北京地区男男性行为人群HIV感染者中传播耐药状况

目的了解北京地区男男性行为人群(MSM)的艾滋病病毒(HIV)传播耐药流行状况。方法收集536例新诊断的HIV感染者基线耐药检测数据,包括266例急性或早期感染者和270例慢性感染者。比较两组患者在病毒亚型和主要传播耐药突变模式,以及对目前我国一线、二线抗病毒治疗药物的预测敏感性差异。结果 536名感染者中,CRF01_AE亚型占52.1%,B亚型占24.8%,CRF07_BC/CRF08_BC占21.6%,另外有1.3%的患者属于独特的重组形式。7.8%的患者带有一种以上的传播耐药突变,其中,蛋白酶抑制剂(PI)类药物相关的耐药突变流行率为6.2%,核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)类药物相关的耐药突变流行率为0.9%,非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)类药物相关的耐药突变流行率为1.7%。仅1例患者(0.2%)被预测对NRTI类药物中的阿巴卡韦(ABC)显著耐药,PI类药物的显著耐药率为0,依非韦伦(EFV)和奈韦拉平(NVP)的显著耐药率为1.3%。急性或近期感染者与慢性感染者相比,在传播耐药流行率、耐药突变模式及预测的药物敏感性上都没有显著差异。结论中国MSM的HIV感染者总体传播耐药率较低,但是PI类药物相关的耐药突变流行率相对较高,值得临床医生予以重视。

HIV的传播耐药

传播耐药（TDR）是抗逆转录病毒治疗广泛开展后不可避免的产物，有增加初始抗病毒治疗失败的风险。目前美国健康和人类服务部（DHHS）指南建议对所有HIV感染者进行TDR筛查。此文对TDR的全球流行情况，影响耐药毒株传播效率的因素，耐药毒株在新宿主中的演变，对临床治疗和病情进展的影响．临床实践中的TDR检测等方面的研究进展作一综述，为临床初始抗病毒药物的选择及相关政策的制定提供依据。

我国HIV传播耐药监测中一类重要问题的处理（英文）

对于HIV传播耐药,WHO给出了截断序贯抽样方法来判别耐药水平,要求的最大样本量是47.但是,中国当前HIV流行水平较低,最大样本量很多时候无法达到,导致不能给出耐药水平的准确判断.为了解决这个问题,本文借助贝叶斯估计,给出了一种方法加于改进.借助于该方法,最大样本147被减小到38.做为该方法的应用,对于WHO抽样方法无发判断的新疆和湖南地区,我们分别给出了低水平耐药和中水平讨药的判定.同时,对于WHO抽样方法能够判断的地区,我们的方法也给出了相同的结论.本文的方法可以应用到样本量不够充足的地区,是WHO抽样方法的改进.

HIV传播耐药的研究进展

高效联合抗反转录病毒治疗已明显改善HIV感染者的预后,HIV耐药是影响抗反转录病毒治疗疗效的重要因素。在未接受抗反转录病毒治疗的HIV感染中亦可检测到HIV耐药突变(即HIV传播耐药)。HIV传播耐药可导致后续抗反转录病毒治疗疗效的下降或失败,其在人群的进一步传播及流行成为重要的公共卫生问题。作者就HIV传播耐药的现有检测方法、国内外流行现状以及耐药检测的临床意义作一综述。

2015年河南省新确证HIV-1感染者耐药传播状况研究

目的调查2015年河南省新确证人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染者中HIV耐药株的流行情况。方法对河南省4个地区2015年1—6月新确证HIV-1感染者确证时的信息资料进行整理,随后进行血样采集,基因型耐药检测和数据的分析。结果共收集到117例患者的样本和信息,得到63例患者的基因型耐药检测结果。63例患者中有11例被检测到携带耐药株,耐药传播率为17.46%。男性的耐药传播率高于女性(P<0.05),20~39岁病例的耐药传播率高于其他年龄段(P<0.05),B亚型的耐药传播率高于其他亚型(P<0.05),郑州地区病例的耐药传播率高于其他地区(P<0.05)。非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)和核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)耐药突变的发生率分别为15.87%(10/63)、4.76%(3/63)。NRTI耐药突变有M184V、K65R和F227FL,NNRTI耐药突变有V106I/V/M、V179D/V/E、G190E、V108I、Y181C和H221Y。2例病例同时携带NNRTI和NRTI耐药突变。CRF07-BC亚型占比最高,为36.51%(23/63),其次为B亚型[34.92%(22/63)]和CRF01-AE[26.98%(17/63)]。结论河南省新确证HIV-1感染者中已经出现了一定程度的耐药传播,CRF07-BC和CRF01-AE已经成为主流毒株亚型。

