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题名信息离散性度量方法在SARS病毒研究中的应用
被引量:4
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作者
张文
唐焕文
方伟武
修志龙
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机构
大连理工大学计算生物学和生物信息学研究所
中国科学院应用数学研究所
大连理工大学环境与生命学院
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出处
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第6期719-723,共5页
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基金
国家自然科学基金(90103033
20176005)
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文摘
多序列比较是分子生物学中的一个基本问题,本文利用一种新型信息离散性度量方法——FDOD方法,将其应用于SARS病毒研究中,对SARS病毒与已知的三类冠状病毒的复制酶、M蛋白、N蛋白和S蛋白进行了进化分析,得出的系统发育树与现有的生物分析基本一致。同时进一步显示了FDOD方法的优点,数学基础好,不带有主观因素,能比较客观地度量生物序列间的差异,且计算过程简单快速,是分子进化研究的一种有效工具。
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关键词
信息离散性度量方法
SARS
病毒研究
应用
非典型肺炎
序列比较
信息熵
系统发育
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Keywords
SARS, sequence comparison, information discrepancy, phylogeny
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分类号
R563.1
[医药卫生—呼吸系统]
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