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佛罗里达红罗非鱼黑色素浓集激素1基因的克隆与表达分析
被引量:
3
1
作者
陈诏
徐鸿飞
+4 位作者
赵何勇
刘康
李华
何金钊
韦玲静
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期73-82,共10页
采用同源克隆技术获得了佛罗里达红罗非鱼(Oreochromis sp.)前原黑色素浓集激素1(prepro-melanin concentrating hormone 1,pmch1)基因c DNA全长序列,将其命名为flpmch1;并通过实时荧光定量PCR(q RTPCR)分析天生黑斑佛罗里达红罗非鱼组...
采用同源克隆技术获得了佛罗里达红罗非鱼(Oreochromis sp.)前原黑色素浓集激素1(prepro-melanin concentrating hormone 1,pmch1)基因c DNA全长序列,将其命名为flpmch1;并通过实时荧光定量PCR(q RTPCR)分析天生黑斑佛罗里达红罗非鱼组织表达谱和低温胁迫后其各组织表达差异。结果表明,flpmch1 c DNA序列全长629 bp,开放阅读框411 bp,编码136个氨基酸,存在12个潜在磷酸化位点和1个长度为199 bp的Cp G岛。Flpmch1与24个物种Pmch1氨基酸序列比对结果表明,Flpmch1与尼罗罗非鱼(O.niloticus)、奥利亚罗非鱼(O.aureus)、莫桑比克罗非鱼(O.mossambicus)、布氏新亮丽鲷(Neolamprologus brichardi)的Pmch1相似性最高。系统进化树分析显示硬骨鱼纲Pmch聚成一个大支,Flpmch1与尼罗罗非鱼Pmch1进化地位最接近。组织表达谱分析显示,flpmch1 m RNA在多个组织中均有表达,其中在脑中表达量最高,且粉白色皮肤中的表达量显著高于黑色皮肤(P<0.01)。低温胁迫后flpmch1 m RNA各组织表达量较对照组均呈下调表达。推断flpmch1可能参与了佛罗里达红罗非鱼天生黑斑的形成和过冬黑化过程。
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关键词
佛罗里达红罗非鱼
黑色素浓集激素1
基因克隆
低温胁迫
组织表达
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题名
佛罗里达红罗非鱼黑色素浓集激素1基因的克隆与表达分析
被引量:
3
1
作者
陈诏
徐鸿飞
赵何勇
刘康
李华
何金钊
韦玲静
机构
广西壮族自治区水产引育种中心
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期73-82,共10页
基金
广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室开放课题(GXKL-AQUA-2014-07)
广西科技计划项目(桂科AB16380029)
广西壮族自治区海洋和渔业厅2018年预算项目<红罗非鱼>选育与示范
文摘
采用同源克隆技术获得了佛罗里达红罗非鱼(Oreochromis sp.)前原黑色素浓集激素1(prepro-melanin concentrating hormone 1,pmch1)基因c DNA全长序列,将其命名为flpmch1;并通过实时荧光定量PCR(q RTPCR)分析天生黑斑佛罗里达红罗非鱼组织表达谱和低温胁迫后其各组织表达差异。结果表明,flpmch1 c DNA序列全长629 bp,开放阅读框411 bp,编码136个氨基酸,存在12个潜在磷酸化位点和1个长度为199 bp的Cp G岛。Flpmch1与24个物种Pmch1氨基酸序列比对结果表明,Flpmch1与尼罗罗非鱼(O.niloticus)、奥利亚罗非鱼(O.aureus)、莫桑比克罗非鱼(O.mossambicus)、布氏新亮丽鲷(Neolamprologus brichardi)的Pmch1相似性最高。系统进化树分析显示硬骨鱼纲Pmch聚成一个大支,Flpmch1与尼罗罗非鱼Pmch1进化地位最接近。组织表达谱分析显示,flpmch1 m RNA在多个组织中均有表达,其中在脑中表达量最高,且粉白色皮肤中的表达量显著高于黑色皮肤(P<0.01)。低温胁迫后flpmch1 m RNA各组织表达量较对照组均呈下调表达。推断flpmch1可能参与了佛罗里达红罗非鱼天生黑斑的形成和过冬黑化过程。
关键词
佛罗里达红罗非鱼
黑色素浓集激素1
基因克隆
低温胁迫
组织表达
Keywords
Florida red tilapia
melanin-concentrating hormone 1
gene cloning
cold stress
tissue expression
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
佛罗里达红罗非鱼黑色素浓集激素1基因的克隆与表达分析
陈诏
徐鸿飞
赵何勇
刘康
李华
何金钊
韦玲静
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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