某肿瘤专科医院多部门协作防控多重耐药菌传播医院感染管理

目的对临床肿瘤患者送检微生物培养标本检出MDROs(multi-drug resistant organisms,多重耐药菌)开展目标性监测;探讨多部门协作防控MDROs传播的医院感染管理。方法完善组织、制定制度和明确职责,对临床送检微生物培养监测到MDROs感染的患者,采取多部门协作防控MDROs感染:(1)营造感控文化氛围;(2)加强MDROs目标性监测;(3)落实隔离措施;(4)重视信息畅通与反馈。结果 2012和2013年度MDROs感染人数千床日检出率分别是0.197‰和0.198‰;期间没有发生MDROs感染传播病例和MDROs感染暴发事件。结论医院多部门协作是防控MDROs传播医院感染的有效管理方法。

重庆市新确证HIV-1感染者传播性耐药突变研究

目的通过对重庆市新确证人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染者耐药基因型的研究,了解我市耐药病毒株的传播水平。方法采集2014年5月至2017年6月我院新确证未治疗的HIV-1感染者的外周血175例,分离血浆后,使用一步法RT-PCR和巢式PCR扩增HIV-1pol区的基因,PCR产物经纯化后测序,将获得的基因序列与美国雅培公司的耐药数据库对比,得出患者对药物的耐药性解释。结果 PCR扩增阳性且测序成功168例,发现16例患者存在耐药突变,传播性耐药突变检出率达9.5%(16/168),其中2014-2017年的耐药比例分别为7.0%、8.0%、9.1%、12.5%,属中度流行。非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)和蛋白酶抑制剂(PIs)耐药突变率分别为9.5%、2.4%和0%。V179D/E(7.1%)和M184V(2.4%)分别是出现最多的NNRTI和NRTI耐药突变位点。168例感染者中,CRF07_BC亚型是主要流行亚型(42.8%),其次为CRF01_AE(38.7%)和CRF08_BC亚型(10.1%)。结论重庆市新确证未治疗HIV-1感染者耐药比例有逐年上升的趋势,应加强监测,预防原发性耐药和耐药毒株的传播。

生猪屠宰过程沙门菌污染状况及其耐药性传播风险

本试验旨在通过监测沙门菌在生猪屠宰各环节和猪肉产品中的污染分布和耐药状况,揭示沙门菌在猪肉生产过程中的传播及耐药情况。选取山东省5个代表性生猪屠宰场为风险观测点,采集肛拭子、屠宰环境拭子、水样品和胴体拭子共552份,参照食品安全国家标准和基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对其中沙门菌进行分离培养和鉴定;参照微量肉汤稀释法检测其药物敏感性;利用多位点序列分型(MLST)鉴定沙门菌的基因型。结果显示,共分离获得58株沙门菌,总阳性检出率为10.5%(58/552);中小型屠宰场(15.6%,33/212)较大型屠宰场(7.4%,25/340)沙门菌污染严重;屠宰环节预冷前样品检出率最高,为26.7%(8/30);不同类型样品中肛拭子样品的检出率最高,为15.1%(16/106)。耐药性检测结果显示,58株沙门菌对氨苄西林的耐药率最高(96.6%,56/58),多重耐药率为96.6%(56/58);中小型屠宰场分离株较大型屠宰场的整体耐药严重,胴体拭子(46.4%,26/56)和肛拭子(28.6%,16/56)分离株的多重耐药率高于环境拭子(25.0%,14/56)。MLST基因分型结果显示,58株沙门菌共对应6个ST型,其中ST40型分布最为广泛,在各个环节中均有检出;其次是ST19型。结果表明,生猪屠宰环节沙门菌污染较为严重,需加强屠宰过程的卫生管控;各规模屠宰场应关注耐药菌和耐药基因在产业链和食物链的传播,制定合理的防控措施,防范其可能导致的食品安全风险。

