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题名QPSO算法和罚函数在代谢通量评估中的应用
被引量:1
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作者
龙海侠
吴淑雷
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机构
海南师范大学信息科学技术学院
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出处
《计算机仿真》
CSCD
北大核心
2013年第6期346-350,共5页
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文摘
针对代谢通量的评估问题属于带约束的优化问题,提出了使用罚函数(penalty function,PF)的量子粒子群优化(Quan-tum-behaved particle swarm optimization,QPSO)算法来解决上述问题,通过处罚约束条件建立单一的目标函数,把带约束的化学计量转换成无约束的,然后使用QPSO算法最小化内部代谢通量。算法可用于评估谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glu-tamicum)的内部代谢通量,实验结果表明,提出的算法能够以较快的收敛速度找到较好的接近最优点的量化值。
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关键词
代谢通量评估
带约束优化
量子粒子群优化算法
罚函数
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Keywords
Metabolic flux estimation
Constrained optimization problem
Quantum- behaved particle swarm opti- mization (QPSO)
Penalty function (PF)
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分类号
TP39
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名基于自适应罚函数的QPSO算法的代谢通量评估
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作者
龙海侠
张秀虹
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机构
海南师范大学信息科学技术学院
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出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2012年第4期1227-1229,1296,共4页
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基金
海南省自然科学基金资助项目(611131
610223)
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文摘
针对代谢通量评估问题属于带约束的优化问题,其目标函数是一个非线性、不可微的并且存在多个局部最小点的复杂函数,提出了使用自适应罚函数的量子粒子群优化算法来解决这个问题。通过自适应罚函数的方法解决约束条件,然后使用QPSO算法最小化内部代谢通量。用此算法评估谷氨酸棒杆菌的内部代谢通量并与传统的优化算法来比较,实验结果证明了该算法的可行性和有效性。
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关键词
代谢通量评估
带约束优化
量子粒子群优化算法
自适应罚函数
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Keywords
metabolic flux estimation
constrained optimization problem
quantum-behaved particle swarm optimization
self-adaptive penalty function
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分类号
TP301.6
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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