鸡IGF1R基因遗传变异与其体尺和屠宰性状的相关性

为探讨鸡胰岛素样生长因子1受体(Insulin-like growth factor receptor 1,IGF1R)遗传变异及其与体尺和屠宰性状的相关性,揭示禽类IGF1R的生物学功能及其遗传特性,为进一步研究改善家禽肉质的调控机制提供参考。以贵州沿河铁叫鸡为研究对象,以PCR扩增获得IGF1R基因后采用直接测序法检查其遗传变异,利用软件SHEsis构建单倍型和双倍型;PopGene软件(ver.1.32)对IGF1R基因的等位基因频率、等位基因型进行计算;并用PowerMarker软件(ver.3.25)分析多态信息含量(PIC);采用PASW Statistics 18.0软件一般线性模型(GLM)分析屠宰性能和体尺与IGF1R基因的关联性。结果显示,鸡IGF1R基因的第3外显子(Exon-3)共发现3个SNPs位点g.105384 C>T、g.105333 A>C和g.110681 A>C,且每个SNP位点均存在3种基因型,3个SNPs位点均属于同义突变,未引起编码氨基酸变化;在沿河铁叫鸡群体中,存在4种单倍型(H1,H2,H3,H4),9种双倍型(H1H1、H1H2、H1H3、H1H4、H2H2、H2H4、H3H3、H3H4和H4H4);关联分析结果提示,g.105384 C>T突变位点上,CC和CT基因型在鸡的体斜长上显著多于CC基因型,TT基因型在鸡的半净膛和全净膛重上则显著高出CC基因型(P<0.05);g.105333 A>C位点,AA和AC基因型在鸡的体斜长显著多于CC基因型(P<0.05),而AA基因型在鸡的半净膛和全净膛重上显著高出CC基因型(P<0.05);g.110681 A>C位点AA基因型在鸡的髋骨宽上显著高出AC和CC基因型(P<0.05),CC基因型腿肌重则显著多AA和AC基因型。3个SNPs位点可作为改善鸡肉质选择的分子遗传标记。