凉山州某县未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的耐药情况分析

目的分析凉山州某县未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的传播性耐药(TDR)情况,为了解当地HIV-1耐药株的传播及抗反转录病毒治疗(ART)方案的制定提供理论依据和技术支撑。方法以来源于2022年1—8月在凉山州某县未接受ART的HIV-1感染者为研究对象,采集其血液样本并分离血浆和血细胞,血浆样本用于HIV-1 RNA定量检测和HIV-1 RNA基因型耐药检测,血细胞样本用于HIV-1 DNA定量检测和HIV-1 DNA基因型耐药检测。结果135例研究对象中,男性75例(55.6%),女性60例(44.4%),中位年龄37.5岁,彝族占比最大(96.3%)。性途径传播为HIV-1主要传播方式(83.0%)。发生TDR的有11例,发生率为8.1%。诊断HIV-1感染距耐药检测时间的中位数为11 d。HIV-1 RNA以10001~100000拷贝/mL占比较多(43.7%)。HIV-1 DNA以101~1000拷贝/106 cells占比较多(55.6%)。HIV-1亚型中,以B+C亚型重组占比最高(51.9%),其次为CRF07_BC重组型(43.0%)。135例研究对象中,有23例(17.0%)出现耐药突变位点,与非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)有关的耐药突变位点有16例(11.9%),K103N是主要的耐药突变位点,依非韦伦和奈韦拉平是主要的耐药药物;与整合酶抑制剂(INSTI)有关的耐药突变位点有6例(4.4%),E157Q是主要的耐药突变位点,埃替拉韦和拉替拉韦是主要的耐药药物;有1例(0.7%)同时出现NNRTI和INSTI耐药突变位点。经过单因素和多因素logistic回归分析,相较于年龄>30岁,年龄≤30岁发生TDR风险更高。结论凉山州某县未接受ART的HIV-1感染者的耐药情况不容忽视,相较于年龄>30岁,年龄≤30岁发生TDR风险更高,建议HIV-1感染者在接受ART前均进行HIV-1耐药检测。

OXA-23型酶介导的鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类抗生素耐药分子传播机制

目的：探讨OXA-23酶在介导鲍曼不动杆菌碳青霉烯类抗生素耐药过程中的传播机制。方法对2010年9月至2012年3月58株产OXA-23型碳青霉烯酶鲍曼不动杆菌进行深入研究，所有菌株运用PCR mapping方法对blaOXA-23基因的周围结构进行扩增及测序分析；根据PFGE型别挑选不同克隆的菌株，进一步采用S1-PFGE以及ApaI-PFGE联合Southern blot杂交法对blaOXA-23基因进行定位分析。结果58株菌中有47株菌的blaOXA-23基因周围结构为Tn2009转座结构、11株为Tn2008转座结构；58株菌属于8个不同的克隆型别（A、B、C、D、E、F1、F2、G和H克隆），其中E克隆的blaOXA-23基因存在2个拷贝，分别位于质粒及染色体上，质粒大小为78.2kb左右；其余克隆菌blaOXA-23基因定位于染色体上，所在片段大小为310.1kb左右，其中D克隆存在2个染色体拷贝。结论转座结构是导致blaOXA-23基因迅速在鲍曼不动杆菌中转移的重要元件，导致鲍曼不动杆菌碳青霉烯类抗生素耐药传播和扩散。

