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参芪复方对糖尿病GK大鼠肝脏组织mRNA、lncRNA表达谱的影响
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作者 刘桠 张翕宇 +2 位作者 谢春光 徐刚 彭思涵 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2024年第1期46-51,I0008-I0012,共11页
目的应用全转录组测序与实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术,探索参芪复方调控糖尿病GK大鼠肝脏信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的机制研究。方法采... 目的应用全转录组测序与实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术,探索参芪复方调控糖尿病GK大鼠肝脏信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的机制研究。方法采用高脂高糖饲料建立2型糖尿病模型,将GK大鼠随机分为模型组、参芪复方组和西药组。另将10只Wistar大鼠设为空白组,予普通饲料喂养。参芪复方组大鼠予参芪复方浸膏灌胃,西药组予西格列汀混悬液灌胃,模型组及空白组灌服生理盐水。干预12周,每周检测空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)。运用HE染色法观察大鼠肝脏组织病理形态,在空白组、模型组和参芪复方组中每组随机选取4只大鼠进行全转录组测序,构建mRNA、lncRNA差异表达谱,分析差异基因生物学功能,并进行RT-qPCR验证。结果与空白组相比,糖尿病GK大鼠FBG显著升高(P<0.05),模型组大鼠肝脏可见肝细胞排列紊乱,边界模糊,出现弥漫空泡状改变,呈中度脂肪变性,伴见炎性浸润、弥漫水肿;与模型组相比,参芪复方组大鼠FBG在12周时明显降低(P<0.05),肝脏组织排列较整齐,脂质沉积、细胞水肿及炎细胞浸润明显减轻。全转录组结果显示,与空白组相比,模型组大鼠mRNA、lncRNA表达谱存在显著差异,决定了糖尿病大鼠生理病理上的差异表现。参芪复方可广泛调控mRNA、lncRNA的差异表达,富集分析显示参芪复方通过调控多条内分泌系统及代谢过程相关信号通路改善糖尿病,包括胰岛素分泌、非酒精性脂肪性肝病、胆固醇代谢、鞘脂代谢、胰岛素抵抗等信号通路。RT-qPCR结果显示,基因Irf1、Trim30、Tmcc3、Insig1与转录组结果一致,转录组准确性较高。结论参芪复方发挥调节血糖及改善肝脏脂质沉积、水肿的作用,可能与广泛调控mRNA、lncRNA的差异表达有关。 展开更多
关键词 参芪复方 2型糖尿病 长链非编码rna(lncrna) 信使rna(mrna)
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m6A与mRNA代谢及其与恶性肿瘤关系的研究进展 被引量:3
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作者 孙善文 雍红梅 周学义 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第10期1781-1786,共6页
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)为高等真核生物信使RNA(messenger RNA,mRNA)中最普遍的内部修饰,几乎影响mRNA代谢的每个步骤,包括mRNA的加工、核输出、翻译以及降解等。该修饰过程由m6A修饰酶:甲基转移酶和去甲基化酶以动态可... N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)为高等真核生物信使RNA(messenger RNA,mRNA)中最普遍的内部修饰,几乎影响mRNA代谢的每个步骤,包括mRNA的加工、核输出、翻译以及降解等。该修饰过程由m6A修饰酶:甲基转移酶和去甲基化酶以动态可逆的方式进行调控。此外生物体中还存在能与m6A特异性识别结合并介导其行使一定生物学功能的m6A结合蛋白。最近,越来越多的研究发现m6A与恶性肿瘤有关,有助于肿瘤干细胞的自我更新,促进恶性肿瘤细胞增殖等。m6A与恶性转化的表型及机制密切相关,表现出m6A靶向治疗人类恶性肿瘤的可能性。换言之,m6A可能成为恶性肿瘤治疗的新靶标。本文旨在对m6A如何调控mRNA代谢及其与恶性肿瘤的关系进行综述。 展开更多
关键词 N6-甲基腺嘌呤(m6A) 信使rna(mrna)代谢 恶性肿瘤 靶标
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大枣中性多糖对小鼠腹腔巨噬细胞分泌肿瘤坏死因子及其mRNA表达的影响 被引量:20
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作者 张庆 雷林生 +1 位作者 杨淑琴 孙莉莎 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2001年第8期592-594,共3页
