结核分枝杆菌中假设蛋白抗原表位的多态性研究

目的探究中国结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)菌株中8个免疫相关的保守性假设蛋白Rv1158c、Rv1461、Rv1977、Rv2182c、Rv3207c、Rv3333c、Rv3378c和Rv3714c人T细胞表位的多态性。方法选取151株我国临床分离到的结核分枝杆菌菌株,对8种抗原基因进行PCR扩增,并运用Bioedit软件进行序列比对,比较其人T细胞表位的多态性。结果在151株菌株中,除了Rv1977外其余7个蛋白都表现保守,这与Comas等的研究结果一致。而Rv1977表现了一定的多态性,发生了3个异义突变和一个单碱基的缺失。在Rv1977中的3个T细胞抗原表位中有1个表位发生了变化。结论结核分枝杆菌中的8个与免疫相关的保守性假设蛋白的T细胞抗原表位中,大部分是保守的,只有Rv1977蛋白具有多态性,这种多态性可能反映了这个抗原参与了逃避宿主免疫的分化选择。

淡色库蚊氯菊酯抗性相关基因PR-XP1cDNA的克隆与序列分析

【目的】克隆淡色库蚊一个全新的氯菊酯抗性相关基因PR-XP1的全长序列,分析、预测其编码蛋白的结构与功能,为阐明该基因的抗性机制及研制新型卫生杀虫剂奠定基础。【方法】依据抗性与敏感品系库蚊差异表达的EST片段(GenBank号:EC093826.1),设计特异性PCR引物,采用RACE技术,克隆淡色库蚊氯菊酯抗性相关基因PR-XP1的全长cDNA序列,运用生物信息学软件对其同源性与系统进化进行分析,并对PR-XP1编码蛋白的结构与功能进行预测。【结果】获得了全长为2 004bp的淡色库蚊氯菊酯抗性相关基因PR-XP1,该基因具有完整的CDS区,编码249个氨基酸。同源性比对与系统进化分析表明,PR-XP1基因核苷酸序列与致倦库蚊(GenBank号:XM_001862469.1)、埃及伊蚊(GenBank号:XM_001658032.1)和冈比亚按蚊(GenBank号:BX021208.1)相关基因的同源性分别为95%,83%和70%;其编码蛋白的氨基酸序列与致倦库蚊、埃及伊蚊、西方蜜蜂、入侵红火蚁、佛罗里达弓背蚁、印度跳蚁等昆虫中"假设性蛋白"的氨基酸序列同源性均达46%以上。结构分析显示,PR-XP1基因编码蛋白可能为具有2个跨膜螺旋的膜蛋白,跨膜区形成了一个特异性的"U"形结构;该基因还具有1个微弱的信号肽位点和24个磷酸化位点。【结论】克隆得到了一个全新的淡色库蚊氯菊酯抗性相关的"保守性假设蛋白"基因PR-XP1,推测其功能与氯菊酯抗性相关。