真菌的分离、鉴定及碳源代谢指纹图谱分析

从采后贮藏过程中发病的"安哥诺"(Prunus angeleno)和"黑琥珀"(Prunus salicina cv.Black amber)李果实中分离到4株丝状病原真菌。通过对病原菌株形态学特征观察以及核糖体rDNA ITS序列系统分析,确定菌株059#为串珠状赤霉(Gibberella moniliformis)、菌株067#为链格孢菌(Alternaria alternata)、菌株087#为草酸青霉(Penicilliumoxalicum)以及菌株088#为塔宾曲霉(Aspergillus tubingensis)。进一步利用Biolog FF MicroPlate分析病原菌对95种碳源的利用能力,结果表明这4种病原菌的最适碳源皆在77种以上,且共同的最适碳源包括D-果糖、D-葡萄糖、蔗糖、山梨糖醇、苹果酸和柠檬酸等45种。

1株蒜薹采后病原真菌的鉴定、rDNA ITS序列及碳源代谢指纹图谱分析

为明确蒜薹贮藏期致病菌种类,增强采后病害防治针对性,从自然发病的苍山草薹上分离到1株丝状致病真菌,经形态学特征观察及rDNA ITS序列分析确定为茄匍柄霉(Stemphylium solani),分析其对95种碳源代谢指纹图谱发现该菌对碳源适应性较强,最适碳源有D-果糖、蔗糖、麦芽糖、α-D-葡萄糖、D-半乳糖等75种,可利用碳源有5种:D-葡萄糖胺、D-塔格糖、γ-羟丁酸、D-苹果酸和尿苷,不可利用碳源有N-乙酰-β-D-甘露糖胺、N-乙酰-D-半乳糖胺、L-海藻糖、i-赤藓糖醇、葡糖醛酰胺等15种。

乌头类生物碱组分在CYP450中的代谢指纹图谱及对CYP450活性的影响

利用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)的多反应监测(MRM)技术,结合多探针底物方法,对单酯型及双酯型乌头类生物碱组分对细胞色素P450(CYP450)亚型的活性影响进行了研究;同时利用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS/MS)对单酯型和双酯型乌头类生物碱组分在CYP450中的代谢指纹图谱进行了研究.活性影响研究结果表明,单酯型生物碱组分对CYP2C及2D的抑制能力较强,其IC50值分别为7.44和6.74μmol/L;双酯型生物碱组分对CYP1A2,3A,2C和2D均有较弱的抑制作用,其IC50值分别为39.48,70.44,17.36和86.04μmol/L.代谢指纹图谱显示,双酯型生物碱组分在大鼠肝微粒体中有6个特异性产物可以作为该反应的特征峰.

代谢组学中代谢指纹分析技术进展

代谢组学主要考察生物体系受刺激或扰动后其内源性代谢产物的变化,从而研究生物体系的代谢途径。代谢指纹分析技术是代谢组学常用的研究手段之一。本文对代谢组学及代谢指纹分析技术的研究进展作相应的论述。

1株桃果实采后病原真菌的鉴定以及碳源代谢指纹图谱分析

从采后贮藏过程中发病的八月脆桃果实(Amygdalus persica cv.Bayuecui)中分离到1株真菌菌株074#.通过对病原菌形态学观察以及核糖体ITS rDNA序列分析,证明菌株074#为灰葡萄孢霉菌(Botrytis elliptica).致病性试验结果表明,桃果实为灰葡萄孢霉菌的寄主.通过Biolog FFMicroPlate分析该病原菌对95种碳源的利用能力,结果表明,Botrytis elliptica代谢指纹图谱为最适碳源包括D-果糖、蔗糖、L-苹果酸、琥珀酸、D-葡萄糖酸、L-天门冬氨酸、L-丝氨酸、腺苷、5'-磷酸腺苷等26种,可利用碳源14种,不可利用碳源55种.

CS-HPLC-ESI-MS^n法分析复方丹参滴丸的代谢指纹图谱(英文)

目的:建立舌下含服复方丹参滴丸后人血浆中活性成分的代谢特征指纹图谱。方法:在不同时间点采集人血浆样品,通过微血管张力实验测试血管扩张效果,采用柱切换系统对样品进行富集纯化。结果:1.5h采集的血浆扩张血管能力最强,在色谱图中出现5个新的色谱峰。结论:色谱图中5个特征色谱峰与复方丹参滴丸的药效物质基础关系密切。

3株罗伦隐球酵母的26S rDNAD1/D2区序列、代谢指纹图谱及生防效力比较分析

研究3株不同来源的酵母拮抗菌(Crytococcus laurentii)001#、010#和012#的种间亲缘关系、Biolog微生物鉴定系统中的不同碳源物质代谢指纹图谱以及对于不同果蔬的侵染病原菌的生防效力。结果表明:亲缘关系相近的菌株001#和010#间的碳源代谢指纹图谱中存在43种相同的最适碳源和13种相同的可利用碳源,菌株012#则与001#和010#利用碳源情况差异性较大,但是它们分别在梨、油桃和芦笋果实上的生防效力却有一些差别,这可能与不同菌株所特异利用的碳源种类以及果蔬中含有的特异的碳源种类和含量有关。发现不同果实的碳源成分和比例引起的拮抗菌生防效果差异的现象,并揭示亲缘关系能在一定程度上通过菌株的碳源代谢特征表现出来,为酵母拮抗菌在生防效力作用机理研究提供参考。

