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分子诊断技术结合传统分离方法在致泻性大肠杆菌检测中的运用分析 被引量:2
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作者 谭寅凤 《临床检验杂志(电子版)》 2020年第3期248-248,共1页
目的探讨分子诊断技术结合传统分离方法在致泻性大肠杆菌检测中的运用。方法对2018年6月-10月500份粪便样本实施致泻性大肠杆菌检测,采用荧光PCR法联合传统分离方法,分析致泻性大肠杆菌检出率及各相关病原菌检出率。结果500份粪便样本,... 目的探讨分子诊断技术结合传统分离方法在致泻性大肠杆菌检测中的运用。方法对2018年6月-10月500份粪便样本实施致泻性大肠杆菌检测,采用荧光PCR法联合传统分离方法,分析致泻性大肠杆菌检出率及各相关病原菌检出率。结果500份粪便样本,致泻性大肠杆菌检出95份,检出率为19.00%,各种病原菌检出率EPEC最高,为8.20%;致泻性大肠杆菌6月份检出率最高,为39.10%,其次为7月份,占16.58%,EPEC、ETEC、EIEC及EAEC均6月份检出率最高。结论采用荧光PCR法联合传统分离方法检测致泻性大肠杆菌准确率高,其次,EAEC及EPEC是致泻性大肠杆菌的主要病原菌。 展开更多
关键词 分子诊断技术 传统分离方法 致泻性大肠杆菌
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基于传统分离和高通量测序的健康和患锈腐病西洋参根际土壤微生物群落分析
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作者 李玲玉 黄璐琦 +4 位作者 李政 王晓 刘伟 张华敏 马春霞 《山东科学》 CAS 2023年第2期41-49,75,共10页
探究健康和患锈腐病西洋参根际土壤微生物的群落多样性和可培养菌株分离,以期为西洋参锈腐病发生机制及防控提供参考。利用传统分离技术和高通量测序技术分析健康和患锈腐病西洋参的根际土壤,探究其微生物的群落组成及多样性变化。经由... 探究健康和患锈腐病西洋参根际土壤微生物的群落多样性和可培养菌株分离,以期为西洋参锈腐病发生机制及防控提供参考。利用传统分离技术和高通量测序技术分析健康和患锈腐病西洋参的根际土壤,探究其微生物的群落组成及多样性变化。经由传统分离技术合计得到24株细菌和25株真菌,优势菌属包括假单胞菌属(Pseudomonas)、芽孢杆菌属(Bacillus)和青霉菌属(Penicillium)。高通量测序结果显示,健康和锈腐病土壤中细菌群落均以蓝细菌门(Cyanobacteria)和变形门(Proteobacteria)为主;患锈腐病组有所降低的为蓝细菌门(Cyanobacteria)、软壁菌门(Tenericutes)和变形菌门(Proteobacteria),大幅上调的为拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)与厚壁菌门(Firmicutes)。健康和锈腐病土壤内所含的真菌群落以子囊菌门(Ascomycota)为主,被锈腐病感染后有所上调的为担子菌亚门(Basidiomycota)、子囊菌门(Ascomycota)与被孢霉门(Mortierellomycota)。感染锈腐病根际土壤细菌多样性明显减少。研究表明健康和锈腐病土壤微生物群落组成与数量明显不同,为西洋参锈腐病的发病机制及防控技术提供了理论依据。 展开更多
关键词 西洋参 根际土壤 细菌和真菌 锈腐病 高通量测序 传统分离方法
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基于传统分离培养和高通量测序不同孔径陶瓷膜过滤前后泡菜汁中微生物变化的研究 被引量:1
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作者 王玉梅 李洋 +2 位作者 罗佳沂 李凯 毛瑞丰 《中国调味品》 CAS 北大核心 2022年第5期60-68,共9页
该实验以萝卜泡菜的汁液为原料,经过不同孔径(0.008,0.05,0.2,0.5μm)的陶瓷膜处理,利用传统生物学以及高通量测序技术分析陶瓷膜过滤前后泡菜汁中微生物的变化,分析不同孔径陶瓷膜对泡菜汁微生物截留的种类的差异性及菌相的变化,最终... 该实验以萝卜泡菜的汁液为原料,经过不同孔径(0.008,0.05,0.2,0.5μm)的陶瓷膜处理,利用传统生物学以及高通量测序技术分析陶瓷膜过滤前后泡菜汁中微生物的变化,分析不同孔径陶瓷膜对泡菜汁微生物截留的种类的差异性及菌相的变化,最终选择最适的陶瓷膜孔径。结果显示:经陶瓷膜处理后泡菜汁中细菌和真菌的多样性降低,膜孔径越小,微生物被截留的效果越好,经过0.008μm陶瓷膜处理后的泡菜汁,采用高通量测序技术未检测到微生物。经过0.05μm陶瓷膜处理后,泡菜汁中的细菌大部分被截留,从门水平上包括Actinobacteriota,Myxococcota,Gemmatimonadota,Chloroflexi,Bacteroidota和Acidobacteriota,从属水平上包括Limosilactobacillus,Brevundimonas;真菌被截留从门水平上包括子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和毛霉门(Mucoromycota),从属水平上包括毕赤酵母属(Pichia)、锁掷孢酵属(Sporidiobolus pararoseus)、掷孢酵母属(Sporobolomyces carnicolor)、曲霉属(Aspergillus)、Saccharomyces和Issatchenki。该研究结果为泡菜汁的膜处理除菌的应用提供了理论依据,同时也为泡菜汁的多元化发展提供了优质原料。 展开更多