肠球菌对氨基糖苷类高水平耐药机制的临床研究进展

耐氨基糖苷类高水平肠球菌(HLAR)是医院感染的重要病原菌,氨基糖苷类修饰酶(AME)是肠球菌对氨基糖苷类高水平耐药的主要机制,其中N-乙酰转移酶(AAC)、O-核苷转移酶(ANT)和O-磷酶转移酶(APH)是参与耐药基因表达的主要氨基糖苷类修饰酶类。现就氨基糖苷类修饰酶的耐药基因及其耐药基因的传播进行临床研究,从而为减少医院HLAR感染的发生提供分子生物学依据。

产金属酶的肠杆菌科细菌耐药表型研究

产金属酶的肠杆菌可细菌可广泛水解多种抗生素,对常规β-内酰胺酶抑制剂(如克拉维酸和舒巴坦等)不具有敏感性,是临床研究领域工人的多重耐药病原体。产金属酶的肠杆菌科细菌所导致的感染症状较其他感染症状更为严重,本文研究旨在对产金属酶的肠杆菌科细菌的耐药基因传播、产金属酶的肠杆菌科细菌多重多重耐药性及与之相关的检测方法进行分析。

5种铜绿假单胞菌高危克隆的流行及耐药情况

细菌引起的感染分为社区感染和医院内感染,社区感染的细菌通常对抗生素敏感,较容易控制,而院内感染较难治疗。铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)是机会性感染的非发酵革兰阴性细菌,一种引起医院内感染的常见细菌,并容易感染术后患者及烧伤患者,影响患者的治疗与恢复。抗生素治疗是人们抵御细菌感染性疾病的有效手段,但是随着抗生素的大量使用,抗生素耐药性细菌不断产生,泛耐药(extensively drug resistant, XDR)甚至是全耐药(pandrug-resistant bacteria, PDR)铜绿假单胞菌已在世界多地医院被检出。而这种广泛的耐药性往往集中在几种特定的铜绿假单胞菌基因型中,如ST111、ST175、ST235、ST308和ST664等;由于无药可用,使得它们所引发的感染异常危险,因此被称为高危克隆。本文就目前国际流行的5种铜绿假单胞菌高危克隆进行系统性综述,包括其流行情况、耐药谱、耐药机制及治疗手段,为高危克隆的甄别和防治提供借鉴。

动物源肺炎克雷伯氏菌多重耐药研究进展

肺炎克雷伯氏菌是一种全球广泛存在的条件致病菌,除了是常见的人医院获得性感染病原体外,近年来越来越多的发现表明其能够引起动物侵袭性感染,且该菌携带多种耐药基因。由于一个肺炎克雷伯氏菌细胞可以同时携带多个质粒,具有从环境中的捕获耐药性质粒、并在环境和动物之间传播质粒的能力,这使得该菌既是耐药基因的“收集者”,也是耐药基因的“关键放大器”和“传递者”。目前动物源肺炎克雷伯氏菌耐药性非常严重,已发现对几乎所有抗生素表现出不同程度的耐药性,包括β-内酰胺类抗生素、氟喹诺酮类抗生素和氨基糖苷类抗生素等,其中部分菌株携带产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)和产碳青霉烯酶(CREs)等耐药基因,出现了泛耐药菌株。人们开展植物提取物、噬菌体及基因编辑技术等研究,以期找到解决动物源肺炎克雷伯氏菌耐药性问题的新方法。如人们发现,某些植物提取物表现出抗菌、抗炎、免疫增强等特点,运用基因编辑技术可敲除特定耐药基因,一些噬菌体则可以特异性杀死动物源肺炎克雷伯氏菌等。这些研究为下一步肺炎克雷伯氏菌相关疾病的临床治疗与控制带来了新希望。该文就近年来对动物源肺炎克雷伯氏菌耐药性研究的相关进展,包括耐药性及耐药基因、防治对策研究等,进行了文献综述。

