肿瘤信息基因启发式宽度优先搜索算法研究

基于基因表达谱的肿瘤检测方法有望成为临床医学上一种快速而有效的肿瘤分子诊断方法,但由于基因表达谱数据存在维数过高、样本量很小以及噪音很大等特点,使得肿瘤信息基因选择成为一件有挑战性的工作.根据肿瘤基因表达谱样本集的特点,提出了一种以支持向量机分类性能为评估准则的寻找信息基因的启发式宽度优先搜索算法,其优点是能够同时搜索到基因数量尽可能少而分类能力尽可能强的多个信息基因子集.实验采用了3种肿瘤样本集以验证新算法的可行性和有效性,对于急性白血病、难以分类的结肠癌和多肿瘤亚型的小圆蓝细胞瘤样本集,分别只需2,4和4个信息基因就能获得100%的4-折交叉验证识别准确率.与其它优秀的肿瘤分类方法相比,实验结果在信息基因数量及其分类性能方面具有明显的优越性.为避免样本集的不同划分对分类性能的影响,提出了一种能够更加客观地反映信息基因子集分类性能的全折交叉验证评估方法.

基于RD-SVM的肿瘤信息基因选择算法

为了从高维、小样本的基因表达数据中有效地选择特征基因,消除与肿瘤分类无关的数据,提出一种随机矩阵替换与支持向量机的肿瘤信息基因选择算法(RD-SVM)。首先构建多组0/1随机向量表示的信息基因子集,并以支持向量机构建分类器评价每组子集的优劣,然后考虑各特征之间的相互作用,以0、1替换策略对基因子集评估,并找到最优基因子集,最后采用5个肿瘤信息基因表达谱数据对算法性能进行测试。结果表明,相对于参比算法,RD-SVM算法不仅提高了肿瘤信息基因的识别精度,同时所选信息基因最少。

B2B在线支付进化系统的信息基因测度模型

针对现有B2B在线支付系统存在的局限性,缺乏有效协同运作机制的问题,基于协同论的序参量原理,发现参与者信息基因是决定B2B在线支付进化系统宏观有序性的微观序参量,构建了"身份特征值+信誉度"二维属性的参与者信息基因模型及有序度测度算法,讨论了B2B在线支付系统的协同进化问题。

图谱方法实现DLBCL信息基因的提取与分类

对肿瘤信息基因的提取及基因表达谱数据的处理,是基因表达谱研究中至关重要的一步。基于图谱理论提出一种新的DLBCL信息基因提取方法。首先,对每一个基因在不同条件下的表达情况构图,使其便于利用图论知识挖掘规律;进而进行奇异值分解(SVD)获取图的谱信息,刻画出该基因的表达规律,根据图谱与理想模板的余弦夹角及距离的运算选取信息基因子集;最后,实验了两组公开数据集,实验结果验证了方法的可行性。

基于支持向量机的结肠癌信息基因提取

基于结肠癌基因表达谱数据集,提出了一种信息基因提取的新方法。该方法结合了支持向量机(SVM)、Bhattacharyya距离、递归特征消除(RFE)和快速基于相关性过滤器(FCBF)方法。首先,利用Bhattacharyya距离与SVM-RFE方法结合去除无关基因,然后运用FCBF方法得到信息基因,最后以支持向量机作为分类器对结肠癌样本进行分类识别。实验结果表明,同现有的方法相比,该方法在提取基因数量和准确率上都有明显的优势。

信息共享性的理论基础——信息基因复制原理

本文试图把信息微分至最小的基本功能单位(信息基因)来进行探讨,认为信息的共享机理就在于信息基因的复制。

伯延古镇景观基因识别及基因信息编码保护研究

古镇的景观文化基因承载着古镇的历史,是古镇地域性景观文化的载体,但是近年来古镇的保护面临挑战。景观基因理论是从地理环境、历史文化及艺术价值等方面对古镇进行解析,为古镇景观的保护提供了新的视角。因此,文章以伯延古镇为例,基于景观基因理论对伯延古镇进行景观基因识别和提取,并进行信息编码保护研究,以期为古镇景观文化保护提供一定的参考。

