低氧响应网络结构化建模与动态演化分析

目的构建低氧响应网络(HRN)的可执行模型,基于计算机进行仿真分析,研究HRN的随机性、并发性等动态演化机制。方法使用随机Petri网(SPN)构建HRN构模型,在此基础上基于具体的演化规则和Gillespie算法对该结构模型的动态演化进行分析。结果得到HRN的动态演化规律,在对HRN切换行为的描述上,仿真结果与实验室结果反映规律具有一致性。结论基于SPN方法可实现HRN的可视化建模,通过对模型的执行和基于给定动力学参数下的随机仿真,可得到与传统实验室实验研究相得益彰的分析结果,有助于进一步分析HRN的结构和功能特性。