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盐生海藻杜氏盐藻的转录组测序以及注释(英文)
被引量:
2
1
作者
Ling HONG
Jun-li LIU
+1 位作者
Samira Z.MIDOUN
Philip C.MILLER
《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》
SCIE
CAS
CSCD
2017年第10期833-844,共12页
目的:解析杜氏盐藻代谢过程,主要关注盐胁迫下累积的代谢物(渗透平衡产物、多胺和类胡萝卜素)的代谢。创新点:本研究通过高通量测序产生了大量来自杜氏盐藻整个生长周期的转录组数据,描述了杜氏盐藻在盐胁迫下累积的渗透平衡产物、多胺...
目的:解析杜氏盐藻代谢过程,主要关注盐胁迫下累积的代谢物(渗透平衡产物、多胺和类胡萝卜素)的代谢。创新点:本研究通过高通量测序产生了大量来自杜氏盐藻整个生长周期的转录组数据,描述了杜氏盐藻在盐胁迫下累积的渗透平衡产物、多胺和类胡萝卜素的代谢过程。另外通过该手段也进一步分析了盐胁迫处理下,抑制精胺合成底物的供应可能会缓解盐藻增殖对胡萝卜素含量的影响。方法:以来自3个不同生长时期的杜氏盐藻为材料,进行大规模转录组测序。在转录组功能注释的基础上,预测了杜氏盐藻盐胁迫下累积的渗透平衡产物(图3)、多胺(图4)和类胡萝卜素(图5)的代谢路径。利用相对定量聚合酶链反应(qP CR)技术构建了相关代谢路径中关键基因的表达谱(图6)。结论:通过杜氏盐藻转录组测序共获取了39 820条单一序列。在功能注释和聚类分析的基础上预测了杜氏盐藻盐胁迫下累积的渗透平衡产物(甘油和脯氨酸)、多胺以及类胡萝卜素的代谢路径。相关代谢途径的关键酶的表达谱分析,说明盐能够调节甘油、脯氨酸以及多胺的代谢过程。抑制精胺合成底物的供应可能会缓解盐藻增殖对胡萝卜素含量的影响。
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关键词
杜氏盐藻
转录谱
代谢过程与调控
调节机制
盐胁迫
原文传递
题名
盐生海藻杜氏盐藻的转录组测序以及注释(英文)
被引量:
2
1
作者
Ling HONG
Jun-li LIU
Samira Z.MIDOUN
Philip C.MILLER
机构
Department of Genetics and Developmental Biology
Systems Biology Research Group
出处
《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》
SCIE
CAS
CSCD
2017年第10期833-844,共12页
基金
Project supported by the National High-Tech R&D Program(863)of China(No.2007AA09Z449)
文摘
目的:解析杜氏盐藻代谢过程,主要关注盐胁迫下累积的代谢物(渗透平衡产物、多胺和类胡萝卜素)的代谢。创新点:本研究通过高通量测序产生了大量来自杜氏盐藻整个生长周期的转录组数据,描述了杜氏盐藻在盐胁迫下累积的渗透平衡产物、多胺和类胡萝卜素的代谢过程。另外通过该手段也进一步分析了盐胁迫处理下,抑制精胺合成底物的供应可能会缓解盐藻增殖对胡萝卜素含量的影响。方法:以来自3个不同生长时期的杜氏盐藻为材料,进行大规模转录组测序。在转录组功能注释的基础上,预测了杜氏盐藻盐胁迫下累积的渗透平衡产物(图3)、多胺(图4)和类胡萝卜素(图5)的代谢路径。利用相对定量聚合酶链反应(qP CR)技术构建了相关代谢路径中关键基因的表达谱(图6)。结论:通过杜氏盐藻转录组测序共获取了39 820条单一序列。在功能注释和聚类分析的基础上预测了杜氏盐藻盐胁迫下累积的渗透平衡产物(甘油和脯氨酸)、多胺以及类胡萝卜素的代谢路径。相关代谢途径的关键酶的表达谱分析,说明盐能够调节甘油、脯氨酸以及多胺的代谢过程。抑制精胺合成底物的供应可能会缓解盐藻增殖对胡萝卜素含量的影响。
关键词
杜氏盐藻
转录谱
代谢过程与调控
调节机制
盐胁迫
Keywords
Dunaliella salina
Transcriptome profile
Metabolic processes and adjustment
Regulatory metabolism
Salt stress
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
盐生海藻杜氏盐藻的转录组测序以及注释(英文)
Ling HONG
Jun-li LIU
Samira Z.MIDOUN
Philip C.MILLER
《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》
SCIE
CAS
CSCD
2017
2
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