北京基因型是哈萨克斯坦耐药结核病的主要原因

地点:哈萨克斯坦的 9 个州,2001 年。目的:分析哈萨克斯坦的耐药结核杆菌分离株的遗传学联系,确定北京基因型的频率。设计:对 2001 年全国耐药监测中 9 个州的所有耐药涂阳病例进行IS6110指纹和间隔区寡核苷酸分型法(spoligotyping)分析。分离株来自 150 名病人(64名初治,86 名复治病人)。结果:8 例(5.3%)为重复感染。其余 142 株,91株(64.1%)分布在 18 个簇,提示耐药结核病的近期传播率很高。这一结果通过分析成簇菌株相似的耐药谱及病人的来源得到更进一步的证实。而且,成簇菌株中 1/3 以上为新病例。其中,70%为北京基因型,而对照组 40 例敏感株中只有 37.5%为北京基因型。结论:耐药结核病的传播是此结核病高发区耐药菌株传播所致。可以看出,北京基因型是引起哈萨克斯坦耐药结核病的主要原因,北京基因型和耐药相关。

吉林省HIV-1感染者治疗前耐药和分子传播网络特征分析

目的了解吉林省HIV-1(human immunodeficiency virus-1,HIV-1)感染者治疗前基因型耐药及分子网络传播情况。方法选取2022年治疗前HIV感染者228名,提取血浆RNA、反转录PCR扩增HIV-1pol基因片段。建立进化树确定亚型、解析基因型耐药突变(drug resistance mutations,DRMs)情况并构建HIV分子网络评估传播关系。结果从228例样本中成功获得206条pol基因序列,基因亚型主要为CRF01AE(60.68%,125/206)、CRF07BC(30.10%,62/206)和B亚型(5.34%,11/206)。总耐药率为9.22%(19/206),耐药突变以非核苷逆转录酶抑制剂为主,占8.25%(17/206)。多因素logistic回归分析表明,40~49岁和≥50岁,离异或丧偶感染人群产生耐药的风险较高(P<0.05)。白城地区和CRF07BC感染者入网风险更大(P<0.05)。有63条序列入网(30.58%,63/206),形成23个分子簇。入网病例中6例携带DRMs。出现本市和跨市连接边关系。异性与同性性传播感染人群存在混合连接边。结论吉林省HIV感染者治疗前耐药率处于中等水平,分子网络中的毒株呈地区聚集性,加强耐药监测,对网络桥梁人群进行有针对性的干预措施,减少治疗前发生耐药传播的可能性。

HIV耐药毒株传播的监测

传播性耐药(transmitted drug resistance,TDR)指HIV耐药毒株的感染,在没有抗逆转录病毒(antiretroviral,ARV)药物暴露史的患者中检出耐药,将影响一线抗病毒治疗及暴露前后预防的效果,是实现艾滋病防治目标的重大现实威胁。耐药毒株适应性的改变是决定其传播风险的根本性生物学因素,影响监测人群选择、从感染到耐药检测时间的确定及检测方法的应用;传播性耐药突变的定义和分类是获得准确监测结果的关键。本文介绍了近年来耐药毒株的适应性、监测的耐药突变、监测人群选择等方面的研究进展,提出了我国TDR监测应重点开展的工作,包括建立适合我国毒株特点的监测耐药突变、建立和使用高分辨测序方法准确鉴定混合碱基、实现TDR监测的规范化等,从而为准确获得TDR监测结果,有效遏制耐药毒株的传播提供科技支撑。

