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三种生物信息学软件对癫痫相关SCN1B错义突变的预测性能评估
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作者 汤斌 周鹏 +1 位作者 李斌 何娜 《临床医学工程》 2019年第6期717-718,共2页
目的使用三种生物信息学软件(MutPred2、PROVEAN和SNAP2)对癫痫相关SCN1B基因错义突变的预测性能进行评估。方法从HGMD数据库收集22个具有明确致病性的错义突变作为阳性组,从dbSNP和ExAC数据库收集136个无疾病表型报道的错义突变作为阴... 目的使用三种生物信息学软件(MutPred2、PROVEAN和SNAP2)对癫痫相关SCN1B基因错义突变的预测性能进行评估。方法从HGMD数据库收集22个具有明确致病性的错义突变作为阳性组,从dbSNP和ExAC数据库收集136个无疾病表型报道的错义突变作为阴性组,评估三种软件的预测性能。结果从准确率、特异度、PPV、NPV、MCC值和AUC值指标进行评估,排名依次均为PROVEAN、SNAP2、MutPred2。PROVEAN软件阳性判断的阈值为-2.5,位于SCN1B错义突变阳性组和阴性组预测分值的中位数(-3.199^-2.026)之间。结论三种软件在使用不同指标参数进行评估时的性能有所不同,其中PROVEAN软件综合多个指标参数对SCN1B基因错义突变的预测性能最佳。 展开更多
关键词 错义突变 生物信息学软件 SCN1B
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生物信息学软件预测猪氨基肽酶N功能与结构
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作者 贾燕 曹金山 魏战勇 《畜牧与饲料科学》 2021年第2期1-6,共6页
[目的]研究猪δ冠状病毒(PDCoV)入侵宿主细胞的感染机制,对其特异性受体猪氨基肽酶N基因编码蛋白功能与结构进行分析。[方法]通过多种生物信息学软件对pAPN蛋白的理化特性、亲疏水性、信号肽、跨膜区、糖基化位点、抗原表位、功能结构... [目的]研究猪δ冠状病毒(PDCoV)入侵宿主细胞的感染机制,对其特异性受体猪氨基肽酶N基因编码蛋白功能与结构进行分析。[方法]通过多种生物信息学软件对pAPN蛋白的理化特性、亲疏水性、信号肽、跨膜区、糖基化位点、抗原表位、功能结构域及结构特征等进行预测分析。[结果]pAPN基因总长为2892 bp,编码963个氨基酸;其中,第35~963位氨基酸为膜外蛋白区,不含信号肽但包含2个典型的功能结构域。pAPN蛋白共有23个糖基化修饰位点和42个抗原表位。pAPN蛋白胞外域空间结构为二聚体,每个单体均可分为Ⅰ~Ⅳ4个结构域。[结论]该研究为了解pAPN蛋白与多种猪肠道冠状病毒相互作用的机制提供了思路。 展开更多
关键词 猪氨基肽酶N 肠道冠状病毒 生物信息学软件 功能 结构
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生物信息学软件研究的可视化分析 被引量:3
3
作者 种乐熹 胡德华 《生物信息学》 2015年第1期54-67,共14页
以Web of Science数据库为数据来源,利用Cite Space和UCINET软件对发表在Nucleic Acids Research期刊上有关生物信息学软件研究的文献做了可视化分析,揭示了该领域的研究力量、作者团队与高被引作者、知识基础、期刊分布、研究热点与前... 以Web of Science数据库为数据来源,利用Cite Space和UCINET软件对发表在Nucleic Acids Research期刊上有关生物信息学软件研究的文献做了可视化分析,揭示了该领域的研究力量、作者团队与高被引作者、知识基础、期刊分布、研究热点与前沿,为生物信息学软件的研究和发展提供必要的参考依据。 展开更多
关键词 生物信息学软件 知识图谱 共被引分析 研究热点 研究前沿
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五种生物信息学软件对于错义突变预测性能的评估 被引量:5
4
作者 陈倩婷 戴聪伶 +2 位作者 张前军 杜娟 李汶 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期625-628,共4页
目的对5种生物信息学软件(SIFT、PolyPhen2、Mutation Taster、Provean、Mutation Assessor)的预测性能进行评估。方法从自有突变数据库、中文数据库、人类基因突变数据库、dbSNP数据库中检索并收集121个具有明确功能学研究的错义突... 目的对5种生物信息学软件(SIFT、PolyPhen2、Mutation Taster、Provean、Mutation Assessor)的预测性能进行评估。方法从自有突变数据库、中文数据库、人类基因突变数据库、dbSNP数据库中检索并收集121个具有明确功能学研究的错义突变以及121个家系分析提示具有致病性的错义突变作为阳性金标准,242个显性遗传病致病基因上最小等位基因频率〉5%的错义突变作为阴性金标准,用上述软件对其进行预测。用敏感度、特异度、阳性预测值、假阳性率、阴性预测值、假阴性率、错误发现率、准确度、受试者工作特征曲线等9个指标评估5种软件的预测性能。结果从敏感度、阴性预测值和假阴性率的指标进行评估,5种软件的排名依次为MutationTaster、PolyPhen2、Provean、SIFT、Mutation Assessor;从特异度和假阳性率指标进行评估,其排名依次为MutationTaster、Provean、MutationAssessor、SIFT、PolyPhen2;从阳性预测值和错误发现率指标进行评估,其排名依次为MutationTaster、Provean、MutationAssessor、PolyPhen2、SIFT;从曲线下面积值和准确度指标进行评估,其排名依次为MutationTaster、Provean、PolyPhen2、MutationAssessor、SIFT。结论各软件在使用不同指标参数进行评估时的性能有所不同,其中MutationTaster软件从9个指标参数评估性能为最佳。 展开更多
关键词 错义突变 生物信息学软件 性能评估
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基于Cytoscape等生物信息学分析软件预测荜茇明碱抗肿瘤靶基因 被引量:6
5
作者 滕文静 李洪霖 李雁 《广州中医药大学学报》 CAS 2017年第5期785-789,共5页
