图书信息学研究的可视化分析

运用Citespace对2002-2010年图书信息学科50种核心期刊题录数据进行可视化分析,揭示出图书信息学科研究的10个子领域、代表研究热点的20个主题词、代表研究前沿的6个主题词,通过将数据划分为三个阶段并分析每个阶段内各年研究热点的变化,总结出图书信息学科研究特点。

DNA甲基化的生物信息学研究进展

作为重要的表观遗传学现象之一,DNA甲基化对基因的表达发挥重要的调控功能.随着高通量检测技术的不断发展,对DNA甲基化的生物信息学研究也成为DNA甲基化研究中的一个非常活跃的热点.对生物信息学在DNA甲基化状态的预测、CpG岛不易被甲基化的机制研究、探索DNA甲基化同其他表观遗传学现象之间的关系以及DNA异常甲基化同癌症的发生和发展之间的关系等方面的研究进展进行综述.

美国社会信息学研究状况综述

本文对美国的社会信息学研究状况进行梳理,旨在对美国社会信息科学的研究提供参考。回顾了社会信息学的定义及其在美国的研究历史,综述了美国在机构团体、会议组织、杂志期刊几个方面的研究状况,并介绍了社会信息科学在美国的教学与研究现状及经费来源情况。

日本国立信息学研究所机构知识库委托项目计量研究及启示

对日本国立信息学研究所在2005-2012年为帮助大学建设机构知识库实施的机构知识库委托项目进行研究，了解其开展状况，为国内开展类似项目提供参考。借助SPSS等软件对实施期间相关数据进行分析处理，分析委托项目的发展脉络，得到中心机构与中心领域，并为国内开展类似合作项目提出四点建议。

人乳头状瘤病毒阳性的头颈鳞状细胞癌特异性基因生物信息学研究

目的分析人乳头状瘤病毒(HPV)阳性的头颈鳞状细胞癌(鳞癌)特异表达基因及关键信号通路,为HPV相关头颈鳞癌筛选有价值的基因标记物,并为进一步的肿瘤机制研究提供参考。方法从GEO高通量基因芯片数据库中筛选出头颈鳞癌具有HPV感染信息的芯片,从中筛出差异基因进行基因本体分析及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析,并筛出头颈鳞癌的特征基因簇和通路,以及关键基因并进行蛋白质相互作用网络可视化分析。通过Cbioportal信息门户以及癌症基因组图谱(TCGA)数据库验证这些特异基因在HPV(+)与HPV(-)头颈鳞癌中的表达差异并分析特异基因与头颈鳞癌患者生存预后的相关性。结果从数据集GSE52088与GSE39366中筛选出42个共同差异基因,其中上调基因25个,下调基因17个,经Cytoscape两轮筛选确定白介素-6(IL-6)、细胞表面标记物CD44、基质金属蛋白酶1(MMP1)、CXC趋化因子配体基序1(CXCL1)4个特异基因。信号通路富集分析显示共同差异基因参与细胞周期、NOD样受体信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路途径等信号通路(P<0.01)。经TCGA数据库以及Cbioportal检验证实特异基因在HPV(+)与HPV(-)头颈鳞癌中的表达差异,且IL-6、CD44表达水平与头颈鳞癌生存预后呈负相关(P<0.01)。结论HPV(+)头颈鳞癌具有特异性基因表达,并可能参与关键信号通路调控肿瘤的发生发展。IL-6、CD44、MMP1、CXCL14个特异基因可能参与HPV(+)头颈鳞癌发展及侵袭过程,其中MMP1、CXCL1有望作为诊断及预后的标志物,IL-6、CD44与头颈鳞癌预后存在相关性,有望成为治疗HPV(+)头颈鳞癌的潜在靶点。

网络信息传播对信息学应用研究的影响效应

以网络信息传播的运行规律及特点 ,探讨了网络信息具有的虚拟性、前瞻性和共享性 ;并分析研究了网络信息传播对信息学应用研究的影响效应。

一部影响深远的创新、适时、务实之作——评《经济信息学理论与应用研究》(修订版)

《经济信息学理论与应用研究》(修订版 )是一部影响深远的创新、适时、务实之作。它是对经济信息人员进行理论武装的教科书 ,是指导经济信息工作实践的参考书 ,是用户获取经济信息的导航标。