艾滋病住院初治患者HIV-1基因亚型及传播性耐药现状分析

目的分析感染科艾滋病住院初治患者HIV-1基因亚型分布特征、传播性耐药(transmitted drug resistance,TDR)现状及其影响因素。方法纳入2020年1月–2022年12月期间在成都市公共卫生临床医疗中心感染科住院并确诊的初治艾滋病患者,收集患者抗病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)前的血液样本,采用in-house法进行HIV基因扩增、测序,系统进化树分析HIV-1基因亚型,HIV耐药数据库在线比对分析耐药突变位点、耐药种类、耐药程度,进行HIV-1基因亚型分布特征和TDR发生情况及其影响因素分析。结果共收集213例患者的血样,HIV基因扩增成功率83.10%(177/213),共检出10种基因亚型,以CRF07_BC最常见(43.50%,77/177),其次为CRF01_AE(37.85%),独特重组亚型(unique recombinant forms,URFs)较少(8.47%),其他亚型10.17%;这4种HIV-1基因亚型仅在不同年龄的分布差异有统计学意义(P=0.024),进一步分析发现仅CRF01_AE和URFs在年龄为30~50岁和年龄>50岁的分布差异有统计学意义,URFs在年龄为30~50岁人群占比较高(P=0.008)。CRF07_BC、CRF01_AE、URFs、其他亚型耐药发生率分别为6.49%、8.96%、13.33%、5.56%,差异无统计学意义(P>0.05);TDR总发生率6.57%,非核苷类逆转录酶抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTIs)TDR发生率5.16%,突变位点主要为V179D/E、E138A/G、V106M/I、Y181C,核苷类逆转录酶抑制剂(nucleoside reverse transcriptase inhibitors,NRTIs)TDR发生率1.88%,突变位点主要为M184V,1例患者发生NNRTIs、NRTIs双重耐药;4.23%高度耐药,0.47%中度耐药,1.88%低度耐药;本研究未发现TDR在不同年份、人口学特征、感染途径、基线状况、机会性感染方面的差异有统计学意义(P>0.05)。结论艾滋病住院初治患者HIV-1基因亚型复杂、多样,TDR总发生率较高,需加强TDR监测,以优化ART治疗、减少耐药传播。

宁夏2017年HIV-1耐药毒株传播情况监测分析

目的了解宁夏未经抗病毒治疗HIV感染人群的HIV耐药毒株传播情况。方法以世界卫生组织"HIV耐药警戒线监测方案"为指导,连续采集2017年7月-12月新确认的宁夏籍HIV感染者血浆样本,进行耐药基因型检测和耐药株传播水平分析。结果 35份样本完成了耐药及基因亚型鉴定,未发现针对蛋白酶抑制剂的相关突变;核苷类逆转录酶抑制剂相关突变株1例,突变位点为A62AV;非核苷类反转录酶抑制剂相关突变株4例,突变位点为V179T/E/VD。但以上突变位点均不是监测相关的突变位点。35例样本的HIV-1亚型为CRF07_BC、CRF01_AE和B亚型。结论宁夏仍属于HIV-1耐药株传播的低流行水平,应持续开展HIV耐药毒株传播的监测。

2021年上海市虹口区HIV-1基因亚型及耐药监测结果分析

目的通过监测2021年上海市虹口区HIV-1基因亚型和耐药情况,为虹口区HIV-1耐药数据库的建立和艾滋病防治策略的及时调整提供数据支撑。方法收集2021年1—12月HIV-1感染者血浆样本,使用反转录–巢式PCR技术进行HIV1病毒Pol基因扩增,通过COMET工具和构建进化树鉴定基因亚型,并采用美国斯坦福大学HIV耐药数据库对其耐药情况进行分析。结果共获得143条Pol基因序列,10种基因亚型,其中CRF01_AE亚型49条(34.27%)、CRF07_BC亚型52条(36.36%)、C亚型13条(9.09%)、B亚型9条(6.29%)、CRF08_BC亚型9条(6.29%)、CRF55_01B亚型4条(2.80%)、CRF67_01B亚型2条(1.40%)、CRF68_01B亚型1条(0.70%)、A亚型1条(0.70%)和独特重组亚型(URFs)3条(2.10%)。研究发现,治疗前耐药率为10.49%(15/143),其中非核苷类反转录酶抑制剂治疗前耐药率为6.29%(9/143);核苷类反转录酶抑制剂治疗前耐药率为1.40%(2/143);蛋白酶抑制剂治疗前耐药率为2.80%(4/143);利匹韦林、奈韦拉平和依非韦伦治疗前耐药率分别为4.90%、3.50%和3.50%。此外,监测到传播耐药率为4.20%(6/143),传播耐药突变位点分别为M46I、M184V、K103N、K101E和Y181C,预测对依非韦伦、奈韦拉平、恩曲他滨和拉米夫定为高度耐药。结论HIV-1基因亚型的构成在虹口区已经愈发多样化,应继续加强辖区内HIV-1基因亚型以及耐药毒株的监测工作,特别是非核苷类逆转录酶抑制剂相关的治疗前耐药和传播耐药研究。