荜茇明碱是从胡椒科植物中分离出的天然生物碱(酰胺类),具有多种药理作用。通过收集总结近20年来有关荜茇明碱的研究文献,总结其作用靶点,将明确的作用靶点提交到Cytoscape、Bingo等生物信息学分析软件中进行下一步文本挖掘,以预测其可... 荜茇明碱是从胡椒科植物中分离出的天然生物碱(酰胺类),具有多种药理作用。通过收集总结近20年来有关荜茇明碱的研究文献,总结其作用靶点,将明确的作用靶点提交到Cytoscape、Bingo等生物信息学分析软件中进行下一步文本挖掘,以预测其可能的生物学功能及相关靶基因。分析结果显示荜茇明碱对多种实体肿瘤及血液病均具有抑制作用,其作用机制主要包括血管生成转移、活性氧簇(ROS)、DNA损伤、诱导细胞凋亡、阻止细胞周期、逆转肿瘤细胞耐药6个方面。通过采用Cytoscape、Bingo等软件进行深入文献挖掘后发现,其抗肿瘤潜能主要涉及78个基因,包含4个主要的分子模块,其潜在靶基因指向可能与核酸变化以及细胞压力处理过程有关。以上分析结果将为荜茇明碱抗肿瘤作用的进一步研究提供新的研究方向。 展开更多
关键词 荜茇明碱 抗肿瘤 靶基因预测 细胞凋亡 生物信息学分析软件
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欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1理化性质与结构的生物信息学分析 被引量:2
6
作者 曹淑芬 李文 +3 位作者 何颖 邹泽红 李林梅 艾云灿 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1291-1294,1298,共5页
目的:运用生物信息学相关软件,预测欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1的理化性质和结构,为Lig v 1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法:查询文献获得Lig v 1的氨基酸序列,运用生物信息学软件分析其理化性质(Prot Param)、... 目的:运用生物信息学相关软件,预测欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1的理化性质和结构,为Lig v 1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法:查询文献获得Lig v 1的氨基酸序列,运用生物信息学软件分析其理化性质(Prot Param)、信号肽(Signal P 4.1 Server)、跨膜区(TMHMM Server v.2.0)、二级结构(GOR4)、MHCⅡ类抗原表位(Net MHCⅡ2.2 Server)、B细胞抗原表位(ProteanTM5.01)以及系统发生树(MEGA 6)。结果:Lig v 1在大肠杆菌中稳定性较好,不存在信号肽与跨膜区;二级结构中无规则卷曲占大多数;Lig v 1潜在MHCⅡ类抗原表位为30~44区域;B细胞抗原表位既具有连续的氨基酸序列,也具有不连续的氨基酸序列;Lig v 1与欧洲白蜡以及木犀榄的同源蛋白进化距离最近。结论:大肠杆菌是适合重组Lig v 1的表达系统,Lig v 1抗原表位分析为低过敏原性改造提供参考。 展开更多
关键词 欧洲女贞 过敏原 生物信息学软件 Lig V 1 抗原表位
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基因表达模式分析及软件系统 被引量:4
7
作者 谢建明 孙啸 +1 位作者 谢雪英 陆祖宏 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第2期201-204,共4页
研究和实现了 4种基因表达模式的聚类方法 ,开发了基因表达模式分析软件系统 .该软件包含了两两平均连锁聚类法、系统聚类法、自组织特征映射法和模糊聚类等聚类算法 ,其中模糊聚类算法是首次用于基因表达模式分析 .该软件同时具有数据... 研究和实现了 4种基因表达模式的聚类方法 ,开发了基因表达模式分析软件系统 .该软件包含了两两平均连锁聚类法、系统聚类法、自组织特征映射法和模糊聚类等聚类算法 ,其中模糊聚类算法是首次用于基因表达模式分析 .该软件同时具有数据过滤、多种相似性度量选择、聚类方法选择和结果可视化等功能 .对于同一组基因表达数据 ,可通过不同的聚类算法的组合 ,提供更多的基因分类信息 。 展开更多
关键词 基因表达模式 聚类分析 软件系统 模糊聚类 生物信息学软件 两两平均连锁聚类法 系统聚类法 自组织特征映射法
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将现代信息技术融入微生物学综合实验的教学探讨
8
作者 韩国民 《现代农业科技》 2018年第16期276-277,共2页
本科生所掌握的现代信息技术与真正的科研应用差距较大,体现在本科论文答辩时图表、参考文献不规范等。结合多年教学经验,笔者将文献管理、信息追踪、图表制作、生物信息学软件使用等多种技能融入微生物学综合实验教学中,显著增强了本... 本科生所掌握的现代信息技术与真正的科研应用差距较大,体现在本科论文答辩时图表、参考文献不规范等。结合多年教学经验,笔者将文献管理、信息追踪、图表制作、生物信息学软件使用等多种技能融入微生物学综合实验教学中,显著增强了本科生论文写作的规范性,并初步培养了生物相关专业本科生科学素养及综合能力。 展开更多
关键词 微生物学综合实验 文献管理 信息追踪 图表制作 生物信息学软件
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Fhhh工程菌株降解PTA废水动力学研究 被引量:2
9
作者 程树培 张徐祥 +4 位作者 石磊 曲蒙蒙 周涛 郝春博 严峻 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第6期116-120,共5页
研究了工程菌株Fhhh降解精对苯二甲酸 (PTA)石化废水的动力学 .将测得的Fhhh降解废水的 6项动力学参数值、废水自然参数值、废水排放标准控制值 ,输入环境生物技术信息学软件 (Ebis)进行计算 .结果表明 ,来源于 3种保存方法的Fhhh菌株... 研究了工程菌株Fhhh降解精对苯二甲酸 (PTA)石化废水的动力学 .将测得的Fhhh降解废水的 6项动力学参数值、废水自然参数值、废水排放标准控制值 ,输入环境生物技术信息学软件 (Ebis)进行计算 .结果表明 ,来源于 3种保存方法的Fhhh菌株中 ,所需反应器的最小体积 (Vmin)为 1 30 9m3 ,比降解率 (qA)的最高数值为0 0 1 36h- 1,是土著菌YZ1的 4倍 ,高于国内外同类研究的 4项数值 ,低于同类研究的 2项数值 .结果表明 ,Fhhh工程菌株具有降解PTA废水的显著优势 . 展开更多
