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基于microRNA表达谱初步构建PLS-DA体液识别模型
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作者 钱水 张晶晶 +1 位作者 王致远 梁桑华 《刑事技术》 2023年第2期146-152,共7页
针对外周血、唾液、精液、月经血、阴道分泌物这五种法医学常见的体液样本,采用二代测序(NGS)平台检测获得microRNA(miRNA)表达谱,使用偏最小二乘判别分析(PLS-DA)建立基于这五种体液的识别模型,并探讨PLS-DA在法医体液溯源中的应用价... 针对外周血、唾液、精液、月经血、阴道分泌物这五种法医学常见的体液样本,采用二代测序(NGS)平台检测获得microRNA(miRNA)表达谱,使用偏最小二乘判别分析(PLS-DA)建立基于这五种体液的识别模型,并探讨PLS-DA在法医体液溯源中的应用价值。经优化小分子RNA文库制备过程,采用Ion Torrent S5 XL测序系统对前述法医学五种体液样本(每种10例)进行小RNA测序,以PLS-DA构建体液识别模型,评估不同数量miRNA标记组合下预测的准确性。本研究获得法医学常见五种体液样本的miRNA表达谱,外周血与月经血中表达量前10名的miRNAs有6个重叠;唾液和阴道分泌物中表达量前10名的miRNAs有4个重叠。基于全数据集、107个和11个miRNAs构建的体液来源识别模型的准确率分别为0.95、0.94、0.89。本研究通过NGS测序分析获得了五种体液样本的miRNA组(miRNome),利用PLS-DA初步构建了体液识别模型,对于应用miRNome进行体液识别的相关研究具有参考价值。 展开更多
关键词 法医遗传学 体液溯源 RNA测序(RNA-seq) 最小二乘判别分析(PLS-DA) 微小RNA(microRNA)
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法医转录组学的研究进展及展望 被引量:1
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作者 蔡美铭 陈曼 +5 位作者 季观庆 方雅婷 许惠 兰琼 白小乐 朱波峰 《中国法医学杂志》 CSCD 2023年第2期166-171,共6页
转录组学是在后基因组时代率先发展起来的一门学科,其主要目的是基于RNA水平研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律。RNA表达水平在器官组织或不同体液中存在差异,与时间也具有一定的相关性。因此,RNA在法医学中具有独特的应用价值,... 转录组学是在后基因组时代率先发展起来的一门学科,其主要目的是基于RNA水平研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律。RNA表达水平在器官组织或不同体液中存在差异,与时间也具有一定的相关性。因此,RNA在法医学中具有独特的应用价值,如在器官组织鉴定、体液(斑)溯源、斑迹离体时间推断、死亡时间推断、年龄推断以及死亡原因分析等方面。本文概括了转录组学的主要分析技术方法,综述了近年来转录组分析在法医学领域的应用研究进展,并对其在法医学领域所面临的问题与前景进行探讨和展望。 展开更多
关键词 转录组学 体液(斑)溯源 斑迹离体时间推断 死亡时间推断 年龄推断 死亡原因分析
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