千里光脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)的保守基序(CSM)与功能结构域分析

基于已构建的千里光全长c DNA文库,克隆其脂肪醛脱羰基酶基因(Gen Bank No.:KT895253),并进一步分析该基因所编码蛋白质(CER1蛋白)的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)和蛋白质功能结构域的关系。蛋白质一级结构分析发现,千里光CER1蛋白由623个氨基酸残基组成;进化树和序列比对结果提示SH-片段和LH-片段这两个富含His的保守基元序列在不同物种中表现出高度保守性;3-D结构预测结果表明,高等植物CER1蛋白水合状态下具有高效的底物结合能力和脂肪醛脱羰基的催化效率。因此,根据脂肪醛脱羰基酶氨基酸保守基序对蛋白质功能域的决定作用,推测CER1蛋白的保守结构域是形成底物结合部位和酶催化活性中心的结构基础。

千里光脂肪酸脱氢酶(D6D)的保守基序(CSM)与功能结构域分析

Δ6-脂肪酸脱氢酶(Δ6 desaturase,D6D)是不饱和脂肪酸合成途径中的限速酶。以高等植物千里光为材料,通过构建全长c DNA文库克隆得到脂肪酸脱氢酶基因(D6D),明确了D6D基因的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)对蛋白质功能结构域的决定作用。结果显示,千里光D6D基因由466个氨基酸残基组成;预测蛋白分子量为53.40 ku,理论等电点为8.48;进化树和序列比对结果提示3个富含His的保守基元序列(HisⅠ-片段、HisⅡ-片段、HisⅢ-片段)在不同物种中表现出高度保守性;三维结构预测结果表明,D6D基因的保守结构域以及一个类似于细胞色素(cytochrome,cyt)b5的血红素结合区是形成底物结合部位和酶催化活性中心的结构基础。