关键词 工程菌株 原生质体融合 PTA废水 动力学 信息学软件
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赤鳞鱼GH全长cDNA扩增和生物信息学分析 被引量:3
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作者 汪艳宏 李洁 +1 位作者 黄丽波 袁学军 《畜牧与兽医》 北大核心 2012年第S1期336-336,共1页
赤鳞鱼(Varicorhinus Macrolepis)是泰山的一种濒危珍贵小型鱼种,生长极其缓慢并且具有很高的营养和药用价值。为了研究赤鳞鱼的生长发育及调控规律,我们用SMART RACE技术克隆了赤磷鱼生长激素(GH)基因的全长cDNA序列。
关键词 赤鳞鱼 cDNA扩增 GH 生物信息学软件 生物信息学分析 RACE SMART 调控规律 鲤科鱼类 亲缘关系
原文传递
EMBOSS和EMBnet 被引量:3
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作者 罗静初 《生物信息学》 2021年第4期223-231,共9页
笔者撰写的“EMBOSS软件包序列分析程序实例”一文,已经在《生物信息学》期刊2021年第19卷第1期发表。此文介绍欧洲分子生物学开放软件包(European Molecular Biology Open Software Suite,EMBOSS)。EMBOSS是欧洲分子生物学网络组织(Eur... 笔者撰写的“EMBOSS软件包序列分析程序实例”一文,已经在《生物信息学》期刊2021年第19卷第1期发表。此文介绍欧洲分子生物学开放软件包(European Molecular Biology Open Software Suite,EMBOSS)。EMBOSS是欧洲分子生物学网络组织(European Molecular Biology Network,EMBnet)于上世纪九十年代末启动的以欧洲国家为主的国际合作项目,是生物信息学领域中较早投入使用的大型开源软件包。本文基于笔者亲身经历,回顾EMBOSS项目的来龙去脉,讲述EMBnet三十多年来的发展历程,及其对生物信息开发、服务和教育培训等方面的贡献,从某个侧面为读者特别是年轻读者展示生物信息学发展早期的一段历史。 展开更多
关键词 生物信息学 生物信息学软件 欧洲分子生物学开放软件包EMBOSS 欧洲分子生物学网络组织EMBnet
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大豆过敏原11S球蛋白G2中A2链结合表位的预测 被引量:9
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作者 刘阳星月 张迪 +3 位作者 姚亚亚 苗字叶 刘壮 李慧静 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第18期152-158,共7页
采用生物信息学软件NCBI Gen Bank数据库、PDB数据库、SWISS-MODEL、Deep View 4.1等预测11S球蛋白G2中A2链的二级结构和三级结构模型,使用Disco Tope 2.0 Server软件预测B细胞构象表位,发现构象表位多位于无规则卷曲处。定位B细胞线性... 采用生物信息学软件NCBI Gen Bank数据库、PDB数据库、SWISS-MODEL、Deep View 4.1等预测11S球蛋白G2中A2链的二级结构和三级结构模型,使用Disco Tope 2.0 Server软件预测B细胞构象表位,发现构象表位多位于无规则卷曲处。定位B细胞线性结合表位,结果表明11S球蛋白G2中A2链的可能线性表位有:^(37)KPDNRIE^(43)、^(79)PSYTNGP^(85)、^(114)SQQRGRSQRP^(123)、^(52)WNPNNK^(57)、^(196)QQGGSQSQKGKQQE^(209)、^(241)QGENEEED^(248)、^(267)RKPQQEEDDDDEEEQ^(281)、^(287)TDKGC^(291)。此表位预测为后续制肽、免疫等操作找出更准确的肽序,以便建立适合我国大豆过敏人群的食品大豆过敏原的检测技术。 展开更多
关键词 大豆过敏原 11S球蛋白G2中A2链 生物信息学软件 蛋白质二级结构 三级结构模型 B细胞表位
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中国两个高IgM综合征家系的基因诊断 被引量:1
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作者 郁俐 汪希珂 王剑 《现代检验医学杂志》 CAS 2013年第3期21-23,26,共4页
目的 对中国两个高IgM综合征(HIGM)家系进行基因突变检测,并应用生物信息学软件加以分析诊断.方法 该研究以2012年中国贵州省收治的两名HIGM先证者(男孩)及其家系成员为研究对象,对先证者的CD40LG,AICDA,CD40和UNG基因外显子及其侧... 目的 对中国两个高IgM综合征(HIGM)家系进行基因突变检测,并应用生物信息学软件加以分析诊断.方法 该研究以2012年中国贵州省收治的两名HIGM先证者(男孩)及其家系成员为研究对象,对先证者的CD40LG,AICDA,CD40和UNG基因外显子及其侧翼序列进行扩增,PCR产物经纯化后Sanger法测序.应用Mutation Surveyor软件检测序列图谱中所有的基因变异点,并运用Alamut软件预测变异的致病性.同时选取100位排除患有HIGM疾病健康者的DNA,作为基因多态性对照.结果 基因测序分析发现:第1例先证者为7岁男孩,其CD40LG基因第5外显子存在错义突变p.Gly167Arg(c.499G〉C),该患者母亲携带此错义突变;第2例先证者为3岁男孩,其CD40LG基因第1外显子存在单碱基缺失c.114delG,导致39位后编码氨基酸发生移码突变,并在53位引入终止密码,形成截断型蛋白(p.Ser39GlnfsX14),患者母亲同样携带此突变.两个突变均未在100位排除患有HIGM疾病健康者中发现.结论 该研究建立了HIGM准确、简便的基因突变筛查办法,CD40LG基因c.114delG突变为国际上首次报道. 展开更多
关键词 高IgM综合征CD40LG基因 基因突变 生物信息学软件
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minTBP-1/RGD和minTBP-1/IGF-1靶向融合蛋白促进2型糖尿病条件下钛种植体骨结合的研究