目的 研究大枣中性多糖(JDP-N)对小鼠腹腔巨噬细胞(Mφ)分泌肿瘤坏死因子(TNF)及其mRNA表达水平的影响。方法 MTT法测定细胞增殖,半定量RT-PCR测定TNF-α mRNA的表达。结果 JDP-N能诱导Mφ分泌TNF,诱生TNF达峰时间约为6 h,与... 目的 研究大枣中性多糖(JDP-N)对小鼠腹腔巨噬细胞(Mφ)分泌肿瘤坏死因子(TNF)及其mRNA表达水平的影响。方法 MTT法测定细胞增殖,半定量RT-PCR测定TNF-α mRNA的表达。结果 JDP-N能诱导Mφ分泌TNF,诱生TNF达峰时间约为6 h,与脂多糖相比,时效关系相仿;蛋白激酶C激活在JDP-N诱导Mφ分泌TNF过程中具有关键性作用;JDP-N能促进MφTNF-α mRNA的表达。结论 JDP-N增强小鼠免疫功能的机制之一是促进Mφ分泌TNF。 展开更多
关键词 大枣中性多糖 肿瘤坏死因子 蛋白激酶C 巨噬细胞 信使rna JDP-N 小鼠 mrna
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CK19、CK20 mRNA在上皮性恶性肿瘤患者外周血中的表达及其意义 被引量:11
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作者 郭英 黄培林 +1 位作者 王景美 谢维 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2003年第1期9-9,共1页
目的 :分析上皮性恶性肿瘤患者外周血中CK19、CK2 0mRNA的表达水平 ,探讨其临床病理意义。方法 :随机选择和收集 5 3例上皮性恶性肿瘤患者的外周血 ,应用巢式RT PCR法联合检测其CK19、CK2 0mRNA表达情况。另取 15例上皮性肿瘤组织为阳... 目的 :分析上皮性恶性肿瘤患者外周血中CK19、CK2 0mRNA的表达水平 ,探讨其临床病理意义。方法 :随机选择和收集 5 3例上皮性恶性肿瘤患者的外周血 ,应用巢式RT PCR法联合检测其CK19、CK2 0mRNA表达情况。另取 15例上皮性肿瘤组织为阳性对照 ,15例非肿瘤患者外周血为阴性对照。结果 :5 3例肿瘤患者外周血中CK19阳性率为 3 5 .8% (19/5 3 ) ,CK2 0阳性率 41.5 % (2 2 /5 3 ) ,两者至少 1项阳性者 69.8% (3 1/5 3 )。 15例肿瘤组织中CK2 0阳性率为 10 0 % (15 /15 ) ,CK19阳性率 86% (13 /15 ) ;15例阴性对照CK19阳性 2例 ,CK2 0阳性 1例。结合肿瘤的临床病理资料分析 ,肿瘤患者外周血CK19、CK2 0mRNA阳性表达与肿瘤浸润深度、临床分期及淋巴结转移间存在明显的相关性 ,而与肿瘤患者的年龄、性别、肿瘤分化程度无明显相关。结论 :CK19、CK2 0mRNA可作为检测上皮性肿瘤外周血微转移的靶基因。联合检测肿瘤患者外周血CK19、CK2 0mRNA可增加外周血循环癌细胞的检测率。 展开更多
关键词 CK19 CK20mrna 上皮性恶性肿瘤 外周血 表达 信使rna 角蛋白 逆转录-聚合酶链反应
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大鼠趋化素样因子1mRNA在哮喘大鼠肺组织中的表达 被引量:2
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作者 杨小琼 邓述恺 +2 位作者 黄忠碧 潘碧 王荣丽 《陕西医学杂志》 CAS 北大核心 2007年第1期14-17,61,共5页
目的观察大鼠趋化素样因子1(rCKLF1)的mRNA在支气管哮喘大鼠肺组织的表达。方法将30只SD大鼠分为对照组(N组)及哮喘组,根据激发时间(1d、3d、7d、14d)不同将哮喘组分为A、B、C、D4组。哮喘激发后取右肺中叶提取组织总RNA。逆转录后行实... 目的观察大鼠趋化素样因子1(rCKLF1)的mRNA在支气管哮喘大鼠肺组织的表达。方法将30只SD大鼠分为对照组(N组)及哮喘组,根据激发时间(1d、3d、7d、14d)不同将哮喘组分为A、B、C、D4组。哮喘激发后取右肺中叶提取组织总RNA。逆转录后行实时荧光定量PCR。了解rCKLF1mRNA的表达。结果rCKLF1在哮喘大鼠的肺组织中表达上调,并呈动态变化,7d达峰值,为正常的12.2倍。结论CKLF1与哮喘的病理生理过程有关。 展开更多
关键词 哮喘/化学谤导 肺/病理学 趋化因子类/代谢 rna 信使/代谢 动物 大鼠
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SLE患者PBMCs雌激素受体mRNA水平与IL-10mRNA水平的研究 被引量:4
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作者 周倩宜 齐文 +1 位作者 成韩锋 王玉亮 《天津医药》 CAS 北大核心 2005年第11期694-696,共3页
