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代谢计算在分子稳定性分析中的应用
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作者 胡扬 年晓红 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2011年第11期71-74,共4页
本文总结了人工代谢算法当前的主要应用领域,分析了信息技术在分子模拟分析中的发展趋势,给出了应用于分子稳定性分析时的代谢计算编码设计模式。并以几种常见分子为例,基于代谢计算分析了物质的稳定性。分析结果表明了该方法的可行性... 本文总结了人工代谢算法当前的主要应用领域,分析了信息技术在分子模拟分析中的发展趋势,给出了应用于分子稳定性分析时的代谢计算编码设计模式。并以几种常见分子为例,基于代谢计算分析了物质的稳定性。分析结果表明了该方法的可行性和有效性。 展开更多
关键词 人工代谢算法 代谢计算 分子稳定性分析 分子建模
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基于质谱数据的计算代谢组学方法学研究进展 被引量:2
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作者 杨军 刘心昱 许国旺 《中国科学:化学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1580-1591,共12页
代谢组学旨在对代谢组进行全景的分析,从而发现生物现象或规律.由于代谢物的种类和数量都非常庞大,对代谢组的分析高度依赖于分析仪器和方法.质谱是代谢组分析最有用的工具,超高效液相色谱-高分辨质谱可以从生物样品中获得大量的代谢物... 代谢组学旨在对代谢组进行全景的分析,从而发现生物现象或规律.由于代谢物的种类和数量都非常庞大,对代谢组的分析高度依赖于分析仪器和方法.质谱是代谢组分析最有用的工具,超高效液相色谱-高分辨质谱可以从生物样品中获得大量的代谢物离子特征,获得丰富的代谢组信息,但如何对质谱数据进行挖掘和利用仍面临极大的挑战.计算代谢组学可以充分利用质谱采集的数据,结合统计、化学计量学、人工智能等方法实现对代谢组学数据的高效处理和分析,推动代谢组学的发展.本文在给出代谢组数据特点的基础上,综述了数据驱动的计算代谢组学方法学进展,包括特征提取、代谢物的注释和鉴定,并简要介绍了知识辅助的计算代谢组学方法,最后对计算代谢组学方法学下一步的发展进行了展望. 展开更多
关键词 计算代谢组学 质谱 特征提取 代谢物注释与鉴定
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Role of(~(18)F)2-fluoro-2-deoxyglucose positron emission tomography in upper gastrointestinal malignancies 被引量:6
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作者 Elizabeth C Smyth Manish A Shah 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2011年第46期5059-5074,共16页
The role of whole-body FDG [(~(18)F)2-fluoro-2-deoxy-glucose] positron emission tomography(PET)scan-ning as an imaging modality in the management of patients with malignancy has evolved enormously over the past two d... The role of whole-body FDG [(~(18)F)2-fluoro-2-deoxy-glucose] positron emission tomography(PET)scan-ning as an imaging modality in the management of patients with malignancy has evolved enormously over the past two decades.FDG-PET has demonstrated signifi cant effi cacy in the staging,prognostication and detection of occult metastatic disease in malignancies of the gastrointestinal tract,in addition to assessment of the response to cytotoxic chemotherapy in a more timely manner than has traditionally been possible by more conventional imaging tools.The sensitivity and specif icity of FDG-PET for the detection and staging of malignancy depend not only on the site and size of the primary tumor and metastases,but also on histologi-cal cell type,reflecting underlying disparities in glucose metabolism.The metabolic response to neo-adjuvant chemotherapy or to chemo-radiotherapy in cancers of the gastro-esophageal junction or stomach has been demonstrated in several prospective studies to correlate signifi cantly with both the histological tumor response to treatment and with consequent improvements in overall survival.This may offer a future paradigm ofpersonalized treatment based on the PET response to chemotherapy.FDG-PET has been less successful in efforts to screen for and detect recurrent upper gastro-intestinal malignancies,and in the detection of low vol-ume metastatic peritoneal disease.Efforts to improve the accuracy of PET include the use of novel radiotrac-ers such as(~(18)F)FLT(3-deoxy-3-fluorothymidine)or 11C-choline,or fusion PET-CT with concurrent high-res-olution computed tomography.This review focuses on the role of FDG-PET scanning in staging and response assessment in malignancies of the upper gastrointesti-nal tract,specif ically gastric,esophageal and pancreas carcinoma. 展开更多
关键词 Positron emission tomography Gastric cancer Esophageal cancer Pancreas cancer
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