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作者 王君俊 张旻 张茜 《医用生物力学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第S01期398-398,共1页
目的通过生物信息学软件设计融合蛋白minTBP-1/RGD和minTBP-1/IGF-1,构建钛种植体仿生化生物活性涂层,提高2型糖尿病(T2DM)钛种植体-骨结合力。方法采用同源建模法结合AutoDock软件设计minTBP-1-GQGQGQGQGQGRGD及3 minTBP-1-GSIEGR-IGF-... 目的通过生物信息学软件设计融合蛋白minTBP-1/RGD和minTBP-1/IGF-1,构建钛种植体仿生化生物活性涂层,提高2型糖尿病(T2DM)钛种植体-骨结合力。方法采用同源建模法结合AutoDock软件设计minTBP-1-GQGQGQGQGQGRGD及3 minTBP-1-GSIEGR-IGF-1融合蛋白,修饰钛种植体并植入T2DM大鼠股骺端。 展开更多
关键词 钛种植体 同源建模法 种植体骨结合 生物活性涂层 融合蛋白 RGD TBP 生物信息学软件
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RNA干扰在抑制PRRSV复制上的研究进展
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作者 樊宏超 姚睿智 +1 位作者 邓清华 马德慧 《山东畜牧兽医》 2016年第4期50-51,共2页
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起猪的一种病毒性疾病,给养猪业造成了巨大的经济损失。
关键词 RNA 养猪业 病毒性疾病 病毒基因组 结构蛋白基因 生物信息学软件 非结构蛋白 基因功能研究 基因合成 抗病毒
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中美中医方证代谢组学技术合作中心成立
16
作者 陆嘉骏 《现代化工》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期105-105,共1页
2016年1月9日,沃特世公司(Waters)在第四届中医药代谢组学研究高峰论坛上宣布与黑龙江中医药大学共同建立中美中医方证代谢组学技术合作中心。该中心由黑龙江中医药大学副校长王喜军教授领导。
关键词 代谢组学技术 方证 合作中心 沃特世 代谢组学研究 副校长 代谢网络 全新技术 生物信息学软件 方法策略
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Social practices of nurse care coordination using sensor technologies e Challenges with an alert system adoption in assisted living communities for older adults
17
作者 Isa Jahnke Nathan Riedel +2 位作者 Mihail Popescu Marjorie Skubic Marilyn Rantz 《International Journal of Nursing Sciences》 CSCD 2021年第3期289-297,I0004,共10页
Objectives:From the view of everyday practices and the socio-technical coordination lens,this study aimed to analyz the gap between creators’intention and the users’implementation(mainly nursing staff and social wor... Objectives:From the view of everyday practices and the socio-technical coordination lens,this study aimed to analyz the gap between creators’intention and the users’implementation(mainly nursing staff and social workers)of an alert system in assisted living communities.Methods:Qualitative methods were employed by way of five user interviews and focus groups with six system developers.Modeling instruments were applied for data collection to analyze the different clinical workflows versus the expectations of the system development team.Results:Results indicate that the clinical workflow changed over time,which led to a mismatch of nurse care coordination,social practices,and technology use.The results show different mental models of the socio-technical practice.Applying the coordination theory,the following recommendations could be developed to overcome the mismatch.First,it is recommended that nursing staff set goals together.Second,a communication rhythmwith the nursing staff and developer teams should be established,with guided questions to facilitate the conversation,to shed light on the different workflows and the difference in