目的:探讨未经刺激外周血单个核细胞(PBMCs)雌激素受体(ER)mRNA水平和白细胞介素10(IL-10)mRNA水平在系统性红斑狼疮发病中的作用。方法:分离25例系统性红斑狼疮(SLE)患者(患者组)和15例正常人(对照组)新鲜外周血单个核细胞,提取总RNA,... 目的:探讨未经刺激外周血单个核细胞(PBMCs)雌激素受体(ER)mRNA水平和白细胞介素10(IL-10)mRNA水平在系统性红斑狼疮发病中的作用。方法:分离25例系统性红斑狼疮(SLE)患者(患者组)和15例正常人(对照组)新鲜外周血单个核细胞,提取总RNA,利用半定量RT-PCR方法逆转录并扩增雌激素受体和IL-10,通过凝胶图像扫描系统对PCR产物的电泳条带进行密度扫描。结果:患者组PBMCsERmRNA水平和IL-10mRNA水平均高于正常对照组(P<0.01)。患者组和对照组PBMCsERmRNA水平与IL-10mRNA水平均呈正相关(r分别为0.442和0.557,P<0.05)。结论:SLE患者外周血单个核细胞存在雌激素受体mRNA和IL-10mRNA表达异常,IL-10表达的上调可能与雌激素受体有关,过量的IL-10可能导致了SLE患者B细胞产生大量自身抗体。 展开更多
关键词 红斑狼疮 系统性 单个核细胞 受体 雌激素 白细胞介素10 rna 信使 雌激素受体mrna mrna水平 SLE患者 IL-10 PBMCS
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17β-雌二醇对大鼠血管平滑肌细胞C反应蛋白及其mRNA表达的影响 被引量:3
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作者 徐利 张心武 +3 位作者 庞晓明 陈琳 刘凯歌 李亚军 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期86-91,共6页
目的:探讨17β-雌二醇对大鼠血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)生成的影响及其相关机制。方法:采用免疫细胞化学法观察17β-雌二醇对正常状态大鼠VSMCs CRP表达的影响,免疫印迹法... 目的:探讨17β-雌二醇对大鼠血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)C反应蛋白(C-reactive protein,CRP)生成的影响及其相关机制。方法:采用免疫细胞化学法观察17β-雌二醇对正常状态大鼠VSMCs CRP表达的影响,免疫印迹法检测其对Ang-Ⅱ刺激大鼠VSMCs CRP及p-ERK1/2表达的影响,RT-PCR方法检测其对Ang-Ⅱ刺激状态大鼠VSMCs CRPmRNA表达的影响。结果:本实验所选用17β-雌二醇浓度(1、10、100 nmol/L)不影响正常状态大鼠VSMCs形态及CRP表达,但呈浓度依赖性抑制Ang-Ⅱ刺激的大鼠VSMCs CRP(r=-0.834,P<0.01)、p-ERK1/2(r=-0.712,P<0.05)及CRP mRNA(r=-0.856,P<0.01)的表达。结论:17β-雌二醇可以抑制Ang-Ⅱ刺激的大鼠VSMCs CRP及其mRNA表达,其作用机制与抑制ERK1/2信号转导通路相关。 展开更多
关键词 rna 信使 遗传 雌二醇 药理学 雌二醇 投药和剂量 平滑 血管 药物作用 C反应蛋白质 药物作用 血管紧张素Ⅱ 药理学 丝裂原活化蛋白激酶1 代谢 信号传导
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母型mRNAs及其功能 被引量:1
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作者 沈虹 李逸平 左嘉客 《细胞生物学杂志》 CSCD 1996年第1期21-27,共7页
早期的胚胎发育是受母型基因调控(Mat-crnal regulation)的,有关的发育信息按母型mRNAs形式被早期胚胎继承下来,并由这些mRNAs衍生的蛋白质调控发育过程,直至合子型基因被活化,过渡为合子型调控(Zygoticregulation,Paternal regulation... 早期的胚胎发育是受母型基因调控(Mat-crnal regulation)的,有关的发育信息按母型mRNAs形式被早期胚胎继承下来,并由这些mRNAs衍生的蛋白质调控发育过程,直至合子型基因被活化,过渡为合子型调控(Zygoticregulation,Paternal regulation)。所以母型信息的存在形式和功能。 展开更多
关键词 rna 信使rna 母型mrnas 功能
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RT-PCR检测乳腺癌患者外周血表皮生长因子受体和细胞角质蛋白-19mRNA的表达 被引量:2
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作者 李锋 任军 +6 位作者 贾军 尤向辉 汪海丹 张燕军 郭晓彤 贠军 斯晓明 《现代肿瘤医学》 CAS 2005年第2期154-158,共5页