基于景观基因信息链的传统村落街巷空间特征及优化策略——以江永县勾蓝瑶寨为例

街巷空间作为传统村落自然生长或规划发展的骨架,系统挖掘其景观基因体系和特征对于传统村落的科学保护与活态利用具有重要意义。本文以景观基因信息链理论为基础框架,以勾蓝瑶寨这一典型瑶族村落为研究案例,在构建街巷空间景观基因信息链识别体系的基础上,通过实地调研和深度访谈等方法,对勾蓝瑶寨的街巷空间特征进行深入分析。研究表明:地形、山水、信仰和民俗是影响勾蓝瑶寨街巷空间的重要景观基因元。街巷空间呈蜿蜒曲折和自然发散的平面街巷形态,景观元素丰富且富有烟火气。景观基因信息点数量众多、历史悠久,特色古建筑装饰和山墙造型使得街巷立面空间独具特色且多变,主体性公共建筑则成为街巷空间集中体现文化风貌、生活习俗的景观。参照性节点类型多样,防御性建筑节点是解构勾蓝瑶寨街巷空间形态的重要基因点。景观基因廊道保存较好,封闭式街巷和曲折错落的纵向空间组织给人较强的封闭感和压迫感。结合勾蓝瑶寨景观基因信息链分析结果,提出了“内修外显”“联点成轴、联轴成链”“凝魂创形”三个方面的基因信息链关联整合策略,为瑶族传统村落的文化景观传承和活化利用提供参考。

人类基因信息利用的价值选择及规则构造

精准医疗的实现以生物医学大数据的存在为前提,患者、受试者的基因信息被用于科学目的,研究者不再将研究对象视为患者,突破了传统医疗上知情同意的“信赖义务”。现代相互关联的大数据环境可能会表现出隐私的相互依存性,个人的隐私受到他人决定的影响。然而,纯个人主义的自治模式过于狭窄,其重在描述传统医患关系框架与权力格局中患者天生的弱势地位,而忽视了其他外在力量的重要性,这在新的技术、政策环境中易出现问题。自治并非唯一价值,其应当与其他价值相平衡。现今的知情同意原则是基于公正伦理学上的预设,而无弱势族群利益保护的考量。精准医疗背景下对基因信息的利用应当严格限定在新的道德框架之内,以群体维度构建基因信息的保护规则,采取“动态+广泛同意”的模式,即以合作研究模式进行,明确当事人的撤销权及其限度。

景观基因信息链视角下海口羊山地区乡土景观特征研究——以涌潭村为例

海南省海口市羊山地区的传统村落具有典型火山和热带地域特色的乡土景观,随着乡村振兴的全面推进,政治景观逐渐影响羊山地区的乡土景观基因,对于羊山地区乡土景观特征的研究显得尤为迫切。本文基于景观基因信息链理论,构建羊山地区乡土景观基因信息链,以羊山地区传统村落涌潭村为具体案例,从景观基因信息元、点、廊道和网络分析羊山地区乡土景观特征。结果表明:1)景观基因信息元内涵丰富,但传承主体缺位,需着重保护信息元的核心载体,创新传承技术和方式;2)景观基因信息点和廊道数量众多,但保护度较差,新的景观要素挤占生存空间,需加强信息点和廊道的保护;3)景观基因信息网络不断延展,需合理科学规划建筑道路,保持其整体协调性和完整性。未来在恢复羊山地区乡土景观的历史文化记忆、构建景观信息载体时,还应关注乡土景观主体之间紧密联系性的创造,并结合数字化技术等进行保护和修复。

海岛渔村景观基因信息库的构建——以东沙村为例

海岛渔村作为独具海洋特色的文化景观空间,具有重要的保护价值和开发潜力。识别海岛渔村景观基因并构建其景观基因信息库,益于从整体视角实现对村落的保护与开发。以东沙村为例,采用ZMET识别其景观基因,引入符号学原理,借助N级编码理论,建立其景观基因信息库,结果显示:东沙村景观基因信息库主要包括布局基因、建筑基因、环境基因、文化基因4大类包含46个单元。未来对于传统村落景观基因信息库的构建可利用地理信息技术进行动态可视化更新,以促进传统村落的保护开发。