代谢指纹技术在曲药分析中的应用

在传统白酒酿造过程中 ,曲药的作用至关重要 ,但曲药分析检测手段的不完善一直是制约传统白酒生产进一步发展的一个重要原因。我厂在研究中发现 ,新兴的代射指纹技术不仅可以对曲药性质进行准确的刻画 ,而且可以具体分析出某种制曲因素 (如制曲环境、制曲工艺、制曲原料等 )对某类微生物群系在曲药中消长的影响。故代谢指纹技术不失为一种应用于更多的了解曲药性质 ,进行曲药检测、曲药研究。

代谢指纹技术在曲药分析中的应用

在传统白酒酿造过程中,曲药的作用至关重要,但曲药分析检测手段的不完善一直是制约传统白酒生产进一步发展的一个重要原因。我厂在研究中发现,新兴的代谢指纹技术不仅可以对曲药性质进行准确的刻画,而且可以具体分析出某种制曲因素(如制曲环境、制曲工艺、制曲原料等)对某类微生物群系在曲药中消长的影响。故代谢指纹技术不失为应用于更多地了解曲药性质、进行曲药检测、曲药研究、工艺控制及改革等的一种新的有效手段。

基于“化学指纹-药动指纹-代谢指纹”关联的化学模式探究天然药物给药机理

通过概述天然药物化学指纹的研究概况,分析天然药物化学指纹特点和发展情况,以及天然药物化学指纹图谱发展的前景;通过概述天然药物药物动力学指纹研究概况,分析了天然药物药物动力学研究的不足,并分析了天然药物药物动力学指纹研究的前景;通过概述代谢组学指纹研究概况,分析代谢组学指纹发展前景。随着三方面研究的深入,必然实现他们的结合,从而提出了基于“化学指纹-药动指纹-代谢指纹”关联的化学模式探究天然药物给药机理。“化学指纹-药动指纹-代谢指纹”所反映出的指纹信息,能较清晰地揭示天然药物的给药机理。建立指纹技术相互关联模式将更直观的揭示天然药物在体内的吸收、分布、代谢和排泄的规律。

1株耐氯霉素腐败微生物的16S rRNA基因序列与碳源代谢指纹图谱分析

从污染的化妆品中分离到1株具有氯霉素抗性的革兰阴性菌213#。通过16S rRNA基因同源性比较,表明分离菌与GenBank中洋葱伯克霍尔德(Burkholderia cepacia)标准菌株同源性为100%,通过Biolog GN2MicroPlate分析该病原菌对95种碳源的利用能力,发现分离菌与Biolog数据库中的B.cepacia具有最相似的特征代谢指纹。

4株水果采后链格孢属真菌的rDNA ITS区序列与碳源代谢指纹图谱差异性分析

从采后贮藏过程中发病的冬枣、樱桃、杏及蓝莓果实中分离到4株丝状病原真菌231#、320#、322#和333#。由形态学特征观察可确定4株病原菌均为链格孢属真菌(Alternaria Nees),r DNA ITS区序列进化树分析结果表明樱桃320#和杏322#与A.alternata(AY625056.1)处于同一分枝,置信度达100%;而蓝莓333#与A.tenuissima(KP324980.1)处于同一分枝,冬枣231#与蓝莓333#和A.tenuissima(KP324980.1)的亲缘性很近,在同一分支上的置信度达100%。对95种碳源的代谢指纹图谱分析的结果表明,4株链格孢属真菌对吐温80、N-乙酰-D-葡萄糖胺、N-乙酰-β-D-甘露糖胺等86种碳源的代谢特征相同,包括78种最适碳源和8种不可利用碳源,其中冬枣231#与A.alternata(Fr.)Keissl的代谢指纹图谱最为相近。4株链格孢属真菌的ITS区序列系统进化树分类与碳源代谢聚类分析结果存在一定差异。

葫芦与西瓜砧穗在不同土壤上根际碳代谢指纹特征与差异

土传病害的发生与微生物关系密切,但砧穗互作下根际微生物活性变化尚不明确。为阐明在不同土壤类型下,砧穗互作对根际微生物活性的影响,采集黑土(吉林)、砖红壤(海南)、黄棕壤(江苏)和灰漠土(新疆)四种类型土壤,并在每种土壤上均种植自根葫芦、自根西瓜、嫁接西瓜(葫芦砧木)以及嫁接葫芦(西瓜砧木),利用Biolog培养技术探究不同处理下根际微生物碳源代谢活性的差异。结果表明,不同土壤类型下微生物代谢活性差异显著(R^2=0.534,p<0.001),不同嫁接植物之间根际微生物碳源利用同样存在显著差异(R^2=0.075,p<0.001)。不同嫁接处理根际微生物对碳源的综合代谢水平自根西瓜>嫁接葫芦(西瓜砧木)>嫁接西瓜(葫芦砧木)>自根葫芦。聚类推进树(Aggregated boosted tree,ABT)分析显示土壤有效磷、速效钾是影响微生物碳源利用的主要因子。评估不同土壤类型下根际微生物碳代谢活性对砧穗互作的响应,可为防控土传病害提供依据。