目的 探讨逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR )方法检测乳腺癌患者外周血表皮生长因子受体(EGFR)mRNA作为乳腺癌循环肿瘤细胞标志的可能性及意义。方法 以转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法,分别对40例乳腺癌患者和30例健康人静脉血进行EGFRm... 目的 探讨逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR )方法检测乳腺癌患者外周血表皮生长因子受体(EGFR)mRNA作为乳腺癌循环肿瘤细胞标志的可能性及意义。方法 以转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法,分别对40例乳腺癌患者和30例健康人静脉血进行EGFRmRNA检测,同时与目前研究较多的循环上皮细胞标志:细胞角质蛋白CK-19的mRNA做比较。结果 在30例健康人外周静脉血中没有发现EGFRmR NA的表达( 0% ),但有8例CK-19阳性( 26. 7% )。而40例乳腺癌患者检测出13例EGFRmRNA阳性(32. 5% ),与正常人相比P<0. 01,两组间存在显著性差异;CK-19的mRNA阳性例数为14 (35. 0% ),与正常人相比P>0. 05,两组间无统计学差异。通过免疫组化检测到25例( 62. 5% )的肿瘤组织中EGFR阳性,所有外周血中EGFRmRNA阳性的病例,相应的原发肿瘤病灶中EGFR蛋白均为阳性,组织中EGFR蛋白高表达的患者外周血EGFRmRNA检出率也高(P<0. 01)。26例初治患者中5例EGFRmRNA阳性(19. 2% ),14例复治患者中8例EGFRmRNA阳性(57. 1% ),两组相比P<0. 05,存在显著性差异。6例曾使用过紫杉醇类药物挽救化疗的转移性患者中1例EGFRmRNA阳性(16. 7% ), 8例未使用过紫杉醇类药物挽救化疗的转移性患者中7例EGFRmRNA阳性(87. 5% ),两组相比P<0. 05,存在显著性差异。 展开更多
关键词 乳腺癌 表皮生长因子受体(EGFR) 细胞角质蛋白-19(CK-19) 信使rna(mrna) 逆转录聚合酶链式反应(RT—PCR) 循环肿瘤细胞 微转移 紫杉醇
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胰腺癌组织中SMO mRNA的表达及其临床意义 被引量:4
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作者 陈志荣 李兆申 +3 位作者 屠振兴 龚燕芳 金晶 满晓华 《胰腺病学》 2005年第2期82-84,共3页
目的研究胰腺癌组织SMOmRNA的表达及其与临床肿瘤指标的关系。方法收集28例手术切除的新鲜胰腺癌及癌旁胰腺组织,利用RT-PCR方法分别检测癌组织和癌旁胰腺组织SMOmRNA的表达情况。结果28例胰腺癌组织中20例胰腺癌组织有SMOmRNA表达(阳性... 目的研究胰腺癌组织SMOmRNA的表达及其与临床肿瘤指标的关系。方法收集28例手术切除的新鲜胰腺癌及癌旁胰腺组织,利用RT-PCR方法分别检测癌组织和癌旁胰腺组织SMOmRNA的表达情况。结果28例胰腺癌组织中20例胰腺癌组织有SMOmRNA表达(阳性率71.4%);28例癌旁胰腺组织中无SMOmRNA的表达;胰腺癌组织和癌旁组织SMOmRNA阳性表达率差异有显著性(P<0.01);SMOmRNA阳性表达率与肿瘤分化程度有关(P<0.05),与肿瘤的大小,淋巴结及远处转移无关(P>0.05)。结论SMOmRNA在胰腺癌组织中有较高的阳性表达率,检测其表达有助于胰腺癌的诊断,并可作为判断胰腺癌恶性程度的重要指标。 展开更多
关键词 胰腺癌 癌组织 SMO mrna 基因表达 rna信使 胰腺肿瘤
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TRAIL mRNA实时荧光定量方法的建立及对慢性乙肝患者外周血单个核细胞检测的意义 被引量:1
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作者 毛丽萍 王惠民 +4 位作者 张子玉 吴月平 章幼奕 王跃国 鞠少卿 《中国误诊学杂志》 CAS 2007年第28期6713-6716,共4页
目的:建立肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)mRNA的实时荧光定量PCR检测方法,探讨慢性乙型肝炎(CHB)患者外周血单个核细胞(PBMCs)中TRAIL mRNA与HBV载量的关系及TRAIL在HBV感染后肝损伤中的作用。方法:自行建立检测TRAIL mRN... 目的:建立肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)mRNA的实时荧光定量PCR检测方法,探讨慢性乙型肝炎(CHB)患者外周血单个核细胞(PBMCs)中TRAIL mRNA与HBV载量的关系及TRAIL在HBV感染后肝损伤中的作用。方法:自行建立检测TRAIL mRNA的TaqMan实时荧光定量RT-PCR法,对58例慢乙肝患者PBMCs中TRAILmRNA进行测定,采用夹心酶联免疫吸附法(ELISA)分析其血清可溶性TRAIL(sTRAIL)水平,实时荧光定量法检测PBMCs中HBV DNA含量,与肝功能相关指标进行相关性分析。结果:各型慢性乙型肝炎患者外周血单个核细胞TRAILmRNA表达水平高于健康者(t=28.311,P〈0.001),但各组间差异显著性,与PBMCs中HBV载量无相关性。CHB轻度、CHB中度、重度-慢性重型肝炎、LC患者血清sTRAIL水平比健康者sTRAIL水平降低(t=0.801,P=0.430;t=2.315,P=0.027;t=2.672,P=0.013;t=5.085,P=0.000),各型慢性乙型肝炎之间差异无统计学意义,与白蛋白(Alb)呈正相关(r=0.426,P=0.002),与TBil、ALT及PBMCs中HBV载量无相关性。结论:慢性乙肝患者PBMCs中TRAILmRNA表达水平增加,血清sTRAIL水平降低,血清sTRAIL与Alb呈正相关,提示外周血单个核细胞膜结合型TRAIL增加,经TRAIL参与的肝细胞损害增加。 展开更多
