涮辣与昆明皱皮椒pAMT生物信息学及表达分析

为分析涮辣与昆明皱皮椒假定的氨基转氨酶(pAMT)的差异,探究pAMT表达规律。本研究基于基因克隆和生物信息学方法分析pAMT基因和蛋白特性,利用qPCR测定pAMT相对表达量。结果显示,涮辣与昆明皱皮椒p AMT由1380个碱基组成,编码459个氨基酸残基,相比昆明皱皮椒,涮辣pAMT存在7个同义突变和5个错义突变位点。顺式作用元件预测结果显示,辣椒pAMT可能受环境和植物激素的影响。蛋白特性结果显示,pAMT蛋白属于Ⅰ型折叠,Ⅲ类转氨酶,为脂溶性、亲水性的不稳定蛋白,主要定位在细胞质中,无信号肽与跨膜结构。两种辣椒pAMT蛋白配体结合位点、活性位点和蛋白磷酸化位点存在差异,不同物种AMT在进化上有保守性,但在亚组间也存在一定差别。在不同发育阶段,pAMT表达呈现先升高后急剧降低,且露地条件下p AMT表达量高于大棚;同一环境条件下,涮辣pAMT表达量整体高于昆明皱皮椒;不同外源物质在一定时间内影响pAMT的表达。相对于昆明皱皮椒,涮辣pAMT基因和蛋白的改变,可能是涮辣辣度极高的原因,并且不同生长环境、发育阶段和外源物质可能通过调节pAMT的表达来影响辣椒中辣椒素的生物合成。