social practices when using sensor technologies or alert systems.Third,a checklist for new employees should be created so they know how and on which devices to use the alert system.Fourth,the user experience with the alert system should be improved(e.g.,an improved user interface).Conclusions:This work indicates recommendations to close the mental model gap to overcome the mismatch between optimal use of the alert system and how the nursing staff is actually using it. 展开更多
关键词 Community health services Health services for the aged Medical informatics applications SOFTWARE
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Evaluation of a Novel Approach for Automated Inventive Conceptual Design of Building Structures
18
作者 Ivan Renev 《Journal of Civil Engineering and Architecture》 2018年第8期550-562,共13页
This research is dedicated to assessment of a method that was earlier proposed and developed in order to increase the degree of automation and software involvement into conceptual decision making during design of stru... This research is dedicated to assessment of a method that was earlier proposed and developed in order to increase the degree of automation and software involvement into conceptual decision making during design of structural elements of buildings. Such instruments of the theory of inventive problem solving as contradiction and function analysis and trimming formed the basis of the proposed approach that was realized in a modern building information modeling software. The common logic of the approach is also provided in the article. Qualitative research methods and particularly collecting, analyzing and interpreting data were applied in this research. Firstly, a literature review of indexed journal articles in the field of the study was performed and some trends for possible development of the topic were identified. Secondly, a survey of potential users of the methodology was conducted and analyzed. The questionnaire results showed that the suggested method and its technical realization gained attraction among respondents, however, some of them are rather cautious regarding application of the approach potentials in their practice. The paper ends with evaluation results discussion, conclusion and proposals for further research. 展开更多
关键词 BUILDINGS STRUCTURES conceptual design AUTOMATION TRIZ (theory of inventive problem solving) function analysis.
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Information Technology Career Interest on High School Students Based on Family Background
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作者 Hotniar Siringoringo Yudi Agustono Suryadi Harmanto Anacostia Kowanda 《Computer Technology and Application》 2011年第3期232-237,共6页