关键词 受体 肿瘤坏死因子/代谢 rna 信使/代谢 聚合酶链反应 肝炎 乙型 慢性/血液 单核细胞/代谢
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OPN和uPA mRNA在肝细胞癌组织中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 陈淑勤 高凌云 +1 位作者 汪晓军 陈崧 《中国误诊学杂志》 CAS 2008年第36期8823-8825,共3页
目的:探讨骨桥蛋白(OPN)mRNA及尿激酶型纤溶酶原激活物(uPA)mRNA在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及与临床病理特征的关系。方法:应用RT-PCR方法检测60例HCC癌组织、20例正常对照肝组织中OPN和uPA mRNA的相对表达量。结果:HCC癌组织中OPN和u... 目的:探讨骨桥蛋白(OPN)mRNA及尿激酶型纤溶酶原激活物(uPA)mRNA在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及与临床病理特征的关系。方法:应用RT-PCR方法检测60例HCC癌组织、20例正常对照肝组织中OPN和uPA mRNA的相对表达量。结果:HCC癌组织中OPN和uPA mRNA的阳性表达率均分别高于对照正常肝组织(P均<0.05);癌组织中OPN mRNA的表达量在有门静脉癌栓形成组及在有早期复发转移组均高于无门静脉癌栓形成组和无早期复发转移组(分别P<0.05和P<0.01),uPA mRNA的表达水平在有包膜浸润和有门静脉癌栓形成组中均高于无包膜浸润和无门静脉癌栓形成组(分别P<0.05和P<0.01);OPN mRNA的高表达和uPA mRNA的高表达呈正相关(P<0.05)。结论:HCC癌组织中OPN的表达水平可以作为判断肝癌细胞转移能力和预示肝癌早期复发的重要指标。阻断OPN的表达可能可以降低uPA的分泌,从而减少肿瘤的浸润和转移。 展开更多
关键词 唾液糖蛋白类/代谢/遗传学 尿纤溶酶原激活物/代谢/遗传学 rna 信使/代谢 肝细胞/代谢/病理学 肝肿瘤/代谢/病理学 人类
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异丙酚靶控输注系统研究不同麻醉深度下兔脑c-fos mRNA水平的改变
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作者 陈建颜 卢健芳 高申山 《中国误诊学杂志》 CAS 2008年第27期6562-6564,共3页
目的:研究异丙酚不同麻醉深度对兔脑c-fos mRNA水平的影响。方法:30只日本大耳兔,随机分为对照组、浅麻醉组、深麻醉组,每组各10只。应用异丙酚靶控输注系统,研究异丙酚不同麻醉深度下大脑额叶皮质,小脑皮质浦肯野细胞层、颗粒细胞层c-f... 目的:研究异丙酚不同麻醉深度对兔脑c-fos mRNA水平的影响。方法:30只日本大耳兔,随机分为对照组、浅麻醉组、深麻醉组,每组各10只。应用异丙酚靶控输注系统,研究异丙酚不同麻醉深度下大脑额叶皮质,小脑皮质浦肯野细胞层、颗粒细胞层c-fos mRNA表达水平的改变。结果:与对照组比较,大脑额叶皮质,小脑皮质浦肯野细胞层c-fos mRNA表达水平随着麻醉深度的增加而显著升高(P<0.05);小脑皮质颗粒细胞层c-fos mRNA表达水平在麻醉状态下显著升高(P<0.05),但麻醉深度的增加并不能进一步降低其灰度值。结论:异丙酚通过增加c-fos mRNA的表达,影响随后反应基因的转录而发挥抑制中枢的作用。异丙酚抑制中枢的作用部位存在区域性差异。 展开更多
关键词 二异丙酚/投药和剂量 麻醉药 静脉/投药和剂量 原癌基因蛋白质c-fos/遗传学/代谢 rna 信使/代谢 动物
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基于lncRNA-mRNA共表达网络探讨党参增强衰老小鼠免疫功能的机制 被引量:16
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作者 陈冬梅 刘佳佳 +3 位作者 蒙洁 康甲超 段永强 王晶 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期307-315,共9页