论个人信息法律体系下的基因信息保护

《民法典》和《个人信息保护法》构成我国个人信息保护的基本法律体系。然而,高度敏感、特异性显著的基因信息之于人格尊严关系重大,亟待特殊制度保护,但抽象概括的现行法缺少针对性,无法全面因应个人基因信息权益保护及社会实践的制度需求,有必要开展专门立法,构建民法典、个人信息保护法、基因信息法三层制度体系。基因信息保护应以基因信息隐私自决与安全为先,兼顾流动利用;以自然人基因权益为本,衡平多重利益;实行法律与伦理共治,融合宽容及责任原则。据此,在基因信息类型化及可处理性分级的前提下,立足通用个人信息法律制度,明晰个人基因信息权益,厘清特定的目的、充分的必要性和严格保护措施等处理前置条件,重点围绕基因信息处理告知同意,开展差异化制度设计,构造非完全行为能力人同意、以书面为原则的同意方式、同意的无条件撤回、基于基因信息类型的同意豁免事由等特殊规则。

传统村落文化景观基因信息链的提取与空间特征研究——以张谷英村为例

传统村落作为我国文化遗产的重要组成部分,积淀着中国传统民族精神和中国智慧。现有传统村落文化景观的形态研究,尚未从整体视角系统分析文化景观基因信息链的空间形态特征。本文以张谷英村为例,结合文化景观基因信息链,运用形态特征基本分析模式探究信息链的空间形态特征,分析空间组织规律和影响因素。结果表明:①张谷英村文化景观基因信息链空间形态特征的基本类型有等级型、文脉型和风水型。等级型的民居信息链依宗族礼制的秩序演化,呈中轴对称、主次分明的“丰”字形;文脉型的耕读信息链以耕读文化为脉络隐性发育,呈线性模糊、散点分布的串珠形;风水型的龙形风水信息链是在山水环境和风水文化的共同作用下,呈虚实相间、巨龙戏珠的树枝形。②三类信息链都彰显了联通性、有序性、向心性和韵律性的空间组织规律。③信息链的发育和形成主要受自然山水、宗族血缘、儒家礼制和风水思想四个方面的影响。

论基因信息的二阶人格权形态

基因信息是运用基因技术方法从包括基因在内的人体生物材料中提取的反映自然人遗传特征的个人信息,具有显著的身份识别性、预测性,呈现私密性、高度敏感性,非普通个人信息以及一般生物识别信息、医疗健康信息等敏感信息可比拟。《中华人民共和国民法典》就私密信息保护采取隐私权与个人信息权益双重进路,基因信息作为私密信息,权利适宜认定为隐私权与个人信息权二阶形态,基因信息隐私权更为基础,二者具有利益一体性、功能互补性、适用接续性等特征。

潇贺古道永州段传统村落景观基因信息链研究——以道县龙村为例

运用景观基因理论,以道县乐福堂乡龙村为例,通过实地调研、深度访谈、文献阅读、影像航拍、测绘等方式,对龙村的景观基因进行了识别与提取,构建了龙村景观基因信息链并对其进行特征分析与研究。结果表明:(1)龙村整体风貌景观基因保存度较好,具有较大的文化研究与历史价值;(2)龙村的景观信息元,即内在主要文化基因以农耕文化为主,其内涵丰富但延续性较差,部分景观信息元未得到有效的传承;(3)龙村景观信息点众多,信息点的保存程度整体优于信息元;(4)龙村景观信息廊道保存相对完整,存在局部松动、断裂等现象;(5)龙村景观信息网络整体保存度一般,需要尽快对相关建筑进行修缮,避免进一步损坏。未来应加强传统村落风貌特征的数字化研究,并且结合地理信息(GIS)技术为传统村落保护提供更加精准化的修复方案。