The objective of this paper is to measure word of mouth influence on IT career interest based on family background on Indonesian students. For this purpose the author used questionnaire as research instrument. Data as... The objective of this paper is to measure word of mouth influence on IT career interest based on family background on Indonesian students. For this purpose the author used questionnaire as research instrument. Data as a value to interest, word of mouth and family background variables, was gathered from high school students in Jakarta metropolitan. Further, data was analyzed using multiple groups on Lisrel software. Result shows that there's difference on the influence of word of mouth on computer/IT career interest based on family background. Model relationship between word of mouth and student interest towards computer/IT is moderated by parent education and birth order. 展开更多
关键词 Career interest family characteristics Indonesian students information technology word of mouth.
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DPOI: Distributed Software System Development Platform for Ocean Information Service
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作者 GUO Zhongwen HU Keyong +1 位作者 JIANG Yongguo SUN Zhaosui 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2015年第1期65-74,共10页
Ocean information management is of great importance as it has been employed in many areas of ocean science and technology. However, the developments of Ocean Information Systems(OISs) often suffer from low efficiency ... Ocean information management is of great importance as it has been employed in many areas of ocean science and technology. However, the developments of Ocean Information Systems(OISs) often suffer from low efficiency because of repetitive work and continuous modifications caused by dynamic requirements. In this paper, the basic requirements of OISs are analyzed first, and then a novel platform DPOI is proposed to improve development efficiency and enhance software quality of OISs by providing off-the-shelf resources. In the platform, the OIS is decomposed hierarchically into a set of modules, which can be reused in different system developments. These modules include the acquisition middleware and data loader that collect data from instruments and files respectively, the database that stores data consistently, the components that support fast application generation, the web services that make the data from distributed sources syntactical by use of predefined schemas and the configuration toolkit that enables software customization. With the assistance of the development platform, the software development needs no programming and the development procedure is thus accelerated greatly. We have applied the development platform in practical developments and evaluated its efficiency in several development practices and different development approaches. The results show that DPOI significantly improves development efficiency and software quality. 展开更多
关键词 ocean information system development platform software customization COMPONENTS
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