目的基于对小鼠脾脏长链非编码RNA(lncRNA)、信使RNA(mRNA)表达谱的检测,探讨中药党参增强衰老小鼠免疫功能的分子机制。方法将100只昆明种小鼠随机分为对照组、模型组和党参低、中、高剂量组(5、10、15 g·kg^(-1));采用每日颈背... 目的基于对小鼠脾脏长链非编码RNA(lncRNA)、信使RNA(mRNA)表达谱的检测,探讨中药党参增强衰老小鼠免疫功能的分子机制。方法将100只昆明种小鼠随机分为对照组、模型组和党参低、中、高剂量组(5、10、15 g·kg^(-1));采用每日颈背部皮下注射D-半乳糖溶液(1.25 mg·g^(-1))建立衰老小鼠模型;党参组每日按上述剂量灌胃给药,给药体积20 mL·kg^(-1),对照组和模型组给予等量生理盐水;连续造模、给药42 d。给药结束后,测定脾脏质量和体质量,计算脾脏脏器系数;采用HE染色法对脾脏组织进行病理学观察,以透射电镜观察脾脏组织超微结构;采用基因芯片技术筛选组间差异表达的lncRNAs和mRNAs,并对差异基因进行通路富集分析;选取组间差异表达的共同lncRNAs和mRNAs进行lncRNA-mRNA共表达网络构建,并采用实时荧光定量PCR法对网络中的基因表达进行验证。结果与对照组比较,模型组小鼠的脾脏质量和脏器系数明显降低(P<0.01);脾脏组织出现病理改变,淋巴细胞发生变异、自噬及凋亡;共有96个lncRNAs和65个mRNAs在衰老后发生了显著变化;Enpp6、Cped1、Galnt15基因表达上调。与模型组比较,党参低、中、高剂量组小鼠的脾脏质量和脏器系数均明显升高(P<0.05,P<0.01);党参对衰老小鼠脾脏组织病理变化及细胞超微结构有明显改善作用;共有623个lncRNAs和435个mRNAs在高剂量党参干预后出现表达差异;差异基因的KEGG通路富集主要与免疫过程、免疫疾病相关,包括同种异体移植物排斥反应、移植物抗宿主病、自身免疫性甲状腺疾病、抗原处理及呈递等;党参高剂量组的Enpp6、Cped1、Galnt15基因表达下调(P<0.01)。结论党参对衰老小鼠脾脏具有一定的保护作用,lncRNA-mRNA共表达网络可能在党参增强衰老小鼠免疫过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 党参 衰老 免疫 基因芯片技术 长链非编码rna(lncrna) 信使rna(mrna) 小鼠
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HPV DNA和HPV E6/E7 mRNA检测在宫颈病变诊治中应用价值的比较 被引量:13
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作者 刘晓旭 梁建梅 +5 位作者 苏学艳 王素娟 赵会娟 秦丽欣 卢雪景 王亚凡 《国际妇产科学杂志》 CAS 2021年第4期462-466,共5页
目的:比较人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)E6/E7 mRNA检测和HPV DNA检测在宫颈病变诊治中的应用价值。方法:选取2018年1月—2019年9月在石家庄市妇幼保健院行宫颈液基薄层细胞学检查(thinprep cytology test,TCT)的患者共33496... 目的:比较人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)E6/E7 mRNA检测和HPV DNA检测在宫颈病变诊治中的应用价值。方法:选取2018年1月—2019年9月在石家庄市妇幼保健院行宫颈液基薄层细胞学检查(thinprep cytology test,TCT)的患者共33496例,其中符合纳入标准的诊断意义不明的非典型鳞状上皮细胞(atypical squamous cells of undetermined significance,ASCUS)患者共3190例,将其随机分为2组,各1595例,分别进行HPV DNA检测(对照组)及HPV E6/E7 mRNA检测(观察组),再对每组的阳性患者进行阴道镜下活检及病理组织学检测,比较2种方法对宫颈病变的检出率。从对照组和观察组阳性的患者中随机各抽取184例,共368例,分别进行HPV E6/E7 mRNA和HPV DNA检测,比较2种方法的诊断效能。结果:对照组高级别宫颈上皮内病变患者的检出率为4.8%(77/1595),观察组为4.1%(66/1595),差异无统计学意义(χ^(2)=0.886,P=0.347)。但与HPV DNA检测相比,HPV E6/E7 mRNA检测具有较高的敏感度(87.50%)、特异度(71.79%)、阳性预测值(49.36%)、阴性预测值(94.81%)、约登指数(0.593)和较低的阴道镜转诊率(42.4%,P<0.05)。结论:对于高级别宫颈上皮内病变,HPV E6/E7 mRNA检测比HPV DNA检测具有更高的诊断效能,可以作为ASCUS患者分流的新方法。 展开更多
关键词 宫颈疾病 人乳头状瘤病毒DNA检测 DNA rna 信使 乳头状瘤病毒科 诊断 HPV E6/E7 mrna检测
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脱腺苷酸酶与RNA代谢调控
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作者 廖小燕 闫永彬 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1002-1016,共15页