关键词 泡菜汁 陶瓷膜 除菌 高通量测序 传统培养分离方法
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生物大分子分离技术:过去、现状和未来 被引量:4
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作者 李洁 何德 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第3期49-53,共5页
生物大分子包括多肽、酶、蛋白质、核酸(DNA和RNA)以及多糖等。生物大分子分离技术是生命科学研究中的关键技术之一。当前,各学科之间的交叉渗透为生物大分子分离技术的发展提供了更多的契机。对以沉淀、透析、超滤和溶剂萃取为代表的... 生物大分子包括多肽、酶、蛋白质、核酸(DNA和RNA)以及多糖等。生物大分子分离技术是生命科学研究中的关键技术之一。当前,各学科之间的交叉渗透为生物大分子分离技术的发展提供了更多的契机。对以沉淀、透析、超滤和溶剂萃取为代表的传统分离技术,以及色谱,电泳等现代分离技术的发展概况、原理、特点及应用进行了综述。并结合生命科学的发展现状,展望了生物大分子分离技术的发展前景。 展开更多
关键词 生物大分子 传统分离方法 现代分离方法 发展状况 前景
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酱香型大曲中细菌的分离与分析 被引量:3
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作者 栗伟 《酿酒》 CAS 2012年第3期37-40,共4页
酱香型白酒工艺中,高温大曲起着重要作用,而大曲中细菌又是主力军,为此中国酱香型白酒发酵酒曲中微生物的主要种类及其特性意义重大.结果表明,在酱香型大曲中,Lactobacillus属细菌充当着重要角色。
关键词 酱香白酒 酒曲 传统微生物分离方法
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基于高通量测序和传统培养分离方法的药用植物内生菌资源研究策略 被引量:22
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作者 王红阳 康传志 +7 位作者 王升 蒋待泉 彭政 徐扬 杜用玺 张燕 刘大会 郭兰萍 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1910-1919,共10页
药用植物内生菌的研究主要依赖传统培养分离的方法,因其具有促生长、提高抗逆性、促进药用活性成分积累或直接产生药用活性成分等功能,逐渐受到广泛关注。然而,通过比较传统培养分离和高通量测序的研究结果发现,用传统方法分离的菌株并... 药用植物内生菌的研究主要依赖传统培养分离的方法,因其具有促生长、提高抗逆性、促进药用活性成分积累或直接产生药用活性成分等功能,逐渐受到广泛关注。然而,通过比较传统培养分离和高通量测序的研究结果发现,用传统方法分离的菌株并不是药用植物真实的优势内生菌。传统培养分离方法具有一定的盲目性和随机性导致在培养基的选择、培养时间、物种之间相互作用等方面缺乏标准。相反,高通量测序技术是近十几年来发展起来的新兴分子生物学技术,因其分辨水平高、不需要培养等特点,可以对环境微生物的群落结构和多样性进行深入分析。因此,该文提出用高通量测序技术指导传统培养分离药用植物内生菌的策略。首先,借助高通量测序技术对药用植物内生菌结构和多样性进行整体了解,确定宿主的优势内生菌;然后根据各优势内生菌的特性设计或查询适合其生长的培养基进行培养分离;最后对分离菌株进行功能研究。高通量测序指导传统培养分离药用植物内生菌可以避免研究者漏筛对宿主重要的功能菌株,扩大药用植物内生菌的研究范围,有利于药用植物内生菌的深入挖掘和利用。 展开更多
关键词 高通量测序技术 传统培养分离方法 药用植物 内生菌
原文传递
PCR-DGGE技术用于石油污染土壤中微生物群落结构多样性的初步研究 被引量:13
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作者 吴伟林 张秀霞 +2 位作者 单宝来 张剑杰 赵朝成 《石油学报(石油加工)》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第4期547-550,共4页
