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题名低剂量辐射下土壤细菌群落及其功能基因的响应
被引量:2
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作者
吴娜
杨多
赵鲁玉
岳海涛
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机构
新疆大学生命科学与技术学院
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出处
《新疆大学学报(自然科学版)(中英文)》
CAS
2021年第5期588-598,共11页
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基金
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2017D01C049)
新疆维吾尔自治区重点研发计划项目(2018B01007).
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文摘
为研究低剂量辐射对土壤微生物组成与丰度的影响,分析微生物组中对辐射胁迫的主效基因,本研究从新疆和布克赛尔蒙古自治县关闭回填的铀矿场采集了辐射剂量从7.71 mSv/y到15.07 mSv/y不等的土壤样品.应用宏基因组测序结合生物信息学分析方法,发现低剂量辐射环境下的土壤中变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、芽单胞菌门、绿弯菌门和酸杆菌亚门为优势菌门,其丰度总和占比达80%以上.属水平上,假单胞菌属数量最多,丰度最高,占31.0%;芽孢杆菌属次之,为11.0%;肠杆菌属为10.3%.辐射剂量高的土壤中,微生物OTU数量最高,多样性丰富度最大.土壤样品中微生物群落碳氮源的代谢强度也与辐射剂量呈正相关.宏基因组测序及分析结果表明:辐射土壤样品中微生物功能基因达到7558个,比正常辐射水平对照组高11.3%,高辐射样品中碱基切除修复通路中的mug(TDG/mug DNA糖基化酶家族蛋白)的数量显著高于对照组和低辐射组.从辐射土壤样品中分离出30个属的可培养菌145株,其中一株藤黄微球菌Micrococcus luteus R17具有辐射和盐碱逆境的耐受性,可作为潜在的底盘菌株加以改造.
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关键词
低剂量辐射胁迫
微生物群落
代谢通路
功能基因
mug
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Keywords
radiation effects
microbial communities
metabolism pathway
functional gene
mug
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分类号
Q939.97
[生物学—微生物学]
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