真核细胞中,RNA 3’端poly(A)或oligo(A)的特异性水解被称为脱腺苷酸化(deadenylation)。脱腺苷酸化的执行者被称为脱腺苷酸酶(deadenylase)。绝大多数真核细胞中都存在多种脱腺苷酸酶,其中CCR4-NOT复合体和PAN2-PAN3复合体负责细胞中... 真核细胞中,RNA 3’端poly(A)或oligo(A)的特异性水解被称为脱腺苷酸化(deadenylation)。脱腺苷酸化的执行者被称为脱腺苷酸酶(deadenylase)。绝大多数真核细胞中都存在多种脱腺苷酸酶,其中CCR4-NOT复合体和PAN2-PAN3复合体负责细胞中大多数mRNA的非特异性降解,PARN和PNLDC1等参与了特定子集mRNA的降解和多种非编码RNA的生物合成。作为RNA水平的重要调控者之一,脱腺苷酸酶参与了几乎所有细胞生命活动和多种重要生理和病理过程。在真核细胞中,脱腺苷酸酶的分子调控机制可能是:细胞中的大量RNA结合蛋白是RNA命运调控的中心分子,一方面根据RNA的状态或细胞需求识别特定的靶标RNA子集,另一方面招募特定脱腺苷酸酶,对特定子集RNA的3’端进行降解或修剪,从而调控RNA的最终命运。细胞中十余种脱腺苷酸酶同工酶、上千种RNA结合蛋白以及多种多样的翻译后修饰构成了复杂的动态分子调控网络,帮助细胞在生长、增殖、分化、应激、死亡等重要生命活动中精确维持RNA稳态或快速转换基因表达谱。 展开更多
关键词 脱腺苷酸酶 酶分子调控 mrna降解 翻译效率 rna代谢 rna结合蛋白
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外阴鳞癌组织MDM2 mRNA和p53蛋白表达及其意义 被引量:6
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作者 欧阳玲 林蓓 +1 位作者 张淑兰 张冰 《肿瘤防治杂志》 2003年第7期727-729,共3页
目的 :探讨外阴鳞癌组织中MDM2mRNA和p5 3蛋白的表达及在外阴鳞癌发生、发展中的作用。方法 :采用RT PCR法检测 31例外阴鳞癌组织中MDM2mRNA表达情况 ,利用免疫组化S P法检测p5 3蛋白的表达 ,并与 31例癌旁正常外阴组织进行对照。结果 ... 目的 :探讨外阴鳞癌组织中MDM2mRNA和p5 3蛋白的表达及在外阴鳞癌发生、发展中的作用。方法 :采用RT PCR法检测 31例外阴鳞癌组织中MDM2mRNA表达情况 ,利用免疫组化S P法检测p5 3蛋白的表达 ,并与 31例癌旁正常外阴组织进行对照。结果 :在外阴鳞癌组织中MDM2mRNA表达率为 2 2 6 % ,明显高于对照组 ,P <0 0 5。MDM 2表达与组织分化程度无关 ,P >0 0 5。外阴鳞癌组织中p5 3蛋白表达阳性率为 5 8 1 % ,明显高于对照组。突变型p5 3在低、中、高分化外阴鳞癌组中的表达率分别为 87 5 %、6 4 3%及 2 2 2 % ,其表达率随着分化程度的降低而升高 ,低分化组中的表达率明显高于高分化组 ,P <0 0 5。MDM2基因扩增与p5 3蛋白表达呈正相关 ,P <0 0 5。结论 :MDM2基因过表达是外阴鳞癌发生、发展过程中较常见的分子事件 ;p5 3基因突变在外阴鳞癌发生、发展中起重要作用。检测p5 展开更多
关键词 DNA结合蛋白质类/生物合成 rna 信使 蛋白质p53/生物合成 外阴肿瘤/代谢 逆转录聚合酶链反应
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风心病心房颤动患者心房肌肌浆网IP_3-I受体mRNA表达变化的研究
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作者 邓海 昝沁 夏小杰 《中国误诊学杂志》 CAS 2004年第7期982-984,共3页
目的 :研究房颤患者肌浆网钙释放通道 - IP3- I受体 (IP3R1 ) m RNA表达的改变 ,探讨房颤时心肌细胞浆Ca2 +超负荷的原因。方法 :风心病二尖瓣狭窄接受外科手术 38例 ,手术时取右心房及右心耳心肌各约 10 0 mg。通过 RT-PCR(逆转录 -聚... 目的 :研究房颤患者肌浆网钙释放通道 - IP3- I受体 (IP3R1 ) m RNA表达的改变 ,探讨房颤时心肌细胞浆Ca2 +超负荷的原因。方法 :风心病二尖瓣狭窄接受外科手术 38例 ,手术时取右心房及右心耳心肌各约 10 0 mg。通过 RT-PCR(逆转录 -聚合酶链反应 )技术 ,以 GAPDH为内参照 ,测量 IP3R1 m RNA的变化。结果 :房颤者肌浆网 IP3R1 m RNA较窦性心律者上调 ,心房不同部位无差别。结论 :房颤患者 IP3R1 m RNA上调 ,说明心肌细胞 Ca2 + 超负荷与肌浆网钙库的排空有关。 展开更多
关键词 风湿性心脏病/代谢 心房颤动/代谢 肌浆网/代谢 受体 胞质和核/生物合成 钙通道/生物合成 rna 信使
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基于TCGA和GEO数据库构建前列腺癌ceRNA网络并筛选相关lncRNAs 被引量:5
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作者 尹冶 丁明霞 +1 位作者 陈振杰 王玉明 《临床肿瘤学杂志》 CAS 北大核心 2020年第11期1011-1017,共7页