采用现代分子生物学技术,结合传统的富集培养过程,直接从土壤中提取细菌总DNA和从培养基富集培养的菌体中提取总DNA,并对基因组总DNA中16S rDNA V3可变区进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)测定,对油田某区块石油污... 采用现代分子生物学技术,结合传统的富集培养过程,直接从土壤中提取细菌总DNA和从培养基富集培养的菌体中提取总DNA,并对基因组总DNA中16S rDNA V3可变区进行聚合酶链式反应(PCR)扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)测定,对油田某区块石油污染土样微生物群落和多样性进行初步研究。结果表明,年代较久的石油重度污染土壤菌群数量少于轻度污染土壤,经人工堆肥处理的土壤生物多样性明显优于未进行人工处理的污染土壤;经堆肥处理的土壤中微生物多样性在纵向上也存在差异,中层土微生物多样性明显,表层土最不明显;不同污染土壤中存在一定数量相同的优势菌群,但也表现了相当的差异性,经堆肥处理的污染土壤中微生物群落组成的相似性在纵向上也存在差异。 展开更多
关键词 石油污染土壤 PCR-DGGE技术 传统培养分离方法 微生物多样性
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Underdetermined Blind Source Separation of Adjacent Satellite Interference Based on Sparseness 被引量:10
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作者 Chengjie Li Lidong Zhu Zhongqiang Luo 《China Communications》 SCIE CSCD 2017年第4期140-149,共10页
The problem of underdetermined blind source separation of adjacent satellite interference is proposed in this paper. Density Clustering algorithm(DC-algorithm) presented in this article is different from traditional m... The problem of underdetermined blind source separation of adjacent satellite interference is proposed in this paper. Density Clustering algorithm(DC-algorithm) presented in this article is different from traditional methods. Sparseness representation has been applied in underdetermined blind signal source separation. However, some difficulties have not been considered, such as the number of sources is unknown or the mixed matrix is ill-conditioned. In order to find out the number of the mixed signals, Short Time Fourier Transform(STFT) is employed to segment received mixtures. Then, we formulate the blind source signal as cluster problem. Furthermore, we construct Cost Function Pair and Decision Coordinate System by using density clustering. At the end of this paper, we discuss the performance of the proposed method and verify the novel method based on several simulations. We verify the proposed method on numerical experiments with real signal transmission, which demonstrates the validity of the proposed method. 展开更多
关键词 adjacent satellite interference Short Time Fourier Transform Decision Coordinate System real signal transmission
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