万里茶道起点下梅古村落景观基因信息链构建及特征分析

传统村落承载着农耕文明和民族文化的精髓。识别传统村落景观特征并掌握其内在肌理,有利于从村落整体视角实现对村落景观的有效保护与传承。以万里茶道第一站下梅村为例,引入景观基因信息链理论,对其景观结构和潜在文化特征进行评估与解析。结果表明:1)受地理位置影响,下梅村整体景观形态保存较为完好,布局充分结合自然山水,形成“三山鼎峙,一水环流”的中国传统风水格局,历史研究和保护价值较高;2)下梅村景观信息元种类繁多、内涵丰富、技艺精湛,但三者传承度较低,原真性现状有待提升;3)下梅村景观信息点数量较多、结构精巧、风格独特,村落自然景观保存程度要劣于人文景观;4)下梅村景观信息廊道为“一字型”商业街、“并列型”滨水观光道及“网络型”巷道,部分道路材质开始出现断裂、拼接与松动等现象,但保存度较为完整;5)下梅村景观信息网络整体性较强,由于大量建筑局部装饰受损度严重,主体结构存在塌毁、残缺等问题,保存度一般,急需有效修缮。未来研究需结合GIS技术、数理分析模型等,增加其可视化分析,为传统村落景观保护性利用提供精准化修复方案,防止再遭破坏。

基于基因组SNP信息分析新疆夏洛莱牛群体的遗传结构和遗传背景初报

近50年来,引入的夏洛莱牛在塔额盆地已初步形成遗传性能稳定、产肉性能好的新类群。然而,在夏洛莱牛的杂交改良和选育过程中,缺乏系统的育种档案资料,存在着群体遗传背景不清、血缘关系不明等问题。本研究利用基因组高通量检测技术,分析新疆夏洛莱杂交新类群核心群中的全基因组水平SNPs变化,样本SNP数据平均检出率(Call Rate值)大于90%(99.40%),检测后分析群体中有效群体含量(Ne)、群体的多态性标记比例(Pn),群体的期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)等数据,得出现有新疆夏洛莱核心群体的纯度较好,有效群体含量为28.69,个体间的亲缘关系呈中等程度、整个群体分为26个家系,个体基于ROH的近交系数值是0.030。结论:基因组分析运用高通量测序,通过关联分析,对新疆夏洛莱肉牛群体明确系谱信息,开展全基因组选育,指导组建核心育种群,为群体的遗传背景和血缘关系提供科学依据,对提高今后新疆夏洛莱群体选种的正确性,缩短世代间隔,建立现代新型良种繁育体系有重要的意义。

消费性基因检测场景下的个人基因信息保护

消费性基因检测的兴起催生了大量的个人基因信息处理活动,检测机构成为特殊的大数据公司。基因信息是一种高度敏感的个人信息,基因检测的商业化给个人基因信息的法律保护带来严峻挑战。消费性基因检测中的个人信息处理质量堪忧,检测报告的科学性和有用性不足,对此应通过完善基因信息处理的相关科学标准来解决。由于基因信息固有的极强的身份识别能力,匿名化作为基因信息处理合法基础的正当性存疑,应适度提高基因信息匿名化的认定标准,并对检测公司等信息处理者课以动态风险评估义务。针对消费者基因信息处理中的同意作用虚化问题,应实行严格的单独同意,不能将同意条款简单混杂在隐私政策或服务协议中。检测公司不能仅仅告知消费者可能与第三方共享基因信息,而应当向消费者如实告知可能通过与第三方共享基因信息而营利。

景观基因信息链视角下古道起点非遗特征研究

非物质文化遗产是乡村文化、乡风乡俗、乡容乡貌的独特标识,承载着中华文明的优良传统和深厚的历史文化积淀。古道是现代交通形成前村落非物质文化产生、传播、发展、演变的重要途径。以徽杭古道起点处伏岭村为例,结合景观基因信息链理论,对其非物质文化遗产景观基因进行识别与提取,构建非物质文化遗产景观基因信息链,探索其风貌特征。结果发现,伏岭村非物质文化遗产丰富,以信息元与信息点最为突出,信息廊道保存较好,但整体文化风貌保存一般。基于此提出针对性意见,以期解决传统村落非遗保护、旅游发展中的问题,为乡村振兴背景下古道沿线村落非物质文化遗产活化传承提供思路。

个人基因信息的刑法保护路径研究——兼论侵犯公民个人信息罪所涉的法益

“基因”与“基因信息”是不同概念,前者是指后者的原初物质载体;后者所指应当与个人健康信息、健康生理信息、生物识别信息相区分;个人基因信息在主体、性质及其应用方面的特点,决定了侵犯公民个人信息罪的法益是具有公法属性的个人法益;在适用该罪所规制的侵犯个人基因信息的行为时,应当将部门规章纳入“违反国家有关规定”的范围;对“情节严重”可以从立法与法理解释上进行完善。