目的利用在线数据库识别前列腺癌中的差异表达基因(DEGs),并基于生物信息学构建前列腺癌竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络。方法下载肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中前列腺癌的RNA测序(RNA-seq)数据和miRNA-Seq数据,筛选出差异表达长非编码RN... 目的利用在线数据库识别前列腺癌中的差异表达基因(DEGs),并基于生物信息学构建前列腺癌竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络。方法下载肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中前列腺癌的RNA测序(RNA-seq)数据和miRNA-Seq数据,筛选出差异表达长非编码RNA(DElncRNA)、差异表达微小RNA(DEmiRNA)和差异表达信使RNA(DEmRNA)。下载基因表达数据库(GEO)中GSE21036数据集的芯片数据,获取DEmiRNA,与TCGA中得到的miRNA取下调型交集。预测交集中miRNA的mRNA及相关lncRNA,与DElncRNA和DEmRNA取上调型交集。据所得调控关系构建网络,并对mRNA进行功能和通路富集分析。结果TCGA组分别获得上调的lncRNA 481个,上调的mRNA 693个,下调的miRNA 51个;GEO组下调的miRNA共18个。对两组下调的miRNA取交集,得到6个共存miRNA。将预测所得mRNA和lncRNA与DElncRNA和DEmRNA取上调型交集,分别获得103个mRNA和19个lncRNA。将所得19个上调的lncRNA、103个mRNA和6个下调的miRNA纳入前列腺癌ceRNA网络的构建。DAVID数据库的基因本体富集论(GO)分析结果显示了16个生物学过程(P<0.05),包括激活转录、RNA聚合酶II启动子转录相关调控、凋亡过程负调控等。KOBAS数据库的京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析结果涉及了激素分泌、Ras信号通路、FoxO信号通路、PI3K/Akt信号通路和cAMP信号通路等(P<0.05)。结论成功构建了促进前列腺癌发生、发展的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,筛选得到19个上调的lncRNA,为前列腺癌发病机制的研究和诊疗生物标志物的探索提供参考依据。 展开更多
关键词 前列腺癌 竞争性内源rna(cerna) 差异表达基因(DEGs) 长非编码rna(lncrna) 微小rna(mirna) 信使rna(mrna)
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乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭患者lncRNA表达谱分析
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作者 李小梅 李荣华 +2 位作者 符小玉 李颖 傅蕾 《生命科学研究》 CAS CSCD 2021年第3期249-258,共10页
为了分析乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭(hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure,HBVACLF)患者与乙肝携带者(asymptomatic carrier,ASC)间差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),探究lncRNA在HBV-ACLF... 为了分析乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭(hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure,HBVACLF)患者与乙肝携带者(asymptomatic carrier,ASC)间差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),探究lncRNA在HBV-ACLF中的功能,选取5例HBV-ACLF患者和5例ASC患者,应用高通量测序检测其外周血中lncRNA及信使RNA(messenger RNA,mRNA)的表达谱,筛选出在两组间差异表达的lncRNA及mRNA,并进一步对差异表达的lncRNA进行生物信息学分析。结果显示,与ASC组相比,HBV-ACLF组中共发现了131个异常表达的lncRNA,表达上调的lncRNA有114个,表达下调的lncRNA有17个,其中lncRNA PIGC上调最显著。GO分析表明,差异表达的lncRNA主要参与病毒复制、固有免疫、小分子物质代谢等生物学过程;KEGG分析发现,差异表达的lncRNA主要参与核黄素代谢、类固醇激素生物合成、果糖和甘露糖代谢、卟啉和叶绿素代谢、叶酸生物合成、氨基酸和核苷酸代谢等信号通路。Cis预测提示,lncRNA PIGC能调控mRNA ENST00000484368的表达。本研究筛选出了在HBV-ACLF患者中差异表达的lncRNA谱,并发现lncRNA很可能通过调节肝细胞的小分子代谢及肝脏免疫反应在HBV-ACLF中发挥作用。 展开更多
关键词 长链非编码rna(lncrna) 信使rna(mrna) 表达谱 乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF) 高通量测序
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