文献信息学的哲学观新论

马克思主义哲学和信息科学是指导文献信息学的理论基础。恩格斯说：“自然科学家可以采取他们所愿意采取的那种态度，他们还是得受哲学的支配。”马克思主义的哲学方法是在概括总结各门具体科学研究成果的基础上，根据自然、社会、思维的一般规律引出的最具有普遍意义的方法论。文献信息学研究自然要依赖这个方法论。

社会信息学在日本

本文通过对日本社会信息学发展过程的探究,对日本高校社会信息学课程的开设、教学特点的探讨、以及对学科代表人物的推介,从一个侧面反映了日本社会信息学的历史和现状,并由此把握其在今后一段时间的发展趋势。

《生物信息学》课程教学模式探讨

在教学实践的基础上,结合生物信息学课程的学科特点,以及现代教育技术,就开设生物信息学课程的必要性及构建最合适的复合型教育模式展开了初步的探讨,为我国生物信息学课程的教学实施提供指导。随着时代的不断进步和发展,生物信息学的内涵也在不断扩大,包括生物信息学所涉及到的计算机基础知识、生物学基础知识、生物信息学研究领域、生物信息学应用领域等等。在生物信息学的教学实施过程中,将多个基础学科交叉融合是必备的,这不仅有助于增强学生对生物信息学科的了解,也对于学生在后续的生物信息学研究中起到了基石的作用。因此,如何将这些涉及范围广、涉及内容深的生物信息学基础课程恰当的传授给学生是教师们最需要考虑的问题,从而形成一套独特的教学体系,使生物信息学的教学工作更顺利,完整的进行下去。

中华医学会第二十次全国医学信息学术会议征文通知

由中华医学会、中华医学会医学信息学分会主办，重庆市卫生信息中心协办的中华医学会第二十次全国医学信息学术会议，将于2014年5月下旬在重庆市召开。本次会议的主题为：“大数据：医学信息学研究与实践”。欢迎本领域的科技工作者踊跃投稿参会。

番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析

DP基因属于DP/E2F转录因子家族,其编码的蛋白是E2F蛋白的二聚化分子伴侣,可能参与调控细胞周期、DNA复制、生长、分化、凋亡等多种细胞进程。根据SGN数据库登录的番茄序列,通过RT-PCR方法从野生型番茄中克隆了一个DP基因,命名为SlDP1。生物信息学预测,SlDP1蛋白定位于细胞核,具有保守的DNA结合域、二聚化区域和C-末端及多个磷酸化位点。蛋白质二级结构预测SlDP1蛋白含51.50%的环状结构,34.55%的α螺旋和2.66%的β折叠。荧光定量PCR分析外源激素对野生型番茄SlDP1基因表达量的影响,发现该基因受外源性乙烯前体ACC的诱导。对环境因子应答的RT-PCR结果表明,在伤害和盐处理的叶中该基因表达不受诱导,而盐处理的根中该基因表达量提高。SlDP1基因表达模式分析表明,该基因在根、花、萼片及成熟时期果实中表达量较高。这些结果为进一步研究SlDP1基因在番茄生长发育过程的功能奠定了基础。

用户满意研究的宏观思考

User Satisfaction shapes the third theoretical platform in information research.This article discusses the definition and origin of user satisfaction from the viewpoint of philosophy.The influences of knowledge economy era on user satisfaction are also described.

日本学术信息的OA出版和机构仓储共建项目的概述及启示

文章对OA的含义进行了简要分析，OA运动主要分为OA出版和机构仓储，文章概述日本这两方面的动态，并给出相应的比较分析，总结出对中国的启示性结论。该文为《数字图书馆论坛》2009年第11期本期话题“Open Access”的文章之一。

网络时代图书馆学基础研究的若干思考

步入 2 1世纪的图书馆学 ,正处于理论变革与学科再造的关键阶段。本文从五个方面就图书馆学基础研究的基本思路和若干内容作了初步探讨。

mRNA选择性剪接与人类疾病

mRNA前体选择性剪接在人类基因组中广泛存在,是增加蛋白质多样性与基因表达复杂程 度的主要原因。它受到许多顺式作用元件与反式作用因子的调控。当这些调控机制遭到破坏时便会出 现不正常的选择性剪接,其结果是导致某些遗传病与肿瘤。大规模分析选择性剪接的方法可以利用 EST数据库进行生物信息学研究,但采用基因芯片的策略将更为有效。

陕西省社会科学信息学会举行学术报告会

2005年10月28日上午，陕西省社会科学信息学会在陕西省委党校召开会议，就开展信息学研究相关问题，邀请甘肃省社会科学院情报所所长、研究员刘珙同志作学术报告。学会会员70余人参加会议。